Агароза

Гель-электрофорез. Электрофорез на геле и крахмале применяют для аналитических целей. Наиболее важным применением гель-электрофореза является иммуноэлектрофорез. Для этого вида анализа используют макропористые гели, в частности гели агара и агарозы. Метод иммуноэлектрофореза основан на том, что после разделения электрофорезом происходит диффузия разделенных веществ — антигенов — в направлении, перпендикулярном направлению электрофореза. Навстречу этим соединениям диффундируют антитела. При соединении антигенов и антител образуются характерные дуги осаждения. Метод иммуноэлектрофореза очень чувствителен при обнаружении антигенов, специфических для данных антител. В настоящее время применяют метод введения радиоактивной метки в антигены, благодаря чему радиоиммуноэлектрофорез является одним из самых чувствительных методов анализа биополимеров. [c.364]

В обычной аффинной хроматографии для иммобилизации субстратов в качестве носителей используются агароза и сшитая сефароза. В качестве сшивающего агента обычно выступает ВгСМ, а мостик образован а,о)-диамином. Эти полисахаридные носители подвержены биодеградации, и, следовательно, органические полимерные гели более удобны в качестве матрицы и допускают более широкий набор химических модификаций. Именно эти причины побудили Уайт-сайдса и сотр. разработать новый метод иммобилизации ферментов в сшитых органических полимерных гелях [126]. По своей простоте и универсальности этот метод превосходит ранее предложенные. Особенно ценен он при иммобилизации относительно лабильных ферментов для использования в ферментерах большого размера при проведении реакций органического синтеза, катализируемых ферментами. [c.257]

Химиче- Агароза Полиме- лат Модифи- Модифи- [c.75]

Таким образом, деградация по Смиту позволяет узнать очень многое о ближнем порядке в структуре полисахарида, включая последовательности из нескольких моносахаридных звеньев. Однако о дальнем порядке мы можем сказать еще меньше, чем в случае частичного гидролиза агарозы. Действительно, найденные сегменты цепей могут быть сгруппированы в блоки, могут чередоваться по определенному (достаточно сложному) закону, могут, наконец, распределяться по цепи хаотически. Обо всех этих характеристиках дальнего порядка мы остаемся в неведении. [c.94]

Целлюлоза построена из остатков моносахаридов одного типа — из остатков глюкопиранозы. Все гликозид-ные связи имеют -конфигурацию и соединяют гликозидный центр одного остатка с кислородным атомом при С-4 следующего (такие связи сокращенно обозначают Р-1- 4). Амилоза устроена аналогично, но все гликозид-ные связи имеют противоположную конфигурацию (а-). В гиалуроновой кислоте (одном из наиболее распространенных полисахаридов соединительной ткани) в цепи чередуются остатки двух разных моносахаридов — В-глю-куроновой кислоты и N-aцeтил-B-глюкoзaминa —со связями Р-1- 3 и Р-1- 4 соответственно. В агарозе, главном гелеобразующем компоненте агара, также чередуются остатки двух моносахаридов -В-галактопиранозы и 3,6-ангид-ро-а-Ь-галактопиранозы. [c.26]

Ассортимент гелей в настоящее время широк это декстрановые гели (сефадекс), полиакриламидные гели, оксиалкилметакрилатные гели, гели агарозы (полисахариды из агар-агара) и др. [c.361]

Значительное различие в скоростях кислотного гидролиза входящих в полисахарид гликозидных связей — явление сравнительно редкое. Во всяком случае та степень избирательности, которая достигается для агарозы, уникальна. В типичных же случаях выходы олигосахаридов при частичном гидролизе гораздо ниже и, следовательно, по информативности результатов такие эксперименты значительно уступают рассмотренному примеру. [c.91]

К гидрофильным мягким гелям относятся сефадексы, или декст-рановыегели, имеющие мостики типа —О—СН2СН(ОН)СН2—О—, агарозные гели, обладающие водородными мостиками, связывающими цепи агарозы, полиакриламидные гели и крахмал. [c.230]

В действительности цепи агарозы высоко регулярны — дальний порядок не нарушен. Однако эти сведения получены всей совокупностью методов структурного анализа, примененных к агарозе, и не могли быть извлечены только из результатов частичного гидролиза описанного типа. [c.91]

В качестве примеров мягких гелей можно привести крахмал, агарозу, полиакриламид, - полидекстраны для водных сред, а также полистирол, сшитый дивинилбензо-лом, и каучуки для органических сред. Жесткими гелями являются пористые стекла и силикагели. [c.80]

Понятие повторяющегося звена, даже для таких простейших структур, как целлюлоза, амилоза, гиалуроновая кислота или агароза, не так примитивно, как может показаться на первый взгляд. Можно, конечно, отнестись к нему просто как к удобной форме сжатой зйписи, отражающей основные черты ковалентной структуры цепи, так [c.28]

Подобная запись не только описывает структуру, но и является прямым выводом из результатов химического анализа этих структур. Например, можно осуществить такое расщепление гиалуроновой кислоты и агарозы, при котором практически единственными продуктами будут дисахариды 33 и 34 — гиалобиоуроновая кислота и агаробиоза соответственно, из чего следует, что именно они являются мономерами , из которых построены эти полимеры. [c.28]

Полисахариды, о которых мы говорили выше, относятся к числу простейших полисахаридных структур. Даже неразветвленные полисахариды, построенные из остатков моносахарида одного типа, могут иметь гораздо более сложное строение. Так, например, глюкан овса содержит сопоставимые количества остатков р-В-глюкопиранозы, связанных 1—>3- и 1- 4-связями. При этом, в отличие, например, от агарозы или гиалуроновой кислоты, эти связи не чередуются правильным образом и не образуют сколько-нибудь значительных блоков из однотипных связей. Поэтому чередование двух типов связей в полисахаридной цепи приходится в данном случае характеризовать как хаотическое. Этим утверждением можно было бы и ограничиться. Мы, однако, пока не знаем, является ли хаотичность истинной или кажущейся. В самом деле, здесь может быть (хотя отнюдь не обязательно должна [c.31]

Возьмем один из полисахаридов красных водорослей — порфиран. Он построен из чередующихся остатков D- и L-галактопиранозы (и в этом смысле подобен агарозе). Однако часть остатков D-галактозы превращена в метиловый эфир (по положению 6), а остатки L-галактозы входят в полисахарид частично в виде эфиров серной кислоты по положению 6, а частично в виде 3,6-ангидропроизвод-ного, как в агарозе. Вариации каждого типа остатков распределены вдоль цепи хаотически, поэтому в целом цепь весьма нерегулярна. Однако, если порфиран обработать щелочью, то в остатках галактозы, этерифицированных серной кислотой, происходит замыкание 3,6-ангидро-циклов. В результате все остатки L-галактозы становятся одинаковыми нерегулярность по этим остаткам исчезает. [c.33]

Весьма важно, что метилирование заведомо регулярного полисахарида (агарозы) приводит к точно такому же (идентичному) метиловому зфиру, который получается описанным путем из порфирана (см. схему, с. 34). [c.33]

В агарозе имеются гликозильные остатки двух видов р-В-галактопиранозильный и 3,6-ангидро-а-Ь-галактопи-ранозильный. Гликозидная связь второго из них гораздо более чувствительна к кислотному гидролизу и некоторым другим аналогичным реакциям расщепления. Поэтому в определенных условиях можно добиться ее избирательного разрыва, не затрагивая при этом гликозидную связь остатка р-В-галактопиранозы. В результате полисахаридная цепь распадается на дисахаридные блоки агаробиозы по схеме, приведенной на с. 89. [c.88]

Образование именно такого дисахарида с полной определенностью указывает на присутствие в исходной цепи отвечающей ему последовательности р-В-галактопирано-за — 3,6-ангидро-Ь-галактопираноза, а высокий выход этого дисахарида означает, что такая последовательность доминирует в цепях. Поскольку из мономерного анализа мы знаем, что два вида моносахаридных остатков входят в состав агарозы в соотношении 1 1, доминирование такого Сегмента возможно только в структуре цепи с чередующимися остатками. Таким образом, мы узнаем о наличии второго типа сегмента 3,6-ангидро-Ь-галактопираноза — [c.88]

Если бы избирательность разрыва гликозидных связей при частичном гидролизе была абсолютной, а выход ди-сахарида — количественным, то из таких результатов можно было бы сделать вполне строгий вывод о регулярности структуры агарозы. Однако даже тогда, когда мы имеем дело с агарозой (случай, совершенно исключительный для всей химии углеводов по степени избирательности химического гидролиза), выход агаробиозы не достигает 100%. Следовательно, мы вправе предполагать наличие в цепи каких-то других последовательностей, помимо тех, сушествование которых мы установили экспериментально. Например, с результатами эксперимента вполне совместимо предположение о наличии некоторого количества сегментов. ..—А—А—... и. ..—Г—Г—..., которые по тем или иным причинам не обнаруживают себя при частичном гидролизе [c.90]

Если не считать отдельных случаев гидролиза экзо-полисахаридазами, у нас пока нет возможностей перебрать полисахаридную цепь звено за звеном, выяснив тем самым полную и точную последовательность всех остатков. А деструктивные методы типа частичного гидролиза оставляют возможность для существования каких-то минорных невыявленных сегментов (как мы видели на примере агарозы). Поэтому структуры цепей, выведенные на основании даже очень подробного исследования, как правило, характеризуются некоторой неопределенностью, по крайней мере в отношении наличия (или отсутствия) какого-то числа отклонений, аномальных звеньев, а также в отношении ограниченной точности определения количественных параметров структуры (таких, например, как число разветвлений на макромолекулу). Расширение арсенала методов, примененных к данному полисахариду, и повышение их точности может, конечно, снизить верхнюю оценку для содержания миноров и для ошибки [c.108]

Другое обстоятельство, еще более фундаментального характера, позволяет поставить под сомнение целесообразность особо точного определения полисахаридных структур. Вспомним то, что говорилось о микрогетерогенности полисахаридных цепей. Благодаря этому явлению в образце полисахарида, подвергающемуся структурному анализу, обычно содержится множество близко родственных структур. Поэтому локализация отдельных моносахаридных звеньев в цепях может быть достигнута с точностью, по крайней мере не большей, чем вариации структур молеку.11 внутри образца, связанные с микрогетерогенностью. Принципиально можно, конечно, свести к минимуму структурные вариации такого типа, например, при помощи тех или иных химических или ферментативных обработок (вспомним, как был превращен нерегулярный полисахарид порфиран в производное регулярного полисахарида агарозы) и путем особо прецизионного фракционирования. Для таких полисахаридов со сведенным к минимуму разбросом структурных параметров можно, по крайней мере в принципе, установить строение гораздо более точно. [c.109]

Характерный пример кислых гелеобразующих полисахаридов представляют каррагинаны, содержащиеся в ряде красных водорослей. Эти полисахариды относятся к тому же типу альтернирующих структур, что и агароза, и могут быть обобщенно представлены формулой 11. Характерной и постоянной особенностью такой структуры является правильное чередование р-1->4 и а-1->3-связей, но при этом структура остатков А и В варьирует в определенных пределах. Остатки А в большинстве случаев представлены 3,6-ангидро-а-В-галактопиранозой (12) или ее 2-О-сульфатом (13), но могут быть и а-В-галактопп-раноза-6-сульфатом (14) и а-В-галактопираноза-2,6-дисульфатом (15). Остаток В — это р-В-галактопира-ноза (16), ее 2-О-сульфат (17) и4-0-сульфат (18) (см. с. 165). [c.164]

Свойства агарозы были рассмотрены в первой книге >той серии, посвященной электрофорезу [Остерман, 19811. Однако ввпду центральной роли, которую играют агарозные матрицы в иекотор .г хроматографических методах (гель-фнльтрация, аффинная хроматография), имеет смысл привести здесь некоторые данные еще раз. Как и [c.53]

Агароза очень гидрофильна, а ее полимерные инти еще в болыией степени. чел1 нити целлюлозы, склонны к образованию водородных связей. Благодаря этому горячий 2—6%-пын раствор агарозы застывает в виде жесткого [c.53]

UlLrogel АсА — еще один вариант жесткой матрицы, обеснечп-вающе широкие возможности выбора размера иор. Здесь контролируемая пористость ПААГ сочетается с жесткостью агарозы — сетка ПААГ полимеризуется внутри жесткого каркаса агарозы. Химнчес- [c.55]

Химический энциклопедический словарь (1983) -- [ c.10 ]

Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.119 , c.161 , c.162 ]

Общая органическая химия Т.11 (1986) -- [ c.214 , c.250 , c.275 , c.286 , c.318 ]

Химия углеводов (1967) -- [ c.537 , c.538 , c.609 ]

Большой энциклопедический словарь Химия изд.2 (1998) -- [ c.10 ]

Энциклопедия полимеров Том 3 (1977) -- [ c.19 ]

Энциклопедия полимеров том 1 (1972) -- [ c.19 ]

Аффинная хроматография (1980) -- [ c.184 , c.199 , c.297 ]

Энциклопедия полимеров Том 1 (1974) -- [ c.19 ]

Энциклопедия полимеров Том 3 (1977) -- [ c.19 ]

Общая микробиология (1987) -- [ c.347 , c.414 ]

Краткая химическая энциклопедия Том 1 (1961) -- [ c.26 ]

Вода в полимерах (1984) -- [ c.0 ]

Химия и биохимия углеводов (1978) -- [ c.147 ]

Иммобилизованные ферменты (1987) -- [ c.14 ]

Электрофорез в разделении биологических макромолекул (1982) -- [ c.52 , c.54 , c.57 , c.59 ]

Аффинная хроматография Методы (1988) -- [ c.11 ]

Методы очистки белков (1995) -- [ c.92 , c.147 , c.164 , c.167 , c.170 ]

Методы практической биохимии (1978) -- [ c.93 , c.95 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.31 , c.141 , c.190 , c.317 ]

Физическая Биохимия (1980) -- [ c.0 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология