Псевдоуридин

Рис. 2. Схема сплайсинга npe-мРНК в ядрах клеток высших эукариот 1 н 3-соотв. 5 - н З -концы ингрона 2-место разветвления Ч -остаток псевдоуридина (отсутствует атом N в положении 1 гетероцтс1а осиования). Толстые линии-экзоны (L1 и L2), тонкие-интроны.

Дигидроуридин Риботимидин Псевдоуридин ид"ин) [c.99]

Значительно реже встречаются С-гликозиды. Один из них, псевдоуридин входит в состав некоторых РНК. С-Гликозиды, в которых агликонами служат остатки аденина, а также остатки не встречающихся в составе ДНК и РНК гетероциклических оснований, являются антибиотиками. Структурные формулы некоторых N- и С-гликозидов приведены на с.93. [c.94]

Большой интерес представляет собой превращение уридина в псевдоуридин (113). Известно, что псевдоуридин образуется в результате перегруппировки уридина, осуществляемой в первоначальном гранскрипте, однако химия такого превращения еще неясна. Существенным является то, что псевдоуридин, так же как и урацил, может спариваться с аденином. Основание, обозначаемое буквой V, представляет собой сильно модифицированный гуанин. На рис. 15-10 по- [c.222]

Наиболее хорошо известный С-нуклеозид, псевдоуридин, был синтезирован прямой реакцией конденсации. Наилучшие выходы (10%) были получены при конденсации 2,4-ди-гр< г-бутокси-5-ли-тийпиримидина с 2,4 3,5-ди-0-бензилиден-/)-рибозой с последующим удалением защитных групп [106]. Однако в целом для синтеза С-нуклеозидов методы конденсации используются редко, поскольку требуются более предсказуемые и гибкие методы. [c.102]

Этот метод опять-таки широко не используется, хотя псевдоуридин был получен из оксазиномицина (72). На схеме (27) представлено превращение псевдоуридина в 5-(Р-Д-рибофуранозил)-6-азаурацил. [c.102]

Первым выделенным мононуклеотидом была инозиновая кислота (IMP, 9), которая была получена из гидролизата мяса Либихом в 1847 г. примерно за 20 лет до выделения нуклеиновых кислот из гнойных клеток Мишером. Взаимосвязь между мононуклеотидами и нуклеиновыми кислотами стала понятна в первой половине двадцатого столетия главным образом в результате работ Левина и др. [6]. Инозиновая кислота не является широкораспространенным в природе нуклеотидом она образовалась в процессе выделения по Либиху за счет дезаминирования АМР, который сам по себе был выделен из мышц лишь в 1927 г. Были выделены все обычные нуклеотиды аденина, цитозина, гуанина, тимина н урацила, так же как и многие минорные нуклеотиды, например, образуюш,иеся из псевдоуридина, дигидроуридина и метилированных производных аденозина и гуанозина. [c.134]

Ряд других веществ растительного и животного происхождения мангиферин, карминовая кислота также, по-видимому, относятся к С-гликозидам, хотя их структура не доказана с полной определенностью, несмотря на многочисленные работы в этом направлении . Наконец, С-гли-козидом является псевдоуридин С (LXXI), выделенный при гидролизе дрожжевой РНК " . [c.357]

Однонитевые макромолекулы всех типов РНК свёрнуты в клубки, отдельные участки которых могут быть спирализованы в двойную спираль за счёт спаривания азотистых оснований в этих участках. Чем больше ионная сила раствора, в котором находится РНК, тем больше доля спирализованных участков. В образовании таких спирализованных структур, чередующихся с аморфными участками, принимают участие от 40 до 70 % всех нуклеотидов РНК. Наибольший процент спирализации обнаружен у тРНК. При нагревании растворов РНК наблюдается переход "спираль - клубок" (так называемое молекулярное плавление). Особенностью маяекул РНК является наличие в её цепях "необычных нуклеотидов" псевдоуридина (см. с. 93) [c.118]

А — аденозин, В — 5-бромуридин, С — цитидин, D — 5,6-дигидро-уридин, G — гуанозин, I — инозин, О — оротидин, S — тиоуридин, U — уридин, X — ксантозин, Ч — псевдоуридин, R — неустановленный пуриновый нуклеозид, Y — неустановленный пиримидиновый нуклеозид. [c.359]

I и н, который можно рассматривать как продукт дезаминирова-гия аденозина (см. 13.2), а также псевдоуридин, который шляется не N-, а С-глйкозидом, с чем связана его высокая УСТОЙЧИВОСТЬ к гидролизу. [c.435]

Особенно много минорных компонентов содержится в транспортных РНК дигидроурацил, псевдоуридин, ксантин, гипоксантин, ацетилцитозин, оротовая кислота и др. [c.172]

Константы спин-спинового взаимодействия между протонами у соседних атомов углерода в фуранозном кольце нуклеозидов (и нуклеотидов) можно использовать для определения конформации кольца П0 зависимости вицинальной константы н-н от двугранного угла Н—С—С—Н, предложенной Карплусом (см. разд. 1.14). Приблизительные значения констант спин-спинового взаимодействия протонов при С-Г и С-2, /и.з были определены в ранних работах [47, 48], но для того, чтобы сделать определенные выводы, необходимо знать и другие константы спин-спинового взаимодействия, определить которые значительно труднее вследствие перекрывания линий. Были описаны хорошо разрещенные спектры уридина [49, 50], псевдоуридина [36] и 3,5-циклических монофосфатов нуклеозидов, например 3, 5 -уридинцикломонофос-фата [51]. [c.418]

РНК также содержат редкие компоненты. Они в большей степени встречаются в тРНК, в меньшей степени — в рибосомных и ядерных РНК. Наиболее распространены производные обычных оснований (цитозина, урацила, аденина и гуанина) с заместителями в гетероциклическом ядре или в экзоциклических аминогруппах. Известны некоторые производные урацила, такие, как 3-метилури-дин, 4-тиоуридин и т. д. Необычная модификация наблюдается в случае псевдоуридина, в котором урацил соединяется с сахаром С-гликозидной, а не N-гликoзиднoй связью за счет атома С-5 гетероциклического ядра [c.303]

С наибольшей скоростью модифицируются редкие компоиенты нуклеиновых кислот — инозин и псевдоуридин. Реакиия с карбодиимидом практически не идет с двухцепочечными полинуклеотидами. В нуклеиновых кислотах, содержащих как двухцепочечные, так и одиоцепочечные участки, модифицируются только последние, что используется при исследованиях вторичной структуры тРНК. [c.389]

К нуклеозидам с различными основаниями, перечисленным здесь, мы можем добавить псевдоуридин, который отличается от ури-дина тем, что содержит урацил, присоединенный к атому С-5 ри-бозы. [c.410]

Выводы о существовании стэкинг-взаимодействий оснований в пиримидиновых нуклеозидах цитидине и уридине были сделаны на основании изучения осмотического давления [35]. Но это взаимодействие не может наблюдаться для таких нуклеозидов с помощью метода ЯМР даже в принципе, поскольку для них отсутствуют эффекты кольцевого тока тем не менее резонансные сигналы протонов, как сообщалось, смещаются в сторону сильного поля в присутствии пурина, что наводит на мысль о стэкинг-взаимодействии между пурином и пиримидином [30]. Аналогичные эффекты наблюдались для псевдоуридина [36]. [c.415]

На рис. 15.7 представлен спектр псевдоуридина, наблюдаемый на частоте 100 МГц и рассчитанный с помощью ЭВМ [36]. Такие расчеты, как мы уже видели, являются наиболее надежным способом получения параметров из сложных сильно связанных спектров. Вицинальные константы спин-спинового взаимодействия для рибо-зы составляют от 5 до 5,2 Гц. Исключение составляют Д-б в и 4 5 с (см. структурную формулу псевдоуридина на стр. 411 и на рис. 15.7 следует заметить, что точное отнесение резонансных сигналов протонов Нв и Не при С-5 не было сделано). Эти две константы равны 3,2 и 4,6 Гц (или наоборот) и почти не зависят от температуры. Эти значения показывают, что ни одна из конформаций заметно не преобладает. Если бы такая конформация существовала, то, как показывает рассмотрение молекулярных моделей, значения 1у2 и /зм должны были бы соответствовать двугран- [c.418]

Смотреть страницы где упоминается термин Псевдоуридин: [c.488] [c.473] [c.91] [c.390] [c.31] [c.32] [c.101] [c.518] [c.95] [c.96] [c.357] [c.93] [c.356] [c.97] [c.99] [c.99] [c.186] [c.187] [c.408] [c.343] [c.411] [c.419]

Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.12 ]

Методы получения и некоторые простые реакции присоединения альдегидов и кетонов Ч.2 (0) -- [ c.474 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.12 ]

Биологическая химия Изд.3 (1998) -- [ c.518 ]

Справочник биохимии (1991) -- [ c.83 , c.95 ]

Биоорганическая химия (1991) -- [ c.436 ]

ЯМР высокого разрешения макромолекул (1977) -- [ c.415 , c.420 ]

Основы биохимии Т 1,2,3 (1985) -- [ c.930 , c.931 ]

Биохимия нуклеиновых кислот (1968) -- [ c.22 , c.59 , c.267 ]

Основы биологической химии (1970) -- [ c.126 , c.522 ]

Органическая химия нуклеиновых кислот (1970) -- [ c.21 , c.52 ]

Химия нуклеозидов и нуклеотидов (1966) -- [ c.111 ]

Биохимический справочник (1979) -- [ c.71 ]

ЯМР высокого разрешения макромолекул (1977) -- [ c.415 , c.420 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.338 , c.342 ]

Гены (1987) -- [ c.88 ]

Биохимия человека Т.2 (1993) -- [ c.9 ]

Биохимия человека Том 2 (1993) -- [ c.9 ]

Гены и геномы Т 2 (1998) -- [ c.54 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.213 ]

Биохимия Т.3 Изд.2 (1985) -- [ c.61 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология