Гомологичная система

Кроме систем рекомбинации, выполняющих общие функции, например рекомбинацию в мейозе у эукариот или рекомбинационную репарацию у всех организмов, существуют специализированные системы гомологичной рекомбинации, выполняющие ту или иную частную задачу. [c.101]

ИЗ цепей ДНК дефектна (например, содержит тиминовый димер или АР-сайт), а комплементарная цепь не могла быть синтезирована из-за дефекта в матрице и поэтому напротив поврежденного участка остается незастроенная брешь (см. рис. 47). Единственный способ безошибочной репарации такого повреждения — это использовать в качестве эталона второй полученный при репликации дуплекс ДНК. т. е. использовать рекомбинацию для репарации повреждения. У Е.соН эту задачу способен выполнить Re A-белок вместе с ферментами репарации. Для НесА-белка одноцепочечный участок двуспиральной молекулы ДНК, содержащий повреждение, является излюбленным участком связывания. Связавшись с таким местом, Re A-6e-лок вовлекает его в рекомбинационное взаимодействие с гомологичным неповрежденным дуплексом, причем как разорванная, так и поврежденная цепи ДНК оказываются спаренными с неповрежденными комплементарными цепями, что позволяет их репарацию описанными в предыдущей главе репарационными системами (рис. 62). Таким путем осуществляется пострепликативная, или рекомбинационная, репарация. Аналогичным образом за счет рекомбинации происходит репарация двуцепочечных разрывов ДНК. [c.94]

Преодолеть указанные затруднения можно лишь при экспрессии клонированных генов в гомологичной системе. Поэтому внимание исследователей наряду с оптимизацией генно-инженерной системы дрожжей привлекает разработка методов клонирования и экспрессии генов в клетках высших эукариот. [c.322]

Известно два матричных процесса биосинтеза синтез нуклеиновых кислот и синтез белка. Между ними есть существенная разница при очень большом подобии — при синтезе нуклеиновых кислот роль матрицы выполняет также нуклеиновая кислота гомологичная система), при синтезе белка матрицей является нуклеиновая кислота, а продуктом синтеза — белок гетерологичная система). Если в первом случае передача информации о последовательности соединения оснований в цепи вновь синтезируемой нуклеиновой кислоты достигается непосредственно путем подбора комплементарных оснований, то при синтезе белка на нуклеиновой матрице должен существовать какой-то промежуточный механизм, позволяющий переводить последовательность оснований матрицы на язык аминокислотной последовательности белка. [c.485]

Подчеркнуты нуклеотиды сайтов рестрикции, подвергающиеся метилированию гомологичными системами модификации по указанному положению [c.49]

Одна из ролей гомологичной рекомбинации состоит в репарации повреждений, с которыми.не могут справиться описанные в предыдущей главе репаративные системы. Такие повреждения возникают, напри.чер, тогда, когда репликативная вилка проезжает через поврежденный участок ДНК до того, как репаративные системы успели устранить повреждение, В этом случае получается, что одна [c.93]

СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫЕ СИСТЕМЫ ГОМОЛОГИЧНОЙ РЕКОМБИНАЦИИ [c.101]

Первая изученная система сайт-специфической рекомбинации — это интеграция фага лямбда в хромосому бактерии-хозяина. Поскольку она описана в главе о вирусах (см. гл.. ХП1), мы не будем здесь на ней останавливаться, от.метим только, что в отличие от рассмотренных случаев хромосо.мы бактерии и фага не гомологичны, а для рекомбинации необходимы специальные последовательности и специализированный фермент. [c.104]

Специализированные системы гомологичной рекомбинация lOf, 3. Сайт-специфическая рекомбинация 104 [c.351]

Универсальность кода. Было показано, что почти все 64 триплета при их испытании в бесклеточных системах несут какую-то смысловую нагрузку. Это делает естественным предположение, согласно которому какие-то черты генетического кода носят универсальный характер. Более того, гетерологич-ные бесклеточные системы (т. е. системы, содержащие рибосомы из организма одного вида, а транспортные РНК и активирующие ферменты — из организма другого вида) способны синтезировать полипептиды так же эффективно, как и соответствующие гомологичные системы, что опять-таки свидетельствует об универсальности кода. Имеются также косвенные данные, говорящие о том, что смысл данного кодона сохраняется неизменным для разных систем. Наконец,, было показано, что белоксинтезирующая система из Е. olt способна транслировать информацию, содержащуюся в РНК из вируса растений. Данные, полученные в опытах на Е. oli и других бактериях, на вирусах, дролоках, проростках растений, ретикулоцитах кролика, печени крысы, гемоглобине человека и т. д., убедительно подтверждают предполо- [c.499]

Во многих случаях знаний о хромофорах оптически активной системы недостаточно для надежного предсказания спектра КД, так же как данных по гомологичным системам порой оказывается недостаточно для проведения полуэмпирических расчетов. И все же измерение оптической активности может быть использовано как удобный метод выявления конформационных изменений и исследования локального окружения хромофоров. В последующих главах мы рассмотрим кинетику и термодинамику коиформациоиных изменений. При выполнении подобных экспериментов необходимо проследить за изменениями структурных параметров в зависимоти от времени, температуры и других переменных. Если система содержит несколько компонентов (например, состоит из участков с разной конформацией), то ее поглощение или оптическая активность всегда будут представлять собой просто среднее арифметическое соответствующих величин. Например, [ 1 = Е Х 0/. где X, — мольная доля /-го компонента, 0, — КД этого компонента. При удачно ( выборе длин волн можно следить за каждым компонентом независимо. [c.83]

Коэффициенты вариации анализов в рамках одной серии (на различных платах для микротитрования) близки к наблюдаемым при сравнении результатов различных серий. Таким образом, важно сравнивать взаимодействия сыворотки с несколькими различными антигенами на одной плате. Это особенно существенно в тех случаях, когда различия между поглощениями, наблюдаемыми в гомологичной системе и в системе с перекрестными взаимодействиями антиген—антитело, недостаточно велики. При рутинном использовании данной методики ELISA различия между результатами повторных анализов составляли около 5%. Воспроизводимость рассматриваемого мультиантигенного варианта метода ELISA характеризуется величиной коэффициента вариации в диапазоне 5—19%. При увеличении степени разведения сыворотки независимо от времени инкубации воспроизводимость анализа ухудшается. Это является еще одним аргументом в пользу применения достаточно концентрированных препаратов сыворотки. Более высокий уровень фонового [c.376]

Наконец, следует отметить, что пределы насыщения, зависящие в первом приближении от числа непарных внешних электронов и от большей или меньшей энергии нарушения электронных пар, нарушаются многими факторами, связанными с более тонким пониманием Системы элементов. Достаточно привести пример трех гомологичных друг другу элементов Сг, Мо и V/, которые имеют различные пределы насыщения хлором СгС14, МоС15 и ШС1 в, что иллюстрирует кайносимметрию хрома. [c.306]

Выше отмечалось (см. разд. 29.1.2.1), что в случае синтетаз жирных кислот структура продукта реакции определяется специфичностью трансацилаз, вводящих в систему предшественники и выводящих из нее продукты реакции. В более общей картине синтеза поликетидов возможностей для вариаций значительно больше. Об этом свидетельствуют как непосредственные энзимологические исследования (см. разд. 29.1.2.2), так и гораздо более многочисленные косвенные данные, относящиеся к менее изученным системам (см. последующие разделы). В то же время специфичность каждого отдельного процесса биосинтеза поликетидов значительно выше, чем в случае синтеза жирных кислот не известно ни одного примера, кроме жирных кислот, когда синтезировался бы весь набор гомологичных соединений. Очевидно, более сложная архитектура продуктов реакции позволяет осуществлять с большей специфичностью конечную стадию процесса, в которой поликетидный скелет стабилизируется (например, путем циклизации) и отщепляется от комплекса. В случае 6-метилсалицилат—синтетазы (см. разд. 29.1.2.2) замена стартового звена ацетил-КоА на про-пионил-КоА приводит к образованию соответствующего 6-этиль-ного производного, но общая скорость процесса снижается более чем в семь раз [26]. Выше уже отмечалась невозможность осуществления заключительной стадии циклизации в случаях, когда вследствие выпадения стадии С-метилирования (схема 6) или использования чужого стартового звена (схема 7) не образуется соответствующее промежуточное соединение. [c.426]

Системы репликации и репарации ДНК хоть и очень редко, но все же ошибаются. В результате в ДНК может включиться неправильный , т.е, не комплементарный матрице, нуклеотид. Другой источник неспаренных нуклеотидов — гомологичная рекомбинация, в ходе которой образуются гетеродуплексы, состоящие из двух комплементарных цепей, исходно принадлежавших разным молекулам ДНК (см. гл. IV), Такие нарушения структуры ДНК репари-р ются, по крайней. мере у бактерий и низших эукариот. Система репарации должна каки.м-то образом отличать друг от друга две цепи одной. молекулы ДНК, чтобы решить, какой из двух неспарен-ных нуклеотидов правильный , и за.менить неправильный нуклеотид на нуклеотид, ко.мплеиентарный правильному . [c.81]

Сайт-специфическая реко.мбинация — это реко.мбинация, которая в отличие от гомологичной не требует протяженных участков гомологии, но для протекания которой необходимы строго определенные последовательности ДНК и специальный ферментативный аппарат. В каждом конкретном случае сайт-специфическая рекомбинация выполняет свою частную функцию, последовательности ДНК для каждого случая также различны, отличаются и фер.менты, поэтому и.меет смысл рассматривать по отдельности различные системы сайт-специфической рекомбинации. Однако из дальнейшего будет ясно, что в общих чертах. механизм сайт-специфической реко.мбинации всегда одинаков. [c.104]

КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ЗАКОНОМЕРНОСТЕЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭВОЛЮЦИИ НА ОСНОВЕ СРАВНИТЕ/ГЬНОГО АНАЛИЗА ГОМОЛОГИЧНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ. [c.41]

Для решения указанных задач нами разработана компьютернвч система исследования закономерностей молекулярной эволюции, описанная ниже, включающая базу данных гомологичн . нуклеотидных последовательностей и комплекс программ лля исследования закономерностей молекулярной эволюции на основе сравнительного анализа гомологичных последовательностей. [c.42]

П р И м е р 21. Очистка ДНК-связывающих белков из ядрышек гепатомы Новикова распределением между двумя колонками ДНК-сефадекса [Bearden, 1980]. Предложенная автором методика УФ-иришивки ДИК к сефадексу G-10 рассмотрена выше. Для очистки ядрышковых белков была использована оригинальная система, показанная на рис. 145. В замкнутую цепь рециркуляции были включены последовательно две колонки ДНК-сефадекса большая (0,9 X 25 см), на которой иммобилизовали 44 мг гетерологичной Д]г1К спермы лосося, и малая (0,9 х 2 см), содержавшая 0,3 мг гомологичной ДНК из ядрышек гепатомы. [c.427]

Интерфероны — это гликопротеины, состоящие из белкового компонента ( 160 аминокислотных остатков) и специфического углеводного компонента. Они синтезируются в животных клетках после возбуждения экзогенным стимулятором и отличаются антивирусным, клеточно- и иммунорегу-ляторным действием, а также особыми антиопухолевыми свойствами. Оптимальный эффект достигается в гомологичной или близкородственной системе, поэтому для человека наиболее действенны человеческие интерфероны. [c.430]

Тройные спирали коллагена большинства позвоночных состоят из двух а -цепей и гомологичной аа-цепи. Пока известна аминокислотная последовательность только ai-цепи, которая включает 1052 остатка [195—1971. За исключением 16 N-концевых и 25 С-концевых остатков, состав (Gly-X-V)m в ней строго соблюдается. Пользуясь этой формулой, можно легко выявить в различных аминокислотных последовательностях коллагеноподобные структуры. В глобулярных белках такие структуры пока еще не были обнаружены. Однако весьма вероятно, что они присутствуют в компоненте lq системы комплемента человека [1981, которая узнает антитела, соединенные с антигенами. Как установлено по электронным микрофотограммам, это белок содержит пучок из 18 параллельных цепей, организованных в шесть коллагеноподобных волокон, которые входят в шесть глобул. Возможно, что в дальнейшем будут выявлены и другие смешанные белки, содержащие коллагеноподобные структуры. [c.91]

Некоторые высшие растения, например гинкго и кэшью, продуцируют алкилфенолы с длинными боковыми цепями и соответствующие кислоты типов (130) — (133), где Н — неразветвленные алкильные цепи от С]з до 19 с нечетным числом атомов углерода и с одной — трелюя двойными связями. Наиболее вероятным путем их биосинтеза является поликетидный путь с использованием жирных Си — С20-КИСЛОТ в качестве стартовых звеньев [75] в самом деле, меченый малонат селективно включается в ароматическую часть молекулы (130). Такой двустадийный биосинтез во многих отношениях напоминает механизм, установленный для превращения обычных жирных С16 — С]8-кислот в гомологичные С22 — Сгг соединения в системах животного происхождения (ср. разд. 25.2). [c.454]

Ферментные системы клеток, с помощью которых осуществляется гомологичная рекомбинация, и тем более лежащие в основе рекомбинации молекулярные события еще недостаточно изучены. Основные сведения о процессах рекомбинации получены генетическими методами путем наблюдения за возникновением новых комбинаций наследуемых признаков в потомстве. Если фрагменты а, а и Ь, Ь попарно неидентичны и несут различающуюся генетическую информацию, то после рекомбинации должны появиться особи, обладаюпще одновременно признании, соответствующими информации, содержавшейся во фрагментах а и Ь, и/или признакакш, определяемыми информацией, свойственной фрагментам а и Ь. [c.171]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология