Диссоциация комплексов фермент — субстрат и фермент— продукт

ТОГО, если данный комплекс важен при катализе, то константы диссоциации, измеренные при изучении связывания, должны приближаться к константам, определенным при изучении начальной скорости реакции в целом, хотя различие в используемых концентрациях белка может вызвать в некоторых случаях трудности при интерпретации. Необходимые константы могут быть получены из изучения начальной скорости для иона металла Ка) и для лиганда, если он является ингибитором Кг). Однако константы диссоциации комплексов фермент — субстрат и фермент — продукт не так легко получить, пока не сделаны допущения относительно скоростьопределяющей стадии реакции и (или) порядка присоединения субстрата (или отщепления продукта). Следовательно, утверждение о кинетической важности таких комплексов, наиболее интересных с точки зрения изучения механизма действия металлоферментов, связано с большими сложностями. [c.450]

Диссоциация комплексов фермент—субстрат и фермент—продукт [c.162]

Таким образом, при изучении множественной атаки возможность повторной ферментативной деструкции субстрата тривиальным способом (в результате диссоциации комплекса фермента с образующимся продуктом и повторная ассоциация с последующей атакой) должна быть полностью исключена. Подобное проведение столь чистого эксперимента было бы возможным лишь при очень сильной зависимости скорости ферментативного гидролиза от степени полимеризации субстрата в широком диапазоне последней. Тогда после первого же расщепления олигомерного субстрата скорость гидролиза должна настолько замедлиться, что реакция фактически остановится. Не исключено, правда, что она остановится и для процесса множественной атаки. [c.79]

Если речь идет о каком-либо функционально значимом узнавании, то образование комплекса не является самоцелью, но лишь сигналом к последуюш,ему действию — ответу системы. Так, узнавание ферментом субстрата приводит к превращению субстрата в продукт реакции, узнавание гормона рецептором — к возникновению определенных внутриклеточных процессов. Чаще всего именно этот ответ и является объектом регистрации. Но в ряде случаев может регистрироваться и само образование комплекса, если, например, используется лиганд, содержащий высокорадиоактивную метку, и комплекс может быть отделен от избытка лиганда за время, исключающее заметную диссоциацию комплекса. Если же измеряется какой-либо химический или биологический ответ на узнавание, то резонно предполагать, что по крайней мере в первом приближении величина, характеризующая этот ответ (например, скорость ферментативной реакции), пропорциональна количеству образовавшегося комплекса. [c.118]

Подход к измерению константы продукта может быть двояким. Продукт реакции вводится заранее в систему фермент — субстрат, после чего измеряется зависимость начальной стационарной скорости реакции в ряду концентраций субстрата и продукта. Этот способ фактически ничем не отличается от способа исследования обычных обратимых ингибиторов. Он позволяет выяснить характер ингибирующего действия продукта реакции, т. е. установить, является ли он конкурентным, неконкурентным или смешанным, и измерить константу диссоциации комплекса фермент -г- продукт. [c.99]

НО отмечалось, что максимальная скорость многих ферментативных реакций, наблюдающаяся при насыщающей концентрации субстрата, а не только кажущаяся величина Кт, зависит от pH. Это заставило предположить, что концентрация ионов водорода определяет не только ионизацию свободного фермента, но также кислотно-основную диссоциацию фермент-субстратного комплекса, причем этот последний процесс влияет на концентрацию активного комплекса Михаэлиса и образование продуктов реакции. [c.109]

Приведем еще один пример. Один из кристаллических промежуточных продуктов пурпурного цвета, выделенный Яги и др. [2—5] в анаэробных условиях из реакционной смеси оксидазы О-аминокислот, представляет собой, по-видимому, истинный фермент-субстратный аддитивный комплекс. Все данные убедительно свидетельствуют о том, что это так. Воздействие на него бензоатом в анаэробных условиях приводит к диссоциации комплекса с выделением субстрата и образованием комп- [c.62]

Самый распространенный тип ингибирования назван конкурентным ингибированием, поскольку наиболее простое объяснение этого типа ингибирования сводится к тому, что ингибитор связывается с тем же самым центром молекулы фермента, что и субстрат, с образованием непродуктивного комплекса. Другими словами, субстрат и ингибитор конкурируют за один и тот же центр связывания и, следовательно, может образоваться только один комплекс фермента с ингибитором — Е1. В простейшем случае конкурентного ингибирования Е1 представляет собой тупиковый комплекс, поскольку распадается он только в результате диссоциации на исходные компоненты (Е Ч- I). Поэтому концентрация комплекса Е1 определяется истинной константой равновесия = [Е1[11/[ЕЦ (см. разд. 3.7), которую называют константой ингибирования. Для многих более сложных типов ингибирования, включая и большинство типов ингибирования продуктом реакции, константу ингибирования нельзя рассматривать как истинную константу равновесия, потому что комплекс фермента с ингибитором не является тупиковым . [c.80]

Так как одновременно с диссоциацией фермент-субстратного комплекса на исходные вещества происходят превращения субстрата в продукт и распад комплекса фермент—продукт на составляющие его компоненты [c.106]

Наряду с образованием фермент-субстратного комплекса возможна его диссоциация со скоростью к на фермент и исходный субстрат, а также распад с образованием продуктов реакции, протекающий со скоростью к . Этот процесс описывается уравнением [c.73]

Опыт показывает, что для многих ферментативных реакций константа скорости диссоциации фермент-субстратного комплекса существенно превышает константу скорости его распада с образованием продуктов реакции. Так, например, при ферментативном гидролизе ацетилхолина и родственных субстратов установлено, что Л > > Ag, поэтому определение значения Кт ДДЯ различных субстратов дало возможность заключить, что наибольшим сродством к ферменту обладает ацетилхолин. [c.129]

Каждый фермент специфичен и имеет активный центр, в котором фермент и субстрат, временно объединяясь, образуют фермент-субстратный комплекс. В результате диссоциации этого комплекса продукт высвобождается. [c.340]

Согласно одной из схем, в комплексе существуют два активных центра, которые могут находиться либо в открытом, либо в закрытом состоянии. Связывание АДФ и Ф в одном центре вызывает такое изменение конформации, которое способствует высвобождению АТФ из другого центра. Аналогично этому, в процессе гидролиза АТФ связывание и гидролиз АТФ приводят к быстрой диссоциации АДФ и Фн из альтернативного центра. Роль компонентов АрН+ состоит в протонировании определенных молекулярных групп АрН или изменении положения полярных групп под действием электрического поля Аср. Нри этом (см. 3 гл. XIV) изменяется характер движения отдельных групп белка в конформационном потенциале. Это и может непосредственно влиять на формирование фермент-субстратного комплекса при связывании субстрата и на отщепление продукта реакции, т. е. на процессы, происходящие в ходе конформационной релаксации. [c.221]

Соотношение между кинетическими параметрами ферментативной реакции уравнения (13) в прямом и обратном направлениях дается уравнением Хелдена [уравнение (14)], в котором Kg и Кр — константы диссоциации комплексов фермент-субстрат и фермент-продукт соответственно. [c.245]

Экспериментально определяемые константы скорости диссоциации комплексов фермент-продукт (или фермент-ингибитор) составляют 1-Ю с , что на три-четыре юрядка выше необходимых для транспептидации. Таким образсм, обычный комплекс фермент-продукт не может быть тем комплексом, ко горы участвует в реакции переноса фрагмента субстрата на акцептор. [c.339]

При насыщающих концентрациях субстратов для реакций с участием некоторых дегидрогеназ лимитирующей стадией является диссоциация комплекса фермент—продукт. Примером такого рода может служить диссоциация при высоких pH комплекса NADH с глицеральдегид-З-фосфат—дегидрогеназой [14], при низкой концентрации соли — комплекса NADH с алкогольдегидрогеназой из печени лошади [15, 16] и комплекса NADPH с глутаматдегидрогеназой [17]. [c.163]

Простые ферментативные реакции. Превращение субстрата 5 под действием фермента Е протекает через предварительное образование фермент-субстратного комплекса Е5. В ферментативном атализе приняты следующие обозначения V — скорость ферментативной реакции V — значение V в условиях насыщения фермента субстратом Кконстанта Михаэлиса, равная концентрации субстрата. при которой V Ks — субстратная константа, константа равновесия (диссоциации) реакции Е + 5 = Е5 —константы скорости прямой и обратной реакции п-й стадии ферментативной реакции [Е], [5], [Р], [I], [А]—концентрация фермента субстрата, продукта, ингибитора и активатора, соответственно. Простейшая схема ферментативной реакакции [c.189]

Субстрат и продукт реакции образуют комплексы с фосфорилиро-ванной формой фермента (Е—Р), а кофермент — с нефосфорилированной (Е). При недостатке глюкозо-1,6-дифосфата происходит диссоциация комплекса с образованием неактивного фермента. Для осуществления каталитического цикла необходимо присутствие некоторого избытка глюкозо-1,6-дифосфата. Изолированный из мышц кролика фермент обычно является фосфорилированным, поэтому может катализировать реакцию и без добавления кофермента. Важную роль в каталитической реакции играют ионы Mg +, в отсутствие которых фермент вообще неактивен. Непосредственно в каталитическом акте Mg + яе участвует, но, будучи связанным с фосфорильной группой фермента, оказывает влияние на равновесие реакции. [c.227]

Известно, что субстраты образуют сначала так называемый коми текс Михаэлиса с суб стратными центрами фермента констан ы диссоциации этих комплексов обозначается К . Лишь затем они образуют переходный комплекс и вступают в реакцию с образованием продуктов. Но структура субстратов обязательно отличается от их же структуры в ереходном комплексе [c.39]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология