Фрагменты природных субстратов

Рассмотрим закономерности гидролиза субстратов лизоцима, принадлежащих всем трем перечисленным группам арилгликози-доБ олигосахарндов, олигосахаридов (синтетические субстраты и фрагменты природных субстратов) и природных нерастворимых субстратов. [c.192]

Подробное исследование механизма действия этих ингибиторов позволило предположить, что их биологическая активность связана прежде всего с наличием остатка р-гидроксилакгона, очевидно из-за структурного сходства этого фрагмента с естественным субстратом фермента 279. Это предположение было положено в основу дизайна ряда более достушшх синтетических аналогов природных ингибиторов. Некоторые из них, например 282, показали очень [c.511]

Фрагменты природных субстратов [c.195]

Во всех случаях эти хромофорные субстраты характеризуются значительно меньшей реакционной способностью по отношению к ферменту, чем природные субстраты или их фрагменты (табл. 38, 39). Так, константы скорости второго порядка кат/ Ст(каик) для [c.192]

Ферментативный гидролиз играет более заметную роль в случае имплантатов, изготовленных из природных полимеров, или при наличии в полимере фрагментов, моделирующих их естественные субстраты. Примером таких полимеров являются полиуретаны, содержащие сахаридные фрагменты [18]. [c.39]

Изучение кинетики ферментативной деградации этих субстратов осложнено трангликолизированием и множественным характером связывания их в активном центре лизоцима [2]. Выше были приведены данные о том, что ферментативный гидролиз коротких олигосахаридов (Gl NA )2 и (Gl NA )3 осушествляется не прямым путем, а скорее через промежуточные стадии трансгликозилирования. Подробная сводка данных по взаимодействию фрагментов природных субстратов — хитина и бактериальной клеточной стенки — с активным центром лизоцима приведена в обзоре [2]. [c.195]

Сильное фармакологическое действие этих лекарственных препаратов основано на сходстве как строения, так и полярности структурного фрагмента 4-аминобензолсульфонамида с 4-амино-бензойной кислотой, являющейся основным фактором в микробиологическом синтезе фолиевой кислоты (гл. 19). Сульфона-мидные лекарства конкурируют с природными субстратами в адсорбции на ферменте, ограничивая тем самым рост микроорганизмов. Организмы человека и других животных не поражаются сульфонамидными препаратами, так как самц они не синтезируют фолиевую кислоту, а получают ее в готовом виде с пищей. [c.95]

Лизоцим катализирует гидролиз Р(1—>-4)-гликозидных связей мукополисахаридов, входящих в состав клеточных стенок некоторых микроорганизмов [ 15]. Помимо этого природного субстрата, который состоит из Ы-ацетилмураминовой кислоты иЫ-аце-тилглюкозамина, лизоцим катализирует также гидролиз хитина (поли-Ы-ацетил-р-глюкозамина) и продуктов его разложения, а также некоторых р-арилди-Ы-хитобиозидов. Подробно изучена трехмерная структура лизоцима он представляет собой глобулярный белок, по форме отдаленно напоминающий бабочку, одно крыло которой содержит значительное количество спиральных фрагментов, а другое состоит в основном из складчатых р-структур. Активный центр расположен между крыльями и организован в виде щели, или впадины, способной вмещать длинноцепочечную полимерную молекулу природного субстрата. [c.151]

Термин полимерный субстрат обычно означает, что данный полимер служит объектом действия на него фермента. В ряде случаев в роли полимерных субстратов используются и синтетические поли- или олигомеры, но они, как правило, моделируют поведение природных полимеров и их фрагментов. Синтетические олигомеры зачастую более доступны, чем их природные аналоги, и их можно приготовить практически однородными (гомополимер-ными) в отношсиуи химической последовательности, в то время как природные полимеры, выделенные из клеток животного, растительного или микробного происхождения, могут содержать дефекты (в химическом отношении, а не с точки зрения биологической целесообразности). Именно этим вызвано в последнее время все возрастающее применение синтетических поли- и олигомеров для изучения механизма их ферментативной деструкции. [c.6]

Многие природные соединения содержат 1,5-диеновый фрагмент, поэтому большие усилия были направлены на поиски методов сочетания [1055] аллильных групп [1056]. Согласно одному из таких методов, симметричное сочетание аллилгалогени-дов, аллилтозилатов и аллилацетатов, приводящее к 1,5-диенам, можно провести при комнатной температуре действием карбонила никеля в таких растворителях, как ТГФ или ДМФ (обзоры см. [1057]). Реакционная способность галогенндов в этих реакциях имеет следующий порядок RI>RBr>R l. В случае несимметричных аллильных субстратов сочетание почти всегда идет по наименее замещенному концу. Эту реакцию можно провести [c.193]

Вследствие возможного коммерческого использования некоторых продуктов для целей медицины необходимо было также изучить микробиологическое окисление природных соединений, содержащих индольный фрагмент. hromoba terium viola eum окисляет триптофан до 5-окситриптофана, хотя последний не был выделен, отчасти вследствие очень низкой степени превращения (значительное количество субстрата осталось неизменным) и отчасти вследствие лабильности этого оксипроизвод-ного [29]. [c.122]

Из табл. 26 следует, что действие фермента наиболее эффективно в отношении субстратов, содержащих более крупные боковые цепи. Ароматические остатки меиее чувствительны относительно медленно гидролизуются амиды аминокислот, имеющих полярные боковые группы. Скорости гидролиза пептидов зависят также от природы аминокислот, примыкающих к N-концевому остатку. В ряде случаев оказалось возможным частично выяснить N-концевую последовательность при подМощи лейцинаминонептидазы. Окисленные А и В-цепи инсулина легко гидролизуются ферментом до свободных аминокислот. Путем кинетического исследования удалось установить последовательность первых шести N-коицевых аминокислот В-цепи инсулина. При помощи лейцинаминопептидазы были получены важные данные об N-концевой последовательности ряда природных пептидов и пептидных фрагментов, полученных из белков. Некоторые белки, например рибонуклеаза, лизоцим, Zn-инсулин и сывороточный альбумин, устойчивы к действию фермента, но легко гидролизуются после окисления надмуравьиной кислотой или после удаления Zn (в случае инсулина). Полное расщепление пептида или белка до аминокислот указывает на L-конфигурацию всех входящих в его состав аминокислот. f [c.183]

Возможны два способа получения модифицированных ДНК-субетратов — химическая модификация канонического субстрата и введение модифицированного основания в ходе его синтеза. Субстраты синтезированые химическим методом имеют некоторые преимущества перед макромолекулярными ДНК. В первую очередь в олигонуклеотиды легче ввести задуманную модификацию при его конструировании, чем модифицировать природную ДНК, а затем убеждаться в полноте ее модификации. Применяя синтетические олигонуклеотиды, можно оценить расщепление сайта с различным нуклеотидным окружением в отсутствии других эффектов, например, сверхскрученности ДНК, неканонических вторичных структур (например, 2-ДНК или крестообразные структуры остова), а также неспецифического взаимодействия ферментов с другими сайтами. Для выяснения картины взаимодействия рестриктаз с ДНК, создаются синтетические ДНК-фрагменты имеющие [c.78]

Интересен вариант мутагенеза молекул ДНК за счет встройки в случайные места экзогенных сегментов ДНК — природных фрагментов или синтетических линкеров (см. рис. 6.1, в). Случайные двухцепочечные разрывы можно вводить в молекулы ДНК путем кратковременного воздействия на них небольшого количества панкреатической ДНКазы I в присутствии катионов Мп2+. Получить молекулы ДНК с одиночными разрывами в разных местах можно, обрабатывая их рестриктазой, имеющей много участков узнавания на данном субстрате, так чтобы каждая молекула ДНК гидролизовалась в среднем лишь по одному участку. Таким образом, в частности, был получен первый гибридный фаг М13тр1 (см. 2.2.6). [c.173]

Смотреть страницы где упоминается термин Фрагменты природных субстратов: [c.138] [c.168] [c.191] [c.195] [c.197] [c.192] [c.197] [c.340] [c.221] [c.282] [c.327] [c.29] [c.93] [c.318] [c.46] [c.115] [c.523] [c.523] [c.381] [c.579] [c.361] [c.88] [c.229] [c.97] [c.77]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология