Апофермент, связывание с коферментом

Рис. 75. Два центра связывания кофермента с апоферментом.

Молекула апофермента выполняет, повидимому, две главные функции 1) активирование простетической группы и 2) связывание фермента с субстратом. Для объяснения механизма активации простетической группы (кофермента) было выдвинуто представление, согласно которому апофермент фиксирует на своей поверхности простетическую группу в таком положении, которое наиболее благоприятно для взаимодействия с субстратом. Можно легко себе представить, что этим путем облегчается возможность столкновений молекул субстрата с активной группой фермента. [c.277]

СВЯЗЫВАНИЕ КОФЕРМЕНТА С АПОФЕРМЕНТОМ И ПОЛУЧЕНИЕ ИСКУССТВЕННЫХ ФЕРМЕНТОВ [c.199]

Имеются 2 предположения о причинах различий в ингибировании роста микроорганизмов алкильными аналогами S-102. Во-первых, возможно, что они сами по себе неактивны в качестве антагонистов витамина В12 и становятся активными только после расщепления Со-С-связи, т. е. различное торможение является результатам различия в стабильности Со-С-связи при ферментативном или самопроизвольном расщеплении внутри клеток микроорганизмов. Во-вторых, возможно, что они не расщепляются внутри клеток и конкурируют в своей первоначальной химической форме при связывании с апоферментом. В таком случае различная степень торможения роста отражает структурную специфичность при конкурировании алкильных аналогов S-102 с ДБК-коферментом в этих микроорганизмах. [c.305]

Роль фосфата заключается в связывании кофермента с соответствующим апоферментом. В работе [301] выдвинута интересная гипотеза (рис. 7.9), согласно которой фосфатная и метильная группы служат своего рода осью, [c.433]

Однако, каталитическая активность фермента не зависит от природы металла комплексообразователя, функция которого, вероятно, состоит в координации лри связывании кофермента и апофермента [53]. [c.278]

В большинстве случаев имеет место очень прочное связывание флавинового кофермента с апоферментом, равновесная константа диссоциации схема (24) составляет около 10 — 10- моль-л , однако кофермент может быть удален при денатурации белка обычными методами. [c.595]

Взаимодействие кофермента с апоферментом отличается высокой специфичностью. Это объясняется, как и в случае субстратной специфичности, наличием в апоферменте центра связывания, комплементарного коферменту. [c.70]

В связывании кофермента с апоферментом участвуют атом азо а в первом положепи i пирими инового кольца, 4- и 2 -метильные, а также пирофосфатная группы. Необходимо, кроме того, наличие метиленового мостика Его удлинение даже на одну метиленовую группу дает производное кофермента, которое неактивно и не связывается с ферментом [439]. Что касается атома серы тназо-лового кольца, то трудно сказать что-либо определенное [c.121]

Повышение стабильности и эффективности действия НАД-зависимых ферментов в растворах может быть достигнуто ковалентным связыванием кофермента или его низкомолекулярного производного с апоферментом [94]. В этом случае в роли полимера-носителя выступает сам активируемый апофермент. Такой прием, по-видимому, важен для создания циркулирующих ферментов медицинского назначения с эндогенно обусловленной активностью. В [95] предложен интересный метод ковалентного связывания кофакторов с активным центром ферментов. Метод основан на способности сополимера акролеина с частично кватернизованным 4-винилпиридином образовывать комплексы с молекулами глобулярных белков так, что белковая глобула оказывается покрытой полимерной оболочкой, содержащей альдегидные группы. Формиатдегидрогеназа в виде комплекса с №-(6-аминогексил)ацетамид-НАД+ и азид-ионом была обработана упомянутым выше сополимером, в результате чего молекула модифицированного кофактора оказалась связанной с белком в его активном центре через амино- [c.106]

Способ связывания ТДФ с активным центром апофермента, вызывающий изменение конформации кофермента, может включать более чем один тип взаимодействия. При этом, кроме электростатического или ковалентного типа связи пирофосфатной группировки кофермента, может наблюдаться взаимодействие с обра,зованием молекулярного комплекса с переносом заряда. Такие комплексы с я-донор-но-акцепторным взаимодействием найдены при исследовании связывания коферментов с боковыми цепями ароматических аминокислот, например триптофана, у флавиновых и пир идиновых ферментов. [c.279]

Нефосфорилированные аналоги кофермента не связываются апоферментом, в то время как сильно связывающиеся фосфонат-ные аналоги каталитически неактивны. Особо важной является альдегидная группа. Первоначально она участвует в образовании имина с е-аминогруппой остатка лизина. УФ-спектр комплекса типичен для основания Шиффа восстановление комплекса борогидридом натрия приводит к необратимой модификации лизинового остатка. Фенольная гидроксильная группа, по-видимому, не принимает участия в связывании, так как соответствующий метиловый афир связывается хорошо, хотя образующийся в результате холофермент и неактивен. И, наконец, мётильная группа не участвует в связывании комплекс апофермента с 2-норпиридоксальфосфа-том активнее комплекса с обычным коферментом. [c.638]

Было показано наличие строгого стереохимического контроля реакций, катализируемых пиридоксальфосфатом [125]. Важным фактором активации а-связей я-системой является стереохимическое расположение ст-связи относительно близрасположенных л-орбиталей. В соответствии с этим Донатаном предложено [126], что разрывающаяся ст-связь должна лежать в плоскости, перпендикулярной плоскости я-системы кофермента. Именно такая конформация позволяет достичь максимального ст — я-перекрывания и максимально уменьшить энергию переходного состояния разрыва связи. Донатан предположил далее, что конформация может контролироваться апоферментом, возможно посредством связывания карбоксилат-иона, что имин (153) может принимать одну из трех возможных конформаций. Последние схематически представлены на схеме (99). Здесь прямоугольником обозначена плоскость пиридинового кольца глаз наблюдателя направлен вдоль связи — N . В каждом случае вертикальной линией изображена лабильная ст-связь. Таким образом, конформация (154) благоприятствует трансаминированию, (155) — декарбоксилированию, а (156) — удалению R (как в серингидроксиметилазе). [c.641]

НАД" и НАДФ представляют собой коферменты большого числа дегидрогеназ связь между ними и апоферментом непрочная, и они ассоциируют между собой только в момент реакции. НАД" и НАДФ принимают непосредственное участие в переносе электронов в ходе окислительно-восстановительных реакций. В соответствии с этим существует две формы каждого из коферментов окисленная и восстановленная. В присутствии восстановленного субстрата (ЗНз) — донора электронов и соответствующей дегидрогеназы пиридиновое кольцо восстанавливается путем связывания в четвертом положении одного протона и двух электронов, а второй протон остается в среде [c.193]

М. Пирас и В. Нокс [59] показали, что молекула апофермента имеет два участка один — каталитический, а другой — для связывания гематина. Они также установили, что некоторые гомологи триптофана, как и сам триптофан, способствуют реакции связывания апофермента с нростети-ческой группой. Более того, аналоги, способствующие этой реакции, оказались эффективными индукторами этого фермента у крыс с удаленными надпочечниками независимо от того, было у этих аналогов сродство к каталитическому участку или нет. Авторы попытались объяснить полученные результаты с помощью модели [60], предложенной ими за двадцать лет до создания модели оперона. Согласно этой модели, считается, что фермент находится в динамическом равновесии со своим предшественником. Субстрат или жестко связанный кофермент, соединяясь с белком, могут повышать его устойчивость к распаду и тем самым увеличивать количество активного фермента. Соответственно равновесие будет смещаться в сторону образования активной формы фермента, потому что синтез фермента продолжается, а распад — нет. В рассматриваемой [c.76]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология