Нуклеозиды синтез

Для синтеза таких олигонуклеотидов используют два метода. Одни из них, так называемый фосфодиэфирный , основан на конденсации нуклеотида (I) с защищенной гидроксильной группой с нуклеозидом [c.366]

СИНТЕЗ одного НУКЛЕОЗИДА ИЗ ДРУГОГО. Взаимопревращение нуклеозидов может происходить в результате изменения либо углеводного остатка, либо основания, а иногда и их обоих. В приведенных ниже примерах показана наиболее часто применяющаяся модификация основания. [c.478]

СИНТЕЗ НУКЛЕОЗИДОВ, НУКЛЕОТИДОВ И ПОЛИНУКЛЕОТИДОВ [c.420]

СХЕМА и.2. СИНТЕЗ НЕКОТОРЫХ НУКЛЕОЗИДОВ [c.424]

Заметим, что образование фосфодиэфирной связи нельзя сводить к простому взаимодействию хлорфосфата с 5 -гидроксилом нуклеозида. Этот метод редко используется для образования фосфодиэфирной связи, поскольку такие реакции протекают медленнее, а сама методика синтеза сравнительно сложна. Ниже будет обсуждаться более удобная реакция хлорфосфата одного нуклеозида со вторым нуклеозидом. Альтернативный подход заключается в образовании фосфодиэфирной связи путем активации in situ нуклеотидов копденспрующнм агентом. Некоторые из таких агентов описаны ниже. [c.174]

Использование дихлорфосфитов — одно из последних достижений практического полинуклеотидного синтеза [40, 41]. При этом применяется активированный фосфорилирующий агент и, таким образом, отпадает необходимость в конденсирующем агенте. Однако в качестве фосфорилирующего агента выступает ие фосфат, а фосфит, повышенная реакционная способность которого делает возможным одностадийное превращение in situ нуклеозида O свободной З -гидроксильной группой в фосфомоноэфпр, а затем в фосфодиэфир путем взаимодействия со свободной 5 -гид-роксильной группой второго нуклеозида, и наконец образуется фосфат в результате быстро протекающего окисления иодом. Реакционная способность хлорфосфита так велика, что обе реакции фосфорилирования проводят при пониженной температуре. Вся последовательность операций занимает меньше одного дня (а время имеет большое значение при синтезе длинных полинуклеотидов). Ниже приведена схема одностадийного синтеза защищенного тимидилил- (3 50-тимидина. о [c.178]

Гилберта — Джонсона метод нуклеозидов синтез 10, 80—84 Гилберта — Джонсона метод, обзор [571] [c.49]

Пуриновые и пиримидиновые основания сильно поглощают в ультрафиолетовой области спектра благодаря наличию я-электронов, Ятах 260 нм (6260 нм 10 ) ДЛЯ ббЛКОБ 1тах 280 НМ. Положение максимума поглощения зависит от структуры основания (отсюда следует, что и от pH раствора, поскольку с изменением pH преобладают различные таутомерные формы), от введения в гетероциклическое ядро заместителей, но незначительно— от структуры сахарного остатка. Такие свойства полезно знать при синтезе пуриновых и пиримидиновых производных, так как их можно характеризовать соответствующими максимумами поглощения в ультрафиолетовых спектрах, а при хроматографическом определении также идентифицировать по поглощению в ультрафиолетовой области, например для Ы-бензоилгуано-зина (синтезируемого бензоилированием основания и сахарного остатка нуклеозида бензоилхлоридом в пиридине с последующим удалением бензоильных групп с сахарного остатка гидроксидом натрия) [c.113]

ЛАБОРАТОРНЫЕ СИНТЕЗЫ НУКЛЕОЗИДОВ [c.475]

Для синтеза нуклеозидмонофосфатов были изучены и другие дихлорфосфаты. 2,2,2-Трихлорэтил-2-хлорфенилхлорфосфат нашел, по-видимому, наиболее широкое применение для синтеза нуклеозид-З -фосфатов. При проведении фосфорилирования в пн- [c.172]

Такое направление реакции мол<но предотвратить, получив пмидазолид пирофосфата и проводя его реакцию с нуклеозид-монофосфатом. Альтернативным путем является гидролиз цикло-карбоната обработкой водным триэтиламином. В настоящее время для синтеза аналогов АТР и GTP, модифицированных по основанию или сахарному остатку, предпочитают использовать именно имидазолидный метод. Один из примеров — синтез [c.137]

Конечно, как и в случае образования пептидной связи, затрачивается определенная энергия, и поэтому необходима активация. Синтез фосфодпэфирной связи был бы невозможен при простом смешивании фосфорной кислоты с соответствующими защищенными нуклеозидами. Наконец (см. ниже), может потребоваться даже блокирование фосфатной группы. Хотя это не строго необходимо (и не применялось в первых нуклеотидных синтезах), такой метод имеет свои преимущества и в настоящее время наиболее распространен. [c.154]

Ацнлирование первичной и вторпчиой гидроксильных групп нуклеозидов чаще всего проводят, обрабатывая нуклеозид ангидридом или хлорангидридом кислоты в пиридине. В зависимости от реакционной способности и условий проведения реакции может также происходить ацилирование экзоциклических аминогрупп, если они присутствуют в гетероциклическом основании (см. выше). Помимо обычных ацильных групп (формильной, ацетильной, бензоильной, хлораце-тильной и т. д.), удаляемых чаще всего в щелочных условиях, предложен ряд ацильных групп, условия удаления которых делают их пригодными для нуклеотидного синтеза. [c.159]

После завершения реакции защитные группы можно удалить в мягких условиях, не затрагивающих фосфодиэфирной связи. На этом основан фосфодиэфирный метод синтеза полинуклеотидов. Продукт реакции — фосфодиэфир со свободной, потенциально уязвимой для воздействия, отрицательно заряженной группой. Далее, с увеличением длины полинуклеотидной цепи число отрицательных зарядов в соединении также будет увеличиваться. Поэтому в зависимости от условий реакции эти потенциально нуклеофильные центры могут участвовать в нежелательных побочных реакциях. Кроме того, такое многозарядное соединение слищком полярно, чтобы можно было проводить его очистку обычными методами органической химии, например с помощью хроматографии на силикагеле. Вместо этого необходимо использовать хроматографию на ионообменных носителях, обладающих меньшей емкостью (например, на ДЭАЭ-целлюлозе). Фосфодиэфирный метод пригоден для получения веществ лишь в небольших количествах. Однако нейтрализация зарядов путем этерифи-кации подходящими защитными группами перед фосфорилирова-нием нуклеозидов устраняет проблемы, упомянутые выше. В этом случае продуктом реакции конденсации является фосфотриэфир. Фосфотриэфирный метод позволяет работать с большими количествами веществ. Ниже описаны некоторые защитные группы, используемые для блокирования фосфата. [c.167]

Синтезы пуриновых и пиримидиновых оснований и нуклеозид-фосфатов могут быть представлены несколькими правдоподобными схемами. Важным исходным веществом был, по-видимому, циа-новодород, термодинамическая устойчивость которого при высоких температурах обеспечивала необходимую концентрацию его в первичной атмосфере. Кальвин указал на обращение знака AG реакции образования H N при 1050 К выше этой температуры AG становится отрицательной, В реакции [c.379]

Синтез проводят путем добавления раствор первого нуклеозида в тетра-гидрофураие к раствору фосфорилирующего агента в лутнднпе, выдерживания смеси в течение короткого времени и затем добавления раствора второго нуклеозида в тетрагидрофуране. Только иосле завершения реакции приступают к окислению, вводя кристаллический иод, растворенный в смеси вода — тетрагидрофуран. Окисление также проходит очень быстро. Конечно, такой порядок добавления реагентов приводит к образованию некоторого количества нежелательных (3 ->-3 )- и (5 5 )-изомеров. Наиример, если две молекулы первого нуклеозида реагируют с хлорофосфитом перед добавлением второго нуклеозида к реакционной смеси, произойдет образование (З З )-изомера.- [c.179]

Представление о строении нуклеиновых кислот нуклеозиды и нуклеотиды. Гетероциклические основания, рибоза (дезоксирибоза) и фосфорная кислота как структурные единицы нуклеиновых кислот. Представление о строении РНК и ДНК. Биологические функции ДНК и РНК. Рибосомальные, информационные и транспортные РНК. Связь между строением и биологическими функциями нуклеиновых кислот. Двойная спираль как модель молекулы ДНК. Роль водородных связей аденин — тимин и гуанин — цитозин в образовании двойной спирали. Правило Ча )-гаффа. Проблема передачи наследственной информации. Вещество, энергия и информация — необходимые компоненты при синтезе белка. Гснетическин код как троичный неперекрывающийся вырожденный код. [c.249]

Стандартность операций в твердофазном синтезе олигонуклеотидов явилась основой для автоматизации процесса. Принцип работы автомата-синтезатора основан на подаче в реактор с помощью насоса (под контролем микропроцессора) защищенных нуклеотидных компонентов реагентов и р-рителей по заданной программе в колонку, содержащую полимерный носитель с закрепленным на нем первым нуклеозидом. После окончания синтеза и отделения полностью защищенного олигонуклеотида от полимерного носителя проводят деблокирование, очистку и анализ синтезир. фрагментов ДНК. Так, с помощью гидрофосфорильного метода [c.300]

Поскольку З -концевым нуклеозидом (—)нити РНК фага является аденозин, можно было бы ожидать, что первым (т. е. 5 -концевым нуклеотидом в (— нпти будет UTP. На самом деле (—)н11ть начинается с GTP, который комплементарен предпослед-не.му остатку в ( )РНК фага Qp (рис. 165). Точно такая же картина Наблюдается и при синтезе (—)нити. Соответственно З -концевые аденознновые остатки как (-г)нити, так и (—)нити появляются в [c.319]

В клетках (как и в пищеварительном канале) нуклеиновые кислоты постоянно подвергаются атаке со стороны различных нуклеаз. Например, существенным фактором в регуляции синтеза белков является разрушение— как правило, довольно быстрое — информационных РНК-Хотя ДНК сама по себе очень устойчива, нуклеазы призваны вырезать поврежденные сегменты из одиночных цепей, что является важной частью процесса репарации ДНК (гл. 15, разд. 3,2). Таким образом, наблюдается активное расщепление полинуклеотидов на мононуклеотиды, гидролизуемые далее фосфатазами до нуклеозидов. Нуклеозиды превращаются в свободные основания под действием нуклеозидфосфорилаз [уравнение (14-52)]. Дальнейший распад цитозина начинается его де- [c.166]

Существуют три основных подхода к синтезу нуклеозидов. Во-первых, нуклеозид можно получить непосредственно из углевода (или его производного) и основания (или его производного) во-вторых, простой N-гликoзид можно превратить в нуклеозид, и, в-третьих, из одного нуклеозида можно синтезировать другой. [c.475]

СИНТЕЗ НУКЛЕОЗИДОВ ПРЯМЫМ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕМ. Нуклеозид можно получить при взаимодействии гликозилгалогенида с алкоксипроизвод-ным основания. Вместо самого основания берут его алкоксипроизводное [c.475]

СИНТЕЗ НУКЛЕОЗИДОВ ИЗ АМИНОСАХАРОВ. Ниже показана конденсация p-этoк и-N-кapбэтoк иaкpилaмидa с 2,3,5-три-0-бензоил-р-ю-рибозиламином, которая после гидролитического отщепления защитных групп дает уридин. Так же как и в предыдущем примере, оксигруппы пентозы здесь ацилированы. [c.477]

Примером агента, который применяется для синтеза нуклеотидов из. нуклеозидов, может служить дибензилхлорфосфат (СвНбСН20)2Р 0)С1. Он реагирует со всеми оксигруппами сахара поэтому для того, чтобы реакция-шла избирательно по 5 -оксигруппе, необходимо защитить 2 - и З -оксигруп-пы, превратив их, например, в кетальные. Чаще всего применяется кеталь ацетона. Пример защиты в общем виде показан ниже. [c.479]

Фундаментальной реакцией в синтезе нуклеозидов является взаи-модействпе галогенпроизводного фураиозы с основанием, действующим в качестве нуклеофила. Гидроксильные группы сахара во время этих операций обычно защищены бензильными, ацетильными или бензоильными группами. Простые эфирные группы можно удалить гидрогеполи-зом, а сложноэфирные группы — взаимодействием с водным основанием или водным аммиаком. Большая часть нриведешшх в данном разделе примеров является производными рибозы или дезоксирибозы. Однако реакции обычпо одинаково применимы также к другим сахарам. [c.421]

Стереохимия введения основания в фуранозный цикл при синтезе нуклеозидов может определяться внутримолекулярным влиянием заместителей в молекуле углевода. Когда в положении 2 фурапозного цикла имеется а-ацилоксизаместитель, основание обычно входит в р-положение [33] [c.423]

Благодаря мягким условиям р-ции, М. р. применяют в синтезе и превращениях прир. соед. (нуклеозидов, углеводов, стероидов, макроцшслов), аминов и аминокислот определенной структуры, для обращения конфигурации исходного спирта. [c.98]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология