Основания азотистые модифицированны

Вставка - появление среди азотистых оснований лишних , часто модифицированных, необычных оснований (примером является вставка димера тимина или циклического реагента - акридина). [c.53]

Титрование гетероциклических азотистых оснований. Пиридин — слабое основание (/( = 1,4-Ю ), и он не оттитровывается в водной среде, его легко удается определить титрованием в диоксане в присутствии модифицированного метилового оранжевого. При титровании выпадает белый осадок перхлората пиридиния. Этот осадок не мешает определению и даже способствует резкости конечной точки титрования, эффективно удаляя ион пиридиния из раствора. [c.419]

Репарация химически модифицированных азотистых оснований [c.454]

Схема 5. Взаимодействие модифицированной ДНК с азотистыми основаниями. [c.582]

Глифталевые и пентафталевые алкиды с малым значением степени иоликонденсации и повышенным содержанием свободных функциональных групп (—СООН и —ОН) способны образовывать мицеллярные водные растворы или лиофильные дисперсии. Растворимость их в воде заметно улучшается и раствор приближается к молекулярному в результате нейтрализации карбоксильных групп (для чего обычно используют летучие азотистые основания), а также при добавлении смешивающихся с водой органических растворителей (спиртов, этилцеллозольва, диоксана и др.). Это обычно тощие и средние алкиды, модифицированные высыхающими маслами или дегидратированным касторовым маслом. [c.217]

При анализе водного экстракта или водного слоя оксидата онределение ведут но модифицированному методу Понндорфа основанному на этерификации циклогексанола азотистой кислотой и окислении образовавшегося эфира раствором перманганата калия. [c.43]

Наблюдавшийся в конце XX в. быстрый прогресс в различных областях молекулярной биологии во многом обусловлен появлением эффективных методов определения первичной структуры ДНК. К таким методам относится селективная химическая модификация различных типов азотистых оснований в составе ДНК с последующим расщеплением меж-нуклеотидных связей в модифицированных звеньях. Реакции селективной модификации по каждому типу азотистых оснований проводятся таким образом, чтобы в каждой молекуле ДНК в среднем модифицировалось только одно звено данного типа. Поскольку все звенья данного типа в составе молекулы эквивалентны и реагируют с модифицирующим агентом с одинаковыми скоростями, то в итоге каждое звено этого типа окажется частично модифицированным. Дальнейшая обработка ДНК вторичным амином или щелочью приводит к отщеплению модифицированных азотистых оснований от цепи ДНК и разрыву полинуклеотидной цепи в местах отщепления гетероциклов. Все перечисленные операции схематично представлены на рис. 8.3. [c.272]

Второй, разработанный А. Максамом и В. Гильбертом, сводится к химической модификации пуриновых и пиримидиновых оснований в ДНК или ее фрагментах, избирательном расщеплении фосфодиэфирных связей по месту модифицированных оснований, разделении продуктов расщепления электрофорезом в полиакриламидном геле и прямому считыванию структуры фрагмента ДНК с полученных электрофореграмм (число полос на электрофоре-грамме продуктов расщепления фрагмента ДНК с модифицированным азотистым основанием равно числу нуклеотидных остатков, содержащих этот пурин или пиримидин, а их положение на электрофореграмме указывает место этого нуклеотидного остатка в анализируемом фрагменте ДНК). [c.203]

К настоящему времени выяснено, что ДНК несет в себе тот генетический рецепт, на основе которого в ряде последовательных клеточных делений образуются идентичные клетки. В процессе воспроизведения ДНК воспроизводится информация, необходимая для синтеза специфических ферментов и других клеточных белков. Генетическая информация, содержащаяся в ДНК, заключена в последовательности четырех типов оснований (А, Т, Г, и Ц) вдоль фосфатноуглеводного остова (т. е. последовательности расположения четырех типов нуклеотидов, из которых построена ДНК). Таким образом, последовательность А—Г—Ц в каком-либо участке цепи несет иную информацию, чем последовательность Г—А—Ц. Последовательность оснований в ДНК может быть модифицирована химически путем обработки ДНК in vitro (вне клетки) или in vivo (внутри клетки) азотистой кислотой, под действием которой первичные аминогруппы аденина, цитозина и гуанина превращаются в группу ОН. Результатом этого оказывается изменение генетического кода, поскольку модифицированная таким образом ДНК вызывает мутации в организме, из которого она первоначально была получена. Резкие изменения могут произойти в тех случаях, когда ДНК бактериофага (который весь состоит из нити ДНК, заключенной в белковую оболочку) вводится в бактериальную клетку. Фаговая ДНК действует в качестве затравки и вызывает в бактериальной клетке синтез новой ДНК и белков по своему образцу , что в конце концов приводит к разрушению клетки, в которую внедрился бактериофаг, и выходу во внешнюю сферу новых фаговых частиц. [c.139]

Взаимодействие модифицированной (апуриновой или апиримидиновой) ДНК с азотистыми основаниями в общем виде можно представить схемой 5 (см. стр. 582). [c.583]

Рис. 2.12. Изменеме во времени степени омылешш пентафталевого олигомера, модифицированного льняным маслом и нейтрализованного различными азотистыми основаниями. (— и---соответственно при эквивалентном и двукратном избытке азотистых оснований)

Г. Е. Фрадкин. После обработки фаговой популяции гидроксиламино.м последний при помощи диализа удалялся из вирусной суспензии. Следовательно, во время облучения гидроксиламин в среде отсутствовал. Предварительная модификация цитозиновых остатков в ДНК фага лямбда, вызываемая гидроксиламином (предположительно образование 4—5-дигидро-4-гидро-ксиламиноцитозина), действительно повышает радиочувствительность фаговой популяции в условиях преобладания непрямого эффекта излучения. Мы полагаем, что механизм повышения радиочувствительности сводится к нарушению специфического процесса комплементарного спаривания азотистых оснований во время репликации фаговой ДНК внутри клетки. В последних рабо тах Брауна, Филипса с соавторами химическими методами установлено, что цитозин, предварительно обработанный гидроксиламином, спаривается не с гуанином, а с аденином. Вследствие этого во вновь образованной ДНК происходят единичные замены гуанина на аденин. До тех пор, пока эти замены не выходят за пределы связанных серий однозначных кодонов, они не сказываются на информационных свойствах ДНК фага. Однако эти единичные замены понижают эффективность механизма, исправляющего ошибки включения, за счет уменьшения резерва однозначны кодонов или, иными словами, за счет уменьшения степени вырожденности структурного кода. Мы не видим большой сложности в этом объяснении, к которому мы сознательно прибегли для освещения возмол<ных молекулярных механизмов, лежащих в основе скрытых повреждений, связанных с тонкими сдвигами в величинах водородных сил в химически модифицированных азотистых основаниях. Как известно, сенсибилизация может обусловливаться уменьшением степени прочности первичной структуры ДНК вследствие лабилизации эфирно-фосфатных связей. Однако при использовании в качестве модифицирующего агента гидроксиламина этот второй механизм отсутствует, так как химическими исслг- [c.173]

Реакция дезаминирования азотистой кислотой лежит в основе общеизвестного метода определения аминогрупп по Ван-Сляйку он описан выше. Если соответствующим образом учитывать ограничения этого стандартного метода и тщательно контролировать условия реакции, то он окажется наиболее удобным способом определения количества свободных аминогрупп в белках. Легче всего реагируют концевые, а-аминогруппы, несколько медленнее—е. -аминогруппы и уже весьма постепенно выделяют азот гуанидинные группы. Тот факт, что количество свободных аминогрупп, определенных по методу Ван-Сляйка, превосходит содержание лизина, рассчитанное на основании аналитических данных, является первым доказательством наличия М-концевых групп в белках. Реакция с азотистой кислотой протекает быстро и количественно она нашла широкое применение для определения степени замещения аминогрупп в модифицированных белках. В последнее время предпочтение стали отдавать нингидринному методу. [c.313]

Для предотвращения таких повреждений существует специальный ре-паративный фермент — урацил-ДДК-гликозидаза, катализирующий гидролиз гликозидной связи между остатками урацила и дезоксирибозы в молекулах ДНК. В результате такого гидролиза в ДНК появляется фрагмент, содержащий дезоксирибозу, лищенную азотистого основания. Затем участки, в состав которых входят такие фрагменты, подвергаются действию специальной эндонуклеазы, которая гидролитически выстригает из цепи ДНК поврежденные фрагменты. На месте модифицированного участка возникает пустотное образование, которое застраивается с помощью фермента ДНК-полимеразы по информации, сохранившейся в неповрежденной цепи, в результате чего исходная структура спирали ДНК полностью восстанавливается. [c.353]

Поскольку полинуклеотидные цепи, составляющие ДНК, образуются за счет соединения в единое целое дезоксирибоз и остатков фосфорной кислоты (формирующих так называемые фосфодиэфирные связи), а также азотистых оснований, то в процессе химического синтеза олигонуклеотидов оказывается возможным в любой из этих трех компонентов вносить определенные изменения. Однако, чтобы с помощью ДНК-синтезатора изготовить модифицированный по тому или иному компоненту олигонуклеотид необходимо предварительно синтезировать содержащий новую группу соответствующий фосфорамидит, называемый синтоном, или просто купить его, так как уже существует немало фирм, занимающихся не только заказным [c.61]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология