ФТК-пептиды циклизация

Концентрация пептида, необходимая для того, чтобы имелась одинаковая возможность как для образования цепи, так и для циклизаций в начальной стадии реакции, предполагая [c.202]

Формально говоря, пептидный синтез сводится попросту к отщеплению воды от двух молекул аминокислот или пептидов схема (1) . Однако на самом деле из-за диполярной природы аминокислот эта реакция термодинамически невыгодна и требует для своего осуществления неприемлемо высоких температур. В любом случае это привело бы к полной неупорядоченности последовательности аминокислот в продукте реакции, а также к продуктам циклизации и поликонденсации. [c.368]

Деградация с помощью ФТЦ проводится в несколько стадий 1) добавление ФТЦ, 2) циклизация ФТК-производного, 3) экстрагирование свободного ФТГ-производного, 4) идентификация и определение ФТГ-производного или анализ укороченного пептида, [c.283]

Отношение циклических и цепочечных форм связей не является следствием одинаковых воз,можностей образовать те или иные связи. Наклонность к циклизации имеют пролин, фенилаланин, аланин, глицин, лейцин и серии. Остальные аминокислоты встречаются несравненно чаще 1В пептидах. Чередование их даже в пептидах подчиняется лишь каким-то не раскрытым закономерностям. Но все же общую схему структур. исследованных нами белков можно наметить в тех или иных вариациях. Мы даем их для ряда белков, не предрешая закономерностей их чередования, как гипотетических структур. [c.444]

Швицер предложил также применять для этой цели цианметиловые эфиры пептидов. Е. А. Морозова и С. Женодарова, синтезировавшие ряд циклогексапептидов, проводили циклизацию самих пептидов, используя внутримолекулярное отщепление воды с помощью дициклогексил-карбодимида или этоксиацетилена. Последний был применен ими впервые. 1 аким путем был получен глицил-лейцил-диглицил-лейцил-глицин. [c.498]

Недавно Роте предложил применять для циклизации пептидов фосфористые соединения — тетраэтилпирофосфит, хлорангидриды эфиров фосфорной кислоты, фосфорный ангидрид, диэтилфосфит и др. [c.498]

В разбавленных кислотах, например, в 0,1 Л/НС1 или щавелевой и уксусной кислотах гидролиз протекает несколько по иному, легче всего отщепляется аспарагиновая и глутаминовая кислоты. Иногда наблюдается вторичная циклизация пептидов. Образовавшийся дикетопипе-разин может распасться по другой амидной группе, что приводит к не- [c.515]

Для реакций циклизации в принципе подходят те же методы конденсации, которые используются и для синтеза линейных пептидов. Из линейного пептида с незащищенной аминофункцией при активировании карбоксила наряду с циклическим пептидом I могут получаться также линейные полимеры П (рис. 2-25). [c.201]

Активирование в виде полимерных активированных эфиров. Принцип активирования карбоксильной группы полимерным носителем для синтеза циклических пептидов был использован Фридкиным и сотр. [488]. N-Защищенная пептидная последовательность, подлежащая циклизации, присоединяется к подходящему полимерному активирующему реагенту. После деблокирования циклический пептид получается путем внутримолекулярного аминолиза [c.202]

В случае применения безводных органических растворителей, содержащих кислоту, возможна миграция ацильных групп, находящихся у определенных остатков оксиаминокислот. Так, при определении концевых групп по методу Эдмана (см. стр. 237—245), согласно которому производное пептида обрабатывают нитрометаном и НС1 [87], уксусной кислотой й НС1 [88] или диоксаном и НС1 [186] для циклизации Ы-Конце-вого остатка, установлено [2, 314], что на последующих стадиях отщепления обнаруживаются небольшие Количества Ы-концевь1Х остатков серина или треонина. В одном случае это привело к неправильному выводу о последовательности аминокислотных остатков [2, 186]. Обычно исследуемое соединение обрабатывают СвНаЫСЗ или динитрофторбензолом при pH 8,5. Если же белок находится в среде с такой величиной pH до добавления реагента, то свободные аминогруппы, появляющиеся в результате миграции ацильной группы от N к О, вновь образуют пептидные связи. Предварительную [c.222]

Реагенты, используемые для этой реакции, указаны в табл. 5. Все эти реагенты в мягких условиях (pH 8,5, низкая температура) образуют производные, отличающиеся друг от Но скорости циклизации и растворимости в кислотных рёагёйтах, вызывающих циклизацию. Указанные реагенты успеШНо рйменялись для исследования простых пептидов, но только ф йлизотиоцианатный метод Эдмана нашел широкое [c.239]

Циклизация производных фенилтиокарбамила (ФТК) проводилась в различных условиях кислотности. При переходе от аминокислот к пептидам с длинными цепями возникают трудности. [c.240]

Для ступенчатого расщепления пептидов разработан метод [ИЗ, 114], по которому ФТК-пептид растворяют в 3 н. НС1 при комнатной температуре и ойределяют конец циклизации по изменению поглощения в диапазоне длин волн 235— 275 ммк. По мере образования ФТГ-производного N-концевой аминокислоты максимум поглощения смещается приблизительно от 240 до 262,5 ммк при минимуме около 240 ммк (рис. 13). Если реакция протекает медленно, то ее проводйт при более высокой температуре (например, при 40°). Обычно продолжительность реакции при комнатной температуре составляет 1,5—24 час. После завершения циклизации ФТГ-производное экстрагируют этилацетатом, а водный раствор выпаривают досуха при низкой температуре, чтобы избежать нежелательного действия кислоты и возможного гидролиза пептидных связей. [c.240]

Другой метод, основанный на использовании безводной трифторуксусной кислоты [100], которая очень хорошо растворяет белки [173], успешно применялся для циклизации (5 мин при 0°) ФТК-производных при последовательном расщеплении в пепсине участка Н.Илей.Глу.Асп.Глу— [90]. Этот метод можно применять также для обработки ФТК-производных других белков. Вследствие быстрого образования промежуточного реакционноспособного тиазолинона (см. схему на стр. 239), по-видимому, это соединение лучше экстрагировать после кратковременного проведения реакции и завершить циклизацию в Зн. НС1, которая не разрушает ФТГ-производных серина и треонина. Представляет интерес тот факт, что очень низкие выходы, полученные Шефердом и сотр. [284] при тщательном изучении расщепления пептидов из кортикотропина, обусловлены потерями (50—70%) на стадии циклизаций в среде ледяная уксусная кислота — НС1 при 75—80° в течение 15 мин. Поскольку тиазолинон образуется быстро и имеет высокую реакционную способность, подобные условия циклизации являются, по-видимому, рлишком жесткими. На основании экспериментальных результатов этих авторов можно предположить, что критическая фаза разложения наблюдается во время расщепления и циклизации или одного из этих процессов, так как в более мягких условиях выход аминокислот при регенерации из ФТК-пептидов оказался ниже, чем выход аминокислоты из ФТГ-производного аланина в аналогичных условиях. Этим можно объяснить, почему некоторые исследователи [108, 151, 242] предпочитают пользоваться методом вычитания, согласно которому N-концевая аминокислота обнаруживается по ее исчезновению. Несмотря на низкие выходы и случайное расщепление связей, Шеферду и сотр. [284] удалось обнаружить N-концевой остаток, так как его количество обычно в 5—10 раз превышает содержание других аминокислот а реакционной смеси. Однако в случае неустойчивой, неэкстрагируемой или встречающейся в пеп [c.244]

Другие методы. Замещенные о-нитрофенильные соединения вводят в свободную аминогруппу действием соответствующего фторпроизводного. Последующее восстановление нитрогруппы позволяет легко осуществить циклизацию аминосо-единения в лактам в мягких условиях. Р. Холли и А. Холли [156] при разработке этого метода исследования простых пептидов применяли 1-фтор-2-нитро-4-карбометоксибензол, но другие исследователи [162, 169] предпочитали работать с более доступным 1-фтор-2,4-динитробензолом. Реакции при ступенчатом расщеплении по методу Р. Холли и А. Холли [156] протекают по следующей схеме [c.245]

Эта реакция не пригодна для отщепления С-концевых остатков пролина, так как они не образуют тиогидантоин, остатков аспарагиновой и глутаминовой кислот, которые образуют циклические ангидриды, а не тиогидантоины (аспарагин и глутамин, наоборот, дают тиогидантоины [301]), а также остатков серина, треонина, цистина, аргинина и лизина [19, 301], которые неустойчивы при циклизации или регенерации аминокислоты из тиогидантоинового производного. Таким образом, этот метод находит весьма ограниченное применение для прямого определения строения пептидов и белков. Для определения С-концевого остатка по разности [107] реакция может оказаться более полезной, но ее все же нельзя использовать для определения аспарагиновой и глутаминовой кислот и пролина. Однако путем микробиологического анализа [107], специфичного для остатков /-аминокислот, эти аминокислоты могут быть определены по потере оптической активности на 50% вследствие рацемизации в том случае, когда они являются С-концевыми. [c.247]

Аналогично использованию многих уретановых производных для защиты аминогрупп существует целый набор простых эфиров, которые можно использовать для защиты карбоксильной группы. Так, бензиловые эфиры (расщепляемые гидрогенолизом илн сильными кислотами) и г/ ет-бутиловые эфиры (расщепляемые кислотной обработкой, но в более мягких условиях) нашли широкое применение для защиты С-терминальиых и боковых карбоксильных групп в производных аминокислот и пептидов. Подобным образом могут быть использованы некоторые содержащие заместители в кольце бензиловые и другие сложные эфиры, аналогичные урета-нам, приведенным в табл. 23.6.1. Эфиры с простыми алкилами (метил или этил), расщепляемые омылением, находят лишь ограниченное применение для защиты карбоксильной функции. Хотя производные пептидов со сложноэфирной группой на С-конце существенно более электрофильны, чем обычные алифатические сложные эфиры (благодаря электронооттягивающим свойствам а-кар-боксамидного заместителя), условия для их расщепления в щелочной среде слишком жестки для пептидов, за исключением самых простых. В общем случае они также непригодны для защиты карбоксильной функции в боковой группе (см. разд. 23.6.2.3) соответствующие уретаны в этих условиях продвергаются внутримолекулярной циклизации в производные гидантоина (см. разд. 23.6,2.1) вместо обычного гидролиза. Тем не менее метиловый и этиловый эфиры являются важными промежуточными продуктами для получения С-терминальных гидразидных производных для продолжения пептидного синтеза азидным методом (см. разд. 23.6.3.4). [c.380]

Циклизация является критическим этапом реакции назависимо от того, идет ли реакция с аминокислотой, с пептидом или с белком. Спектры поглощения ФТК-производного и циклизованного ФТГ-производного имеют различные максимумы 270 и 240 нм соответственно. Поэтому за процессом циклизации можно следить спектрофотометрически при 240 нм реакция заканчивается, когда перестает изменяться экстинкция при этой длине волны. Если циклизация идет слишком медленно, процесс можно ускорить, увеличив концентрацию кислоты или осторожно нагревая смесь. Однако нужно помнить, что существуют устойчивые пептидные связи, циклизация которых идет очень медленно или не идет вообще. [c.287]

Эгот реагент исйО,. 1ьзован [41 для циклизации пептидов путем активирования аминогруппы. Реакцию проводят при температуре 140 в условиях высокого разбавления. [c.411]

К числу топохимических операций следует отнести и циклизацию био/югически активных линейных пептидов за счет вмидных, дису/1ьфидных или иных ковалентных связей. Такая модификация [c.174]

Основная область научных исследований — химия белка. Разработал (1920—1930) методы получения пептидов, в частности ами-нолизом азлактонов аминокислотами или их эфирами (реакция Бергманна). Открыл (1926) реакцию циклизации К-галогенацил-аминокислот с одновременным де-галогенированием при нагревании с уксусным ангидридом в пиридине с образованием азлакюнов (реакция Бергманна). Установил (1928) способность натрия и лития присоединяться к многоядерным ароматическим углеводородам. Совместно с Л. Зервасом предложил (1932—1936) способы получения исходных производных аминокислот, в частности способ создания К-карбоксипроизводных. Провел цикл исследований, посвященных протеолитическим ферментам и положенных в основу современной классификации последних. Открыл (1934) реакцию определения С-концевой аминокислоты в пептидах через соответствующие альдегиды, полученные превращением пептида в азид, затем в карбобенз-оксипроизводное с последующими гидрированием и гидролизом (карбобензокси-метод, или реакция Бергманна). Издал труды Э. Г. Фи- [c.50]

Действие фенилизотиоцианата на пептиды с образованием производного тиомочевины и его последующая циклизация при действии хлористого водорода в нитрометане с отщеплением Ы-концевой аминокислоты в виде фенилтиогидан- [c.496]

Способы получения более сложных циклопептидов. Сложные циклопептиды получаются значительно труднее, чем циклодипептиды. Наиболее распространенный способ их получения состоит в обработке циклизуемого пептида дициклогексилкар-бодиимидом (см. стр. 804). При этом одновременно протекают Две конкурирующие реакции—циклизация пептида [c.808]

Однако определенные несимметричные ангидриды типа R 00Y [прц V = Р СО, Р КСО, Р ЗОг, (Р 0)2Р0] находят применение (особенно при получении пептидов [19,20]), так как высокая электронная плотность V направляет реакцию по карбонильной группе, удаленной от заместителя У. В синтезах используют также смешанный ангидрид, получаемый из уксусного ангидрида и муравьиной кислоты этот ангидрид избирательно взаимодействует с аминами по формильному углероду, с образованием формамидов [21]. Этот реагент используется также для формилирования аминогруппы аминокислот перед пептидным синтезом [19,, 22]. Циклические ангидриды, такие как фталевый или янтарный, также реагируют с аммиаком или аминами [4, 23, 24], давая после раскрытия кольца моноамид дикарбоновой кислоты (амидовую кислоту) схема (7), стадия (а) . Для выделения амидовой кислоты необходимо тщательно контролировать условия во избежание циклизации в имид схема (7), стадия (б) . И действительно, эта реакция является одним из главных методов синтеза имидов (см. разд. 9.9.1.8). [c.393]

И. Л. Кнунянц положил начало химии меркаптоаминокислот и разработал новые методы синтеза серусодержащих пептидов. В 1968— 1974 гг. он совместно с сотрудниками осуществил синтез и изучил свойства нятичленных ненасыщенных циклических дисульфидов, в частности 1,2-дитиолан-З-онов, образующихся внутримолекулярной циклизацией р-моногидродитиокарбоновых кислот. [c.93]

Смотреть страницы где упоминается термин ФТК-пептиды циклизация: [c.203] [c.203] [c.241] [c.288] [c.467] [c.468] [c.155] [c.155] [c.203] [c.206] [c.268] [c.231] [c.266] [c.301] [c.385] [c.703] [c.529] [c.529] [c.153] [c.365] [c.404] [c.84] [c.808] [c.203]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология