Комплементарность молекул

Расстояние между атомами кислорода экваториальных ОН-групп составляет 0,485 нм, и оно практически точно соответствует положению второго максимума радиальной функции распределения жидкой воды (-0,49 нм). Такое стерическое соответствие и позволило прийти к заключению, что молекулы многих сахаридов, имеющих достаточное число еОН-групп, могут точно размещаться в квазикристаллической водной матрице. При этом водородные связи вода-вода замещаются связями сахарид-вода. В дополнение к этому необходимо привести чрезвычайно интересный факт, заключающийся в том, что критическое расстояние кислород-кислород -0,49 нм является характерным для большинства биологических молекул [29]. Стерическая комплементарность молекул углеводов (и молекул других биологически важных веществ) и трехмерной упорядоченности жидкой воды, по-видимому, дает возможность этому растворителю играть столь важную роль в жизненно важных процессах. [c.78]

Взаимодействия между комплементарными молекулами — слабые взаимодействия. Но сложная игра этих слабых сил [c.563]

Гибридизация — это процесс, в ходе которого одноцепочечная НК-мишень связывается с зондом — комплементарной молекулой, помеченной радиоактивным изотопом или ферментом. В качестве зондов могут использоваться как ДНК, так и РНК. ДНК-зонды являются двухцепочечными и перед применением их необходимо денатурировать (например, нагреванием), чтобы получить одноцепочечные фрагменты. [c.96]

Установлено, что комплементарные молекулы РНК и денатурированная ДНК способны в определенных условиях образовывать двухтяжевые гибридные комплексы типа одна нить ДНК —одна нить РНК. [c.114]

Способность оснований к распознаванию своего партнера приводит к свертыванию двух таких сахарофосфатных цепей в структуру, известную как двойная спираль, что экспериментально установлено рентгеноструктурным методом. В этой структуре две комплементарные молекулы ДНК, каждая из которых образована ковалентными связями, удерживаются вместе в спиральной конформации гораздо более слабыми водородными связями. Поскольку взаимодействия между азотистыми основаниями в высшей степени специфичны, спираль может сформироваться лишь в том случае, если последовательности оснований в обеих цепях полностью идентичны. [c.114]

Рис. 10. Гипотетическая схема взаимодействия РНК с комплексом Р-РНК — аминокислота. Комплементарность молекул Р-РНК и участков спиральной матрицы схематически показаны как совпадение контуров их реактивных участков Ез — энзиматическая система активации, АМР ааз — активированная аминокислота (оа)

Более поздние исследования показали, что легко можно осуществить физическую фиксацию ДНК в гелях ацетата целлюлозы или агар-агара (в отсутствие какого-либо химического агента) закрепленная таким образом ДНК образует водородные связи с комплементарными молекулами и, следовательно, может быть использована для очистки и выделения специфической РНК [570]. [c.371]

Известны три вида процессов, в рамках которых осуществляется специализированный перенос информации (см. рис. 11.1). Один из них, перенос информации от РНК к РНК, удается зафиксировать только в клетках, зараженных вирусами, генетический материал которых представляет собой РНК. Это, например, вирус табачной мозаики (ВТМ) и многие другие вирусы растений, РНК-содержащие бактериофаги и некоторые вирусы животных, такие, как полиовирусы. Эти вирусные геномные РНК, одноцепочечные или двухцепочечные, обязательно несут гены, кодирующие специфические РНК-репликазы, т.е. ферменты, которые по РНК-матрице могут синтезировать комплементарные молекулы РНК. Эти молекулы в свою очередь могут служить матрицами для аналогичного синтеза копий родительских цепей РНК. Перенос генетической информации от РНК к РНК также основан на принципе комплементарности оснований в родительской и дочерней цепях РНК. [c.49]

Рис. 1-5. Репликация последовательности полинуклеотида (здесь молекулы РНК). На стадии 1 исходная молекула РНК служит матрицей для образования молекулы РНК с комплементарной последовательностью. На стадии 2 эта комплементарная молекула в свою очередь служит матрицей для образования молекулы РНК с исходной последовательностью. Поскольку каждая матрица способна произвести много комплементарных копий,

Информация, содержащаяся в одноцепочечной РНК, реализуется в виде определенной последовательности пуриновых и пиримидиновых оснований (т. е. в первичной структуре) полимерной цепи. Эта последовательность комплементарна кодирующей цепи гена, с которой считывается РНК. Вследствие комплементарности молекула РНК способна специфически связываться (гибридизоваться) с кодирующей цепью, но не гибридизуется с некодирующей це- [c.59]

Основная идея вряд ли может быть проще Единственная довольно неожиданная особенность заключается в том, что обе цепочки не идентичны, а комплементарны Можно представить даже еще более простой механизм, в котором одинаковое спаривается с одинаковым с тем, чтобы обе парные цепочки оказались идентичными, но характер химических взаимодействии, скорее, несколько облегчает точное соответствие друг другу комплементарным молекулам, нежели абсолютно идентичным [c.54]

B. Две одноцепочечные комплементарные молекулы ДНК образуют [c.28]

На самом деле структура ДНК является еще более сложной, так как две составляющие ее полимерные спирали закручены в противоположном направлении иными словами, они антипараллельны. Если двигаться вдоль обеих спиралей в одном и том же направлении, то в одной из них связь между сахарными и фосфатными остатками будет -5, 3 - 5, 3 -5, 3 -, а в другой — -3, 5 -3, 5 -3, 5 -. Во время синтеза белка одна из цепей двойной спирали ДНК служит активным источником информации для клетки, являясь матрицей для образования так называемой информационной или матричной рибонуклеиновой кислоты (мРНК). При делении клетки обе нити двойной спирали выступают в роли матриц для синтеза комплементарных молекул ДНК. Таким образом, каждое дочернее ядро после деления содержит по паре нитей ДНК или по нескольку пар этих нитей, которые идентичны родительской ДНК. Этот процесс представлен схематически на рис. 27-6 и более подробно — на рис. 27-7. [c.485]

Таким образом, многие факторы влияют на взаимодействие иммобилизованного лиганда с комплементарной молекулой. Как биоспецифическая, так и небиоспецифическая сорбция основана по сути дела на тех же электростатических и гидрофобных взаимодействиях и их комбинации. Вклад небиоспецифических взаимодействий можно лучше оценить, сопоставляя константы диссоциации комплекса выделяемой макромолекулы с иммобилизованным аффинным лигандом и с тем же лигандом в растворе, используемом для элюирования (гл. 4). Такая характеристика аффинной системы весьма необходима, особенно если аффинная [c.101]

Для упорядоченного механизма иммобилизация лиганда А подвержена обычным ограничениям аффинной хроматографии. Б этом случае иммобилизация лиганда В не приводит к конкурентному сорбенту для комплементарной молекулы исключение составляют случаи, когда лиганд А присутствует в рабочем буферном растворе, в котором наносят фермент на колонку. Таким образом, присутствие лиганда А является необходимым для связывания сорбентом ферментов, поскольку лиганд В связывает двойной комплекс лиганд А — фермент. Это позволяет ввести в хроматографию предварительный отбор — из бирательное связывание, последующее элюирование достигается удалением лиганда А из рабочего буферного раствора. [c.110]

Было показано также, что в процессе экстрагирования вирусных нуклеиновых кислот и отделения их от белка может происходить комплексирование в действительности одноценочечных комплементарных молекул, так что обнаруживаемая двухцепочечность может быть на деле артефактом, связанным с фенольным или детергентным методами выделения внутриклеточной РНК. Были получены данные в пользу гипотезы, что матричная (—)-цень удерживается в комплексе с возникающей (4-)-цепью в основном не за счет спаривания оснований, а каким-то менее жестким способом, возможно с помощью молекул репликазы [117, 549]. Именно выраженной способностью образующейся РНК действовать в качестве информационной РНК и связываться с рибосомами, может быть, и объясняется быстрое снятие этой цепи с матрицы. Наряду с этими данными, однако, в последнее время были получены новые данные о существовании РФ- и РПФ-форм РНК у фагов и вирусов растений [25, 46, 221]. Проведенный недавно анализ образующихся 5 -концевых групп [c.241]

Таким образом, два разных теста-определение степени сродства клеток в опытах с длительной инкубацией (эксперименты с самосортировкой ) и измерение скорости слипания клеток (опыты по связыванию радиоактивных клеток)-дают аналогичные результаты, хотя механизмы обоих явлений могут быть разными. К сожалению, до сих пор не ясно, что именно обеспечивает процессы тканеспецифического узнавания-внеклеточные факторы агрегации, комплементарные молекулы клеточных поверхностей или какие-то иные механизмы. [c.209]

Этого недостатка лишен сополимеризационный метод иммобилизации, позволяющий создать полимерной носитель, комплементарный молекуле фермента. Фермент химически модифицируют (например, по аминогруппам) аналогом мономера, т. е. [c.129]

Ранее П. Доти (США) и его сотрудники показали, что двойную спираль ДНК можно расплетать или денатурировать, применяя различные воздействия (повышение температуры, изменение pH и др.). В то же время, если инкубировать денатурированную одноцепочечную ДНК при температуре ниже той, которая вызывает денатурацию, комплементарные цепи реагируют между собою, вновь образуя двойную спираль, — происходит ренатурация ДНК. Если к ДНК добавить комплементарную РНК, может происходитьобразование гибридов ДНК—РНК — гибридизация, которая в дальнейшем стала одним из мощнейших методов изучения нуклеиновых кислот, позволяя выявлять комплементарные молекулы. [c.20]

Молекулы (В растворе, помещенные в лунки агарового геля, радиально диффундируют и образуют иммунные комплексы с комплементарными молекулами антител или антигенов, содержащихся IB жидкой фазе агара. В стандартной РИД агар содержит моноспецифические антитела, а радиально диффундирующий антиген, встречаясь с ними, образует кольцо преципитации. До тех пор пока в лунке сохраняется избыток антигена, процсходит постепенное увеличение диаметра кольца преципитации. Реакция протекает в течение нескольких дней, причем время проведения определяется молекулярными размерами антигена. В случае IgM (мол. масса 900 000) времени требуется по крайней мере вдвое больше, чем для IgG (мол. масса 150 000). На практике, если молекулы имеют размер IgG или менее, для построения количественной кривой с использованием Стандартных разведений антигена достаточно 24-часо-вой инкубации при 4°С или 16-часовой при комнатной температуре. Количественная оценка основана на том, что размеры кольца преципитации прямо пропорциональны количеству антигена IB лунке ( при равных объемах препаратов в лунках). По квадрату диаметра колец преципитации (D ) можно судить о соотношении концентраций антигена в лунках даже при сокращении времени инкубации. Для построения калибровочной кривой используют стандартные разведения антигена, концентрация которых отличается в 10—20 раз и может достигать 5 м кг/мл. Образцы соотносят с калибровочной кривой, измеряя размеры кольца преципитации на еще влажном геле. [c.208]

Олигонуклеотидные зонды представляют собой синтетические одноцепочечные молекулы ДНК длиной приблизительно в 20 оснований. Такие зонды можно использовать для выявления точечных мутаций. Для этого требуется пара олигонуклеотидных зондов ОДИН комплементарный к нормальной и другой-к мутантной ДНК. Зонды гибридизуют с рестрикционными фрагментами ДНК либо на блотинговых пленках Саузерна, либо в осушенном агарозном геле, и затем фильтр или гель промывают в таких условиях, чтобы плохо сопряженные ДНК-гибриды дестабилизировались и удалялись с фильтра, а гибриды из комплементарных молекул оставались на нем. Этот подход использовали для диагностирования серповидноклеточной анемии, Р-талассемии и а-1-антитрипсиндефицита [6, 13, 22]. [c.71]

В вопросе о конформации НАД и НАДН следует выделить две стороны (в порядке важности и сложности) 1) конформация НАД в растворе и 2) конформация НАД jp фермент-коферментном комплексе. Строгая ориентация в пространстве отдельных частей молекулы динуклеотида необходима для вполне определенного расположения нико- инамидного кольца относительно функциональных групп фермента, а также молекулы субстрата. Малейшее изменение углов валентных связей или межатомных расстояний в молекуле кофермента должно приводить к нарушению уникальной согласованности и эффективности каталитического процесса. Вследствие комплементарности молекулы кофермента участку связывания поверхности фермента (кофермент является слепком с участка связывания) изучение структуры НАД в фермент-коферментном комплексе дает непосредственную информацию о пространственном расположении функциональных групп активного центра фермента, взаимодействующих с коферментом. [c.21]

Согласно ей одиночные цепи ДНК служат матррщами при синтезе комплементарных молекул (репликация). Далее смысловая цепь ДНК конкретного гена служит матрицей для синтеза точного транскрипта (пре-мРНК) соответствующего гена (транскрипция). Затем следует процесс созревания матричной РНК (процессинг), при котором происходит модификация молекулы и сплайсинг. Описанные события происходят в ядре клетки (рис. IV. 16). Зрелая иРНК выходит в цитоплазму, где на рибосомах осуществляется процесс перевода информации, записанной в последовательности иРНК, в аминокислотную последовательность соответствующего белка (трансляция). [c.73]

III. Рецептор третьего типа е-чувствительный комплекс g — комплекс, воспринимающий комплементарные молекулы к— комплементарная молекула с А— чувствительной группой Z— ферментотоксическая группа /— адсорбированная эндогенная молекула. [c.338]

Смотреть страницы где упоминается термин Комплементарность молекул: [c.115] [c.187] [c.341] [c.461] [c.82] [c.217] [c.24] [c.396] [c.332] [c.335] [c.163] [c.165] [c.226] [c.68] [c.67] [c.33] [c.19] [c.332] [c.335] [c.172] [c.178]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология