Фенилаланин идентификация

Целью данной работы является разделение и идентификация аминокислот, смесь которых дается студенту в виде раствора. Задача разработана для гликокола (глицин гли), аланина (ала), валина (вал) и фенилаланина (фен). [c.36]

Рис. 9.7.6. Изображение пространствениого строения центральной части участка 3-структуры ОПИТ. Десять остатков аминокислоты обозначены следующими буквами С — цистеин, F — фенилаланин, I — изолейцнн, Q — глутамин, R — аргинин, Т — треонин, V — валин, Y — тирозин. Водородные связи между группами NH и СО обозначены щтриховкой. Отметим, что протоны NH л-го остатка и протоны С"Н (п - 1)-го остатка, обозначенные стрелками, расположены очень близко. Наблюдаемые NOE позволяют провести последовательную идентификацию резонансных сигналов. (Из работы [9.31].)

Идентификация замен оснований в результате частичного мутагенеза. Так как генетический код хорошо известен, можно идентифицировать замены оснований при частичных мутациях. Предположим, например, что мутаген способен приводить к частой замене фенилаланина на изолейцин. Триплетные кодоны ДНК, соответствующие фенилаланину, представляют собой последовательности ААА и AAG, а для изолейцина — ТАА, TAG и TAT. Поскольку большинство мутаций приводит к замене только одного основания, данный мутаген будет вызывать частое замещение А на Т. [c.187]

Расщепление полипептидной цепи на фрагменты проводят обычно при помощи протеолитических ферментов, таких, как трипсин, химотрипсин или пепсин. Эти ферменты действуют на различные участки полипептидной цепи, так как имеют повышенное сродство к различным аминокислотным остаткам. Необходимо учитывать также соседние аминокислотные остатки, т. е. пространственное окружение атакуемой пептидной связи. Оказалось, что трипсин гидролизует только те пептидные связи, в образовании которых участвует карбоксильная группа лизина или аргинина, а химотрипсин гидролизует связи по фенилаланину, триптофану и тирозину Обычно протеолитические ферменты, гидролизующие полипептидные цепи, предварительно иммобилизуют на нерастворимых матрицах для более легкого отделения их от продуктов гидролиза. Далее определяют аминокислотные последовательности каждого полипептидного фрагмента. Для этого чаще всего используют метод Эдмана, заключающийся в анализе полипептида только с Ж-конца. Концевая аминокислота при взаимодействии с фенилизотиоцианатом в щелочной среде образует стойкое соединение, которое можно отщепить от полипептида без его деградации. Фенилтиогидантоиновое (ФТГ) производное аминокислоты идентифицируется хроматографическим методом. После идентификации концевого Ж-амино-кислотного остатка метка вводится в следующий аминокислотный остаток, [c.41]

Общая методика разделения двадцати ФТГ-аминокислот включает хроматографию на двух колонках (/ и //) и идентификацию ФТГ-аргинина и ФТГ-гнстидина—хроматографией на бумаге. На колонку / с скоростью 15 мл/ч подают систему А, а после выхода ФТГ-фенилаланина—систему Б. [c.383]

Этим методом Томида и сотр. [24[ подтвердили D-конфигура-пию фенилаланина в грамицидине J , идентифицировав N-ТФА-метиловые эфиры l-Рго-L-Val, L-Val-l-Огп, l-Огп-L-Leu, L-Leu-D-Phe и D-Phe-L-Рго. Ta же последовательность была доказана и для грамицидина S при идентификации хроматограммы частичного гидролизата. [c.172]

В 1961 г. Ниренберг и Маттеи [173] сделали очень важное наблюдение если к системе, содерн<ащей смесь 20 аминокислот, добавить синтетический полимер поли-У, то только одна аминокислота, а именно фенилаланин, включается в кислотонерастворимый белковоподобный полимер, который при идентификации оказался иолифенилалапином. Следовательно, фенилаланин закодирован в РНК сочетанием УУУ. [c.273]

Из обычных аминокислот флуоресцируют только те, которые содержат ароматические системы, например триптофан, тирозин и фенилаланин [343]. Они поглощают только ниже 300 нм, и в этой области возбуждаются также многие другие распространенные соединения, например продукты гидролиза белков. Поэтому Ваалкс и Юденфренд [344] разработали для тирозина химический метод (реакция с а-нитрозо-р-нафтолом в присутствии азотной и азотистой кислот) получения флуоресцирующего продукта, который можно возбудить в видимой области при 460 нм. Такой способ применяется, например, для определения тирозина в плазме или ткани с использованием сравнительно простой методики, не требующей полного выделения тирозина. В биохимических исследованиях такой принцип — сдвиг параметров флуоресценции в более длинноволновую область — очень часто используется с целью избежать помех, обусловленных многими сопутствующими веществами, и обеспечить более надежную идентификацию. [c.435]

Аргинин 1 фенилаланин ] пролин ] лейцин + изолейцин I валин лизин тирозин I аланин 1 треонин 1 глицин дженколевая кислота 1 серин лан-тионин I глутаминовая кислота аспарагиновая кислота цистин цистиновая кислота. Идентификация (порядок — в первой, фенольной, хроматограмме) [c.271]

Новая аминокислота тирозин триптофан I фенилаланин [ метионин лейцин I изолейцин валин 1 новая аминокислота пролин треонин гистидин I аланин новая аминокислота I серинI глицин аргинин лизин I глутаминовая кислота ] аспарагиновая кислота. Идентификация и определение (порядок — в первой, коллидиновой, хроматограмме) [c.271]

Разделение и определение сс - Валил - орнитин ] орнитил-лейцин 1 лейцил-фенилаланин I фенилаланил-пролин. Идентификация [c.272]

Применение динитрофенильных производных, введенных в практику Зангером [25] с целью идентификации и количественного определения концевых аминогрупп, позволяет получить ценные сведения о количестве открытых цепей в белке. Кроме того, такие меченые аминокислоты служат в качестве реперных точек при исследовании неполного гидролиза (1346). В этом отношении полезными являются также е -аминогруппы лизина. Путем неполного гидролиза, осуществляемого с помощью кислоты и различных типов ферментов, оказалось возможным разрывать длинные полипептидные цепи в различных точках и путем анализа установить единственно возможную конфигурацию. Этим способом Зангер и Таппи[99]и Зангер и Томпсон [100] определили порядок чередования аминокислот в двух типах цепей, входящих в состав инсулина (табл. 27). Такой подход к проблеме структуры белка был облегчен широким применением новейших микрометодов хроматографии на бумаге и силикагеле и ионофореза. Таким образом, оказывается, что одна из крупнейших проблем химии белка поддается изучению с помощью весьма простых и экономичных методов. Цепи в инсулине имеют различную длину, причем цепь с N-концевым фенилаланином (цепь В) состоит из 30 остатков, а соответствующая глициновая цепь (цепь А) — из 21 остатка. Порядок чередования аминокислот и их содержание даны в табл. 27. Можно отметить следующее. Цепь А не содержит лизина, гистидина, аргинина, треонина, фенилаланина и пролина все эти компоненты входят в состав цепи В, в которой, в свою очередь, совсем нет изолейцина. Не наблюдается ни регулярного чередования аминокислот, ни тенденции к чередованию полярных и неполярных групп. Три ароматические аминокислоты (фен.фен.тир.) расположены последовательно, и два остатка глутаминовой кислоты связаны с двумя остатками ци-стеина (глу.глу.цис.цис.). В обеих цепях содержится шесть цистеиновых остатков, четыре из которых расположены врозь, а только что упомянутые два — рядом друг с другом в молекуле нативного белка все они существуют в форме цистина, но какие из них расположены между пептидными цепями, а какие в самих пептидных цепях — неизвестно. Часть дикарбоновых кислот присутствует в виде амидов — четыре в цепи А и две в цепи В. [c.255]

Перед хроматографированием бумагу ватман 1 необходимо промыть 20 %-ной уксусной кислотой. Для идентификации диметиламинокислот применяют двумерное хроматографирование в первом направлении используют систему к-бутанол —пиридин —вода (5 2 3), во втором направлении — систему i-бyтaнoл —уксусная кислота — вода (4 1 5).Удобно также хроматографировать в системе фенол — вода (4 1) в первом направлении и в системе бутанол уксусная кислота —во втором. После разделения хроматограмму сушат при комнатной температуре. Диметил-аминопроизводные фенилаланина, лейцина и изолейцина отделяют, используя т.рет.-амиловый спирт, насыщенный водой, в атмосфере триметиламипа. [c.484]

Следовательно, в приближений АВХ, которое часто выполняется (рис. 13.7), Xi можно получить прямо путем изме рения внешнего расщепления в квартете а-протона, так как оно равно /i2+/i3. Для фенилаланина, у которого конформер /, по-видимому, наименее устойчив по сте рическим причинам, найдено, что 1=0,26 (для катиона), 0,28 (для цвиттериона) я 0,30 (для аниона), что несколько меньше среднестатистического значения (0,33). К сожалению, если сигналы протонов Нг я Нз в спектре не идентифицированы точно, измерить соотношение между конформерами I и II иевозможно. Такая идентификация возможна лри стереоопецифи-ческом замещении одного из этих протонов на дейтерий, но это до оих пор не сделано. Ясно, что конформеры / и II присутствуют не в равных количествах, так как иначе Ju и 1 з были бы щриблизи-тельно равны. Обычно предполагают [8, 17], что при наличия объемных заместителей (СеНз и СООН) в гране-положении конформер III является предпочтительным. Тогда получаем следующие соотношения [c.273]

Выделение и идентификация феромонов были бы значительно упрощены, если бы удалось выяснить механизм биосинтеза феромонов. Некоторые успехи по выяснению механизма биосинтеза феромонов самцов (афродизиаков), возбуждающих самку, уже достигнуты. Так, например, обнаружено, что у самцов некоторых видов совоК, испускающих пахучие вещества с пучков волосков, синтез 2-фенилэтанола из фенилаланина проходит через образование коричной кислоты. При этом 2-фенилэтанол, как и бензальдегид, до испускания самцом находится в основных экзокринных железах Стобба в виде глюкозидов — фенэтил-0-глюкозида и бензил- 3-глю- [c.9]

Методы идентификации ЫНг-концевых остатков, обсуждаемые ниже, представляют собой другое мощное средство для выяснения вопроса об идентичности аминокислотных последовательностей полипептидных цепей субъединиц. Неидентичность двух цепей инсулина очевидна (см. табл. 6.2), поскольку на 1 моль инсулина приходится по 1 молю NH2-кoнцeвыx глицина и фенилаланина, В про- [c.172]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология