Карбоксипептидаза эффективность

Карбоксипептидаза катализирует отщепление С-концевой аминокислоты от пептидной цепи, причем наиболее эффективно отщепляются кислоты, содержащие гидрофобные ароматические остатки [c.324]

Однако чаще всего непосредственно участвующий в ферментативной реакции ион металла выполняет, как и в обычных органических реакциях, роль кислоты Льюиса, которая действует аналогично протону, но с большей эффективностью (т. е. является суперкислотой, см. гл. 9). В таких реакциях всегда наблюдается одновременный перенос протона между ферментом и субстратом, поэтому в некотором смысле их можно рассматривать как катализируемый ионами металла ферментативный перенос протона. В качестве примера рассмотрим механизм реакции, катализируемой карбоксипептидазой. [c.149]

В клубнях картофеля обнаружена группа родственных полипептидов, действующих как эффективные ингибиторы карбоксипептидазы А и карбоксипептидазы В [76]. [c.213]

Карбоксипептидаза Y отщепляет практически все аминокислоты, включая пролин, и ее специфичность аналогична специфичности СРС. Гидролиз проходит наиболее эффективно при pH 5,5 — 6,5. Оптимальное значение pH для отщепления лизина и аргинина — 7,0. [c.68]

Эффективность карбоксипептидаз. Вьще-ляемые поджелудочной железой карбоксипептидазы более эффективно гидролизуют белки на завершающих этапах пищеварения, чем на начальных. Объясните, почему. [c.777]

Если к карбоксипептидазе, которая мало чувствительна к кислородному эффекту, добавить органические вещества, то в общем случае они впитывают радикалы и поэтому обладают весьма постоянным, недовольно слабым защитным действием [16]. Вообще говоря, эффективность специфических защитных агентов (большинство таких агентов представляет собой вещества, содержащие серу) в 50 раз больше эффективности органических соединений. Интересно отметить, что при расчете на одинаковые веса чистая сера эффективнее тиомочевины, считающейся хорошим защитным агентом, а при расчете на одинаковое число атомов серы—приблизительно так же эффективна. [c.217]

Действительно, многочисленные экспериментальные факты подтверждают этот теоретический прогноз. Наибольшее количество работ посвящено изучению миграции энергии от тирозина к триптофану. В опытах на модельных соединениях (ди- и олигопептидах, содержащих тирозин и триптофан) в спектрах возбуждения триптофановой флуоресценции выявлен вклад тирозинового поглощения — сенсибилизированная флуоресценция. Наибольшая эффективность миграции энергии отмечалась для тех соединений, в которых тирозин и триптофан непосредственно соединены между собой пептидной связью. Разделение тирозина и триптофана алифатическими аминокислотами в полипептиде, т. е. увеличение расстояния между ними, снижало эффективность миграции энергии. С помощью метода спектров возбуждения выявлен также тирозин-триптофановый перенос энергии и в белках. Так, по данным Кронмана и Холмса, эффективность миграции энергии у пепсина составляет 80, у карбоксипептидазы — 81, у трипсиногена — 91, [c.253]

Карбоксипептидаза А в отличие от химотрипсина ингибируется анионами, причем эффективность ингибирования снижается в ряду [c.224]

Соединения (II) и (III) оказались чрезвычайно эффективными ингибиторами карбоксипептидаз В и N соответственно [2590,25913 [c.244]

Карбоксипептидаза эффективно расщ< пляет карбаматные и карбонатныт связи в производных фенил. "анина [c.162]

СООН) гидроксиламином показали, что в отсутствие 2п(П) гидроксиламин является эффективным нуклеофилом, способным атаковать ангидридную группу, но атака не катализируется 2п(И). Напротив, характер зависимости скорости гидролиза от pH указывает на то, что 2п(П) катализирует атаку ангидрида ОН-ионом, а не молекулой воды, и что этот процесс гораздо быстрее, чем некатали-зируемая атака гидроксиламином. Следовательно, связывание 2п(П) с ОН- (из Н2О) делает ион ОН- чрезвычайно эффективным нуклеофилом, с которым не может конкурировать даже такой хороший нуклеофил, как гидроксиламин. Напомним, что на первой стадии действия карбоксипептидазы 2п(11) [c.347]

В связи с этим главный вопрос относительно предполагаемого ферментативного механизма действия карбоксипептидазы А состоит в стерической возможности и способности карбоксильной группы 01и-270 эффективно участвовать в нуклеофильной реакции. Фактически доказательство ее участия сейчас уже получено в спектроскопических исследованиях при температурах <0°С (—60°С) ковалентного ацилферментного промежуточного соединения, полученного при гидролизе субстрата О-(гранс-л-хлорциннамоил)-г-Р-фениллактата карбоксипептидазой А [224]. Более того, результаты свидетельствуют о том, что деацилирование промежуточного смешанного ангидрида катализируется связанной с цинком гидроксильной группой. [c.351]

Активность лейцинаминопептидазы, выражаемая числом молей субстрата, расщепляемых в минуту весовой единицей фермента, значительно выше активности карбоксипептидазы, которая в свою очередь активнее папаина—одной из наиболее эффективных протеиназ [297]. Вследствие высокой активности лейцинаминопептидазы даже менее чувствительные связи в полипептидных цепях могут гидролизоваться с заметной скоростью. Кроме того, специфичность действия лейцинаминопептидазы не ограничивается остатками определенного типа, как в случае карбоксипептидазы. Так, фермент освобождает полуцистиновые остатки из пептидных связей. Пролин и аминокислоты с полярными боковыми группами также отщепляются, хотя скорости гидролиза могут быть небольшими. В некоторых случаях подобный широкий спектр активности выгоден, но он увеличивает трудности при попытках установить последовательность сцепления аминокислот на основании данных о скорости отщепления аминокислот при разрыве пептидных связей [149]. [c.236]

Различие в механизмах гидролиза под действием химотрип-сина и карбоксипептидазы и в механизмах декарбоксилирования под действием металлозависимых ферментов и ферментов, действующих через основание Шиффа, является отражением различия в восприимчивости карбонилсодержащих соединений к кислотному и основному катализу. Нуклеофильные и основные свойства боковых цепей белковой молекулы вполне достаточны для проявления ферментом каталитической активности, тогда как ионы металлов являются гораздо более эффективными кислотными катализаторами по сравнению с протонами, о чем убедительно свидетельствует пример металлоферментов. Другая причина широкой распространенности металлоферментов связана, вероятно, с полидентатным характером комплексов металлов. Строго определенное пространственное расположение не- [c.148]

Во всех случаях, как это видно на примере карбоксипептидазы А, белок организует работу кофактора наиболее эффективным образом. Более того, в зависимости от структуры белка может усиливаться одна из присущих кофактору нескольких функций, в результате чего в разных комплекса.х один и тот же кофактор играет существенно разную роль. Например, гем в комплексе с глобином в незначительной мере проявляет свою склонность к окислительно-восстановительным превращениям и функционирует в основном как комплекс, координирующий молекулу Ог. В каталазе в комплексе с соответствующим апоферментом он проявляет способность катализировать двухэлектронное окисление — восстановление Н2О2. В цитохроме с тот же гем выполняет функцию одноэлектронного переносчика, меняя в каждом акте переноса электрона состояние иона железа от Fe(II) к Fe(III) и обратно. [c.207]

Взаимодействию фермента с субстратом предшествует сближение и ориентация субстрата по отношению к активному центру фермента. Затем образуются фермент-субстратные комплексы, реальное существование которых может быть зафиксировано различными способами. Наиболее наглядным и эффективным является метод рентгеноструктурного анализа. В качестве примера можно привести идентификацию фермент-субстратного комплекса карбоксипептидазы А и ее субстрата глицил-ь-тирозина. Метод дает возможность не только установить сам факт образования комплекса, но и определить типы связей. Более простым, но достаточно эффективным методом является спектральный анализ фермента и соответствующего фермент-субстратного комплекса. Таким образом, бьши, в частности, идентифицированы фермент-суб-стратные комплексы для ряда флавиновых ферментов. В последние годы широкое распространение получило применение синтетических субстратов, благодаря которым можно моделировать ряд стадий ферментативного процесса, в том числе и связанных с образованием фермент-субстратного комплекса. [c.69]

В настоящее время невозможно рационально объяснить относительную защитную эффективность различных веществ. Наиболее высокими защитными свойствами обладают серусодержащие соединения. Известно, например, что тиосульфат и элементарная сера обладают хорошими защитными свойствами. Особенно высокими защитными свойствами обладает тиомочевина, которая при защите карбоксипептидазы почти в 10 000 раз более эффективна, чем мочевина. [c.237]

Нужно отметить, что специфичность карбоксипептидазы по отношению к субстрату в значительной мере определяется природой С-концевого остатка. Большинство эффективно расш,епляемых субстратов имеет ароматические С-концевые остатки, тогда как концевой пролин блокирует пептид от действия карбоксипептидазы. У а-кортикотропина освобождаются только три аминокислоты, потому что четвертой аминокислотой является пролин. [c.32]

В процессе пищеварения белки расщепляются на меньшие полипептиды с помощью панкреатических эндопептидаз. Следовательно, на завершающих этапах пишеварения эффективность карбоксипептидазы возрастает за счет увеличения количества СООН-концов. [c.998]

На основе этих заключений были сформулированы многочисленные правила предсказания вторичных структур. О степени их надежности можно судить по результатам сопоставления предсказанных вторичных структур с наблюдаемыми в белках известного пространственного строения. Приведем несколько примеров. В карбоксипептидазе (307 остатков) в а-спиралях находится 115 остатков правильно предсказаны 86, неправильно — 43. В а-цепи гемоглобина (146 остатков) из 114 а-спиральных остатков идентифицированы 56 при 77 ошибках. В 20 рассмотренных Лимом белках содержится 3100 остатков в а-спирали входят 1145, правильно отнесены 590, неправильно — 555 в -структу-рах находится 425 остатков, 124 из них определены правильно, 351 — неправильно. Остатки в нерегулярных областях из 1540 случаев в 634 указаны как клубковые, а в 906 — отнесены к регулярным структурам. Эти данные взяты из работы Лима и касаются белков, использованных автором при выводе стереохимических правил. Если правила применяются к белкам, не вошедшим в состав базовых, то эффективность предсказания, как правило, значительно ниже. Например, согласно анализу Дж. Ленстры, точность предсказания методом Лима а-спирали [c.257]

Весьма эффективные ингибиторы получаются, если объединить в одной структуре оба продукта ферментативного гидролиза (так называемые bl-produ t analogues). Например, 1-бензилсукцинат (I) ингибирует карбоксипептидазу с Kj=0,45 МКМ [25893, частично воспроизводя структуру гиппуровой кислоты и фенилаланина [c.244]

Одна из функций, которую выполняют металлы в металло-ферментах, состоит в том, что они выступают в роли электро-фильных катализаторов, стабилизирующих образующиеся отрицательные заряды. В карбоксипептидазе (гл. 12) карбонильный кислород амидной группы субстрата связан координационной связью с ионом цинка этого фермента, что приводит к поляризации амида, подвергающегося нуклеофильной атаке, и эффективной стабилизации тетраэдрического промежуточного соединения. [c.67]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология