Циклические пептиды (циклопептиды)

Циклические пептиды (циклопептиды) [c.807]

Все эти положения были высказаны Э. Фишером более 50 лет тому назад. Но за последние 10—15 лет был накоплен огромный фактический материал о продуктах распада белка и было синтезировано огромное число пептидов, среди них ряд природных, что окончательно подтвердило эту точку зрения (см. стр 524—525). Наряду с полипептидами и белками за последнее время среди природных соединений найдено значительное количество циклических пептидов. Некоторые из них обладают гормональным действием, например вазопрессин, регулирующий кровяное давление, другие являются продуктами жизнедеятельности микроорганизмов, например грамицидины. Одни из этих циклопептидов состоят только из аминокислотных остатков (грамицидин), другие содержат в цикле и другие элементы— серу. Швицер предложил называть первые гомодетными и вторые гетеродетными циклопептидами. [c.486]

Аминокислоты в циклическом пептиде нумеруются таким образом, что первая по алфавиту аминокислота получает номер 1, а последующая нумерация производится по направлению часовой стрелки. Такой способ нумерации неприменим, однако, к схемам синтеза пептидов по часто использующейся системе Швицера особенно это относится к синтетическим аналогам природных циклопептидов. В этих случаях за основу берется аминокислотная последовательность линейного пептида, из которого был получен соответствующий циклопептид. [c.15]

Циклические гомомерные пептиды можно подразделить на гомодетные и гетеродетные циклические пептиды. Циклопептиды первой группы содержат только пептидные связи в соединениях второй группы в образовании цикла принимает участие одна или несколько других функциональных групп. [c.346]

Тем не менее некоторые идентифицированные пептидные фраг-манты — Phe-Val-Phe, Phe-Phe-Ala, Phe-Val-Ala и Phe-Phe-Phe — не соответствовали этой структуре. Происхождение таких вводя-ших В заблуждение пептидных фрагментов объяснялось на основе предположения о том, что при кислотном гидролизе циклопептида в метаноле образуется циклический пептид с меньшим размером цикла, а остальная часть молекулы затем элиминируется. Реакция вызывается трансаннулярными взаимодействиями и приводит к образованию новой пептидной связи, отсутствовавшей в исходном пептиде. Если затрагиваются только две аминокислоты и элиминируется меньшая часть цикла, то может образоваться дикетопиперазин. Сочетание методов ГЖХ и масс-спектрометрии с жидкостной хроматографией использовали Байер и Кениг [18] в исследовании последовательностей пептидного синтеза, проведенного по методу Меррифилда [31]. [c.171]

Для выделения циклического пептида из реакционной смеси раствор последней в воде или водном спирте пропускают последовательно через кислую и основную ионообменные смолы, которые абсорбируют все полярные побочные продукты. Очистку циклопептидов проводили также с помощью противоточного распределения [1215] и колоночной хроматографии на целлюлозе [1285]. Одним из самых существенных этапов идентификации продукта циклизации является определение его молекулярного веса. Для этого применяют метод изотермической перегонки в трифторуксусной [1285, 2018, 2533] или в муравьиной кислоте [2545], а также криоскопический метод. В последнем случае, кроме обычно используемых фенола и камфоры, предложено также применять диметилсульфоксид [2031, 2035] и ге-аминогек-сагидробензойную кислоту [1865, 1868]. [c.348]

Возможность реакции удвоения при циклизации пептидов заставляет рассмотреть некоторые общие вопросы циклообразования в связи с величиной цикла. Молекула простейшего циклического пептида, циклодипептида (дикетопиперазина), представляет собой шестичленное кольцо. Наличие свободного вращения вокруг простых связей приводит к тому, что циклические соединения с большей величиной цикла обычно свободны от напряжения. Поэтому теоретически возможно существование любых циклопептидов, больших, чем циклодипептиды. Однако факт удвоения показывает, что это не отвечает действительности. По-видимому, причиной удвоения является наличие определенной конфигурации амидной связи. Амидная группировка вследствие мезомерного эффекта (1) является плоской [104, 936] и существует в энергетически наиболее выгодной транс-конфигурации [c.349]

Исследование циклопептидов представляет собой одну из наиболее важных областей пептидной химии, так как большое число биологически активных веществ имеют циклопептидную структуру. Разработка методов синтеза циклических пептидов и изучение их свойств представляет задачу большой важности. [c.404]

Несмотря на целый ряд работ по синтезу грамицидина С 1 и его аналогов тироцидина А 1 , а также по моделышм синтезам различных циклопептидов в целом химия циклических пептидов изучена недостаточно. [c.133]

Впоследствии Вейганд [7] сообщил об анализе последовательности метионинсодержащего циклического нонапептида, который был обнаружен как примесь в вышеупомянутом циклопептиде. Перед частичным гидролизом пептид сначала десульфировали на никеле Ренея, так как в условиях частичного метанолиза соляной кислотой в метаноле метионин разлагается, и по этой причине метионинсодержащие пептиды отсутствуют на хроматограмме. После перевода в соответствующие производные с помощью ГЖХ можно было разделить 16 пептидов, как показано на рис. 7, и идентифицировать их масс-спектрометрически [c.169]

Линейный пептид, способный к циклизации, можно получить двумя путями активированием карбоксильной группы свободного пептида или отщеплением N-защитной группы после того, как карбоксильная группа уже активирована. Естественно, в любом случае оказывается необходимым высокое разбавление. На практике чаще применяют второй путь. Большинство синтетических циклопептидов получено методом активированных эфиров, т. е. путем отщепления N-защитной группы у активированного эфира N-защищенного пептида. При снятии аминозащитной группировки образуется соль по аминогруппе, которая временно предохраняет последнюю от немедленной реакции с активированной карбоксильной группой. Чаще всего применяли следующие комбинации цианметиловый эфир и тритильная группа [1341, 2018, 2030, 2031, 2517], п-нитрофениловый эфир и тритильная группа [2026, 2028, 2029], /г-нитрофениловый эфир и г/ ег-бутилоксикарбонильная группа [377, 2033] и п-нитрофениловый эфир и бензилоксикарбонильная группа [1341, 1871, 2010, 2031, 2106]. Выделение свободного эфира пептида из его соли осуществляли добавлением к реакционной смеси основания, обычно пиридина [377, 1341, 2010, 2018, 2031, 2106, 2517, 2533] или суспензии карбоната магния [1214, 1215]. Для циклизации использовали и азидный метод в этом случае исходным соединением служил азид карбобензоксипептида, причем карбобензоксигруппу после разбавления отщепляли каталитическим гидрогенолизом [2568]. Поскольку гидразиды реагируют с азотистой кислотой быстрее, чем амины, можно также непосредственно получить азид свободного пептида из соответствующего гидразида. В ходе этого превращения аминогруппу необходимо защищать солеобразованием, т. е. реакционная смесь должна быть в достаточной степени кислой. Свободный аминоазид выделяют добавлением водного раствора бикарбоната натрия [2003, 2072, 2615, 2623, 2624, 2634]. Получаемые из свободных пептидов хлор-гидраты хлорангидридов пептидов также пригодны для циклизации. В этом случае циклизацию обычно проводят, добавляя триэтиламин к раствору хлоргидрата хлорангидрида пептида в диметилформамиде [1870]. Хлорангидридный метод оказался очень полезным при синтезе циклических пептолидов. Худшие, результаты получаются при циклизации методом смешанных ангидридов [302], так как промежуточные соединения, как правило, плохо растворимы в органических растворителях. Напротив, [c.347]