Пурин комплементарные пары

Межмолекулярные водородные связи образуются только между определенными парами производных пиримидина и пурина, которые называются комплементарными парами. Такими комплементарными парами являются урацил—аденин, тимин—аденин и цитозин—гуанин (рис. 103). [c.716]

Переход молекулы в возбужденное состояние характеризуется перераспределением электронной плотности, т. е. изменением электронной структуры и вследствие этого ее реакционной способности. В связи с этим представляют интерес квантовохимические расчеты электронной структуры гетероциклических оснований нуклеиновых кислот в возбужденном состоянии (об их электронной структуре в основном состоянии см. гл. 3). Такие расчеты были выполнены главным образом для пиримидинов б1-бэ Получены также некоторые данные, характеризующие триплетное состояние пуринов и возбужденные состояния комплементарных пар оснований [c.627]

Что касается третьих членов триплетов, то можно заметить, что там, где в кодоне находится пиримидин, в антикодоне появляется пурин, и наоборот. Таким образом, обычное правило, согласно которому комплементарные пары содержат пурин и пиримидин, выполняется и в данном случае, хотя специфичность здесь меньше. По-видимому, главным фактором, определяющим комплементарность пуринов и пиримидинов, является [c.43]

Комплементарность приводит к тому, что каждая пара оснований содержит по одному пурину и пиримидину. Такая специфичность определяется структурной конфигурацией оснований и их способностью [c.81]

На рис. 7.2 изображены некоторые из наиболее часто встречающихся модифицированных оснований. Наблюдаемая тенденция состоит в том, что у пиримидинов (С и и) модификации менее сложны, чем у пуринов (А и С). Некоторые из них затрагивают основания, принимающие участие в комплементарном взаимодействии, и поэтому приводят к изменению стабильности пар или даже к сме- [c.88]

Важнейшей особенностью АТ- и СС-пар, на которую обратили внимание Уотсон и Крик, была не просто хорошая геометрия образуемых водородных связей. Другие конфигурации спаривания оснований также обладают этим свойством и действительно превалируют в комплексах между изолированными мономерами (гл. 6). Особенностью предложенной Уотсоном и Криком схемы является то, что расстояния между местами присоединения оснований к сахарам оказываются практически одинаковыми для АТ- и СС-пар. Поэтому одна и та же геометрия двойной спирали одинаково хорошо подходит для обоих типов пар без какого-либо нарушения или потери симметрии (рис. З.П). Второй важной особенностью модели Уотсона — Крика является существование осей псевдосимметрии С2, лежащих в плоскости пар оснований. Поворот вокруг этих осей переставляет — -гликозидную связь пурина с N —С -связью комплементарного пиримидина. Эти оси существуют как в АТ-, так и в СС-парах (рис. 3.11), откуда следует, что геометрия АТ-, ТА-, [c.168]

Эти результаты показывают, что и в случае различных оснований образование водородных связей вряд ли играет существенную роль, поскольку константа взаимодействия между комплементарной парой аденин + урацил, например, не превосходит по величине константу гомоассоциации аденина, которую можно оценить по значению константы взаимодействия пары аденин -Ь пурин. [c.232]

Модель Уотсона и Крика — модель макромолекулярной организации ДНК, предложенная Уотсоном и Криком в 1953 г. на основании рентгеноструктурных исследований и данных о химическом строении ДНК. Согласно гипотезе Уотсона и Крика, молекула ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей и образует правовинтовую спираль, в которой обе цепи закручены вокруг одной и той же оси и удерживаются водородными связями между их азотистыми основаниями. Азотистые основания в такой структуре укладываются парами, составленными из пурина одной цепи и пиримидина — другой. Глубокий анализ возможностей образования комплементарных пар показал, что наиболее вероятными являются пары аденин—тимин и гуанин—цитозин. Другие варианты комплементарных пар не получили экспериментального подтверждения. Одним из наиболее важных доводов в пользу того, что молекула ДНК имеет структуру двойной спирали, являются количественные совпадевия в содержании аденина и тимина и гуанина и цитозина. [c.60]

В работе [38] рассмотрены возможные физико-химические механизмы, при омощи которых матричные ферменты — полимеразы могут влиять на степень очности матричных синтезов и, следовательно, регулировать ее. В частности редполагается, что ферменты синтеза и репарации нуклеиновых кислот содер ат узнающий участок , определяющий правильность комплементного спаря ания (в результате образования дополнительных водородных связей) по ин вариантным для комплементарных пар атомам N = 3 пуринов и 0 = 2 пиримн динов. Такой узнающий участок (центр) фермента играет роль дополнитель ной белково-нуклеиновой матрицы, способной усиливать отбор правильных и выбраковывать неправильные пары. [c.53]

IV. Окислители, восстановители и свободные радикалы. В эту группу мутагенов входят азотистая кислота, перекиси, альдегиды, соли тяжелых металлов, кислород и др. Наиболее хорошо изучена реакция взаимодействия азотистой кислоты с аминогруппами оснований нуклеиновых кислот. Азотистая кислота вызывает мутации вируса табачной мозаики, некоторых фагов, бактерий и дрожжей. Ее мутагенный эффект связан с дезаминированием пуринов и пи-римидинов ДНК и РНК, т. е. с отделением от них группы ЫНг. При этом дезаминированный аденин превращается в гипоксантин (рис. 83), который в молекуле ДНК образует комплементарную пару уже не с тимином, а с цитозином. Реакция дезаминирования идет по уравнению Е—КН24-НЫ02=К—ОН- -N2+ +Н2О. [c.201]

Детальный анализ всевозможных вариантов образования водородных связей между основаниями показал, что в биспиральной молекуле ДНК основания уложены парами пурин из одной цепи и пиримидин из другой в соответствии с правилами Чаргаффа. Поскольку ориентация оснований на плоскости не является, очевидно, произвольной, и основания в полинуклеотидах представлены в лактамной форме, наиболее вероятными были признаны пары аденин-тимин и гуанин-цитозин. Этот способ спаривания получил в дальнейшем экспериментальное подтверждение. Избирательность взаимодействия пар А-Т и Г-Ц принято выражать термином комплементарность , а соответствующие азотистые основания называют комплементарными. Стабильность А-Т оснований обеспечивается двумя водородными связями, а пар Г-Ц - тремя, что в свою очередь определяется особенностями расположения функциональных групп азотистых оснований. Длина водородных связей между основаниями составляет около 0,3 нм. Таким образом, комплементарными оказываются не только отдельные основания, но и дезоксирибонуклеотидные цепи ДНК [c.108]

Две комплементарные антипараллельные цепи, соединенные водородными связями, закручены одна вокруг другой, при этом-фосфатные группы расположены снаружи, а пурин-пиримидино-вые пары составляют как бы ядро структуры. Образование водородных связей между двумя пуринами в такой структуре стерически невозможно, а два пиримидина слишком малы и находятся слишком далеко друг от друга, чтобы между ними могло осуществляться взаимодействие таким образом, обычно каждая пара образована одним остатком пурина и одним, остатком пиримидина. [c.7]

Рис. 40.2. Узнавание кодона антикодоном. UUU—один из кодонов фенилаланина. Молекула тРНК, заряженная фенилаланином (Phe), содержит в антикодоновом участке комплементарную последовательность ААА, образующую комплекс с кодоном из трех пар оснований. Антикодоновый участок, как правило, содержит следующую гептануклеотидную последовательность варьируемый нуклеотид (N) модифицированный пурин (Ри ) антикодон (X, Y, Z) два пиримидина

Первичная структура. Если имеются данные о нуклеотидной последовательности одной цепи, то большинство профамм позволяют построить комплементарную цепь, вычислить нуклеотидный состав, выявить участки, богатые пуринами, пиримидинами или определенными сочетаниями оснований, и определить частоту встречаемости различных динуклеотидов (рис. 7.15). Могут быть выявлены специфические субпоследовательности в пределах определенного сегмента, что часто используется для нахождения сайтов для рестриктирующих эндонуклеаз (рис. 7.16). В программу введена информация о сайтах узнавания для известных ферментов, и по одной команде выдаются сведения о положении этих сайтов для каждого из ферментов, числе ожидаемых фрагментов, образующихся при расщеплении ими ДНК, размере каждого фрагмента в парах оснований и его процентном отнощении к общей длине сегмента, а также о нуклеотидных остатках, соответствующих концам каждого фрагмента. Существуют также профаммы, которые могут предсказать, какие продукты будут получены при совместном действии двух или нескольких эвдо-нуклеаз. При этом предсказания делаются как для линейных, так и для кольцевых молекул. Полученная информация может использоваться для подтверждения данных секвенирования путем сравнительного анализа ожидаемого и реального результатов действия эндонуклеаз. [c.330]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология