Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Цепи также Участки

    N-конце имеется вариабельный участок (Уц) длиной примерно 115 аминокислотных остатков. Соответственно и у L-цепей есть N-концевой вариабельный участок (Vl) длиной примерно ПО аминокислот. С-концевая половина L-цепей ( ПО аминокислот) называется константной областью (С ), поскольку независимо от последовательности она представлена последовательностью одного из двух типов X или X. Н-цепи также содержат N-концевые константные области, Сн, состоящие из 330 аминокислотных остатков. Они бывают нескольких типов и определяют класс и эффекторные функции соответствующих антител. [c.285]


    Гликофорин - первый мембранный белок, для которого была определена аминокислотная последовательность. Этот трансмембранный гликопротеин содержит 131 аминокислотный остаток и около 100 остатков сахара его молекулярная масса равна 30 кДа [241]. Из рис. 1.6 видно, что большая часть полипептидной цепи гликофорина находится на наружной поверхности мембраны, где локализован гидрофильный N-концевой фрагмент. С-Концевой участок цепи, также составленный преимущественно из гидрофильных остатков, погружен в цитоплазму, а гидрофобный фрагмент в форме единичной а-спирали из 20 аминокислотных остатков пронизывает неполярный липидный бислой. [c.58]

    В этом идеальном случае внешняя характеристика генератора представлена равнобокой гиперболой (рис. 9, кривая А). Такая характеристика не может быть беспредельной. Практически она осуществима в некотором диапазоне нагрузки от /щщ до /щах- При токах, меньших /щщ действует ограничение напряжения i/max по условиям насыщения магнитной цепи генератора (участок а—б). Значение / ах обусловлено допустимым тепловым состоянием ма-, шины (участок б—г). Для машин постоянного тока необходимо учитывать также и ограничения условиям коммутации. Для сохранения постоянства мощности и возможно большем диапазоне внешней, т. е. тяговой нагрузки тепловоза, желательно, чтобы диапазон /щщ—был как можно шире. Однако, устанавливая границы работы по гиперболической внешней характеристике, необходимо руководствоваться и технико-экономическими показателями. [c.11]

    Активный центр должен также содерн<ать участок, который связывает растущий конец новой цепи, и участок, специфически взаимодействующий с нуклеозидтрифосфатами (дифосфаты не действуют), но тоже неспецифичный по отношению к пуриновым и пиримидиновым основаниям. По-видимому, можно рассматривать нуклеотид ДНК-матрицы, находящийся в данный момент в области активного центра фермента, как временную часть активного центра, придающую ферменту специфичность по отношению к пуриновым и пиримидиновым основаниям, которой лишен сам активный центр. Основание такого работающего нуклеотида матрицы благодаря положению групп, образующих водородные связи, придает центру специфическое сродство к нуклеотиду, содержащему комплементарное осно- [c.11]

    К ним относятся 1) положения трех дисульфидных мостиков, 2) гидрофобные остатки в С-концевом участке В-цепи и 3) С- и N-концевые участки А-цепи. Использование химических модификаций и замен отдельных аминокислот шести этих участков помогли идентифицировать сложный активный центр (рис. 51.2). Расположенный на С-конце В-цепи гидрофобный участок участвует также в димеризации инсулина. [c.248]


    Молекулы высших алканов (Л Ю) представляют собой почти свободное сочленение двух более коротких цепей. Каждая такая цепь участвует в реакциях переноса водородных связей С-Н...С независимо от остальной части молекулы. Диэлектрическая релаксация и процессы перестройки структуры жидких алканов при П 9-1.0 не зависят от длины углеводородной цепи. Этим можно объяснить практически постоянное значение времени релаксации в высших алканах, а также, то, что значение /1// оказывается близким к значению 4// н-пентана. Wo TpY высших алканов не равно tpj н-пентана. По-видимому, время релаксации, наблюдаемое в наших опытах, определяется константой скорости лимитирующей реакции, т.е. той, в которой участвует наиболее длинный участок молекулы, > [c.172]

    Предыдущее выражение качественно показывает, что большие напряжения в цепи будут получены только в том случае, если константы силового взаимодействия примерно того же порядка, что и в кристалле, и если модули упругости одинаково велики для всех участков по длине цепи. Один слабый участок значительно увеличивает среднее смещение и уменьшает напряжение. Следует также напомнить, что увеличение напряжения цепи вызвано не длиной I и абсолютным числом п точек [c.141]

    Свойства сополимеров изменяются не только в зависимости от природы мономеров, но также от их соотношения, метода сополимеризации, температуры, инициирования и т. д. Обычно сополимеры имеют нерегулярное строение, так как в их цепях различные элементарные звенья расположены беспорядочно, и нельзя выделить периодически повторяющийся участок цепи. В связи с участием в реакции нескольких мономеров и соответственно нескольких образующихся радикалов сополимеризация значительно осложняется. Так, при двух мономерах рост цепи может протекать по крайней мере четырьмя путями [c.458]

    В грунтовом электролите в условиях активной защиты всегда присутствуют ионы, способные восстанавливаться. Видимо, поэтому практически во всех анализируемых КСС не был обнаружен участок, параллельный оси абсцисс. Следует также отметить, что с увеличением напряжения КСС полное сопротивление электрической цепи несколько уменьшается, в том случае если сооружение имеет защитный потенциал. [c.36]

    Было высказано предположение, что экзоны кодируют определенные автономные элементы укладки полипептидной. цепи, представляющие собой функциональные сегменты белковой молекулы, которые сортируются в процессе эволюции. Если процессы такой перетасовки генетического материала, механизмы которых не рассматриваются, идут по районам интронов, то структура экзонов не изменяется и, следовательно, не нарушаются функциональные свойства отдельных белковых доменов. Экзоны могут соответствовать участкам доменов или отдельным белковым доменам, т. е. тем участкам белковой молекулы, которые можно выделить как пространственно делимые структуры, обладающие определенной биологической функцией. Установление раз.меров экзонов во многих генах показало, что главный класс экзонов имеет раз.меры около 140 п. и., что соответствует 40—50 а. о. в молекуле белка. Большая часть белковых доменов, содержащих в среднем 100—130 а. о., складывается из нескольких элементов вторичной структуры ( су-первторичных структурных единиц), кодируемых отдельными экзонами. М-терминальный участок из нескольких гидрофобных аминокислот (сигнальный пептид) секреторных белков, как правило, также кодируется отдельным экзоном. [c.192]

    Этот факт можно объяснить, если рассмотреть осциллограмму тока проводимости между электродами зондов (см. рис. 3, г, д). Нижний зонд дает всплеск тока приблизительно в момент прохождения фронта пламени верхнего отрицательного электрода. Следовательно, цепь отрицательный электрод — фронт горения — положительный электрод с этого момента также замкнута, и через свежую смесь течет ток. Этот ток возрастает с ростом напряженности электрического поля. В момент прохождения фронта пламени отрицательного электрода положительные ионы образуют около него пространственный заряд. Избыточные электроны, разгоняясь нолем, могут достигнуть положительного электрода, замкнув цепь. Фронт пламени из-за условий поджига искривлен. Путь наименьшего сопротивления для прохождения электронов будет на участке максимального выброса фронта пламени в свежую смесь. По этому пути, представляюш ему собой тонкий шнур, и будет проходить ток. При протекании электрического тока в шнуре выделяется джоулево тепло, которое разогревает газ в шнуре. Как только температура газа достигнет температуры воспламенения, произойдет воспламенение смеси в шнуре. Температура быстро возрастет до температуры горения. В зоне горения в результате неравновесной ионизации образуются заряженные частицы. Электрическое сопротивление на этом участке резко падает, ток растет. Данный участок является новым источником воспламенения. Образуется дополнительный фронт пламени. В результате, время, за которое происходит сгорание оставшейся смеси, резко сократится. Уменьшение времени горения за счет образования дополнительного фронта пламени значительнее уменьшения времени горения за счет электрического ветра. Поэтому обш,ее время горения сокращается, а скорость распространения пламени возрастает. [c.84]

    На рис. 16-16 показано, как гипотетический фермент Е1 может модифицировать участок ДНК путем метилирования основания в одной из двух палиндромных последовательностей. Этот фермент, которому приписывается довольно необычная специфичность, должен также метилировать второй участок в комплементарной цепи, но вне палиндромной области. После репликации одна молекула ДНК остается неизмененной, тогда как вторая окажется субстратом фермента Е2. Под действием последнего произойдет метилирование второй половины палиндрома и всех ДНК-потомков. В результате совместного действия ферментов Е1 и Е2 модифицированные клетки будут все больше и больше отличаться [c.362]


    Существует два определения длины ветви. При рассмотрении реального процесса формирования макромолекулы ветвью называют участок цепи между узлом ветвления и концевой группой образовавшейся боковой цепочки. Согласно этому определению число ветвей в макромолекуле равно (/-2)т, где/ - функциональность узла ветвления (число цепочек, сходящихся в одном узле), т -Число узлов ветвления в макромолекуле. А при проведении расчетов структурных характеристик разветвленных макромолекул, основанных на моделях разветвленных структур, за ветвь принимают отрезок между соседними узлами ветвления, а также между концевой группой и ближайшим к ней узлом ветвления. При таком определении число ветвей в макромолекуле равно (/- 1)/и-н1. Соответственно [c.123]

    Этот обходной путь включает несколько переносчиков электронов, которые входят в существующую цепь переноса электронов от фотосистемы II к фотосистеме I, а также участок, осуществляющий процесс фосфорилирования. Затраченная энергия на перемещение одного электрона по этому циклу составляет один квант света. В этом цикле не образуется НАДФ Н и не выделяется О2, но происходит накопление энергии за счет образования при фосфорилировании АТФ. [c.200]

    Двойной линией показаны две полинуклеотидные цепи ДНК хромосомной двойной спирали, прерывистыми линиями — цепи, не содержащие метки, сплошными — меченые цепи. За две генерации до выделения хромосомы (Og) полностью немеченная ДНК родительской клетки находилась в той же стадии на Vs завершенной репликации, как и ее внучатые ядра (2,0 g), показанные на фиг. 98. Допустим, что точка pi является точкой начала репликации, а Рг — точкой, в которой находится репликациоиная вилка. Спустя некоторое время (0,15 g) репликационная вилка передвинулась в точку рз после этого добавляли Н-тимин. и все вновь синтезированные цепи ДНК содержали метку Н. Спустя Ve времени генерации (0,3 g) репликации хромосомы завершалась, так как репликационная вилка достигала р,. Две дочерние хромосомы содержали наполовину меченные двойные спирали от Рз до pi, но были совершенно не мечены в остальной части. Проследим теперь судьбу одной из дочерних хромосом, в которой репликационная вилка достигла точки рз спустя Va времени генерации (1,0 g). На этой стадии участки А к Б. я также участок В от рз до pi содержали наполовину меченные двойные спирали сектор В от рз до Рз совершенно не содержал метки. Спустя /з времени генерации (1,3 g) репликационная Y-вилка снова достигла pi. Две внучатые хромосомы содержали полностью меченные двойные спирали от р, до pi и меченные наполовину в остальной части. Проследим теперь за двумя внучатыми хромосомами, в которых репликационная вилка достигла р, спустя Vs времени генерации (2,0 g), и в результате образовались хромосомы, по характеру распределения метки совершенно подобные той, которую удалось наблюдать на радиоавтографе, приведенном [c.204]

    После того как образование синапсиса произошло, короткий участок гетеродуплекса, в котором начали спариваться цепи, принадлежащие двум разным молекулам ДНК, увеличивается за счет направляемой белком миграции ветви, которая также катализируется белком гесА Миграция ветви может происходить в любой точке там, где две одинаковые по своей последовательности одиночные цепи ДНЕ пытаются спариться с одной и той же комплементарной цепью, неспаренный участок одной цепи выгесняет спаренный участок другой, смещая таким образом точку ветвления, хотя само число спаренных оснований при этом не изменяется. Спонтанно миграция ветви идет с равной вероятностью в обоих направлениях и потому трудно сжидать, чтобы она [c.306]

    Селен — типичный полупроводник. Важным свойством его как полупроводника является резкое увеличение электрической проводимости при освещении. На границе селена с металлическим проводником образуется запорный слой — участок цепи, способный пропускать электрический ток только в одном направлении. В связи с этими свойствами селен применяется в полупроводниковой технике для изготовления выпрямителей и фотоэлементов с запорным слоем. Теллур — тоже полупроводник, но его применение более ограничено. Селениды и теллуриды некоторых металлов также обладают полупроводниковыми свойствами и применяются в электронике. В небольших к личествах теллур служит легирующей добавкой к свинцу, улучшая его мехп шческие свойства. [c.468]

    Если 5 = 5а, то = д. На рис. 63 изображены поляризационная кривая меди, а также катодный участок поляризационной кривой водорода и анодный участок кривой кислорода при электролизе раствора (2и504С медными электродами. Видно, что смещение потенциалов катода Дф и анода Дфа от равновесного значения фр после замыкания цепи вызывает восстановление ионов меди на катоде и окисление свободной меди на аноде. [c.209]

    Наличие путей альтернативного сплайсинга существенно увеличивает число разных мРНК, транскрибируемых с одного гена (рис. 106, 2, б). При образовании мРНК тропонина с помощью механизма альтернативного сплайсинга используется также взаимоисключающая и взаимозаменяемая экспрессия экзонов 16 и 17, кодирующих определенный участок полипептидной цепи тропонина. На разных стадиях развития образуются а- и р-тропонины, различающиеся последовательностью из 14 аминокислот, начиная с 229-го и кончая 242-м аминокислотным остатком. Остальные участки полипептидной цепи этих изотипов тропонина идентичны. Остается не ясным, какие изменения функциональных свойств тропонина обусловлены экспрессией того илн иного экзона в составе мРИК- [c.183]

    Гистон НЗ из тимуса теленка содержит 135 аминокислотных остатков [288], причем суммарный заряд первых 53 из них составляет -М8. Возможно, именно эта часть белка связывается с ДНК. В то же время карбоксильный конец этого гистона обладает гидрофобными свойствами и лишь в незначительной степени — основными. Интересные кластеры основных аминокислот были обнаружены в отдельных участках полипептидной цепи гистона Н2а [289]. Одна из любопытных особенностей строения гистонов — это наличие большого числа микромодификаций, сводящихся к фосфорилированию остатков серина, ацетилированию и метилированию остатков лизина, а также метилированию боковых цепей аргинина. Так, например, остатки Ьуз-14 и Ьуз-23 в гистоне НЗ К-ацетилированы, тогда как остатки Ьуз-9 и Ьуз-27 частично 8-Ы-метилированы — каждый участок содержит частично моно-, частично ди- и частично триметильные производные. [c.302]

    Обычно для характеристики эффективности О.ф. используют величины Н /2е или /2е, указывающие сколько протонов (либо электрич. зарядов) переносится через мембрану при транспорте пары электронов через данный участок дыхат. цепи, а также отношение Н /АТФ, показывающее, сколько протонов нужно перенести снаружи внутрь митохондрий через АТФ-синтетазу для синтеза 1 молекулы АТФ. Величина q 2й составляет для г нктов сопряжения 1, 2 и 3 соотв. 3-4, 2 и 4. Величина Н /АТФ при синтезе АТФ внутри митохондрий равна 2 одиако еще один Н может тратиться на вынос синтезированного АТФ из матрикса в цитоплазму переносчиком адениновых нуклеотидов в обмен на АДФ Поэтому кажущаяся величина /АТФ ру,и равна 3. [c.339]

    Для эффективной экспрессии генов необходимо не только, чтобы репрессор был инактивирован индуктором, но также реализовался и специфич. положит, сигнал включения, к-рый опосредуется Р. б., работающими в паре с циклич. аденозинмонофосфатом (цАМФ). Последний связывается со специфическими Р. б. (т.наз. САР-белок-активатор ката-болитных генов, или белковый активатор катаболизма-БАК). Это димер с мол. м. 45 тыс. После связывания с цАМФ он приобретает способность присоединяться к специфич. участкам на ДНК, резко увеличивая эффективность транскрипции генов соответствующего оперона. При этом САР не влияет на скорость роста цепи мРНК, а контролирует стадию инициации транскрипции-присоединение РНК-полимеразы к промотору. В противоположность реп-рессору САР (в комплексе с цАМФ) облегчает связывание РНК-полимеразы с ДНК и делает акты инициации транс-кр1шции более частыми. Участок присоединения САР к ДНК примыкает непосредственно к промотору со стороны, противоположной той, где локализован оператор. [c.218]

    Следует подчеркнуть, что именно ван-дер-ваальсовы взаимодействия формируют структуры, в которых остатки ys и ys , а также ys и ys оказываются сближенными на расстояние, необходимое для образования дисульфидных связей, расположение которых соответствует экспериментально полученной схеме. С другой стороны, только после образования этих связей избирательно стабилизируется единственная конформация основной цепи молекулы. Автоматическое сближение остатков цистеина при расчете плотноупакованных структур является хорошим контролем правильности найденной конформации, так как фиксация конформационных углов основной цепи допускает лишь незначительные (на 1,5-2 A) изменения расстояний между СР-атомами цистеинов, необходимые для формирования дисульфидных связей. На заключительном этапе расчета (см. рис. 1П.12) уже для целой молекулы тертиапина рассматривались конформационные возможности боковых цепей и коротких N- и С-концевых участков, расположенных за пределами системы дисульфидных связей. Участок Gly -Lys °-Lys молекулы тертиапина лабилен в интервале 0-6 ккал/моль у него имеется восемь различных конформаций основной цепи, относящихся к четырем типам. [c.311]

    Наиболее представительна по числу низкоэнергетических конформаций группа А. В ней находится глобальная структура а-эндорфина (A ), а также незначительно уступающие ей по энергии структуры A4 ( / ощ = = 1,0 ккал/моль), А5 (1,7), А2, Аб(4,4) и А7 (4,7). Все конформации этой группы в центре, на участке Thr - Thr , имеют а-спираль протяженностью около двух витков. По обе стороны спирали основные цепи дипептидов Met - Thi и Thr - Рго приобретают развернутые формы. Конформации А отличаются друг от друга ориентациями N-концевого участка Туг - Met , для которого выгодными оказываются почти все предпочтительные конформации молекулы Met-энкефалина (сравните табл. III.22 и Ш.21), и положениями С-концевого участка. Таким образом, характерной особенностью структурных вариантов группы А является наличие жесткой нуклеации в центральной части молекулы при сравнительно лабильных N- и С-концевых фрагментах. В глобальной структуре а-эндорфина (А]) энкефалиновый участок последовательности, сохраняя все свои выгодные внутренние контакты, эффективно взаимодействует с остальной частью молекулы (-18,0 ккал/моль). То же относится и к фрагменту Leu " - Val - Thr , энергия взаимодействия которого с Туг - Рго составляет около -8,0 ккал/моль. Существенную роль в стабилизации пространственной структуры а-эндорфина играют боковые цепи остатков Glu и Lys , находящиеся в середине последовательности и взаимодействующие одновременно с удаленными остатками на обоих концах цепи. Гидрофобная часть боковой цепи Glu эффективно взаимодействует как с предшествующими остатками Туг (-3,0 ккал/моль), Phe (-1,5), Met (-3,0), так и с последующими Gin" ( ,5), Thr (-1,6), Val (-3,3). Сближенной с обоими концами последовательности оказывается также боковая цепь Lys , вызывая при этом, как и Glu, незначительную дестабилизацию за счет взаимодействия с одноименно заряженным остатком Туг. Большая протяженность, высокая лабильность и наличие противоположных зарядов у боковых цепей позволяет остаткам Glu и Lys приблизительно с равным успехом играть цементирующую роль при [c.355]

    В глобальной структуре ys -Tyr самой предпочтительной для Tyr - ys оказалась конформациия B2 -R3 -H -B3 (R3 ) с развернутой формой основной цепи. Это неудивительно, поскольку такое состояние стерически наиболее комплементарно участку ys -Ile , входящему в противостоящий участок -структуры. При состыковке фрагмента Tyr - ys с фрагментом ys -Tyr , имеющим конформацию с i/ 6m = = 1,8 ккал/моль, наиболее выгодной также оказалась развернутая форма основной цепи. Однако в этом случае взаимодействия Tyr - ys с предшествующими остатками менее эффективны, и разница в энергии двух возможных конформационных вариантов фрагмента ys - ys увеличилась до 3,0 ккал/моль. Кроме того, структура ys -Tyr с i/ойщ = = 1,8 ккал/моль не отвечает важному геометрическому критерию, о котором будет говориться ниже. [c.448]

    В последующей работе Н. Гё и Г. Абе [60] детально рассмотрели статистико-механическую модель локальных структур, идея которой уже прослеживалась в изложенных только что исследованиях Н. Гё и Г. Такетоми [57-59]. Под локальной структурой понимается конформация участка полипептидной цепи, которая образуется на определенной стадии процесса свертывания и которая без существенных изменений входит в нативную конформацию белка. В отличие от общепринятого представления о том, что сборка полипептидной цепи начинается с образования вторичных структур, и составляющего основное содержание процесса, а также инициирующего его последующее развитие, Гё и Абе априори не отдают предпочтения ни одной локальной структуре, регулярной или нерегулярной. Наличие а-спиралей, Р-складчатых листов, изгибов и прочих образований оценивается их статистическими вкладами и статистико-механическим поведением всей белковой молекулы посредством парциальной функции. В этой функции не учтен вклад стабилизирующих контактов между локальными структурами на отдельных участках цепи. Отсюда и название анализируемого представления о процессе белкового свертывания как модели невзаимодействующих локальных структур По существу, она аналогична бусиничной модели без подвесок Кунтца и соавт. [32], только в данном случае Гё и Абе представляют белковую цепь не в виде отдельных аминокислотных остатков, аппроксимированных жесткими сферами, а в виде целых конформационно жестких образований, каждое из которых включает непрерывный участок аминокислотной последовательности. Предположение об отсутствии взаимодействий между ними позволяет рассчитать парциальную функцию модели. Но даже в этом случае непременными условиями являются знание нативной конформации, которая обязательно должна быть однодоменной, и предположение [c.492]

    В табл. IV.27 сопоставлены энергетические матрицы взаимодействий валентно-несвязанных атомов в конформациях Aj природного гормона и [Рго ]-АТ II. Видно, что замена VaP на Рго практически не сказывается на энергии невалентных контактов. Без изменений остается геометрия конформаций А) в обеих молекулах. Заметно увеличился существовавший и ранее разрыв в энергии структур А и В. Теперь он значительно превысил отметку 10,0 ккал/моль. В табл. IV.27 сравнены внутриостаточные энергии взаимодействия конформации В4 АТ II (4,6 ккал/моль) с лучшей конформацией группы В - также В4 [Рго ]-АТ II (11,8 ккал/моль). Рост конформационной энергии у синтетического аналога обусловлен ослаблением стабилизации приблизительно на 9,0 ккал/моль между Arg и Val , His . Причиной послужило жесткое пролиновое кольцо, ставшее помехой для сближения боковых цепей этих остатков. При замене VaF на Рго не запрещаются конформации ни в группе А, ни в группе В, так как в обоих случаях участок Tyr -Val имеет развернутую форму. Тем не менее расчет показал, что ситуация здесь в принципе аналогична только что рассмотренной, т.е. наблюдается понижение относительной энергин конформаций А и повышение относительной энергии конформаций В- [c.574]


Смотреть страницы где упоминается термин Цепи также Участки: [c.306]    [c.170]    [c.170]    [c.412]    [c.124]    [c.57]    [c.407]    [c.164]    [c.365]    [c.311]    [c.407]    [c.410]    [c.262]    [c.602]    [c.604]    [c.104]    [c.353]    [c.400]    [c.339]    [c.379]    [c.141]    [c.217]   
Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.0 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.0 ]




ПОИСК







© 2025 chem21.info Реклама на сайте