Остатки нуклеотидные

ДНК-полимеразной реакции (рассуатриваемой в гл. II при обсуждении репликации ДНК). Принцип метода показан иа рис. 7. Как и при секвенировании ДНК по Максаму — Гилберту, здесь добиваются, чтобы обрыв цепи (при попадании на ее З -конец комплементарного терминаторного нуклеотидного остатка) происходил равновероятно по всем положениям данного остатка (рис. 7 — остаток Т). Это достигается экспериментальным выбором правиль ного соотношения дезоксинуклеозидтрифосфатов и терминаторного [c.18]

В изолированных нуклеозидах и нуклеотидах переход от С2 --эндо- к СЗ -эндо- и между син- и анти-конформациями происходит достаточно легко (хотя в зависимости от характера основания для данного соединения существуют предпочтительные конформации так, например, пиримидиновые нуклеозиды находятся в основном в акти-конформации). Если же нуклеотидный остаток встроен в по-линуклеотидную цепь, [c.23]

Инициация транскрипции сопровождается модификацией З -конца РНК с образованием специфической нуклеотидной структуры, в которой 7-метилированный остаток гуанозин-э -трифосфата соединен 5 —5 -фосфодиэфирной связью с концевым нуклеотидом РНК. Эго так называе.мый кэп (англ. ap), который присоединяется сразу после инициации транскрипции к адениловому или гуанило-вому остаткам. Поэтому сайт инициации транскрипции часто называют кэп-сайтом [c.174]

В соответствии с известной моделью Уотсона и Крика [27] нуклеиновые кислоты образуют двойную спираль, состоящую из двух цепей, в которых гетероциклические основания одной цепи связаны водородными связями с основаниями другой цепи. При этом всегда оказываются связанными друг с другом остаток аденина с остатком урацила или остаток гуанина с остатком цитозина. Обе комбинации очень близки по размерам, поэтому несмотря на их чередование поли-нуклеотидная цепь имеет высокую пространственную регулярность. [c.646]

S РНК содержит несколько посттранскрипционно модифицированных (минорных) нуклеотидных остатков (см. рис. 14), и почти все они локализуются именно в неспаренных участках цепи, в основном в З -концевой трети молекулы. В 16S РНК Е. соИ имеются щбА (два сблокированных остатка в петле З -концевой щпильки, положения 1518—1519), m G (один остаток, положение 527), m G (два остатка, положения 966 и 1207), ш С (два остатка, положения 967 и 1407), m m (один остаток, положение 1402) и mU (положение 1498). Многие из этих минорных остатков эволюционно консервативны и наблюдаются у других бактерий. Интересно, что З -концевая щпилька, включающая спираль из 10 пар нуклеотидов, оказывается инвариантной для известных 16S и 18S РНК, и два сблокированных т А в торцевой петле щпильки также обязательно присутствуют как у прокариот, так и у эукариот. [c.77]

Гамов попытался проверить правильность своего кода, сопоставив возможность сочетания ромбов с известной первичной структурой инсулина и адренокортикотропина. При этом возникли неразрешимые противоречия. Дальнейшие исследования показали, что никакие перекрывающиеся коды нельзя согласовать с опытом. Наличие перекрытий в кодонах может выражаться в корреляциях между соседними аминокислотными остатками. Иными словами, некоторые парные сочетания остатков должны быть запрещены. Анализ первичных структур белкои показал, что таких корреляций нет —любой остаток может следовать за любым, хотя разные остатки встречаются с различными частотами [4, 5]. Можно, однако, представить себе перекрывающиеся нуклеотидные коды, допускающие любую последовательность аминокислот [6]. [c.555]

Следует подчеркнуть, что отрицательно заряженные фосфатные группы (по одной на каждый нуклеотидный остаток) являются важной деталью структуры ДНК. Величина рК остатка фосфорной кислоты близка здесь к единице. [c.81]

Фосфорный остаток нуклеотидного лиганда цианокобаламина этерифициро-ван 127], однако не полностью, так как третий гидроксил в виде аниона фосфорной группы компенсирован положительным зарядом атома кобальта. Таким образом, витамин В,2 представляет собой внутреннюю соль. [c.579]

Уже на раннем этапе изучения пространственной структуры ДНК выяснилось, что при изменении внешних условий двойная спираль может принимать формы, отличные от уотсон-криковской (В-фор-мы). Так, при понижении влажности (в препарате образца для рентгеноструктурного анализа) или активности воды в растворе (при добавлении спирта, например) ДНК переходит в так называемую А-форму (рис. 14). Этот переход связан в первую очередь с изменением конформации углеводного остатка. Если в В-форме ДНК остаток дезоксирибозы находится в С2 -дайо-конформации, то при переходе в А-форму он принимает СЗ -зк<Зо-конформацию. Как было показано на рис. И, это приводит к уменьшению расстояния между фосфатными группами и, следовательно, к уменьшению расстояний между нуклеотидными парами вдоль оси спирали (до примерно 0,25 нм при И нуклеотидных остатках на виток спирали).. Диаметр спирали увеличивается, изменяется ширина и глубина бороздок, пары оснований образуют с осью спирали угол около 20 и, главное, смещены к пери(]жрии спирали. Вследствие этого спи- [c.26]

Несмотря на принципиальную разницу в строении нуклеиновых кислот и нуклеотидных коферментов, из которых одни являются полимерами, а другие к полимерам пе относятся, а также, несмотря на различие в их биологических функциях, оба эти подкласса нуклеотидов целесообразно рассматривать сообща. Это связано с тем, что в основе их химического строения лежат соединения одного и того же типа, которые обычно 1азывают мононуклеотидами. Мононуклеотиды—соединения, в которых на одно пиримидиновое или нуриновое ядро приходится один остаток моносахарида и один остаток фосфорной кислоты. Мононуклеотиды являются мономерами, и.з которых в результате поликонденсации образуются НК, Вместе с те.м мононуклеотиды являются обязательной частью молекулы нуклеотидных коферментов, что и определяет принадлежность коферментов этого типа к классу нуклеотидов, [c.175]

Кроме того, недавно стали известны нуклеотидные конферменты, в которых остаток нуклеотида связан с остатком минеральной кислоты. Они, видимо, оказывают влияние на солевой обмен и являются переносчиками сульфогруппы. Примером такого рода соединений, участвующих в биохим ических процессах, может служить так называемый активный сульфат (Via), выделенный в 1955 г. Липпманом и синтезированный в I9S9 г. Бэддили. [c.231]

В последние годы из различных природных источников выделены и другие представители нуклеотидных коферментов этого типа. Было найдено, что нуклеотидный остаток может быть соединен не только с сахарами, как в УДФГ, но и с пептидами. Строение этих нуклеотидных коэнзимов установлено, в основном, теми же приемами, что и строение УДФГ, Строение большинства из них подтверждено химическим синтезом. [c.240]

На каждые 3,4 А вдоль главной оси отдельной цепи—спирали приходится один нуклеотидный остаток. Угол между смежными нуклеотидными остатками одной и той же цени составляет 36", так что структура повторяется через каждые К) остатков данной цепи, т. е. через 34 А. Принципиально новой и очень важной особенностью модели отсона и Крика является наличие взаимной связи обеих образующих макромолекулу спиральных цепей при помощи попарного взаимодействия каждого гетероциклического основания одной цепи с со- [c.258]

Белковая инженерия, или получение новых белков, преследует две цели 1) позволяет понять, как работают те или иные белки 2) получать новые, еще неизвестные белки, и>югда более совершенные, активные. Так были получены так называемые химеры, т.е. гибриды разных белков друг с другом. В этом случае сшиваемые гены остаются без изменений, но можно проводить направленный мутагенез изменять любой нуклеотидный остаток в гене. Такие действия приводят к замене АК в белке и в этом случае получают белок с измененными свойствами. [c.61]

Хорошим примером полицистронной мРНК является РНК малого РНК-содержащего бактериального вируса (фага) MS2. Фаг MS2 — сферический он имеет диаметр 2,5 нм и молекулярную массу 3,6 10 дальтон. Фаг построен из 180 субъединиц белка оболочки с молекулярной массой 14700 дальтон каждая, одной молекулы так называемого А-белка с молекулярной массой 38000 дальтон и одной молекулы РНК с молекулярной массой 10 дальтон. После попадания фага в клетку Е. соИ (а также в бесклеточной системе трансляции) эта РНК служит матрицей для белка оболочки, А-белка и субъединицы РНК-репликазы с молекулярной массой 62000 дальтон, которая в состав фага не входит. Схема расположения соответствующих цистронов вдоль цепи этой мРНК дана на рис. 6. Цепь начинается с G, имеющего трифосфат на своем 5 -гидроксиле. Далее следует длинная некодирующая нуклеотидная последовательность. Общая длина 5 -концевой некодирующей последовательности 129 остатков в ней встречаются триплеты AUG и GUG, которые, однако, не являются инициаторными. Первый инициаторный кодон, GUG, начинает кодирующую последовательность А-белка (А-цистрон). А-цистрон имеет длину 1179 остатков и заканчивается терминаторным кодоном UAG. Затем идет некодирующая вставка длиной 26 остатков. Следующая кодирующая последовательность начинается с AUG и имеет длину 390 остатков это —цистрон белка оболочки (С-цистрон). Он оканчивается терминаторным кодоном UAA, и за ним непосредственно следует второй терминаторный кодон UAG. Последовательность длиной 36 остатков отделяет С-цистрон от S-цистрона, кодирующего субъединицу РНК-синте-тазы. S-цистрон начинается с AUG, имеет длину 1635 остатков и заканчивается UAG. За ним через один остаток (т. е. не в фазе) имеется еще один терминаторный триплет UGA. З -концевая некодирующая последовательность имеет общую длину 174 остатка и заканчивается аденозином со свободной г/мс-гликольной группиров- [c.20]

В связи с рассмотрением РНК фага MS2, следует указать также на другой способ размещения разных кодирующих последовательностей в одной мРНК. Дело в том, что MS2 РНК кодирует еще и четвертый белок, названный белком лизиса, или L-белком (он, повидимому, участвует в лизисе хозяйской клетки на завершающей фазе инфекции). Этот белок закодирован участком РНК, начинающимся в конце С-цистрона, захватывающим всю 36-нуклеотидную вставку между С-цистроном и S-цистроном и заканчивающимся в пределах S-цистрона рамка считывания этого перекрывающегося L-цистрона сдвинута вправо на один остаток (+1 сдвиг), так что никакие его участки не транслируются при синтезе С-белка и S-белка. L-цистрон имеет свой инициаторный кодон AUG, не в фазе с кодонами С-цистрона, и, соответственно, свой терминаторный кодон UAA, не в фазе с кодонами S-цистрона. Эта ситуация изображена на рис. 7. Использование перекрывающихся кодирующих последовательностей в пределах одной мРНК встречается, однако, не часто и свойственно, по-видимому, в основном вирусным системам, где экономия места для размещения цистронов играет особенно важную роль. [c.21]

Антикодоновый триплет находится приблизительно в середине цепи тРНК (ЮС в положении 34—36 на рис. 12). С 5 -стороны от него всегда находятся два пиримидиновых остатка, а с 3 -стороны — часто два пуриновых остатка, хотя второй остаток может быть и пиримидиновым, как в случае тРНК (рис. 12). Эти семь нуклеотидных остатков вместе образуют так называемую антикодоновую петлю (АС-петлю), взаимодействующую с мРНК и обладающую характерной пространственной структурой (см. ниже). [c.30]

S субчастица рибосомы хлоропластов высших растений имеет 16S РНК приблизительно такого же размера (1490 нуклеотидных остатков у Zea mays). РНК малой рибосомной субчастицы митохондрий грибов и высших растений несколько крупнее (1661 нуклеотидный остаток у дрожжей). Наоборот, минирибосомы митохондрий млекопитающих содержат в малой субчастице относительно короткую РНК, обозначаемую как 12S РНК (954—956 нуклеотидных остатков у человека и мыши, соответственно). [c.69]

Мононуклеотиды и их производные, а также динуклеотиды присутствуют в клетках в свободном виде и играют важную роль в обмене веществ. В частности, нуклеотидную структуру имеют многие коферменты, включая коферменты оксидоредуктаз. Мононуклеотиды, присоединяя еще один остаток фосфата, образуют фосфоаигидридную связь (наподобие связи, имеющейся в пирофосфате) и превращаются в иуклеозиддифосфаты (соответственно они обозначаются сокращенно АДФ, ГДФ, УДФ, ЦДФ и ТДФ). Последние, присоединяя еще один остаток фосфата, образуют иуклеозидтрифосфаты (соответственно обозначаются АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ и ТТФ). [c.103]

Наличие гуанина в моче человека показано Вейссманом, Бромбергом и Гутманом [207, 208]. Сообщается о выделении из сапропеля аналога витамина Bi2, который содержит гуанин и рибозу [209, 210]. На основании данных ультрафиолетового спектра предположено, что рибоза присоединена к седьмому атому пуринового ядра. По своему строению этот аналог близок витамину Bi2, только вместо бензимидазольного заместителя в нем содержится гуаниновый остаток. Сходный гуанинсодержащий аналог витамина В12 выделен из ферментативной жидкости No ardia [211]. Нуклеотид, в состав которого входят гуанин и фукоза, выделен из овечьего молока [212]. Гуанин обнаружен также в нуклеотидном ферменте (гуанозиндифосфат маннозы), который содержится в дрожжах [213—215]. [c.137]

Нетрудно убедиться, что в расчете на одну образовавшуюся гликозидную связь расходуется одна пирофосфатная связь в молекуле АТФ. Действительно, после прохождения реакции гликозилирования нуклеотидный остаток освобождается в виде нуклеозиддифосфата. Для его превращения в нуклеозидтрифосфат с целью повторного использования в реакции (IX.13) пеоб.чодим перенос на него одного фосфата по реакции [c.375]

Смотреть страницы где упоминается термин Остатки нуклеотидные: [c.39] [c.323] [c.494] [c.504] [c.506] [c.623] [c.624] [c.625] [c.175] [c.238] [c.171] [c.239] [c.9] [c.30] [c.34] [c.56] [c.134] [c.222] [c.39] [c.233] [c.13] [c.185] [c.186] [c.681] [c.239]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология