Гексапептиды

Следует подчеркнуть, что в этом небольшом, казалось бы, химическом процессе - отщепление гексапептида от предшественника-заключено важное биологическое значение, поскольку при этом происходят формирование активного центра и образование трехмерной структуры трипсина, а известно (см. главы 1 и 4), что и белки биологически активны только в своей нативной трехмерной конформации. В том, что трипсин, как и другие протеиназы, вырабатывается в поджелудочной железе в неактивной форме, также имеется определенный физиологический смысл, поскольку в противном случае трипсин мог бы оказывать разрушающее протеолитическое действие не только на клетки самой железы, но и на другие ферменты, синтезируемые в ней (амилаза, липаза и др.). В то же время поджелудочная железа защищает себя еще одним механизмом-синтезом специфического белка ингибитора панкреатического трипсина. Этот ингибитор оказался [c.420]

Таким же способом могуг быть получены тетра-, пента-, гексапептиды и Ть д., носящие общее название полипептидов. [c.236]

В вакууме AE(NHa-NHe) = 4,9 ккал/моль В присутствии гексапептида AE(NHa-NHe) = 3,4 ккал/моль [c.92]

В вакууме ДЕ(К МНа-1, 4-Т ЫНа) = 2,9 ккал/моль В присутствии гексапептида ДЕ(К КНа-1,4-Т КНа) = 3,9 ккал/моль [c.92]

П ALA-GLY-SER-ASN-LEU-ASP Система гексапептид П-1, 3-диоксан (1, ЗД) [c.94]

Другую большую группу провитаминов представляют стерины, содержащие двойные связи, при расщеплении способные образовать отдельные циклы, соединенные полиеновой цепью. Эти стерины при облучении кожи ультрафиолетовыми лучами солнечного или искусственного света переходят в витамины группы О. К провитаминам относится также никотиновая кислота, переходящая в никотинамид, а также малоактивные ди- и гексапептиды птероилглутаминовой кислоты, переходящие в птероилглутаминовую (фолиевую) кислоту. [c.632]

X выявила резкую энергетическую дифференциацию конформаций фрагмента цикло-(Су8 -Су8 ). Наиболее предпочтительные конформации восьми форм основной цепи циклического гексапептида с величинами = 0 [c.330]

С целью изучения влияния биомолекул на характер кон-формациониых превращений лекарственных субстратов нами с помощью полуэмпирического метода АМ1 в рамках пакета Hyper hem [1] исследован характер поверхности потенциальной энергии (ППЭ) молекулы тетрагидро-1,3-оксазина (1,3-ОА) в присутствии произвольного ациклического гексапептида П, построенного из остатков /. аминокислот, связанных по -типу. При этом рассматривалось 5 типов взаимного расположения молекул 1,3-ОА и П. [c.92]

Известно, что биомолекула оказывает большое влияние на лекарственный субстрат, существенно перестраивая энергетику конформационных превращений последнего. В этой связи с целью моделирования взаимодействия в системе рецеп-тор-субстрат > на начальном этапе связывания, нами с помощью полуэмпирического метода АМ1 в рамках пакета Hyper hem исследован характер поверхности потенциальной энергии (ППЭ) молекулы 1,3-диоксана в присутствии произвольного ациклического гексапептида П, построенного из остатков L-аминокислот, связанных по -типу. Рассматривались 8 типов взаимного расположения молекул 1,3-диоксана и гексапептида. [c.93]

Гормои из бычьего гипофиза (Рб-МСГ) отличается от свиного гормона (р-МСГ) тем, что в нем вторая аминокислота (глутаминовая) замещена на серин. Синтетический Рб-МСГ, несущий в молекуле шесть защитных групп, при испытании на коже лягушки показывает активность 1,4-10 ед г по сравнению с 1,2-10 ед/г для Рб МСГ (Швайцер, 1959). Синтетичес <ий 8—13 гексапептид имеет активность только 2-10 ед г ((Кдапелер, 1961). [c.700]

Таким образом, альбомицин представляет циклический гексапептид серил-ди-серил-три (N -гидpoк и-N°-aцeтил)-opнитил, комплексно связанный с ионом Ре , а также через оксигруппу серина и сульфон с пиримидиновым основанием, содержащим 3 атома азота. [c.744]

В процессе биосинтеза П. в результате специфич. протеолиза от N-конца его предшественника отщепляется пептид, состоящий из 25 аминокислотных остатков (сигнальный пептид). Образовавшийся промежут. продукт - пропаратгор-мон-малоактивен. После отщепления N-концевого гексапептида он превращается в П. Секреция П. паращитовид-ными железами регулируется Са , находящимся в плазме крови повышение концентрации Са понижает секрецию гормона, понижение-усиливает. [c.446]

Исходные 354 структурных варианта гексапептида ys -Lys сформированы из конформационных состояний перекрывающихся по трем остаткам фрагментов ys - ys ° и Ala -Lys с i/общ 6,0 ккал/моль (см. рис. III.20). Они имели 76 форм основной цепи, распределяюп ихся по [c.317]

Иная ситуация имеет место у фрагмента ys - ys l Минимизация 100 исходных структур 64 шейпов пептидного скелета участка ys - ys выявила их резкое различие в стабильности. В интервал 0-5,0 ккал/моль попадает всего пять конформаций, причем четыре из них, самые предпочтительные (L/общ = 0-1,3 ккал/моль), имеют идентичное конформационное состояние на участке ys - ys , отвечающее глобальной структуре свободного гексапептида. В самых выгодных конформациях линейного октапептида ys - ys участок ys - ys представляет собой жесткую нуклеацию, а ys - ys - лабильную часть. В нуклеации расстояние между атомами S боковых цепей ys и ys составляет -3,6 A. Образование между ними валентной связи S-S, т.е. сближение до 2,04 A, сопровождается незначительным изменением геометрии, которое не приводит к нарушению стабилизирующих невалентных взаимодействий, сложившихся в оптимальной конформации линейной последовательности ys - ys . В то же время создание S-S-связи между ys и ys , как и между ys и ys стерически невозможно. Таким образом, конформационный анализ фрагментов Met -Thr, ys -Lys и ys - ys сократил количество возможных у инсектотоксина систем дисульфидных связей со 105 до следующих шести (приведены номера остатков ys) (см. рис. III. 20) [c.319]

ЩИМИСЯ В белковой цепи в положениях 1-2 и 1-3. Найденные наборы структур пента- и гексапептидного циклов с S-S-мостиком существенно облегчают расчет пространственного строения соответствующих природных молекул или отдельных фрагментов любого аминокислотного состава. Так, в случае пентапептидов цикло-[Су5 -(Х)з-Суз ] из 972 возможных структурных вариантов требуется рассмотрение лишь 33 циклических форм пептидного остова, замкнутого дисульфидной связью, а в случае гексапептидов цикло-[Су5 -(Х)4-Су5 ] вместо 2916 - только 74, энергия которых попадает в широкий интервал 0-10 ккал/моль. Данные расчета последнего модельного пептида были использованы в конформационном анализе ряда нейрогормонов [106, 107]. [c.328]

Рассмотрим конформационные возможности линейного тетрапептидного фрагмента окситоцина y8 -Pro -Leu -Gly -NH2- Известно, что остаток Pro не только сам имеет ограниченную конформационную свободу в областях В и R, но и значительно затрудняет подвижность предшествующего остатка, обусловливая для него энергетическую предпочтительность форм В и L. Поскольку во всех предпочтительных структурах циклического гексапептида значения угла < 0°, то в анализе тетрапептида для остатка Су8 принята В-форма основной цепи. Всего для минимизации энергии было составлено 144 варианта фрагмента y8 -Gly -NH2 четырех возможных структурных типов пептидного скелета еее, eef, efe и eff). Как следует из расчетов, наиболее представителен по числу низкоэнергетических состояний тип основной цепи eff. Исходные приближения для анализа всей молекулы окситоцина были составлены соответственно из 8 и 10 низкоэнергетических конформаций гекса- и тетрапептидного фрагментов. Минимизация их энергии по всем двугранным углам основной и боковой цепей свидетельствует о нереальности подавляющего большинства рассмотренных конформаций. В широкий энергетический интервал 0-9,0 ккал/моль из 80 состояний попадает лишь 20. Глобальная конформация окситоцина состоит из самых выгодных состояний гексапептидного цикла и тетра- [c.330]

Меланотропин. Молекула у-меланотропина быка представляет собой пептидную цепь из 12 аминокислотных остатков Tyr -Val -Met —Gly" --His -Phe -Arg -Trp -Asp -Arg -Phe"-Gly . Типичный для а- и Р-форм меланотропинов гептапептидный участок Met -Glu -His -Phe -Arg -Trp --Gly здесь модифицирован остаток СШ заменен на Gly , а Gly - на Asp. Отрицательный заряд как бы передвинут с начала участка на конец. Среди рассмотренных меланотропинов у-МСГ содержит наименьшее число остатков. Тем не менее расчет этого гормона оказался наиболее многоступенчатым и трудоемким, что связано со слабой диффере1щиацией конформационных состояний по энергии и необходимостью анализа большого количества структурных вариантов. Потребовалось рассмотрение целого ряда ди-, три- и тетрапептидов, низкоэнергетические конформации которых послужили исходными в расчете фрагментов Tyr -Phe , His -Arg" и His -Gly . На завершающем этапе были использованы низкоэнергетические структуры гексапептида Tyr -Phe и октапептида His -Gly , принадлежащих соответственно 21 и 27 шейпам пептидного скелета и имеющих энергию < 7,0-8,0 ккал/ыоль. Всего было проанализировано 228 конформаций у-МСГ 216 форм основной цепи 168 шейпов. Минимизация энергии не выявила существенной детерминации оптимальных структур. В интервал 0-10,0 ккал/моль попало 78 конформаций 14 типов, которые приведены в табл. 1П,28, Полученные данные, таким образом, свидетельствуют об отсутствии в последовательности у-МСГ в отличие от других меланотропинов четких нуклеационных участков, складывающихся в определенную структуру под воздействием средних взаимодействий. [c.370]

Фрагмент Arg -Pro. Начнем рассмотрение с результатов анализа N-концевого нонапептидного участка молекулы. На основе низкоэнергетических конформаций перекрывающихся дипептидов были исследованы структуры трипептидов Arg -Asp , Pro -Phe", Phe" -Leu и тетрапептида Leu -Pro . Данные о конформационных состояниях первых двух трипептидов послужили исходными для расчета тетрапептида Arg -Phe , который вместе с трипептидом Phe -Leu стал базовым для анализа гексапептида Arg -Leu . Знание конформационных возможностей гексапептида Arg -Leu и тетрапептида Leu -Pro сделало реальным структурное исследование фрагмента Arg -Pro . На основе полученных данных был составлен набор структур Arg -Pro для минимизации энергии при варьировании 43 двугранных углов ф, у, со, X, включающий 299 конформационных вариантов, которые распадаются на 24 шейпа. Энергетическое распределение полученных данных представлено в табл. IV.3. Результаты расчета свидетельствуют о резкой энергетической дифференциации [c.428]

Субтилизин был получен в кристаллическом виде Гунтле-бергом и Оттезеном [130] из среды, в которой выращивался штамм В. 8иЫШ8. Первоначально этот протеолитический фермент был обнаружен по его способности вызывать ограниченный гидролиз нативного овальбумина, сопровождающийся образованием другого способного кристаллизоваться белка — плакальбумина [200] — и гексапептида Ала.Гли.Вал.Асп.Ала. Ала [231]. [c.211]

Первый этап заключается в нахождении центров инициации. Для инициации спирали необходимо наличие гексапептида, содержащего четыре спиралеобразующих остатка И или Н (Т" эквивалентно половине Ь ), а также не более одного прерывания спирали Ь или В . Четыре таких пептида, определяющие две нуклеации, показаны на рис. 6.2. Точно так же инициация -структуры [c.143]

Р-структуру (соответствеиио а- и р-потенциалы остатков), взяты нз табл. 6.1 и 6.2. Критерии оценки приведены на рнсуике в рамке. При предсказании а-спирали гексапептиды со средней склонностью выше 1,00 выделены сплошными линиями. Также обозначены пентапептиды со средней Р-склонностью выше 1,00. Тетрапептидные концевые участки спиралей н складчатых листов со средней склонностью выше 1,00 отмечены штрих-пунктнрными, а ниже 1,00 — пунктирными линиями. Склонность остатка входить в поворот цепи зависит от его положения в рассматриваемом тетрапептиде. Таким образом, у каждого остатка выявляются четыре склонности. Все они умножаются иа 10 . г(-По-тенциал является произведением склонностей остатков в тетрапептиде. На рисунке они обведены кружками и приведены в тех же строках, что и (-склонности тетрапептида. Все потенциалы умножены на 10Н. Тетрапептиды с потенциалами выше 50-10- подчеркнуты сплошными линиями, а несколько ниже этой величины — пунктирной линией. [c.144]

Наиболее изученный ряд циклических гексапептидов составляют железосодержащие метаболиты класса сидерохромов. Эта тема отражена в обзорах [124, 125], ниже рассмотрены лищь основные данные по структуре и свойствам. Феррихром (82) был впервые выделен х25 лет назад, и показано, что он является важным фактором микробного роста. Впоследствии были выделены родственные соединения, и найдено, что не содержащие металлов [c.315]

Рентгеноструктурное исследование циклического гексапептида иламицина В (83) согласуется со структурой, предложенной ра- [c.316]

Наиболее простым примером такой регуляции является, пожалуй, синтез ферментов в форме неактивного предщественника. Больше всего известны в этой связи мощные протеолитические ферменты процесса пищеварения. Понятно, что в клетках, производящих эти ферменты, проявление их активности было бы нежелательным. В связи с этим пепсин, трипсин и химотрипсин синтезируются в виде неактивных зимогенов . Пепсиноген затем секретируется в желудок, где совместное действие высокой концентрации кислоты и в особенности протеолитическая активность ужа присутствующего там пепсина приводит к удалению 44-членного пептидного фрагмента и образованию активного фермента. Активацию трипсиногена, заключающуюся в удалении гексапептида, осуществляет фермент энтерокиназа, а также (автокаталитически) уже образовавшийся трипсин, в то время как химотрипсин получается из химотрипсиногена посредством протеолитического действия трипсина, высвобождающего в результате важную для активности химотрипсина концевую +ЫНз-группу изолейцина-16 (см. разд. 24.1.3.4). [c.536]

Общеизвестно, что биологически активные белки, особенно секретируемые клетками, такие как ферменты и полипептидные гормоны, синтезируются в виде молекул неактивных предшественников, активируемых посредством специфического гидролитического удаления пептидных фрагментов в результате действия протеолитических ферментов. Этот ограниченный протеолиз вызывает конформационное изменение, в результате которого важные для активности группы занимают правильное пространственное взаимное расположение. Иногда расщепление пептидной связи может высвободить существенную для активности амино- или карбоксильную группу. Одним из простейших примеров ограниченного цротеолиза является активация трипсиногена до трипсина, катализируемая энтерокиназой и автокатализируемая самим трипсином. Процесс активации заключается в отщеплении гексапептида от Л -концатрипсиногена (12). [c.551]

Пенициллины не являются истинными ингибиторами синтеза белка, однако их антибактериальный эффект связан с торможением синтеза гексапептидов, входящих в состав клеточной стенки. Механизм их синтеза отличается от рибосомного механизма синтеза белка. Эритромицин и олеандомицин тормозят активность транслоказы в процессе трансляции, подобно циклогексимиду, исключительно в 80S рибосомах, т.е. тормозят синтез белка в клетках животных. [c.543]

Многие стимулирующие рост растений флуоресцирующие псевдомонады секретируют си-дерофор, представляющий собой линейный гексапептид, который состоит из чередующихся L-и D-аминокислот и связанного флуоресцентного хромофора (рис. 14.8). Один из таких сидерофоров, так называемый псевдобактин, обладает сродством к Fe(III) s 10 л моль . Сходные сидерофоры синтезируют все флуоресцирующие псевдомонады. [c.322]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология