Октапептиды

Если полиамид образован из относительно небольшого числа аминокислот, то используется термин пептиды с префиксом, указывающим число аминокислотных остатков (например, дипептид, трипептид, октапептид). Если полиамид образован из очень большого числа аминокислот, то употребляется термин белок . Молекулярная масса белков составляет 10 —10 . Следует отметить, что нижняя граница этого термина очень неопределенная. [c.296]

Завершающие этапы конформационного анализа гормона, излагаемые ниже, включают рассмотрение конформационных возможностей пентапептида Arg -Leu , а переход от His -Leu к молекуле секретина - двух пентапептидов Gln °-Gln , Leu -VaP NH2 и октапептида Gln °-Val NH2. [c.381]

Исходные приближения для минимизации энергии октапептида Glu - ys сформированы из самого предпочтительного конформационного [c.434]

Восемь низкоэнергетических конформаций шейпов 62/46/2 и 2/4 2/62/2 представляют собой комбинации самых выгодных состояний свободных нонапептида Arg -Pro и пентапептида Tyr - ys , к наиболее предпочтительным относятся также состояния октапептида Glu - ys , приведенные в табл. IV.6. В конформациях шейпа 2/465/2 противоположные свернутые концы пептидной цепи удалены друг от друга (рис. IV.9). В более компактных конформациях 62/4 2/62/2 сближенными оказываются остатки Рго , ys и Pro с остатками Туг ° и ys . Однако из-за специфики боковых цепей этих остатков и их взаимного расположения эффективных невалентных взаимодействий здесь не возникает. Энергия конформаций подобного типа также слагается практически аддитивно из вкладов свободных фрагментов Arg -Pro и Tyr °- ys . Конформации обоих шейпов различаются только состоянием (В или R) остатка Рго . Из-за отсутствия дальних взаимодействий изменение одного угла уу приблизительно на 180 не сопряжено со значительными энергетическими затратами. [c.438]

Ангиотензин П — октапептид, сильно повышающий кровяное давление. Действие специфической протеиназы, ренина, в почке приводит к образованию из гликопротеина крови декапептида ангиотензина I схема (8) . Обработка гликопротеина трипсином [c.555]

Понижение давления возможно также в результате ингибирования фермента пептиднлдипептидазы (кининазы-Щ к-рый катализирует превращение неактивного декапептида ангиотензина-1 в сильный прессорный октапептид ангио-тензин-П и инактивирует брадикинин, расширяющий сосуды. К таким ингибиторам относятся, напр., тепротид-5-Oxo-Pro-Trp-Pro-Arg-Pro-Gln-iso-Leu-Pro-OH (буквенные обозначения см. в ст. Аминокислоты), каптоприл (X). [c.572]

Сладкие пептиды, такие, как дипептидный эфир аспартам (разд. 2.3.1.12.1), горькие пептиды из продуктов ферментации (соевый соус, сыр и т. д.), а также пептиды из белков рыбы или говядины, улучшают вкус пищи, как изолированный в 1978 г. Ямасаки и Маекава из мясного сока октапептид Ьу5-01у-А5р-01и-01и-8ег-Ьеи-А1а, широко используются в пищевой промышленности. [c.90]

В С-концевой области наблюдается значительная гомология с гастрином и це-рулином. Полученный триптическим расщеплением амид С-концевого октапептида и соответствующий додекапептид показывают более высокую биологическую активность, чем нативный гормон. Для амида октапептида действие (при расчете на 1 мг) в 10 раз более высокое. Для амида додекапептида установлена в 2,5 раза более высокая активность в тесте иа сокращение желчного пузыря по сравнению с природным гормоном, причем было отмечено сильное увеличение обычно слабо выраженной гастриновой активности. [c.278]

Построенные из L-амннокнслот аматохсины — циклические октапептиды, содержащие на месте тиоэфирной связи сульфоксидный мостик [c.311]

Исходными в анализе инсектотоксина служили наборы оптимальных конформаций свободных монопептидов, полученных из расчета соответствующих метиламидов N-ацетил-а-аминокислот. На их основе были рассчитаны конформационные состояния перекрывающихся дипептидных фрагментов. Низкоэнергетические варианты всех возможных форм основ-Иой цепи и шейпов дипептидов использованы в расчете более сложных участков молекулы. Ниже мы остановимся на некоторых узловых моментах конформационного анализа инсектотоксина. Завершающая стадия расчета октапептида Met -Thr заключалась в рассмотрении 130 исходных приближений 18 различных форм основной цепи. Минимизация выявила резкую дифференциацию конформаций по энергии в широкий энергетический интервал i/общ = С Ю ккал/моль попали лишь восемь родственных структурных вариантов. Во всех случаях боковые цепи остатков ys и ys находятся далеко друг от друга и принудительное сближение атомов Сопровождается значительным повышением энергии. [c.317]

Иная ситуация имеет место у фрагмента ys - ys l Минимизация 100 исходных структур 64 шейпов пептидного скелета участка ys - ys выявила их резкое различие в стабильности. В интервал 0-5,0 ккал/моль попадает всего пять конформаций, причем четыре из них, самые предпочтительные (L/общ = 0-1,3 ккал/моль), имеют идентичное конформационное состояние на участке ys - ys , отвечающее глобальной структуре свободного гексапептида. В самых выгодных конформациях линейного октапептида ys - ys участок ys - ys представляет собой жесткую нуклеацию, а ys - ys - лабильную часть. В нуклеации расстояние между атомами S боковых цепей ys и ys составляет -3,6 A. Образование между ними валентной связи S-S, т.е. сближение до 2,04 A, сопровождается незначительным изменением геометрии, которое не приводит к нарушению стабилизирующих невалентных взаимодействий, сложившихся в оптимальной конформации линейной последовательности ys - ys . В то же время создание S-S-связи между ys и ys , как и между ys и ys стерически невозможно. Таким образом, конформационный анализ фрагментов Met -Thr, ys -Lys и ys - ys сократил количество возможных у инсектотоксина систем дисульфидных связей со 105 до следующих шести (приведены номера остатков ys) (см. рис. III. 20) [c.319]

В конформационном анализе фрагмента Met - ys °, однако, не принята во внимание возможность образования дисульфидной связи между остатками ys ° и ys . Была рассмотрена только вероятность образования шести S-S-мостиков между остатками ys , ys и ys , ys , ys °. Остановимся сначала на результатах расчета фрагмента Met - ys , в пределах которого возможно образование смеси фрагментов с дисульфидными связями ys - ys или ys - ys . Расчету этого участка инсектотоксина предшествовало детальное рассмотрение конформационных возможностей ряда фрагментов меньшей длины (см. рис. III.20). Кроме отмеченного октапептида Met -Thr были рассчитаны Thr -Pro (646), Thr -Asp" (495), Arg -Met 2 (1135), Met -Gln (1051), Met -Pro"> [c.320]

Меланотропин. Молекула у-меланотропина быка представляет собой пептидную цепь из 12 аминокислотных остатков Tyr -Val -Met —Gly" --His -Phe -Arg -Trp -Asp -Arg -Phe"-Gly . Типичный для а- и Р-форм меланотропинов гептапептидный участок Met -Glu -His -Phe -Arg -Trp --Gly здесь модифицирован остаток СШ заменен на Gly , а Gly - на Asp. Отрицательный заряд как бы передвинут с начала участка на конец. Среди рассмотренных меланотропинов у-МСГ содержит наименьшее число остатков. Тем не менее расчет этого гормона оказался наиболее многоступенчатым и трудоемким, что связано со слабой диффере1щиацией конформационных состояний по энергии и необходимостью анализа большого количества структурных вариантов. Потребовалось рассмотрение целого ряда ди-, три- и тетрапептидов, низкоэнергетические конформации которых послужили исходными в расчете фрагментов Tyr -Phe , His -Arg" и His -Gly . На завершающем этапе были использованы низкоэнергетические структуры гексапептида Tyr -Phe и октапептида His -Gly , принадлежащих соответственно 21 и 27 шейпам пептидного скелета и имеющих энергию < 7,0-8,0 ккал/ыоль. Всего было проанализировано 228 конформаций у-МСГ 216 форм основной цепи 168 шейпов. Минимизация энергии не выявила существенной детерминации оптимальных структур. В интервал 0-10,0 ккал/моль попало 78 конформаций 14 типов, которые приведены в табл. 1П,28, Полученные данные, таким образом, свидетельствуют об отсутствии в последовательности у-МСГ в отличие от других меланотропинов четких нуклеационных участков, складывающихся в определенную структуру под воздействием средних взаимодействий. [c.370]

Последний шаг в изучении пространственной структуры гормона, в конечном счете, основывался на оптимальных конформациях докоза-пептида His -Leu с энергией / сщ 10,0 ккал/моль и на отмеченных только что конформациях октапептида Ghi -Val- NH2 с энергией С/ бт 8,0 ккал/моль (см. табл. Ш.ЗО). Всего было рассмотрено 84 структурных варианта гептакозапептида. Если иметь в виду найденные низкоэнергетические оптимальные состояния молекулы, к которым до некоторой степени условно относим ее конформации с величинами С/общ интервале 0-10,0 ккал/моль, то основной результат решения прямой структурной задачи секретина может быть сформулирован следующим образом пространственное строение гормона в условиях полярной среды представляет собой два семейства конформаций f efeef-j-Vq и Vn-/i7-V , отличающихся друг от друга состоянием центрального тетрапептидного участка Arg 2-Leu -Arg -Asp (рис. Ш.31, табл. 111.31) Vn и Ve - являются вариабельными N- и С-концевыми фрагментами, состоящими соответственно из шести и пяти аминокислотных остатков. Они могут принимать различные конформационные состояния, мало отличающиеся у свободной Молекулы по энергии. Фрагменты Vnj и разделены конформационно Жестким участком последовательности Thr -Leu , который может находиться в одной из двух практически изоэнергетических пространствен- [c.381]

Фрагмент Arg - ys . Конформационный анализ тетрадекапептидного участка БПТИ включает предварительный расчет пентапептида Tyr O- ys и октапептида Gly - ys , а затем с использованием данных по ионапептиду Arg -Pro - последовательности Arg - ys (рис. IV.8). Расчет фрагмента Tyr - ys выполнен, исходя из предпочтительных конформаций перекрывающихся дипептидных участков, которые были получены из анализа всех возможных комбинаций конформационных состояний соответствующих молекул метиламидов N-ацетил-а-аминокислот. Сочета- [c.433]

Среди ВОЗМОЖНЫХ конформеров пентапептида Tyr - ys с полностью свернутой формой шейпа /4 лишь один вариант с основной цепью rio bi1-H -R -B имеет низкую энергию. В конформации октапептида шейпа е/4 фрагменты Glu -Pro с развернутой формой цепи и Tyr - ys со свернутой формой остаются в значительной степени автономными, возникает только одно новое взаимодействие между Рго и Pro (-1,2 ккал/моль). Ситуация заметно меняется, когда фрагмент Рго -Туг становится свернутым, т.е. при переходе к конформации e- fs- Фрагменты сближаются, и появляются стабилизирующие контакты между Pro и Thr" (-2,3 ккал/моль), Pro и Рго (-0,8 ккал/моль) и Glu и Рго (-2,1 ккал/моль). Однако и в этом случае между новыми и ранее [c.436]

Существовавшими у свободных три- и пентапептидных фрагментов Лзаимодействиями нет удовлетворенной согласованности - появление новых сопровождается ослаблением других. Тем не менее энергия единственной конформации шейпа е/з остается одной из самых минимальных. Таким образом, проведенный анализ октапептида Ои -Суз не обнаружил конформаций, содержащих такие контакты между фрагментами 01и -Рго и Туг -Суз , которые привели бы к значительному понижению общей энергии. Лучшими вариантами у ОШ -Суз оказались в которых при минимальных контактах между 01и -Рго и Туг -Суз фрагменты имеют структуры, отвечающие наиболее предпочтительным Структурам при свободном состоянии этих фрагментов. К ним, прежде всего, относятся конформации шейпов е 2 и формами основной [c.437]

Фрагмент Arg - ys . На завершающем этапе расчета для фрагмента Arg -Tyr были получены семь низкоэнергетических структурных вариантов, оставленных для последующего анализа. В двух самых выгодных конформациях с i/общ - О 2,1 ккал/моль (см. табл. IV.9) С-концевой участок Lys -Tyr имеет полностью развернутую форму цепи. Расчет фрагмента Phe -Tyr показал, что для него реальна лишь одна конформация, которая является частью антипараллельной -структуры. Ее дальнейшее формирование представляется тем более вероятным, что в самых выгодных конформациях предшествующего фрагмента Arg -Tyr С-концевой участок имеет комплементарную -структуре развернутую форму основной цепи. В связи с этим перед расчетом фрагмента Arg - ys были рассмотрены конформационные возможности фрагментов ys -Туг , Tyr -Gly и ys - ys . Исходные варианты фрагмента ys -Туг 5 составлены из конформационных состояний октапептида ys -Tyr , которые он принимает в семи оставленных для дальнейшего анализа низкоэнергетических структурах Arg -Tyr и в одной конформации тетра- eкaпeптидa Phe -Tyr . Всего было рассчитано 14 вариантов, так как при включении ys -Tyr в последовательность ys -Tyr снимается энергетическое вырождение R- и В-форм остатка Туг и число вариантов увеличивается. Результаты расчета полностью подтвердили сделанное предположение о предрасположенности встраивания остатков ys -Tyr в -структуру В результате минимизации энергии при варьировании двугранных углов основных и боковых цепей фрагментов ys -Phe и А1а - УГ35 выяснилось, что для фрагмента ys -Tyr реальны только два конформационных состояния - именно те, которые на участке ys -Tyr Имеют развернутую форму и входят в самые предпочтительные струк-,Туры фрагмента Arg -Tyr (УоОщ = О и 2,1 ккал/моль). Другие структурные варианты, по крайней мере, на 12 ккал/моль менее стабильны. [c.447]

Lсамые предпочтительные конформации - Вд и Fi, имеющие очень выкую энергию у АТ II. В следующих пяти аналогах остаток [Phe ]-АТ II последовательно заменен на остатки Ala, Leu, Val, Ile и, наконец, Tyr, т.е. ha гидрофобные остатки постепенно увеличивающегося объема. Существенных изменений конформационных возможностей по сравнению с природным октапептидом при этом не наблюдается. Во всех случаях доминируют конформации группы А. Энергетическое распределение конформаций [Туг ]-АТ II практически совпадает, как и можно было ожидать, с распределением АТ II. [c.575]

Этим методом удалось показать, что С-концевой Leu в синтетическом октапептиде содержит > 10% о-энантиомера, в то время как неконцевой Leu содержит только 1,1%. Причина этого — рацемизация С-концевого Leu при использовании твердофазного синтеза. Совершенно ясно, что этот метод секвенаторного хирального аминокислотного анализа является весьма перспективным. В дальнейшем его, вероятно, можно будет использовать дл, структурного анализа пептидных антибиотиков и родственных природных продуктов. [c.185]

Фаллотоксины — это циклические гептапептиды, соединенные мостиками боковых цепей остатков триптофана и цистеина общий для этих соединений скелет показан в (84). За исключением указанных остатков все аминокислоты имеют -конфигурацию. Аматоксины (85) имеют цикл большего размера (октапептиды) с мостиковым атомом серы,, окисленным до сульфоксидной группировки, и гидроксильный заместитель в положении 6 индольного ядра. Все токсины аманита содержат Y-гидроксилированные аминокислоты, что является условием их токсичности. [c.317]

Для завершающего соединения 7 /-концевого, центрального и С-концевого фрагментов было исследовано несколько возможностей [114, 115]. По первому пути (схема (64) метиловый эфир Л -концевого пентапептида превращали в соответствующий гидразид, затем в азид и конденсировали с центральным октапептидом. Реакция шла медленно из-за возрастающих пространственных затруднений, создаваемых 7 /-концевой грег-бутильной сложноэфирной группировкой центрального пептида по мере его превращения. [c.415]

В последнее время выяснены некоторые закономерности синтеза физиологически активных пептидов из биологически инертных предшественников—белков в результате процесса, называемого посттрансляционной модификацией (постсинтетические превращения белковой молекулы). Известно, например, что ангиотензины (представленные октапептидами), оказывающие выраженное сосудосуживающее действие, образуются из присутствующего в сыворотке крови неактивного белка ангиотензиногена в результате последовательного действия ряда иротеолитических ферментов (ренина и особого фермента, участвующего в превращении неактивного ангиотензина I в активный ангиотензин II). [c.75]

Считают, что под влиянием специальной пептидазы, обнаруженной в плазме крови итканях,—ангиотензин I превращающего фермента (дипеп-тидил-карбоксипептидаза I) из ангиотензина I образуется октапептид ангиотензин II. Главным местом этого превращения являются легкие. [c.613]

Семейство включает 7 октапептидов, различающихся ацильиой группой и остатками 6 и 7. Нарушает нормальную проницаемость мембран для малых молекул. Смесь октапептидов в 3-10 раз более эффективна против грамноложительных бактерий, чем полимиксин (см.). См. обзор [ARB [c.249]

Синтез минералокортикоидов контролируется ренин-ангиотензиновой системой, основным компонентом которой является ангаотензин-П-октапептид, образующийся из полипептидного предшественника. [c.158]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология