РНК вирусная конформация

Конформация пептида должна быть такой же, как у эпитопа в интактной вирусной частице. [c.233]

В некоторых случаях в качестве живых вакцин можно использовать генетически модифицированные (рекомбинантные) микроорганизмы (бактерии или вирусы). Такие вакцины содержат либо непатогенные микроорганизмы, синтезирующие антигенные детерминанты определенного патогенного агента, либо штаммы патогенных микроорганизмов, у которых модифицированы или делетированы гены вирулентности. В этих случаях основные антигенные детерминанты являются составными компонентами бактериальных или вирусных частиц и имеют такую же конформацию, какую они принимают в болезнетворном микроорганизме. Изолированный же антиген часто утрачивает исходную конформацию и вызывает лишь слабый иммунный ответ. [c.234]

В биологических системах конформация РНК часто определяется конформацией ассоциированного с ней белка. Например, свободный белок вируса табачной мозаики (ВТМ), взятый отдельно от РНК, сам образует структуру с характерной для вируса формой. Если же отделить РНК вируса от белковой части, то РНК не образует той структуры, которой она обладает внутри вирусной частицы. [c.339]

Выделение вирусных белков сопряжено с разрывом множества связей, соединяющих белковые субъединицы друг с другом и с РНК, но, поскольку это связи того же типа, что и связи, обеспечивающие конформацию самих субъединиц, все вирусные белки в процессе выделения в той или иной степени денатурируют. Однако хорошо известно, что нативная конформация белков определяется их аминокислотной последовательностью, а денатурированные белки способны к самопроизвольному восстановлению своей нативной конформации, если для этого созданы подходящие условия [7]. Точно так же вновь синтезированные пептидные цепи автоматически сворачиваются в присущую им нативную конформацию (см. гл. IX, разд. Б). [c.216]

Рибосомные белки большинства животных представлены в осн. умеренно основными полипептидами, хотя имеется неск. нейтральных и кислых белков. Мол. м. рибосомных белков варьирует от 6 тыс. до 60 тыс. В прокариотической Р. малая субчастица (30S) содержит ок. 20, большая (50S)-ok. 30 разл. белков в эукариотической Р. 40S субчастица включает ок. 30 белков, а 60S-ок. 40 (обычно Р. не содержат двух или неск. одинаковых белков). 1 ибосомиые белки характеризуются глобулярной компактной конформацией с развитой вторичной и третичной структурой они занимают преим. периферич. положение в ядре, состоящем из рРНК. В отличие от вирусных нуклеопротеидов в структурно асим. [c.264]

Как мы уже отмечали, субъединицы оболочек икосаэдрических вирусов и некоторых ферментов могут быть квазиэквивалентньши. Эта особенность ответственна за спирализацию жгутиков бактерий, она же лежит в основе некоторых интересных структурных особенностей вируса табачной мозаики. Белковые субъединицы вируса могут быть уложены либо в спираль с числом субъединиц на один виток, равным 16,3 (рис. 4-7), либо в плоские кольца из 17 субъединиц каждое [36а]. При этом конформационные различия очень малы. Кольца способны диме-ризоваться, однако крупных агрегатов они не образуют. Удивительно, что димерные кольца не обладают диэдрической симметрией. Все субъединицы в них ориентированы одинаково, но находятся в двух разных конформациях. Есть предположение, что такие диски являются промежуточной структурой при сборке вирусной частицы. Согласно рентгеноструктурным данным, внутренние участки нвазиэквивалентных субъединиц диска играют роль своего рода ловушек, ожидающих момента, когда в состав вируса включится РНК. После этого диски меняют конформацию и образуют завиток , инициируя рост спиральных вирусных частиц [36а]. Эти и многие другие интересные данные позволили предположить, что квазиэквивалентность белковых субъединиц в сочетании с их способностью менять свою конформацию лежит в основе многих биологических явлений. [c.295]

Конформация РНК значительно менее определенна. Известно, что вирусная РНК может существовать либо в форме двойной спирали, либо как однониточная форма. Информационная РНК существует в форме одной нити. Нативная рибосомная РНК связана с белком, как уже указывалось на с. 400. Обе эти РНК, по-видимому, имеют свернутые структуры, в которых основания в некоторой степени связаны стекинг-взаимодействием (см. разд. 15.3 и 15.6). Конформация тРНК была объектом многих исследований [c.403]

Хотя РНК иногда и обнаруживается в виде двухспиральных ДНК-но-добных структур, эта конформация встречается редко и только у вирусных РНК [45]. В большинстве своем РНК имеют одиоцепочечную моле- [c.265]

Как уже отмечалось, конформация РНК в растворе зависит от ионной силы раствора, температуры и других факторов. Так, в зависимости от условий высокополимерная РНК может существовать в виде трех крайних конформаций — компактного клубка, палочки и развернутой нити. Эти структурные формы РНК обратимы (рис. 54). При низкой ионной силе раствора и комнатной температуре молекула РНК имеет форму асимметрической компактной палочки, построенной из располон енных в параллельных плоскостях спиральных участков с диаметром 400 А для вирусной РНК и 200 А — для рРНК кишечной палочки (рис. 54, а). При увеличении ионной силы раствора, когда возрастает степень экранирования заряженных фосфатных групп и, следовательно, уменьшается электростатическое отталкивание, компактные палочки становятся менее асимметричными и переходят в состояние, напоминающее компактные клубки (рис. 54, б). При повышении температуры раствора, уменьшении ионной силы ниже 10" (обессоленные растворы), действии кислот, щелочей, формамида и других реа1ентов происходит разрыв дополнительных связен. Полинуклеотидная цепь РНК разворачивается, приобретая форму распрямленных нитей или рыхлых беспорядочных клубков (рис. 54, в). При на1ревании разворачивание цепи РНК происходит независимо от величины ионной силы раствора. [c.432]

Денатурация белков — процесс обычно обратимый. Однако разные белки очень сильно различаются по своей способности к восстановлению исходной конформации после удаления денатуранта. В связи с тем, что конкурентные реакции неспецифической агрегации белков обычно вызывают образование нерастворимых осадков, сдвигая равновесие в растворе, многие белки с трудом поддаются ренатурацни. Следовательно, диссоциацию вирусных белков следует проводить таким образом, чтобы свести сопутствующий ей процесс денатурации к минимуму. [c.49]

В состав болыпинства вирусных белков входят, по-видимому, остатки цистеипа, —8Н-группы которых оказывают определенное влияние па конформацию и взаимодействие белковых субъединиц. В связи с этим обработка различных вирусов ртутьорганическими соединениями — веществами, обладающими высоким сродством к — ЗН-группам,— может вызвать самые различные последствия. [c.53]

Вирусная оболочка (или капсид) построена в общих чертах из относительно небольших белковых молекул, имеющих правильную форму и способных поэтому собираться в устойчивые оболочки определенных размеров. Процесс этот осуществляется за счет образования водородных связей, ионных и гидрофобных взаимодействий, а не обычных химических связей. Структурные особенности вирусных белков, обусловливающие такое высокое специфическое связывание идентичных, а иногда и неидентичных молекул, по-видимому, не менее сложны, чем у ферлюнтов или ряда других белков, таких, как авидин или антитела [357], связывающихся со своими субстратами и другими малыми или большими молекулами с высокой степенью сродства и специфичности. Эта способность к специфическому связыванию обусловлена специфической конформацией белка, которая в свою очередь определяется последовательностью образующих белки аминокислот. Именно по этой причине выяснение аминокислотной последовательности вирусных белков и представляет громадный интерес. Работа по изучению вирусных белков проводилась в целом ряде лабораторий на множестве различных вирусов. Первичная структура вирусных белков представляет интерес не только потому, что с ней связана функциональная активность белков, [c.63]

Опираясь на всю сумму имеющихся химических, иммунологических. электрофоретических и энзидюлогических данных [135], относящихся к реакционноспособности, а следовательно, и к близости различных групп аминокислот к поверхности, удалось установить приблизительное пространственное расположение ряда участков пептидной цепи ВТМ, как это схематически представлено на фиг. 13. Такой надежный метод конформационного ана.тиза белков, как рассеяние рентгеновских лучей под малыми углами, до недавнего времени применяли только для белков, образующих крупные кристаллы. Однако последние успехи в этой области позволяют надеяться, что картина пространственной конформации белка ВТМ в составе вирусной частицы будет получена в недалеком будущем. [c.78]

Различия в чувствительности к нуклеазам тоже могут быть обусловлены различиями в конформации. РНК фагов QP и I2 имеет более компактную конформацию. Но это происходит, возможно, потому, что еще в известной степени сохраняется то состояние, в котором она находилась в вирусной частице. Об этом свидетельствует тот факт, что обработка ЭДТА, по-видимому, разрушает эту конформацию. [c.108]

По-видимому, близкое к только что рассмотренному и столь же непонятное явление представляет собой следующее наблюдение. РНК фага QP крайне чувствительна к РНК-азе. В опытах in vitro молекула этой РНК распадается на отдельные фрагменты в результате даже незначительного воздействия РНК-азой (0° С, 30 мин, отношение РНК/фермент = 200 ООО). Разрывы имеют специфическую локализацию. Под действием РНК-азы молекула РНК распадается с образованием прежде всего фрагмента (несущего З -конец), на долю которого приходится 68% всей РНК. Остаток насчитывает 32% [29, 30]. Высказывалось предположение, что столь избирательная чувствительность к ферменту обусловлена некоторыми особенностями конформации вирусной РНК. Довольно высокие константы седиментации фаговых нуклеиновых кислот и РНК вируса мозаики костра безостого по сравнению с РНК ВТМ (около 28 и 30S для молекулярных весов i -10 и 2-10 ) наводят на мысль, что нуклеиновые [c.112]

Ацилирующие агенты (уксусный, янтарный или малеи-новый ангидриды, бензоилхлорид и т. п.) издавна применяются в белковой химии, но для модификации нуклеиновых кислот в нейтральных водных растворах они непригодны. Различные реакции ацилирования были недавно использованы для прощупывания конформации белка ВТМ в вирусной частице. Реакция сукцинилирова-ния и легко обратимая реакция малеинирования приводят к замене — КНз-групп на — СОО -группы. В результате белки вирусной обо [очки диссоциируют на субъединицы и растворяются [59, 154, 447]. Ацилироваться, вообще говоря, могут амино-фенольные и тиоловые группы. Но из них, как правило, лишь аминогруппы находятся на поверхности белков, и, таким образом, эти реакции моишо считать аминоспецифичными. Однако в особых случаях весьма легко ацилируются и фенольные и незащищенные ЗН-группы. Так, в ВТМ один из четырех тирозиновых остатков (ближайший к С-концу, № 139) [c.198]

После синтеза и до того момента, когда вирусные гликопротеины начинают собираться в вирионы, происходит ряд модификаций. Во-первых, модифицируются олигосахаридные цепи, причем их модификация зависит от клетки-хозяина [46]. В белке р62 присутствуют три олигосахаридные цепи, а в белке Е1 SIN две (в белке Е1 SFV только одна олигосахаридная цепь). Эти модификации включают отщепление остатков глюкозы и маннозы и добавление галактозы, N-ацетилглюкозами-на, фукозы и сиаловых кислот [47] (рис. 21.5). Вероятно, они влияют на конформацию гликопротеинов и играют важную роль на начальных стадиях сворачивания белка. И хотя эти изменения могут облегчать транспорт через органеллы, они не необходимы для этого процесса [30], Во-вторых, происходит протеолитическое расщепление гликопротеина р62 с образованием ЕЗ и Е2. Оно осуществляется трипсиноподобной активностью, расщепляющей по связи агринин — серии. В SFV домен ЕЗ остается связанным с гликопротеиновым комплексом, тогда как в SIN он теряется [37]. В-третьих, описаны два типа аци-лирования этих белков. Один состоит в ацетилировании N-концевой аминокислоты р62 [3] второй включает присоединение остатков длинноцепочечных жирных кислот [75], вероятно, в количестве от одного до двух на Е1 и от трех до шести на [c.355]

К тому моменту, когда молекула НА в ходе вирусного биогенеза достигает поверхности зараженной клетки, она приобретает нужную конформацию, модифицируется всеми необходимыми олигосахаридными остатками и вместе с двумя другими мономерами формирует тример. При этом протеолитическое расщепление, приводящее к отделению НА1 от НА2, происходит вне клетки и осуществляется трипсиноподобными ферментами [43]. Эти протеазы в изобилии обнаруживаются в межклеточном пространстве дыхательных путей, в которых и реплицируется вирус гриппа. Их очень много как в куриных эмбрионах, так и в культуре клеток птиц. Однако вирус гриппа А может размно- [c.457]

Все ранее изложенные экспериментальные результаты, касались гидролиза двухспиральных ДНК. Однако, в середине 70-х годов появились сообщения [85, 86], что некоторые рестриктазы (Нае П1, Sia I и Hha I) специфически расщепляют однонитевую ДНК бактериофагов М13 и ФХ174. С целью объяснения этих экспериментальных результатов, авторы [85] предположили, что вирусная ДНК находится в конформации, в которой ее нити частично перекрываются, образуя дуплексы как раз в районе участка расщепляемого этими ферментами. [c.77]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология