Отклонения от уравнения Михаэлиса—Ментен

КИНЕТИЧЕСКИЕ УРАВНЕНИЯ АНРИ И МИХАЭЛИСА — МЕНТЕН. ОТКЛОНЕНИЯ ОТ УРАВНЕНИЯ МИХАЭЛИСА — МЕНТЕН [c.5]

ОТКЛОНЕНИЯ ОТ УРАВНЕНИЯ МИХАЭЛИСА — МЕНТЕН [c.21]

Прочие типичные случаи отклонения кинетического поведения ферментативных реакций от уравнения Михаэлиса — Ментен (реакция двух субстратов с одним ферментом, реакция двух ферментов с одним субстратом, влияние примесей в препарате фермента на кинетику реакции т. д.) будут рассмотрены при решении соответствующих задач. [c.116]

Несмотря на то что схема (1.7) и уравнение Михаэлиса — Ментен не соответствует на молекулярном уровне ни одному механизму реакции, его использование получило большое распространение. Это одно из фундаментальных уравнений ферментативной кинетики. Уравнение Михаэлиса — Ментен феноменологически описывает практически все ферментативные реа1кции, а наблюдаемые отклонения, как правило, связаны с усложнением простейшей схемы. Дело в том, что уравнение Михаэлиса — Ментен отражает фундаментальную особенность ферментативных реакций — участие в механизме процессов лабильных промежуточных соединений субстрата и активного центра фермента. [c.12]

Необходимо упомянуть еи ,е об одной часто применяемой альтернативной форме уравнения Михаэлиса — Ментен, поскольку она обладает тем преимуществом, что позволяет заметить такие отклонения от линейности, которые могли быть пропущены в графиках, приведенных на рис. 6.8 и 6.9. Если умножить уравнение (6.4)8 на и произвести соответствующие преобразования, то получим [c.346]

В целом ряде случаев мембранные ферменты обнаруживают отклонения от гиперболической кинетики, описываемой уравнением Михаэлиса—Ментен. Для объяснения этого феномена создаются оригинальные концепции о существовании специального регуляторного центра с низким сродством к субстрату, обеспечивающего аллостерическую регуляцию активности исходную или индуцируемую гетерогенность активных центров фермента в олигомерных ансамблях изменение конформации белковых молекул вследствие фазовых переходов мембранных липидов ИТ. п. [c.97]

Затем изучали вопрос давала ли программа расчета криволинейной регрессии хороший минимум для суммы квадратов, если за начальные оценки принимать корректные значения параметров. Было установлено, что из 530 случаев имитирования Г-тест давал правильную оценку для порядка уравнения с вероятностью 0,62. Эта вероятность уменьшалась вместе с увеличением степени следующим образом 1 1 (0,98), 2 2 (0,71), 3 3 (0,43), 4 4 (0,34). Оказалось, однако, что вероятность обнаружения отклонений от кинетики Михаэлиса—Ментен с помощью / -теста, т. е. обнаружения в уравнениях порядка п п членов, по крайней мере второй степени, равна приблизительно 0,8. [c.105]

Ясно, что необходимым условием использования данного подхода яв./ яется подчинение кинетики ферментативного гидролиза уравнению Михаэлиса- Ментен. Отклонения от этого уравнения, вызванные такими эффектами, как трансглюкозилирование, ингибирование или активация субстратом, различная pH- или температурная зависимость скоростей гидролиза используемых пар субстратов будут искажать левую часть соотношения (20) п, следовательно, приведут к неверным показателям сродства сайтов активного центра к мономерным остаткам субстрата. [c.43]

Известен большой класс ферментативных реакций, для которых уравнение Михаэлиса — Ментен не описывает экспериментально наблюдаемой зависимости ско рости от концентрации субстрата. Эти случаи связаны со значительными изменениями в механизме реакции , как правило, вызывают интерес исследователей, поскольку эффекты такого рода имеют большое регуляторное значение. Известно иесколько механизмов, приводящих к неми-хаэлисовым завйсимостям скорости реакции. Все эти механизмы связаны со взаимодействием с ферментом нескольких молекул субстрата. Отклонения могут быть вызваны ингибированием или активацией реакции избытком субстрата, а также аллостериче-скими эффектами. [c.21]

До 1961 г. обсуждение относительных достоинств трех линейных графиков касалось в основном вопросов о том, насколько они удобны и как четко выявляют отклонения от уравнения Михаэлиса—Ментен. Пока обсуждение ограничивалось рассмотрением только этих вопросов, никаких серьезных доводов, позволяюпцих отдать предпочтение какому-либо линейному графику, фактически не существовало. Это положение убедительно подтверждается результатами обобщений, проведенных Диксоном и Уэббом (см. [78]), Совсем недавно Уилкинсон [149], с одной стороны, и Иоханес и Ламри [86], с другой, поставили вопросе статистическом разбросе данных для всех линейных анаморфоз уравнения Михаэлиса—Ментен . Полученные этими авторами результаты и соответствующие выводы детально рассмотрены в гл.10, однако некоторые важные моменты стоит отметить здесь. Для определения параметров, строго говоря, вообще нецелесообразно использовать графики (линейные или любые другие). Для этой цели следует применять ЭВМ (см. гл. 10), а один из линейных графиков можно представлять далее только для иллюстраций. Иногда высказывается точка зрения, что, поскольку неудовлетворительными являются все три графика, имеет смысл использовать наиболее привычный из них — график двойных обратных координат. Однако это предложение противоречит принципу, гласящему, что задача правосудия состоит не только в том, чтобы добиться справедливости, но и в том, чтобы показать, каким путем оно этого добилось. Если результаты эксперимента представить в двойных обратных координатах и здесь же показать линию, полученную путем независимых (не дающих, очевидно, разброса) вычислений, то эта расчетная линия из-за больших отклонений ряда точек в области малых концентраций субстрата покажется проведенной некорректно. Аналогичная ситуация возникает и при использовании двух других линейных графиков, однако в этих случаях данному вопросу не придают особого значения. [c.47]

Отклонения от уравнения Михаэлиса—Ментен должны наблюдаться и для многих других механизмов с разветвленными путями [1391, однако эти отклонения могут быть настолько малыми, что обнаружить их не удастся, как этой было показано,например, Гулбински и Клеландом [61] для галактокиназы (разд. 3.7и 5.2). В настоящее время не известно ни одного случая кооперативности ферментативной кинетики подобного рода, и, по-видимому, энзимологи будут продолжать использовать равновесные модели, пока это будет целесообразно. [c.197]

Известны также и другие зависимости. Экспериментально наблюдаются зависимости скорости реакции от концентрации субстрата с экстремумом (рис. 2.7, кривая 6) или с ускорением на начальном этапе (рис. 2.7, кривая в). За каждым из этих случаев стоит соответствующий механизм, который приводит к тому или иному типу зависимости. Для этих реакций уравнение Михаэлиса—Ментен не описывает экспериментально наблюдаемой зависимости скорости от концентрации субстрата. Эти случаи связаны со значительными изменениями в механизме реакции и, как правило, вызывают интерес исследователей, поскольку эффекты такого рода имеют большое регуляторное значение. Известно несколько механизмов, приводящих к немихаэлисовым зависимостям скорости реакции. Все эти механизмы связаны с взаимодействием с ферментом нескольких молекул субстрата. Отклонения могут быть вызваны ингибированием или активацией реакции избытком субстрата, а также аллостерическими эффектами. [c.101]

Для графического анализа данных и обнаружения отклонений от идеальности весьма полезно преобразовать уравнение Михаэлиса — Ментен в линейную форму. Чаще всего для этого используют метод Лайнуивера—Бэрка. Взяв величины, обратные правой и левой частям уравнения (3.1), и подставив выражение (3.2), мы получим уравнение Лайнуивера — Бэрка [5] [c.117]

В этих книгах отражены успехи в изучении кинетических механизмов сложных ферментативных процессов, в разработке правил вывода уравнений стационарной скорости, в анализе кинетики действия аллостерических и многокомпонентных ферментных систем. В последние годы особенно большое внимание стали уделять отклонениям от линейности различных графиков — двойных обратных величин, V от v/S, S/v от S и других, в которых обычно принято представлять кинетические данные для определения параметров Кт и Vmax. Всс больше наблюдается случаев, когда в уравнение скорости реакции необходимо вводить концентрационные члены в квадрате и высших степенях. Однако даже в одном из самых поздних изданий ( Ферменты М. Диксона и Э. Уэбба) подобные примеры рассмотрены в разделе Особые случаи стационарной кинетики , хотя есть основания считать, что отклонения от кинетики Михаэлиса — Ментен являются скорее правилом, чем исключением. В данной книге авторы попытались изложить основные прин- [c.5]

Результаты измерений начальных скоростей при различных концентрациях субстрата удобнее всего представлять графически, с тем чтобы можно было оценить значения кинетических параметров и точность эксперимента. Самый простой способ графического представления данных, описываемых уравнением (2.8), состоит в построении графика зависимости у от s в результате получается равнобочная гипербола (рис.2.1) с асимптотой v = V для ординаты v и с асимптотой = —/См Для абсциссы s. Однако для прайтических целей этот график оказывается наименее пригодным обусловлено это тем, что, во-первых, довольно трудно точно построить равнобочные гиперболы во-вторых, определенные трудности возникают и при построении асимптот всегда хочется провести их как можно ближе к кривой в-третьих, трудно проводить сопоставление гипербол между собой и, в-четвертых, очень трудно обнаружить отклонения от ожидаемой кривой, если они существуют. Михаэлис и Ментен [113], отдавая себе отчет во всех этих трудностях, строили график в координатах (у Igs). Этот график, как видно из рис. 2.3, представляет собой симметричную S-образную кривую, которая имеет максимальный наклон при S = /См- Дифференцирование уравнения (2.8) показывает, что [c.43]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология