Дезоксирибонуклеотиды

Рис. 5.12. Синтез ДНК в обычных условиях. Очередной дезоксирибонуклеотид (дезоксирибонуклеозид-трифосфат dNTP) спаривается с комплементарным нуклеотидом матричной цепи. Между 3 -гидроксильной группой последнего нуклеотида в растущей цепи и а-фосфатной группой присоединяемого нуклеотида образуется фосфодиэфирная связь.

Холофермент ДНК-полимеразы 111 может димеризоваться. На этом основании выдвинуто предположение, что две молекулы холофермента, праймосома, и, возможно, дополнительная хеликаза образуют в клетке единый комплекс — реплисоиу, которая движется по ДНК, одновременно синтезируя обе новые цепи (рис. 34). Не исключено, что в состав гипотетической реплисомы входят и некоторые ферменты биосинтеза нуклеотидов — предшественников ДНК-Это было бы разумна, учитывая, что дезоксирибонуклеотиды нужны в клетке только для синтеза ДНК. [c.58]

Таким образом, нуклеиновые кислоты можно рассматривать как продукты конденсации монофосфорных эфиров нуклеозидов, называемых соответственно рибонуклеотидами или дезоксирибонуклеотидами (табл. 20). Поэтому нуклеиновые кислоты объединяют под общим названием .полинуклеотиды . [c.358]

Получены доказательства, что образование каждого фрагмента Оказаки требует наличия короткого затравочного комплементарного праймера — участка РНК, синтез которого катализируется праймазой. Затем при участии ДНК-полимеразы П1 синтезируются длинные участки ДНК. РНК-затравки далее вырезаются при участии ДНК-полимеразы I, а свободные места их (бреши) замещаются (достраиваются) комгшементарными дезоксирибонуклеотидами под действием той же ДНК-полимеразы I наконец, сшивание разъединенных участков отстающей цепи осуществляется при помощи ДНК-лигаз. Подобный механизм челночного синтеза ДНК легко объясняет фактические данные о накоплении коротких фрагментов ДНК у Е. oll во время репликации ДНК. [c.483]

Ключевым моментом в идентификации места фосфорилирова-ния в дезоксирибонуклеотидах было использование региоселектив-ности реакции трифенилметилхлорида (тритилхлорида) с первичными (в большей степени, чем со вторичными) гидроксильными группами. Этот факт был положен в основу специального синтеза дезокситимидин-З -фосфата (18) и -5 -фосфата (19) из дезокси-тимидина схема (4) [20). Было подтверждено, что 5 -фосфат (19) идентичен мононуклеотиду, полученному Танхаузером [14). [c.38]

Первые семь соединений — рибонуклеотиды, а последние четыре — дезоксирибонуклеотиды. Все соединения, образующие 3 -фосфаты, дают также 5 -фосфат, дифосфат и трифосфат (как это видно, например, из структурной формулы аденина, приведенной в тексте). Все 5 -монофосфаты способны к образованию дифосфатов и трифосфатов. [c.474]

Для Природных дезоксирибонуклеотидов возможно существование двух изомеров — З -фосфата (IV) и 5 -фосфата (V). [c.215]

НУКЛЕОТИДЫ (нуклеозидфосфаты), эфиры фосфорной к-ты и нуклеозидов по одному или неск. гидроксилам остатка моносахарида в более широком смысле-соед., в к-рых моносахаридный остаток нуклеозида или его неприродного аналога этерифицирован одной или неск. моно- или олигофосфатными группами. В зависимости от природы нуклеозида различают рнбо- и дезоксирибонуклеотиды, пиримидиновые и пуриновые Н. [c.304]

Строение ДНК как продуктов поликонденсации дезоксирибонуклеотидов вытекает из того, что при их гидролизе единственным продуктом реакции оказываются дезоксирибонуклеотиды. Огромный молекулярный вес ДНК говорит о высокой степени полимеризации этого биогенного полимера. [c.246]

Таким образом, при каждом шаге новое основание извлекается из матрицы ДНК, и дезоксирибонуклеотид, комплементарный рибонуклеотид которого лишился пирофосфата, поворачивается назад в ДНК с восстановлением водородных связей. Ось гибридной спирали движется вдоль ДНК винтовым способом с одновременным перемещением фермента. [c.568]

Полимерные молекулы ДНК состоят нз остатков четырех типов дезоксирибонуклеотидов, в которые в качестве углеводного компонента входит дезоксирибоза, а ] етероциклическнмн основаниями являются аденин, гуа-1Н1И, ЦИТ031Н1 н тимин [c.439]

РЕПЛИКАЦИЯ (от позднелат. repli atio-повторение) (редупликация), самовоспроизведение нуклеиновых к-т (обычно ДНК, у нек-рых вирусов РНК), обеспечивающее точное копирование генетнч. информации и передачу ее от поколения к поколению. При Р. ДНК нуклеотидная последовательность копируется (целиком вля частично) в виде комплементарной последовательности (см. Комплементарность) дезоксирибонуклеотидов. [c.252]

Чтобы обеспечить образование непрерывной цепи ДНК из многих таких фрагментов, в действие вступает особая система репарации ДНК, удаляющая РНК-затравку и заменяющая ее на ДНК. У бактерий РНК-затравка удаляется нуклеотид за нуклеотидом благодаря 5 -> З -экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы. При этом каждый отщепленный рибонуклеотидный мономер замещается соответствующим дезоксирибонуклеотидом (в качестве затравки используется З -конец синтезированного на старой цепи фрагмента). Завершает весь процесс фермент ДНК-лигаза, катализирующий образование фосфодиэфирной связи между группой З -ОН нового фрагмента ДНК и 5 -фосфатной группой предыдущего фрагмента. Образование этой связи требует затраты энергии, к-рая поставляется в ходе сопряженного гидролиза пирофосфатной связи кофермента-никотинамидадениндинуклеотида (в бактериальных клетках) или АТФ (в животных клетках и у бактериофагов). [c.253]

Применение реакции с тоиЛенилхлорметаном в ряду дезоксирибонуклеотидов позволяет получить производные, избирательно защищенные уО ) и С(з), и далее осуществить синтез обоих изомерных дезоксирибонуклеотидов. Это можно видеть из следующей схемы синтеза обоих тимидинфосфатов [c.224]

Как было указано ранее, нуклеиновые кислоты делятся на дезоксирибонуклеиновые (ДНК), являюцщеся полимерами (а точнее продуктами поликонденсации) дезоксирибонуклеотидов, и рибонуклеиновые (РНК) — полимеры рибонуклеотидов. Строение, а также физико-химическая характеристика и биологическая функция ДНК и РНК различны, и поэтому эти вопросы будут рассматриваться отдельно для каждого вида полимера. [c.246]

В 1958 г. Хорана предложил для последовательной деструкции цоли-дезоксирибонуклеотидов использовать избирательный ферментативный гидролиз. Были найдены два специфических фермента, которые избирательно расщепляли 3 -5 -связь дизамещенного эфира по месту связи Ссз)—О или С сз)—С ("5) — О. Фосфодиэстераза селезенки расщепляла эту связь по месту С(5)—О, оставляя С (з)-фосфат, диэстераза змеиного яда — связь С (3) —О, оставляя С (5)-фосфат. Так как в полимерной цепи ДНК или соответствующего олигонуклеотида с одного края всегда находится нуклеотид со свободной С (3)-гидроксильной группой, а с другой стороны цепь заканчивается нуклеотидом со свободным С (Г)-гидроксилом, то, очевидно, можно, действуя тем или иным ферментом, последовательно разрушать цепь с одного из ее концов, идентифицируя отщепляющиеся мононуклеотиды с помощью бумажной хроматографии. [c.254]

ДНК-полимераза HI катализирует сопряженный синтез ведущей (лидирующей) и отстающей цепей ДНК при репликации (см. далее). Более точно выяснена также роль ДНК-полимеразы I она катализирует отщепление затравочного олигорибонуклеотидного праймера и заполнение образующихся после этого пробелов (ниш) дезоксирибонуклеотидами. Известно, что ДНК-полимеразы II из Е. oli (мол. масса 88000) выполняет ремонтные функции, исправляя повреждения цепей ДНК. Укажем также, что ДНК-полимераза I в качестве матрицы использует одноцепочечные участки, в то время как ДНК-полимераза III—двухцепочечные ДНК, в которых имеются короткие одноцепочечные последовательности. [c.480]

Этап И — элонгация синтеза ДНК—включает два кажущихся одинаковыми, но резко различающихся по механизму синтеза лидирующей и отстающей цепей на обеих материнских цепях ДНК. Синтез лидирующей цепи начинается с синтеза праймера (при участии праймазы) у точки начала репликации, затем к праймеру присоединяются дезоксирибонуклеотиды под действием ДНК-полимеразы III далее синтез протекает непрерывно, следуя шагу репликационной вилки. Синтез отстающей цепи, напротив, протекает в направлении, обратном движению репликационной вилки и начинается фрагментарно. Фрагменты всякий раз синтезируются раздельно, начиная с синтеза праймера, который может переноситься с готового фрагмента при помощи одного из белковых факторов репликации в точку старта биосинтеза последующего фрагмента противоположно направлению синтеза фрагментов. Элонгация завершается отделением олигорибонуклеотидных праймеров, объединением отдельных фрагментов ДНК при помощи ДНК-лигаз и формированием дочерней цепи ДНК. Нельзя исключить, однако, возможности сопряженного и согласованного механизма синтеза лидирующей и отстающей цепей ДНК при участии полимераз и всего комплекса праймасом. [c.486]

При каждом шаге транскрипции новое основание извлекается из матрицы ДНК и дезоксирибонуклеотид, комплементарных рибонуклеотид которого лишился пирофосфата, поворачивается на.яад в ДНК с восстановлением водородных связей. Ось гибридной двойной спирали движется вдоль двойной спирали ДНК винтовым способом с одновременным перемещением фермента. На рис. 8.6 показана схема двуспиральной ДНК и растущего конца РНК при действии РНК-нолимеразы. Энергетика транскрипции сводится к сопряжению экзергонических и эндергониче- [c.267]

Фосфорные эфиры нуклеозидов называются нуклеотидами — рибонуклеотидами и дезоксирибонуклеотидами. Этерификация рибозы может происходить по трем гидроксилам — в 5 -, 3 - и 2 -положениях. С фосфорилированием по 2 -положению в нуклеиновых кислотах встречаться не приходится в дезоксири-бозе оно вообще невозможно. Приведем структурные формулы некоторых нуклеотидов. [c.86]

Вся информация о строении и функционировании любого живого организма содержится в закодированном ввде в его генетическом материале, основу которого составляет дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК). ДНК большинства организмов — это длинная двухцепочечная полимерная молекула. Последовательность мономерных единиц (дезоксирибонуклеотидов) в одной ее цепи соответствует (комплементарна) последовательности дезоксирибонуклеотидов в другой. Принцип комплементарности обеспечивает идентичность новосинтезированных молекул ДНК, образующихся при их удвоении (репликации), исходным молекулам. Индивидуальными генетическими элементами со строго специфичной нуклеотидной последовательностью, кодирующими определенные продукты, являются гены. Одни из них кодируют белки, другие -только молекулы РНК. Информация, содержащаяся в генах, которые кодируют белки (структурных генах), расшифровывается в ходе двух последовательных процессов синтеза РНК (транскрипции) и синтеза белка (трансляции). Сначала на определенном участке ДНК как на матрице синтезируется матричная РНК (мРНК). Затем в ходе согласованной работы многокомпонентной системы при участии транспортных РНК (тРНК), мРНК, ферментов и различных белковых факторов осуществляется синтез белковой молекулы. Все эти процессы обеспечивают правильный перевод зашифрованной в ДНК генетической информации с языка нуклеотидов на язык аминокислот. Аминокислотная последовательность белковой молекулы однозначно задает ее структуру и функции. [c.29]

Денатурация. Первый этап ПЦР состоит в тепловой денатурации образца ДНК выдерживанием его при температуре 95 °С в течение по крайней мере 1 мин. Помимо ДНК, в реакционной смеси содержатся в избытке два праймера, термостабильная ДНК-полимераза Taq, выделенная из бактерий Ткегти5 ациап-сиз, и четыре дезоксирибонуклеотида. [c.94]

Смотреть страницы где упоминается термин Дезоксирибонуклеотиды: [c.182] [c.82] [c.163] [c.163] [c.169] [c.425] [c.589] [c.589] [c.210] [c.255] [c.294] [c.44] [c.82] [c.36] [c.41] [c.185] [c.235] [c.475] [c.476] [c.499] [c.493] [c.584]

Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.12 , c.58 , c.82 , c.264 ]

Химический энциклопедический словарь (1983) -- [ c.394 , c.395 ]

Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.122 , c.128 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.12 , c.58 , c.82 , c.264 ]

Биологическая химия Изд.3 (1998) -- [ c.475 , c.476 ]

Молекулярная биотехнология принципы и применение (2002) -- [ c.32 , c.32 ]

Большой энциклопедический словарь Химия изд.2 (1998) -- [ c.394 , c.395 ]

Основы биохимии Т 1,2,3 (1985) -- [ c.856 , c.857 , c.900 , c.904 ]

Органическая химия 1969г (1969) -- [ c.647 ]

Органическая химия 1973г (1973) -- [ c.600 ]

Биохимия нуклеиновых кислот (1968) -- [ c.23 , c.180 ]

Органическая химия Издание 4 (1981) -- [ c.553 , c.554 ]

Органическая химия (1972) -- [ c.433 ]

Химия высокомолекулярных соединений Издание 2 (1966) -- [ c.444 ]

Органическая химия (1972) -- [ c.433 ]

Органическая химия Издание 2 (1976) -- [ c.432 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.362 ]

Гены и геномы Т 2 (1998) -- [ c.31 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.196 ]

Биологическая химия (2004) -- [ c.103 , c.375 , c.377 ]

Биохимия Т.3 Изд.2 (1985) -- [ c.266 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология