Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Цитозин ионизация

    Другим общепринятым методом разделения оснований является ионообменная хроматография. Большинство оснований содержит по крайней мере один заместитель, способный к ионизации, в результате чего молекулы приобретают положительный или отрицательный заряд (табл. 37.5). Вследствие этого возможно использование как катионитов, так и анионитов. Хорошим примером разделения оснований является хроматография на катионите дауэкс 50 (№) в 2 н. соляной кислоте [33]. При этом основания элюируются в следующем порядке урацил, цитозин, гуанин, аденин. Аналогичным образом, но при элюировании в линейном градиенте соляной кислоты (1—4 М) выделяли метилированные основания (в основном метилированные производные гуанина) из полных гидролизатов РНК хлорной кислотой [63]. Также на катионите анализировали основания, отщепленные от полирибонуклеотидов в ходе ступенчатой деградации полинуклеотидной цепи периодатным окислением [53]. [c.44]


    Исходя из конформационных форм рибозы и дезоксирибозы (см. гл. 2), можно заключить, что возможность такого взаимодействия особенно велика в случае нуклеозид-5 -фосфатов, фосфатные группы которых могут находиться в пространственной близости к циклу основания. Значительно менее тесного контакта с основанием следует ожидать для 2 - и З -фосфатных групп, которые находятся в гране-положении по отношению к основанию. В случае производных цитозина, где при ионизации ядра образуются цвиттерионы, стабильность последних, таким образом, должна быть выше в случае 5 -фосфатов, что, очевидно, приводит к большему увеличению р/Са по сравнению с нуклеозидом, чем в случае 2 - и З -фосфатов. При диссоциации производных ура- [c.188]

Рис. 30. Спектр поглощения цитозина в трех различных состояниях ионизации i—форма I (рН=1) 2—форма II (рН=7,2) г—форма III (pH—14) 4—спектр совершенно непохожего соединения-триптофана. Рис. 30. <a href="/info/715212">Спектр поглощения цитозина</a> в трех <a href="/info/1497979">различных состояниях</a> ионизации i—форма I (рН=1) 2—форма II (рН=7,2) г—форма III (pH—14) 4—спектр совершенно непохожего соединения-триптофана.
    ДНК превращается в клубок при смещении pH как в кислую, так и в щелочную области. В первом случае это объясняется ионизацией КНа-групп гуанина, цитозина и аденина и возникающими дополнительными силами кулоновского отталкивания. Во втором случае при pH 12 происходит ионизация енольных групп, обра-ззтощихся из кетогр5ШП гуанина и тимина, вследствие чего разрываются водородные связи. [c.193]

    Влияние pH на конформации полинуклеотидных цепей в растворе обусловлено тем обстоятельством, что водородные связи, стабилизующие спиральную структуру, образуются в этих молекулах между группами, способными к ионизации, и поэтому ионизация хотя бы одной из групп, участвующих в об.разовании водородной связи, означает одновременно разрыв последней, что ведет к изменению конформации молекулы. В этом случае мы встречаемся с ярким примером специфических взаимодействий, о которых говорилось ранее применительно к полипептидам (см. 26, 27). Действительно, ионизация оснований, т. е. процесс отдачи или связывания протона (соответственно для кислотных и основных ионизуемых групп) осуществляется лишь при отсутствии водородных связей в спиральной форме такой процесс не имеет места. Пуриновые и пиримидиновые основания, входящие в ДНК и синтетические полинуклеотиды, образуют водородные связи между аминогруппой и атомом азота, включенным в цикл, с одной стороны, и группой —МН—СО — с другой. Отрицательные логарифмы констант диссоциации этих групп соответственно равны —2,9 (гуанин) 3,7—3,8 (аденин) 4,5—4,8 (цитозин) р/Скн-со 9,5—11,4 (гуанин, тимин, урацил). Поскольку аминогруппа присоединяет протон, а группа —NH—СО— отдает его, то первая заряжена при pH < рКш2 а вторая при pH > рКш-со- Таким образом, в диапазоне рК 2 < рН < / АГын-со пуриновые и пиримидиновые основания не заряжены, и здесь возможно существование спиральной конформации молекул. Интересный [c.372]


    Имеющиеся косвенные доказательства существования водородной связи между карбонильной группой при С-2 пиримидинового кольца и водородом гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы можно разбить на две группы. Одна группа — это данные о различии физических свойств или химической реакционной способности для пиримидиновых нуклеозидов и их производных, в которых имеется гидроксильная группа при С-2 (например, уридин, уридин-З -фосфат, уридин-5 -фосфат) и производных, в которых эта гидроксильная группа отсутствует (например, 2 -дезоксиури-дин, уридин-2 -фосфат, алкилурацилы). Помимо уже упоминавшихся данных по УФ-спектрам производных уридина сюда относятся данные о различии констант ионизации для производных цитозина этих двух групп отличия в спектрах ЯМР пиримидиновых нуклеотидов 33, а также различие в скоростях протекания некоторых реакций рибо- и дезоксирибонуклеозидов (например, фотохимической гидратации производных цитидинакаталитического гидрирования и гидроксиламинолиза 9 производных уридина). [c.141]

    Так как при подкислении необратимая денатурация происходит почти исключительно при тех значениях pH, при которых протонируются гуаниновые остатки, ясно, что протонирование остатков аденина или цитозина (возможно, по Кгположению) [208, 2151 не обязательно ведет к разделению двух цепей ДНК- Можно ожидать, что ионизация основных групп и тепловые эффекты при денатурации протекают совместно [201, 208], так как для того, чтобы вызвать денатурацию при повышенных температурах, необходимо меньше кислоты. Объяснение необратимой кислотной денатурации ДНК позволяет предположить, что протонирование гуаниновых остатков сопровождается таутомерным смещением от 6-кето- к 6-оксипурину с разрывом обеих водородных связей в гуанин-цито-зиновой паре [216[. Такое таутомерное смещение (рис. 8-15) [c.566]

    В основе обеих спиралей лежит сахарофосфатная структура. Р —остаток фосфорной кислоты, связанный эфирными связями с соседними молекулами сахара дезоксирибозы. Свободная ОН-группа способна к ионизации. Внутренняя часть каждой цепи состоит из последовательности четырех оснований адснина (А), цитозина (С), гуанина (О) и тимииа (Т). Возможны два варианта связывания оснований, принадлежащих разным цепям либо аденин связывается двумя водородными связями с тимином, либо гуанин — с цитозином тремя водородными связями (водородные связи показаны штриховыми линиями). Также показаны связи между основаниями и главной цепью (сплошные линии — связь видна или штриховыми — связь закрывается главной цепью). В нейтральной среде, которая обычно свойственна организмам, основания не ионизируются. В растворе с низкой ионной силой отталкивающее взаимодействие между отрицательными зарядами иа фосфатных группах может приводить к искажению структуры и в конечном итоге к денатурации. Однако при достаточно В >1сокой концентрации электролита в клетках электростатическое взаимодействие между анионными группами подавляется. [c.67]

    Для разделения пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов и нуклеотидов используются различные хроматографические методы. В случае нуклеотидов используется также электрофорез. Эти методы пригодны и для разделения производных рибозы и дезоксирибозы. Разделение нуклеотидов зависит от присутствия в пуринах и пиримидинах способных к ионизации групп, а именно енольных гидроксидных групп урацила, тимина н гуанина с рК в интервале от 9 до 12,5 и амииогрупп аденина, гуаиина и цитозина с рК между 2 и 4,5. Кроме того, все нуклеотиды обладают двумя кислотными группами замещенной фосфорной кислоты с р 1 1 и рК 6. [c.214]


Смотреть страницы где упоминается термин Цитозин ионизация: [c.214]    [c.47]    [c.195]    [c.338]    [c.52]   
Органическая химия нуклеиновых кислот (1970) -- [ c.19 , c.124 , c.178 , c.181 , c.183 , c.188 , c.190 , c.190 , c.193 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Цитозин



© 2024 chem21.info Реклама на сайте