Аксиальное отношение

Для сравнения также даны радиусы инерции против молекулярной массы для некоторых типичных глобулярных белков — лизоцима (Lys), миоглобина (Mb) и гемоглобина (НЬ). Наклон прямой этой зависимости составляет 1 / 3, что характерно для гомологичного ряда белков глобулярной компактной формы. (Глобулярная компактная конформация белков вовсе не означает их сферической формы и допускает определенные вариации аксиального отношения эквивалентного эллипсоида вращения) [c.96]

Так как величина х пропорциональна отношению для идеальных кристаллических игл, авторы заключают, что пластическая деформация в интервале X от 8 до 40 действительно изменяет аксиально , отношение указанным образом. [c.234]

Перрин [3] вывел уравнение, связывающее аксиальные отношения вытянутых и сплюснутых эллипсоидов с измеренными коэффициентами трения. При выводе этого уравнения Перрин исходил из предположения, что в условиях эксперимента возможны все ориентации эллипсоидов. Соответствующие уравнения Перрина, [c.133]

В котором величина ///л является функцией аксиального отношения в соответствии с уравнением Перрена, а множитель /л//о учитывает гидратную оболочку частицы. Для определения этого множителя Кремер [5] предложил уравнение, связывающее его с гидратацией макромолекул [c.134]

Модель Эйнштейна послужила основой для вывода уравнений, связывающих вискозиметрические данные с асимметрией молекул. Например, уравнение для палочкообразных частиц, которые рассматривались как жесткие цепочки из шариков, было получено путем соответствующей модификации уравнений Эйнштейна. Наи-боле плодотворный результат был получен Симхой [11] для случайно ориентированных гидродинамически эквивалентных эллипсоидов вращения (с пренебрежимо малым вкладом броуновского вращательного движения, т. е. при большом отношении градиента скорости потока к коэффициенту вращательной диффузии а= G/0). Для вытянутых эллипсоидов, если а и Ф близки к нулю, величина v является функцией аксиального отношения р [c.139]

С фактором формы v и с объемной долей Ф. При этом фактор формы как функция аксиального отношения для каждого данного р известен. Если — объем гидродинамически эквивалентного эллипсоида и концентрация с выражена в г/дл, то выражение (VII. И) можно переписать в форме [c.140]

Следовательно, характеристическую вязкость можно выразить через N (число Авогадро), молекулярную массу М, объем Уэ гидродинамически эквивалентного эллипсоида (соответствующего гидратированной частице) и фактор формы V, протабулированный для разных значений аксиального отношения р (или д). [c.140]

Значения аксиальных отношений эллипсоидов вращения для разных значений фрикционного отношения вычислены Перреном [3]. Вводя новый фактор формы F (известные функции р н д) в уравнение (VII. 16), получаем [c.140]

Значения р как функции аксиального отношения эллипсоидов вращения [6] [c.141]

Этот метод был успешно применен для ряда систем, в том числе для нуклеиновых кислот [7] и / -актина [8]. Как показано в последней работе, увеличение аксиального отношения в 4 раза (от 50 до 200) вызывает изменение вычисленного значения Ь всего лишь от 58 до 66 А, что может служить примером нечувствительности толщины частицы 2Ь к выбранному для расчета значению аксиального отношения а/6. [c.212]

При изменении конформации молекулы происходит одновременное изменение либо асимметрии (аксиального отношения), либо эффективного объема молекулы, либо и того и другого одновременно. Значительные изменения конформации, такие, например, как при денатурации белка, вызывают заметные изменения скорости [c.216]

Вряд ли столь значительные конформационные изменения имеют какие-либо физиологические значения, но для химика они интересны. В аллостерических ферментах, например, аксиальное отношение или эффективный объем изменяются, вероятно, лишь на несколько процентов. В табл. 9 приведены два возможных случая [c.217]

Сравнение чувствительности некоторых параметров макромолекул к изменениям их аксиального отношения и эффективного объема. Рассмотрена гипотетическая частица почти сферической формы диаметром 100 А. Прочерк (—) в таблице означает, что соответствующий параметр изменяется не более чем на 1%, т. е. для всех практических задач остается постоянным [3] [c.217]

Как видно из таблицы, эффекты изменений аксиального отношения alb и объема Уэ различны. Тогда как [c.217]

Используя уравнение (VII. 18), получаем р=3,5. Согласно табл. 3, это отвечает вытянутому эллипсоиду с аксиальным отношением 200 1. Такое отношение, хотя и велико, но возможно. Вычислим теперь эффективный объем такой частицы из уравнений (VII. 12) (определение V) и (VII. 15). Полученное значение Уз = 0,11 мл/г [c.236]

Название Молекулярный вес Форма Аксиальное отношение Изоэлектрическая точка Источник Функция [c.80]

Для граничных условий смачиваемой поверхности можно получить аналитическое выражение зависимости коэффициента трения эллипсоида от аксиального отношения. Эту зависимость удобно представить как отношение коэффициента трения эллипсоида (/) к коэффициенту трения для сферы того же объема (/ .ф). Отношение поступательных коэффициентов трения равно [c.196]

Аксиальное отношение Вытянутый Сплющенный [c.199]

Даже если предположить, что удельный парциальный объем может быть измерен или точно оценен, коэффициент трения в уравнении (10.68) все еще остается функцией трех переменных, а именно аксиального отношения эллипсоида, молекулярной массы и гидратации. В большинстве случаев две величины из трех должны быть измерены независимо, что позволяет вычислить третью. Ранее было показано, что б, можно измерить или оценить с достаточной точностью. Существует много способов определения М, а определив М, можно найти величину/ и отсюда вычислить фактор формы Перрена F. Однако, если заранее неизвестно, является ли частица вытянутой или сплющенной, значение фактора формы не дает непосредственно представления о форме макромолекулы. [c.218]

Если частица не гидратирована, то аксиальное отношение является максимально возможным. В этом случае аксиальное отношение вытянутого и сплющенного эллипсоидов находят из таблицы факторов формы Перрена, используя соотношение [c.218]

Вычислите время релаксации вращения для белка с мол. массой 100 ООО, считая, что парциальный удельный объем равен 0,74 см г , гидратация составляет 0,3 г Н О (г белка) и белок может быть аппроксимирован вытянутым эллипсоидом с аксиальным отношением 8. [Примечание лучше использовать данные рис. 10.11, Б, чем уравнение [c.221]

Аксиальное отношение (ширина/длина) [c.329]

Название Молекулярная масса Форма Аксиальное отношение Изоэлект- рическая точка Источник Функция [c.126]

Здесь парциальный удельный объем и относится к не-сольватированной частице, а пи — масса растворителя с плотностью р, сольватирующего 1 г чистого растворенного вещества. Таким образом, величина, стоящая в скобках, выражает вызванное гидратацией относительное увеличение объема частицы. Показатель степени /з отражает просто связь между объемом и радиусом (и коэффициентом трения). Онкли [4] объединил уравнения Перрина и уравнение (УП.5), учитывающее гидратацию, в виде семейства кривых для различных значений фрикционного отношения. Предположив некоторое вероятное значение для гидратации т и выбрав на графике кривую, отвечающую измеренному фрикционному отношению, можно определить аксиальное отношение для вытянутого или сплюснутого эллипсоида. [c.134]

Метод Шераги — Манделькерна страдает тем недостатком, что зависимость параметра р от аксиального отношения очень мала. Это влечет за собой необходимость очень точного определения всех величин, используемых для вычисления этого параметра. Другая трудность метода заключается в несоответствии степени асимметрии статистических клубков с измеряемой для них величиной Р последняя отвечает аксиальному отношению стержней с р = 15. Прочие недостатки этого метода рассмотрены в работе [16]. Величину Уэ не следует путать с парциальным удельным объемом v. Если их отношение близко к единице, то это свидетельствует о компактности конформации молекулы [17]. Уэльс и Ван Холд [18] проанализировали связь между конформацией и величиной ks, где ks выражает зависимость 1/s от концентрации 1/s = l/s°(l + ks ). Величина этого отношения была определена для большого числа различных белков и некоторых органических полимеров (Крис и Найт [c.143]

По величине аксиального отношения (отношение длины молекулы к ширине) белки делят на глобулярные (аксиальное отношение меньше 10, чаще 3,4 — ферменты, альбумины, глобулины) и фибрил- [c.20]

Большинство биологических молекул не имеют сферической формы. В основном они представляют собой компактные, глобулярные,часто несимметричные твердые частицы. Более реальной моделью для описания формы таких макромолекул является эллипсоид вращения, сплющенный или вытянутый. Эллипсоид того и другого вида является предельным случаем эллипсоида общего вида с тремя различный осями (рис. 10.10). Сш1Ю-щенный эллипсоид имеет дискообразную форму, образованную вращением эллипса вокруг короткой полуоси Ь обе его длинные полуоси одинаковы. Вытянутый эллипсоид имеет стержнеобразную форму, образованную вращением эллипса вокруг длинной полуоси а его короткие полуоси Ь одинаковы. Для эллипсоида любого вида аксиальное отношение определяется как отношение длинной полуоси к короткой (а/Ь). [c.196]

РИС. 10.12. Влияние граничных усповий на вращательные коэффициенты трения. Кривая а соответствует вращению сплющеииого эллипсоида вокруг длинной оси, кривая Ь вращению вытянутого эллипсоида вокруг короткой оси. Результаты представлены в виде зависимости от обратной величины аксиального отнощения Ь/а, что позволяет рассматривать их при бесконечном аксиальном отношении. [Bauer et al., J.Am. hem. So ., 96, 6840 (1974).] [c.200]

Одно и то же значение величины F соответствует многим возможным формам частицы, две из которых являются эллипсоидами вращения. Из табл. 10.2 можно видеть, что неопределенность в описании формы очень велика. В предельном случае, при больших значениях величины F, можно уверенно считать частицу вытянутой, так как дискообразная частица с фактором Перрена, ббльпшм чем 1,5, должна иметь ничтожную величину малой полуоси, что нереально. При очень малых значениях F поступательные коэффихщ-енты трения вытянутого и сплющенного эллипсоидов практически не различаются, хотя, как это видно из рис. 10.9, вытянутый и сплющенный эллипсоиды (оба с аксиальным отношением 2) являются совершенно различными физическими объектами. Естественно, если форма частицы известна заранее, скажем по данным электронной микроскопии, то коэффициент трения позволяет определить либо молекулярную массу, либо гидратацию, если одна из этих величин определена независимо. [c.218]