Уридин спектры

Рис. 15.6. Температурные зависимости химических сдвигов протонов при С-5, С-б и С-1 уридин-5 -монофосфата (УМФ) в спектрах ПМР (100 МГц) его растворов

Несмотря на эти недостатки, спектроскопию КР применяли для исследования некоторых систем металл — лиганд [12—15], а также для изучения взаимодействия комплексов платины (II) с такими основаниями, как цитидин и уридин [16]. Проблема низкой интенсивности спектров КР может быть решена использованием спектроскопии резонансного комбинационного рассеяния. В ней частота рамановского возбуждения соответствует частоте полосы электронного спектра поглощения лиганда или комплекса. Впервые этот метод применили для исследования взаимодействия тетрацианэтилена с органическими электронодонорными соединениями. Полученные константы устойчивости, несмотря на сравнительно низкую воспроизводимость, хорошо согласуются с величинами, определенными другими методами [17]. В связи со снижением общей интенсивности из-за поглощения излучения образующимся комплексом в качестве внутреннего стандарта использовали полосу растворителя. [c.148]

Возможность образования такой водородной связи может быть легко продемонстрирована на молекулярных моделях нуклеозидов с анга-конформацией. Впервые предположение о таком взаимодействии было выдвинуто для объяснения различия УФ-спектров в сильнощелочной среде уридина и уридин-З -фосфата, с одной стороны, и уридин-2 -фосфата, с другой стороны Прямых доказательств образования такого рода водородной связи до сих пор не получено. Расстояние между атомами кислорода 2-экзо-О и 2 -экзо-0 в кристаллах пиримидиновых рибонуклеозидов и рибонуклеотидов , полученное на основании данных рентгенографии, превышает расстояние, требуемое для образования водородной связи. Однако это не удивительно, так как в кристаллической решетке и тот и другой атомы кислорода находятся в непосредственной близости с функциональными группами соседних молекул нуклеотида такие межмолекулярные взаимодействия могут преобладать в данном случае над внутримолекулярными взаимодействиями, существующими в разбавленных растворах. [c.141]

Рис. 5.4. УФ-Спектр уридина pH 6,9 до (кривая )) и после обработки 0,33 М раствором формальде-. гида (кривая 2).

В еще более мягких условиях протекает взаимодействие 4-тио-уридин-2 (3 )-фосфата с Ы-этил-малеинимидом 5 при pH 7,8 и 37 °С реакция в 0,003 М растворе реагента завершается за 3 ч. УФ-Спектры и данные электрофореза продукта реакции согласуются со структурой ХХУП (2-тиоуридин и его фосфаты не вступают в подобную реакцию). [c.429]

Данные по периодатному окислению псевдоуридин-З -фосфата и уридин-2 (3 )-фосфата приведены в табл. 11.1. При pH 7,5 урацил-5-карбоновая кислота является единственным продуктом окисления псевдоуридин-З -фосфата, поглощающим в ультрафиолетовой области одновременно становится заметным и другой процесс — разрушение соединения с потерей характерного поглощения в УФ-области спектра. Образующиеся при этом продукты не идентифицированы, и механизм реакции остается неясным (см. также ). [c.611]

СТГ обладает широким спектром биологического действия. Он влияет на все клетки организма, определяя интенсивность обмена углеводов, белков, липидов и минеральных веществ. Он усиливает биосинтез белка, ДНК, РНК и гликогена и в то же время способствует мобилизации жиров из депо и распаду высших жирных кислот и глюкозы в тканях. Помимо активации процессов ассимиляции, сопровождающихся увеличением размеров тела, ростом скелета, СТГ координирует и регулирует скорость протекания обменных процессов. Кроме того, СТГ человека и приматов (но не других животных) обладает измеримой лактогенной активностью. Предполагают, что многие биологические эффекты этого гормона осуществляются через особый белковый фактор, образующийся в печени под влиянием гормона. Этот фактор был назван сульфирующим или тимидиловым, поскольку он стимулирует включение сульфата в хрящи, тимидина—в ДНК, уридина—в РНК и пролина—в коллаген. По своей природе этот фактор оказался пептидом с мол. массой 8000. Учитывая его биологическую роль, ему дали наименование соматомедин , т.е. медиатор действия СТГ в организме. [c.259]

Рис. 8.5.10. Корреляционный спектр гетероядерных протон — азот-15 сдвигов 0,7 мМ раствора tRNA , меченого 65% N в положении N3 всех оснований производных уридина, полученный с помощью последовательности, изображенной иа рнс. 8.5.9, в, с развязкой в течение времени 1г, но без (1г) -импульса в периоде эволюции. Циклированием фазы были выделены сигналы, связанные только с гетероядерной двухквантовой когерентностью, и с помощью м,етода сдвига матрицы данных (разд. 6.6.1) были удалены протонные сдвиги из ш -области. Спектр получен при накоплении сигнала в течение 6 ч от образца объемом 200 мкл. (Из работы [[8,131.)

Катц и Пенман [27] наблюдали чрезвычайно большой сдвиг резонансного сигнала NH-группы гуанозина в слабое поле и уменьшение экранирования протонов NH2-rpynn гуанозина и цити-дина, если два этих соединения смешать в с б-ДМСО. На рис. 15.5 [8, 27] показаны спектры протонного резонанса отдельных нуклеозидов и их смесей в молярном соотношении 1 1. Однако для другой пары комплементарных оснований — аденозина и уридина — в спектрах ПМР не обнаруживается такого взаимодействия. Это согласуется с тем известным фактом, что основания этой пары значительно слабее связываются друг с другом [28]. [c.414]

Константы спин-спинового взаимодействия между протонами у соседних атомов углерода в фуранозном кольце нуклеозидов (и нуклеотидов) можно использовать для определения конформации кольца П0 зависимости вицинальной константы н-н от двугранного угла Н—С—С—Н, предложенной Карплусом (см. разд. 1.14). Приблизительные значения констант спин-спинового взаимодействия протонов при С-Г и С-2, /и.з были определены в ранних работах [47, 48], но для того, чтобы сделать определенные выводы, необходимо знать и другие константы спин-спинового взаимодействия, определить которые значительно труднее вследствие перекрывания линий. Были описаны хорошо разрещенные спектры уридина [49, 50], псевдоуридина [36] и 3,5-циклических монофосфатов нуклеозидов, например 3, 5 -уридинцикломонофос-фата [51]. [c.418]

Нуклеозиды представляют собой К-гликозиды (Н-В-фурано-р-рибо-зиды и Н-дезокси-О-фурано- -рибозиды соответственно) приведенных выше пуринов и пиримидинов. Соединение сахарного остатка с атомом азота в положении 9 пуринового ядра было доказано исследованием ультрафиолетовых спектров поглощения, показавших, что спектры аденозина, гуанозина и других пуриновых нуклеозидов тождественны со спектрами соответственно 9-метиладенина, 9-метилгуапина и т.д. (Дж. М. Гулланд, 1932 г.). Положение связи рибозного остатка в цитидине и уридине было определено химическим путем. [c.775]

Имеющиеся косвенные доказательства существования водородной связи между карбонильной группой при С-2 пиримидинового кольца и водородом гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы можно разбить на две группы. Одна группа — это данные о различии физических свойств или химической реакционной способности для пиримидиновых нуклеозидов и их производных, в которых имеется гидроксильная группа при С-2 (например, уридин, уридин-З -фосфат, уридин-5 -фосфат) и производных, в которых эта гидроксильная группа отсутствует (например, 2 -дезоксиури-дин, уридин-2 -фосфат, алкилурацилы). Помимо уже упоминавшихся данных по УФ-спектрам производных уридина сюда относятся данные о различии констант ионизации для производных цитозина этих двух групп отличия в спектрах ЯМР пиримидиновых нуклеотидов 33, а также различие в скоростях протекания некоторых реакций рибо- и дезоксирибонуклеозидов (например, фотохимической гидратации производных цитидинакаталитического гидрирования и гидроксиламинолиза 9 производных уридина). [c.141]

Спектры ЯМР. Спектры ЯМР при исследовании в неводных растворителях дают возможность определить место локализации ПОДВИЖНЫХ протонов. В случае уридина и тимидина в спектре ЯМР, полученном в диметилсульфоксиде в области химических сдвигов примерно 11 м. д., наблюдается пик, площадь которого соответствует одному протону, и который является резонансным сигналом протона N—Н. Это означает, что в данных условиях тимидин и уридин существуют в дикетоформе [c.167]

Спектры ЯМР. Кетоаминоструктура цитидина сохраняется и в неводных растворителях, как это следует из изучения спектров ЯМР. Так, в диметилсульфоксиде в области б 7,5 м. д. наблюдается характерный для ароматической аминогруппы пик, соответствующий двум протонам тогда как пик протона N—Н в области И м- д. не наблюдается. Это хорошо видно при сравнении спектра ЯМР цитидина со спектрами тимидина или уридина (см. выше). Отсюда следует, что в диметилсульфоксиде цитидин имеет аминострук-туру. Спектры основания в дез [c.171]

То же относится и к локализации отрицательного заряда, образующегося при отщеплении протона от нуклеозидов типа уридина или гуанозина. На основании близкой аналогии ИК-спектров гуанозина и его 0-метилпроизводного в щелочной среде и исчезновения характеристической полосы колебаний С = 0-группы при высоких значениях pH делается вывод о преимущественной локализации отрицательного заряда на кислородном атоме. Этот же вывод можно сделать из аналогии УФ-спектров аниона 9-этилгуанина и 2,6-диаминопурина По-видимому, эти выводы справедливы также и для инозина. [c.182]

Аналогия УФ-спектров аниона уридина и его 4-э/сзо-О-алкиль-ного производного приводит к выводу о преимущественной локализации отрицательного заряда на кислородном атоме 0-4 С этим согласуется и близость ИК-спектра уридина в щелочной среде с ИК-спектром дигидропиримидона-2 ээ. Однако для тимидина предложены различные структуры аниона —с локализацией отрицательного заряда на 0-2 и на 0-4 [c.182]

Рис. 12.4. УФ-спектры поглощения уридина (кривая 1) и фотогидрата уридина (кривая 2) в нейтральной среде и аниона фотогидрата уридила при рн 12 (кривая 3)

Инфракрасные спектры поглощения нуклеозидов и нуклеотидов в тяжелой воде показывают, что в нейтральном водном растворе тимидин и уридин существуют, вероятно, в дикетонной форме, а цитидин и аденозин — в аминной форме [46]. Изучены также спектры диссоциированных форм [165. Очевидно, что кажущиеся значения рД обусловлены не только наличием замещающей группы, но связаны также с влиянием соседней части кольцевой системы пурина или пиримидина. Природа этих групп имеет большое значение в отношении водородных связей между производными пурина и пиримидина в макромолекулярных структурах нуклеиновых кислот. [c.52]

Теоретические исследования этих хромофоров показали, что спектры поглощения рибонуклеотидов в области 190—300 нм имеют я —>я -природу [298, 564, 565]. Метод вычисления вращательной силы с помощью теории связанного осциллятора, особенно в случае циклонукле-озидов, указывает на то, что эта теория объясняет большинство примеров проявления оптической активности в пиримидиновых нуклеозидах [83]. Метод КД, как один из многих экспериментальных методов изучения глико-зидной конформации в нуклеозидах, использован недавно для исследования конформации цитидина, 2, 3 -изопро-пилиденцитидина, уридина и 2, 3 -изопропилиденуридина в воде и органических растворителях [566]. Данные, полученные с помощью КД, для многочисленных пиримидиновых нуклеозидов позволяют, кроме того, изучить фуранозную конформацию, влияющую на оптическую активность [564, 565]. [c.89]

ОТНОСЯЩИЙСЯ К смеси мононуклеотидов АМФ и УМФ (динатриевая соль аде-нозин-5-монофосфата и динатриевая соль уридин-5-монофосфата), совершенно идентичен спектру, рассчитанному путем суммирования спектров этих соединений. Было показано [53, 54], что поли-А и ноли-У, взаимодействуя друг с другом, образуют посредством водородных связей двойную спираль, аналогичную спирали Д1Н1К. Отклонение от аддитивности поэтому можно объяснить взаимодействием полинуклеотндных цепей. [c.59]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология