Диссоциация и сборка

Разборка рибосомных частиц происходит при их инкубации в условиях повышенной ионной силы и высокой концентрации Вначале процесс сводится лишь к диссоциации рибосомных белков в порядке, обратном наблюдаемому при сборке. Исследования пространственной структуры малой частицы рибосомной РНК с различным содержанием белков методами электронной микроскопии и малоуглового рентгеновского и нейтронного рассеяния убеждают в том, что всего шесть белков из 21, а именно те, которые первыми присоединяются к 16S РНК при сборке, удерживают плотность упаковки и форму полинуклеотидной цепи, свойственные функ- [c.54]

Использование субъединиц для построения больших структур имеет несколько преимуществ 1) для построения большой структуры из многократно повторенных субъединиц меньшего размера требуется меньше генетической информации 2) поскольку субъединицы связаны между собой многими сравнительно слабыми связями, их сборка и диссоциация легко поддаются контролю 3) сборка структуры из субъединиц позволяет сводить к минимуму количество ошибок, так как функционирование специального механизма корректирования в процессе сборки может устранять испорченные субъединицы. [c.150]

Те же силы, которые определяют пространственную структуру белков, ответственны и за образование белковых агрегатов. Белки, имеющие центр связывания, комплементарный их собственной поверхности, могут образовывать димеры, замкнутые кольца, сферические частицы или спиральные полимеры. Смесь множества различных белков, содержащая иногда структурные нуклеиновые кислоты, может самопроизвольно собираться в пробирке в большие сложные структуры. Однако не все клеточные структуры способны к самопроизвольной реконструкции после диссоциации на отдельные компоненты, так как процесс сборки во многих случаях включает необратимые этапы. [c.155]

Такой способ построения больших структур имеет ряд очевидных преимуществ. Во-первых, невалентная агрегация одинаковых субъединиц требует меньше генетической информации, а следовательно, меньше генетического материала. Во-вторых, сборка и диссоциация большой структуры, построенной за счет невалентных взаимодействий, легко поддается контролю. В-третьих, сборка структуры из субъединиц позволяет свести к минимуму количество ошибок, поскольку функционирование специального механизма корректирования в процессе сборки может устранить испорченные субъединицы [169, 170]. [c.410]

Б. Микротрубочки распадаются, когда концентрация тубулина падает ниже критической величины. В этих условиях скорость сборки не равна скорости диссоциации, и микротрубочки постепенно укорачиваются. Наличие прикрепленных микротрубочек делает такое объяснение более вероятным по сравнению с двумя другими изложенными (в вопросе) возможностями. Ни откреплением от центросомы, ни случайным разрывом нельзя объяснить стабильность связанных микротрубочек. [c.486]

Другими словами метод химической сборки позволяет получать простые и сложные твердые вещества как уже известные, так и новые соединения заданного состава и стро(шия, в том числе и такие, которые не могут быть получены другими способами. Его можно использовать для целенаправленного создания новых сорбентов, катализаторов и других материалов, а также покрытий. Мы видим, что прямой синтез твердых тел с- его подчас крайне тял елыми условиями, задаваемыми термодинамикой процесса, может быть заменен ступенчатым, а именно, чередованием в определенной последовательности актов необратимой химической сорбции. Химическая энергия этого экзотермического процесса используется для принудительного размещения структурных единиц в заранее намеченном порядке, т. е. для химической сборки твердого тела. Большим преимуществом данного метода является то, что твердые вещества этим методом можно получать при сравнительно невысоких температурах и давлениях, и, во всяком случае, при температурах и давлениях значительно более низких, чем равновесные в процессе прямого синтеза или диссоциации соответствующего твердого тела. [c.213]

Гистоны проявляют высокую специфичность при взаимодействии друг с другом. При смешивании в растворе наиболее специфичные комплексы возникают при взаимодействии гистонов НЗ и Н4 с образованием тетрамеров, состоящих из двух молекул каждого из этих гистонов. Гистоны Н2А и Н2В при взаимодействии образуют высокоспецифичные димеры. При повышении концентрации соли нуклеосомы диссоциируют сначала происходит отщепление одного димера Н2А-Н2В, затем второго такого димера и в последнюю очередь диссоциация от ДНК гистонового тетрамера (НЗ—Н4)з. При понижении ионной силы порядок реассоциации обратный и в конце образуется реконструированная нуклеосома. Реконструкция нуклеосом облегчается в присутствии полианионов, в частности белков, содержащих много сгруппированных в одном месте кислых аминокислот. Реконструкцию нуклеосомы можно проводить не только из ДНК и отдельно взятых димеров и тетрамеров, но также из ДНК и свободных гистонов. Очевидно, структура нуклеосомы в значительной степени определяется гистон-гистоновыми взаимодействиями и структурой гистонового октамера. Так, гистоновый октамер, реконструированный при высокой концентрации соли из гистонов в отсутствии ДНК, по многим свойствам сходен с октамером в составе нуклеосомы. Сборка гистонового октамера происходит за счет взаимодействий центральных гидрофобных сегментов молекул гистонов между собой. Удаление Ы-концевых участков гистонов с помощью мягкой обработки трипсином не препятствует сборке октамера и даже образованию нуклеосом. [c.241]

Участие посторонних белков в сборке, как оказалось, не соответствует традиционному представлению о наличии прямой аналогии между механизмами свертывания полипептидных цепей в искусственных условиях и клетке. Ставшие известными функции молекулярных шаперонов потребовали определенной коррекции давно сформулированного и многократно подтвержденного в опытах in vitro принципа не нуждающейся в каких-либо посредниках самосборки белка. Выяснилось, что это не совсем так. Более того, оказалось, что в сложных клеточных условиях нужны белки, ассистирующие не только котрансляционное и посттрансляционное свертывание полипептидных цепей, но и помогающие транспорту белковых молекул через мембраны, реорганизации, диссоциации и ассоциации белков в олигомерные комплексы, сборке олигомеров внутри органелл и ликвидации белковых повреждений, вызванных стрессовыми и иными внешними воздействиями. [c.420]

Указанное свойство лидерных пептидов должно приводить к замедлению их сборки при дефиците соответствующей аминокислоты. Пред1К)лагается, что в этом случае торможение движения рибосомы по растущей цепи мРНК предотвращает образование такой вторичной структуры мРИК, которая способствовала бы диссоциации РНКП от матрицы ДНК- [c.36]

На диссоциацию и сборку олигомерного белка может оказывать влияние pH среды, и этот фактор может быть причиной получения недостаточно четких данных. Замечено [171], что в некоторых случаях конформация мономера может в такой стспе1ш зависеть от pH среды, что реакция со сшивающими агентами вообще не идет. [c.57]

Гибридизация гемоглобина [178]. Смесь гемоглобина 5 и радиоактивно меченного гемоглобина Л (1 1) с целью диссоциации на а- и р-цепи диализуют при 3 X в течение 48 ч против 0,1 М натрийацетатного буфера (pH 5). Сборку проводят путем повторного диализа против дистиллированной воды в течение 24 ч. Хроматографическим путем получают радиоактивно меченный гемоглобин 5— гибридный белок, образованный в результате обмена а-це-пями гемоглобина А и 5. [c.58]

Идентифицируя продукты диссоциации, можно определить соотношение мономеров в олигомере. Существенное значение может иметь pH среды. Например, агглютинин проростков пшеницы и его сукцинилпроизводное при рН>5 — димеры, но диссоциируют при рН< 5, [122]. Зависимость четвертичной структуры от pH определяет условия сборки и реконструкции белка. Гемоцианин, агрегат из 8 гексамеров, диссоциирует на мономеры и димеры при pH 8,9 (в присутствии ЭДТА для связывания Са2+). Напротив, при изменении ионной силы, pH и концентрации Са + гемоцианин диссоциирует с образованием комплексов гексамера промежуточного размера [20]. [c.59]

Для отдельных олигомеров существенное значение могут иметь параметры среды, например величина pH, После диссоциации фумаразы в мочевине [186] и диализа против воды не происходит сборки активного тетрамера, однако реконструкция удается при диализе против буфера в отсутствие мочевины (разд. 1.4,4.1). Первоначально образующийся продукт обладает частичной активностью и является в основном димером, хотя данные флуоресценции и кругового дихроизма совпадают с соответствующими параметрами нативного тетрамера. [c.59]

Чтобы обойти эту трудность, нативный с г -элемент был обработан янтарным ангидридом в надежде на то, что таким образом будет защищен важный остаток лизина. Метод оказался удачным, и выделенные таким образом г -субъедииицы оказались способными к реассоциации. Однако в условиях, в которых проходила сборка, все еще наблюдалась некоторая диссоциация г - и Г2-субъединиц. Поэтому, если они инкубируются вместе до добавления сз-субъединиц, картина электрофоретического разделения гибридов АТСазы будет размазанной, она будет представлять собой семь неразрещаемых полос. Если же вместо этого быстро смещать между собой 1 -, Г2- и сз-субъединицы, реассоциирован-ный фермент проявится в виде четырех дискретных электрофоретических полос. Им соответствуют соединения с г , с г г , с Г2г и с г . Это указывает на то, что Г2-элементы сохраняют свою индивидуальность в нативном ферменте,-и субъединичный состав последнего можно записать в виде (Сз)2(г2)з (рис. 2.48,В). Доказательством того, что два мономера в каждом Г2-элементе контактируют между собой в нативной структуре, может [c.137]

У примитивных эукариот ядерная оболочка во время митоза не распадается (Lima-de-Faria, 1983). Непременная диссоциация клеточного ядра—эволюционно более позднее явление. В приобретаемой ядром способности к диссоциации и к обратной сборке, быть может, кроется прямое указание на процесс его первоначального формирования. Ядро возникает одноактно путем самосборки части эндоплазматического ретикулума в сферическую структуру. Вот почему у него нет явных предшественников. С точки зрения эволюции органелл и клетки это быстрое образование путем самосборки имеет большое значение. Оно показывает, что на уровне клеточной организации многоступенчатые процессы не обязательны — могут происходить и скачкообразные события. Соответственно и управляют ими только такие простые химические реакции, как фос-форилирование, участвующее в самосборке внутренней ядер-ной мембраны. [c.215]

Что касается терминации трансляции, то специальные механизмы регуляции в этом случае не обнаружены (если не считать облигатной зависимости процесса от СТР). Однако необходимо отметить возможность проскакивания рибосомы через некоторые слабые терминирующие кодоны (например, иСА), что, с одной стороны, позволяет рибосоме транслировать полицистрон-ные матрицы без диссоциации от иРНК, а с другой — обеспечивает образование небольшого количества более длинных полипептидов, могущих выполнять важную функциональную роль (например, при сборке фага Ор). [c.90]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология