Векторная система

Рис. 35. Образование векторной системы (б), соответствующей заданной структуре (а)

Рис. 42. Модельная структура из четырех атомов на ячейку (а) и соответствующая ей векторная система (б)

Рис. 43. Модельная структура с плоскостью зеркального отражения (а) и соответствующая ей векторная система (6)

Чтобы понять, как функционирует векторная система на основе фага X, необходимо рассмотреть молекулярные аспекты литического цикла развития. Инфекционная фаговая частица имеет головку, в которой заключена плотно упакованная ДНК длиной примерно 50 т. п. н., и отросток с отходящими от него тонкими белковыми нитями (фибриллами). Сборка головки и отростка и упаковка ДНК четко скоординированы. ДНК фага - это линейная двухцепочечная молекула длиной 50 т. п. н. с одноцепочечными 5 - хвоста-ми из 12 нуклеотидов. Их называют липкими ( os) концами, поскольку они взаимно комплементарны и могут спариваться друг с другом. После того как фаговая ДНК проходит через отросток и попадает в Е. соИ, os-концы соединяются с образованием кольцевой молекулы. На раннем этапе литического цикла в результате репликации кольцевой молекулы ДНК образуется линейная молекула, состоящая из нескольких сегментов длиной 50 т. п. н. (рис. 4.16, ). Каждый из таких сегментов упаковывается в белковую головку, к последней присоединяется уже собранный отросток и образуется новая фаговая частица (рис. 4.16, . При упаковке молекулы ДНК длиной менее 38 т. п. н. получается неинфекционная фаговая частица, а фрагменты длиной более 52 т. п. н. не умещаются в головку. Сегменты длиной 50 т. п. н. в линейной молекуле ДНК разделены os-сайтами, и именно по этим сайтам разрезается молекула, когда очередной сегмент заполняет головку. Разрезание осуществляет фермент, находящийся у входа в головку. [c.72]

Векторные системы для клонирования очень крупных фрагментов ДНК [c.76]

Как определяют нуклеотидную последовательность клонированной ДНК с помощью векторной системы на основе фага М13 [c.104]

Векторные системы на основе Ti-плазмид [c.377]

Ti-плазмида, включившись в хромосомную ДНК обычным способом, перенесет и свою Т-ДНК, которая теперь не несет генов корончатого галла. Следующим логическим шагом в развитии этой системы стало клонирование чужеродного маркерного гена и гена, интересующего исследователя, в Т-ДНК, чтобы их можно было транспортировать в хромосомную ДНК растения-хозяина. Векторная система на основе Ti-плазмид нашла широкое применение во всем мире. Ее используют для создания трансгенных растений в тысячах лабораторий. [c.383]

Векторная система на основе фага Р1, использующаяся для введения в клетки Е.соИ вектора с крупной вставкой (100-300 т.п.н.) с помощью электропорации. [c.550]

Векторные системы можно конструировать из ДНК, несущих маркер(-ы), с последующим включением их, например, в клетки эукариот, в том числе — млекопитающих [c.197]

Генная инженерия. Плазмиды, органеллы, транспозоны и вирусы как векторные системы. В генноинженерном эксперименте необходимо изолировать конкретный ген, включить его в наследственный аппарат растительной клетки и регенерировать фертильное растение (способное к размножению) с измененным [c.510]

Ti-плазмиды оказались хорошими векторными системами для осуществления генноинженерных экспериментов с растениями, поскольку Т-ДНК этих плазмид обладает достаточно высокой эффективной емкостью (порядка 50 ООО пн чужеродной ДНК могут быть перенесены и встроены с ее помощью в хромосомную ДНК [c.512]

Разработаны векторные системы на основе растительных хло-ропластов и митохондрий, ДНК которых имеют гомологичные области с ядерной ДНК, что облегчает обмен участками между ними при выполнении генноинженерных экспериментов. [c.513]

Преимущества. Цена оборудования гораздо ниже, чем у векторной системы (по крайней мере, для оборудования низшего и среднего класса), возможность изображать сплошные и заштрихованные области, легкость программирования. [c.142]

Симметрия элементарной ячейки кристалла может быть описана одной из 230 пространственных групп. Для описания симметрии функции Патерсона требуются только 24 пространственные группы. Бургер [57 ] дает три теоремы, которые могут быть использованы для вывода пространственной группы векторной системы из пространственной группы основной системы, а также приводит таблицу, в которой для каждой пространственной группы основной системы представлен ее векторный эквивалент. [c.151]

Рассмотрим детали модельной структуры. В кристалле разности -X,, Vj = y — yt, Wj = z — zi являются компонентами вектора, проведенного из гo в s-тый атом ячейки (рис. 112 а). В пространстве модельной структуры они являются координатами /-го атома ячейки (рис. 112 6). Следовательно, этот /-тый атом модели находится в конце межатомного вектора г /, отложенного от начала координат элементарной ячейки модели. Таким путем строится вся модель все межатомные векторы откладываются от общего начала координат и в концах их помещаются атомы . Отсюда названия — пространство межатомных векторов, или коротко векторное пространство , векторная система , — часто применяемые для обозначения рассматриваемого построения. [c.420]

На элементарную ячейку пространства межатомных векторов приходится атомов . Из них N помещается непосредственно в начале координат ячейки они находятся в конце векторов нулевой длины (случай 5 /) остальные Л (Л —1) связаны попарно центром инверсии в начале координат. Это понятно если в структуре кристалла существует вектор соединяющий й атом с 5-ым, то имеется и обратный вектор проведенный из 5-го атома в й. Пространство межатомных векторов всегда обладает центрами инверсии. В полном соответствии с этим структурные амплитуды отражений от векторной системы (т. е. структурные факторы) являются вещественными величинами. [c.421]

Изложение удобно разделить на две последовательные стадии. Первая относится к предельному случаю точечных атомов и соответственно точечной межатомной функции ( векторной системе ) вторая—к реальной электронной плотности и соответственно межатомной функции. [c.481]

Рис. 137. Анализ векторной системы центросимметричной структуры а—смещение произвольного вектора б—смещение вектора, проходящего через центр инверсии структуры

Поскольку выделенные на первом этапе основная и инверсированная структуры смещены друг относительно друга, будут смещены и соответствующие им элементы симметрии. Это позволяет разделить отобранные максимумы на две группы, внутри каждой из которых действуют одни и те же операции симметрии, но между которыми симметрической связи нет. На рис. 138 в качестве примера рассмотрена векторная система группы атомов, связанных плоскостью симметрии первый этап анализа системы проведен на основе сопряжения в середине некоторого радиус-вектора, второй—на основе свойств симметрии структуры (рис. 138 б). [c.485]

Обычно фитовирусы реплицируются с образованием большого числа копий молекул нуклеиновых кислот — 10 и более молекул на зараженную клетку. Например, при репликации вируса табачной мозаики образуется 10 молекул нуклеиновых кислот (РНК) на клетку. Поэтому фргговирусы представляют собой очень эффективные средства для получения хорошей экспрессии чужеродного гена. Кроме высокой копийности вирусной нуклеиновой кислоты вирусные векторные системы имеют еще ряд преимуществ малый размер генома (возможность легкой манипуляции вирусной ДНК) и сильные промоторы, обеспечивающие эффективную экспрессию чужеродных генов. [c.148]

Векторные системы, способные интегрировать крупные вставки (>100 т. п. н.), имеют большую ценность при анализе сложных эукариотических геномов. Без таких векторов не обойтись, например, при картировании генома человека или при идентификации отдельных генов. В отличие от библиотек с небольшими вставками, в геномной библиотеке с крупными вставками скорее всего будет представлен весь генетический материал организма. Кроме того, в этом случае уменьшается число клонов, которые нужно поддерживать, и увеличивается вероятность того, что каждый из генов будет присутствовать в своем клоне. Для клонирования фрагментов ДНК размером от 100 до 300 т. п. н. был сконструирован низкокопийный плазмидный вектор на основе бактериофага Р1 — химерная конструкция, называемая искусственной хромосомой на основе фага Р1. Был создан также очень стабильный вектор, способный интегрировать вставки длиной от 150 до 300 т. п. н., на основе Р-плазмиды (F-фактора, или фактора фертильности) Е. соИ, которая представлена в клетке одной или двумя копиями, с селекционной системой la Z векторов pU . Эта конструк- [c.76]

Слияние белков программируется на уровне ДНК лигированием кодирующих участков соответствующих генов. В самом простом виде векторная система слияния предусматривает включение гена-мишени или его сегмента в кодирующий участок клонированного гена-хо-зяина. Очень важно, чтобы РНК, транскрибируемая с клонированного гена-мишени, имела правильную нуклеотидную последовательность, [c.112]

Если вектор представляет собой плазмиду, реплицирующуюся независимо от хромосомы, то он должен содержать сайт инициации репликации, функционирующий в хозяйской клетке. Если же вектор предназначен для встраивания в хозяйскую хромосомную ДНК, то для обеспечения рекомбинации он должен нести последовательность, комплементарную определенному участку хромосомной ДНК хозяина (хромосомный сайт интеграции). Поскольку технически многие операции с рекомбинантными ДНК сложнее проводить в клетках эукариот, чем прокариот, большинство эукариотических векторов сконструированы как челночные. Другими словами, эти векторы несут два типа сайтов инициации трансляции и два типа селективных маркерных генов, одни из которых функционируют в Es heri hia oli, а другие — в эукариотических хозяйских клетках. Такие векторные системы экспрессии разработаны для дрожжей, насекомых и клеток млекопитающих. [c.136]

Опишите основные свойства интегративной векторной системы Р. pastoris, обладающей высоким уровнем экспрессии. [c.156]

Для получения трансгенных растений необходима эффективная векторная система. Первые попытки создания таких систем основывались на использовании Ti-плазмиды почвенной бактерии А. tumefa iens, поскольку после инфицирования чувствительных двудольных растений часть Ti-плазмиды (Т-ДНК) встраивается непосредственно в хромосомную ДНК клетки растения-реципиен-та. Однако при инфицировании растений Ti-плазмидой на трансформированных растениях образуется корончатый галл - опухоль, препятствующая нормальному [c.383]

Вирусы растений — как векторы обычно мало пригодны из-за своей патогенности для растительных организмов и неспособности встраиваться в хромосомы хозяйской эукариотической клетки В настоящее время наметились подходы к изучению и оценке трех векторных систем двухцепочечной ДНК вируса мозаики цветной капусты, одноцепочечной РНК вируса погремковости табака, одноцепочечной ДНК вируса золотистой мозаики фасоли Из них лишь первая оставляет надежды на дальнейшее продвижение этой системы в сторону практической реализации пока в лабораторных условиях Не исключается возможность объединения ДНК вируса мозаики цветной капусты с Т-ДНК Ti-плазмиды из Agroba tenmn и расширить крзт растений — реципиентов такой векторной системы [c.197]

До сих пор признают, что векторная система на основе цитоплазматического вируса мозаики цветной калусты (содержит двухцепочечную ДНК) оказывается наиболее приемлемой в генноинженерных экспериментах с растениями, хотя многое здесь остается неизученным (например, молекулярные механизмы проявления симптомов заболевания растения-хозяина от поражения вирусом, неопределенность диалазона растений-хозяев и возможность его расширения, неспособность векторной системы встраиваться в геном хозяина, и др.). [c.514]

Для того чтобы решить, какую часть рассчитать, нужно рассмотреть симметрию векторной системы. В случае пространственной группы 222 система векторов имеет симметрию Сттт. Если рассчитать функцию Патерсона для объема, ограниченного величинами следующих отрезков на ребрах векторной ячейки [/ от О до [c.160]

Рис. 136. Анализ векторной системы при помощи смещений фрагмента структуры а—построение векторной системы б—смещения вектора в—использование свойства псевдоинверсии г и 3—смещения треугольника

Рис. 138. Использование симметрии при анализг векторной системы

Справочник химика 21

Химия и химическая технология