Гаплотип

Гуморальные и клеточные реакции, ответственные за отторжение тканей и органов при межвидовой их пересадке или же при пересадке пациенту, не состоящему в родстве с донором, направлены в основном против так называемых антигенов гистосовместимости, расположенных на поверхности клеток. Впервые эти белки были открыты при изучении антигенов лейкоцитов человека (НЬА). Кодирующие их гены расположены на 6-й хромосоме. Эти поверхностные маркеры играют ключевую роль в узнавании организмом своих и чужих клеток. Предварительный подбор НЬА-гаплотипов донора и реципиента существенно улучшил результаты операций по пересадке органов. Четыре из пяти главных локусов (А, В, С и Ог) комплекса генов НЬА (рис. 8.2) кодируют серологически определенные [c.331]

Антигены HLA связаны также с некоторыми заболеваниями. Изучение частоты встречаемости их у населения позволило выявить, что некоторые болезни возникают чаще в группах с определенными специфическими гаплотипами HLA. Так, степень риска возникновения целиакии составляет около 73 для гаплотипа D3, а ревматоидного артрита — 4 для D4, т. е. эти заболевания встречаются соответственно в 73 или 4 раза чаще у лиц, обладающих этими антигенами, чем у тех, кто этих антигенов не имеет. Таким образом, HLA-типирование позволяет оценить вероятность возникновения определенного заболевания в конкретной популяции и способствует осуществлению мер по идентификации и предотвращению болезней (там, где такие меры предпринимаются). [c.332]

Поскольку каждый из 12 сайтов может быть представлен одной из двух форм, то всего возможно 2 — 4096 различных вариантов гаплотипов (нуклеотидных последовательностей) правда, если альтернативные [c.182]

Рис. 25.11. В популяциях человека широко представлены 9 гаплотипов семейства Р-глобинов. Можно выделить два больших сегмента в последовательности 5 -участок включает гены г, 7, и фР З -участок состоит из гена Р и фланкирующей последовательности длиной 18 т.п.н. Три распространенных типа последовательности 5 -участка обозначены

Таблица 25.6. Гены семейства Р-глобинов человека. Наблюдаемые и теоретически ожидаемые частоты девяти распространенных гаплотипов. Любой гаплотип включает две составные части 5 и 3, каждая из которых представлена тремя широко распространенными типами последовательности. Теоретически ожидаемые частоты гаплотипов (в скобках) вычислялись в предположении, что различные 3 - и 5 -последовательности сочетаются случайно

Рис. 3.21. Модификация гомологичным аллелем в системе КЬ. - В-положительная кровь с нормальной реакцией -слабая реакция (О -вариант), О - О-отрицательная кровь. Гаплотип С(1е снижает экспрессию фактора О, в результате этого формируется фенотип В". [605].

Рис. 3.37. Родословная с кроссинговером между генами Н1А-А и НЬА-С главного комплекса гистосовместимости. Кроссинговер между А и С должен был произойти в гаметах отца и привести к гаплотипу 1, 2, 27 у пятого ребенка [193].

Неравновесие по сцеплению. Одна из наиболее важных характеристик системы HLA-свойство некоторых HLA-аллелей встречаться вместе чаще, чем это можно было бы ожидать при случайном комбинировании. В табл. 3.10 приведены некоторые примеры. Например, гаплотип (А1, В8) встречается примерно в пять раз чаще, чем ожидается. [c.219]

Ожидаемые частоты гаплотипов вычислены в предположении об отсутствии ассоциации. [c.220]

Какие-либо две популяции, гомозиготные по разным гаплотипам, смешались относительно недавно, и происходящий с низкой частотой кроссинговер еще не обеспечил случайное распределение аллелей. [c.221]

Таким образом, частота Aai.bs гаплотипов HLA-A 1 и В8 равна [c.221]

С точки зрения эволюции человеческого вида 5000 лет-ничтожный срок. Тот факт, что величина А может сойти на нет за такое короткое время при отсутствии отбора, предполагает, что по крайней мере для этого конкретного гаплотипа (HLA-A1, В8) его частота поддерживается на сравнительно высоком уровне действием отбора определенного типа [581]. Мы считаем весьма вероятным, что отбором можно объяснить также некоторые другие распространенные случаи неравновесия по сцеплению и что влияние недавно произошедшего слияния популяций не имеет большого значения. Определенные гаплотипы обладают, по-видимому, селективным преимуществом, и это поддерживает более высокую их частоту в популяции по сравнению с другими. Вместе с тем это [c.221]

Рис. 3.45. Последствия неравного кроссинговера. В последовательных поколениях могут формироваться хромосомы с неограниченным (теоретически) числом тандемно расположенных аллелей. Неравный кроссинговер между любыми из них может привести к еще более длинным (или более коротким) гаплотипам. Ь1. ... .. Ь относятся к гомологичным генам.

Специфическое сочетание полиморфных сайтов в генном кластере (или генетическом локусе) называется гаплотипом. Например, расположение пяти сайтов возможного полиморфизма можно записать как Н---1---ь в направлении от 5 к 3. Совокупность четырех основных гаплотипов, различающихся между собой минорными вариациями в 5 сайтах гена р-глобина, (табл. 4.14) была названа остов . [c.79]

Обнаруженный в локусе Hb полиморфизм позволяет проследить возникновение и распространение различных гемоглобинопатий. Можно предположить, что мутация гемоглобин S возникла независимо в трех различных географических зонах (Сенегал, Бенин, Банту) и затем широко распространилась благодаря селективному преимуществу, которое она дает против заболевания малярией [1833]. Среди хромосом с мутацией НЬЕ в Юго-Восточной Азии различают три гаплотипа, один из которых возникает в результате кроссинговера в горячей точке (см. выше). Мутация гемоглобин С сцеплена, как правило, с одним гаплотипом (см., однако, разд. 6.2.1.6). [c.98]

Генетический статус каждого ПДРФ-локуса на одной хромосоме называют гаплотипом. В случае одного сайта существуют два возможных [c.453]

Среди членов представленной на рис. 20.16 родословной в большинстве случаев наблюдается косегрегация гаплотипа (8,2) с заболеванием это позволяет предположить, что в данной семье локус BFN находится именно на хромосоме 8,2. Можно было ожидать, что и индивиды П1-18, rV-4 и IV-14, получившие от больного родителя хромосому (8,2), также будут больны, однако это предположение не подтвердилось. Возможно, эти исключения связаны с неполной [c.457]

Гаплотип (Haplotype) Комбинация аллелей на одной хромосоме диплоидного организма. [c.546]

Примером генетически обусловленного заболевания может быть и диабет, но механизм наследования и молекулярная основа его остаются неясными. У пациентов группы 1, страдающих юношеским диабетом, наблюдается полная или почти полная гибель -клеток островков Лангерганса, и инсулин у них не образуется. Такая разновидность диабета чаще всего встречаете у гаплотипов Dr3 и Dr4 HLA. В группе 2 (диабет взрослых) уровень инсулина в крови больных близок к норме или повышен аномалии у них иные, и среди них— нечувствительность рецепторов к инсулину. Они и приводят к недостатку инсулина.. У больных диабетом группы 2 взаимосвязи с определенными типами HLA не выявлено. Ротвейн и др. (Rotwein et al., 1981) использовали метод RFLP для анализа ДНК 35 здоровых людей, 17 больных диабетом из группы 1 и 35 — из группы 2.. У 26% здоровых людей в последовательности ДНК, прилегающей к 5 -концу гена инсулина, были обнаружены вставки длиной 1,5—3,4 кЬр. Такие же вставки присутствуют и в ДНК 35% больных группы 1 и 66% — группы 2 (рис. 8,7). Была [c.344]

В другой части хромосомы 6 расположена другая группа генов, которые называют генами HLA-D. Они тоже участвуют в отторжении трансплантатов, хотя действуют по-другому. Они также имеют много аллелей и необходимы для функционирования Т-кнеток другого типа, которые называются Т-хелперами (разд. 14.9). У каждого человека есть две хромосомы 6 (диплоидный набор) и, следовательно, два аллеля каждого из генов А, В, С, а также различные D-гены (по-видимому, всего три). (Есть по крайней мере 40 аллелей А, 59 аллелей В и 12 аллелей С.) Особая комбинация генов, детерминирующих антигены А, В, С и D на хромосоме, называется ганлотипом (сокращение от гаплоидный генотип ). Поэтому у каждого человека есть два гаплотипа, по одному на каждой хромосоме 6. Ввиду того, что гены одного гаплотипа находятся на одной и той же хромосоме и расположены не очень далеко друг от друга, во время мейоза они остаются вместе и вместе передаются от родителя к ребенку. Возможны миллионы комбинаций аллелей, однако из-за наличия гаплотипов между членами семьи проявляется больще сходства, чем между людьми, не состоящими в родстве. Кроме того, некоторые гаплотипы встречаются чаще, чем другие, а некоторые дают более сильный иммунный ответ по сравнению с другими. [c.270]

Nat. A ad. S i. USA, 79, 5631-5635) исследовали участок ДНК D. melanogaster длиной 12 ООО п. H., содержащий локус Adh. Анализировали 18 геномов с использованием семи ферментов рестрикции, идентифицирующих 24 сайта. В отношении 20 сайтов все 18 геномов оказались одинаковыми, а в отношении остальных четырех сайтов-полиморфными. Выявлено 7 гаплотипов, различающихся следующим образом [c.108]

Гаплотип. Комбинация аллелей тес-носцепленных локусов комбинация определенных последовательностей нуклеотидов в данной молекуле ДНК. [c.305]

Модификация другим аллелем антиципация (опережение). Фенотипическое выражение гена может быть модифицировано не только генами других локусов, но и нормальным аллелем. Такой пример дает генетика резус-фактора (разд. 3.5.4). Некоторые образцы крови при тестировании с сывороткой анти-КЬВ не дают ни строго положительной, ни строго отрицательной реакции, точнее, дают слабо положительную реакцию. Их называют В . В большинстве случаев этот эффект обусловлен специфическим аллелем, но имеются исключения. В нескольких семьях реакция В" наблюдалась только у тех членов семьи, в генотипе которых гомологичный аллель был представлен гаплотипом С(1е (рис. 3.21). С помошью дополнительного статистического анализа была показана аллельная модификация при доминантно наследующейся миотонической дистрофии (16090). При этом медленно прогрессирующем заболевании миотония сочетается с относительно мягкой мышечной дистрофией и катарактой. Это заболевание обнаруживает необычную степень варьирования возраста начала. Обследование обширной родослов- [c.171]

Б. Аутосомное сцепление между локусом Rh и доминантным эллиптоцитозом ( ). Имеются два кроссовера (указаны стрелками) II. 11 и П1.9. Во всех других случаях ген эллиптоцитоза находится Б фазе притяжения (г/ис-положение) с гаплотипом De. -не обследован. (Lawler, Sandler, Ann. Eugen. 1954.) [c.194]

Рис. 3.33. Предполагаемое образование трех редких Rh-гаплотипов из более частых вследствие кроссинговера (Ra e, Sanger [166]). Каждая диаграмма предполагает самостоятельное событие кроссинговера.

Рассмотрим два аллеля двух сцепленных локусов с частотами ру и р2. При свободной рекомбинации между ними их совместная частота h, т.е. частота гапло-типа, должна составлять р -р2- Если получен такой результат, то говорят, что эти два локуса находятся в равновесии по сцеплению. Если частота гаплотипа h выше, чем ожидается при свободной рекомбинации. [c.219]

Буквы а, Ь, с, d, х и у соответствуют разным HLA-гаплотипам. Все трансплантаты были совместимы по группам крови АВО. Данные по пересадке кожи взяты у Цеппеллини. Цифры, характеризующие приживаемость почки, представляют собой приблизительные значения и взяты из работ Опелза и Тореби. [c.220]

Генетическая детерминация. Генетический анализ показал, что мимикрия у бабочек контролируется кластером тесно сцепленных генов, супергеном , кроссинговер внутри которого происходит крайне редко. При этом гаплотипы, подобно набору аллелей с широким плейотропным эффектом, влияют одновременно на окраску тела, форму и рисунок крыла. Имеются, однако, убедительные данные о том, что кроссинговер внутри кластера все же идет. Наиболее вероятная последовательность локусов такова, что гены, контролирующие окраску тела (В) и наличие или отсутствие хвоста (Т), расположены в противоположных концах генного кластера, а гены, контролирующие рисунок на задних крыльях (W), окраску эполет (Е) и рисунок на передних крыльях (F), расположены, по-видимому, между ними. Вероятная последовательность локусов определена на основе сравнения частот кроссоверов и некроссо-веров в исследованных популяциях. Таким образом, логика в рассуждении в этом случае та же, что и у Фишера, когда он обосновывал последова- [c.223]

Эта гипотеза вовсе не исключает идею о том, что HLA (или 1г) антигены на поверхности клетки могут действовать как рецепторы для патогенных агентов. Эту концепцию можно проверить непосредственно с помощью семейных исследований двух типов. Обнаружение одновременно заболевания и одинаковых HLA-антигенов у пораженных членов одной семьи совместимо с гипотезой о вирусных рецепторах и с гипотезой о кросс-реакциях с MHKpo6Hbnvin антигенами, а также с гипотезой тесно сцепленных генов иммунного ответа. Комбинация 1г-аллелей в транс-положении с HLA-аллелями, которые обычно ассоциируют с ними вследствие неравновесия по сцеплению, означала бы наличие семей, в которых ни один из заболевших не обнаружил бы гаплотипов с антигеном, обычно ассоциирующим с болезнью. Такие семьи и в самом деле наблюдались. Однако при неравновесии по сцеплению в большинстве семей с пораженными маркерный ген системы HLA и ген болезни будут находиться в г/мс-положении, а в меньшей части семей-в тршс-положении. Следовательно, для семей, несущих этот ген в трднс-положении, предсказание на основе гипотезы 1г-локуса противоречило бы предсказаниям на основе других гипотез. [c.270]

Иногда (очень редко) близнецы образуются в результате одновременного оплодотворения разными спермиями ооцита и его полярного тельца (разд, 1.2,24), В одном таком случае вместе с нормальным ребенком родился близнец-урод без сердца. Аномальный близнец возник в результате оплодотворения другим спермием первого полярного тельца, на что указывали гетсромор-фные варианты хромосом и НЬА-гаплотипы [577], [c.277]

Отличительной чертой вариабельности ДНК в р-глобиновом кластере является неравновесие по сцеплению полиморфных сайтов. Если бы в течение многих поколений происходила свободная рекомбинация, сочетание полиморфных сайтов было бы случайным, а число различных гаплотипов составило 2", где и-количество возможньк сайтов полиморфизма. В действительности обнаруживается лишь несколько гаплоти- [c.79]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология