Изомеризация свободного фермента

Г ), за которой следует стадия его изомеризации (стадии 2, 2, 2"). Кроме того, исследование свободного фермента показало,, что белок существует в двух конформациях (стадия 3). [c.227]

Стабильные формы фермента (такие формы, которые не способны к мономолекулярному распаду с высвобождением субстрата пли продукта или к изомеризации с превращением в эти формы) будут обозначаться буквами Е, Р, О, Н, где Е представляет собой свободный фермент. Последовательный механизм включает только одну стабильную форму фермента (свободный фермент). Механизмы пинг-понг включают две или большее число стабильных форм. [c.356]

Для каждого класса субстратов (3, 5 -динуклеотид, 2, 3 циклофосфат, 3 -нуклеотид) реакция включает бимолекулярную стадию образования первичного комплекса (стадии 1,1 , 1 "), за которой следует его изомеризация (стадии 2,2, 2"). Кроме того, исследование свободного фермента показало, что фермент существует в двух конформациях (стадия 3). Эти кинетические результаты были сопоставлены с данными рентгеноструктурного анализа, что позволило постулировать детальный механизм действия фермента. [c.185]

Полученные результаты позволили сделать определенные выводы о трех группировках активного центра, значения р/С для которых составляли 5, 6 и 6, 7. На основании зависимости этих величин от температуры был сделан вывод, что наименьшее значение р/С относится к карбоксильной группе (слабая температурная зависимость), а наибольшее — к имидазольной группировке (сильная температурная зависимость). Природа группировки с промежуточным значением р/С, равным 6, оставалась (и остается до сих пор) неясной. Сама величина р/С 6 может быть отнесена к имидазолу, но вместе с тем она не зависит от температуры, что характерно для карбоксила. Авторы предполагают, что это имидазол с аномальной величиной АН ионизации, однако признают, что для окончательного доказательства этого предположения, нужны дополнительные данные. В этой работе были установлены детали механизма действия рибонуклеазы, в том числе обнаружены реакции изомеризации свободного фермента и комплекса фермент—продукт. Тшатель-ность кинетического анализа, проведенного в этой работе, позволяет отнестись с доверием к предложенному авторами химическому механизму действия рибонуклеазы, хотя не вполне ясно, действительно ли все обнаруженные реакции изомеризации входят в последовательность каталитических реакций. [c.218]

Как это повлияет на вид уравнения скорости Прежде всего, любое произведение из первоначального уравнения войдет и в новое уравнение, добавятся только сомножители или Лги поэтому никакие комбинации концентраций реагентов не исчезнут. Однако, помимо этого, появятся произведения, которые не содержат ни 12 ни /С21, но содержат как ку,с, так и к . Если каждая из констант ftj, и к является простой константой скорости первого порядка, то вид уравнения не изменится. Если же обе константы связаны с концентрациями реагентов (например, к и kyjb), то при модификации механизма в уравнении скорости появятся ранее отсутствовавшие члены, содержащие ah. Все изложенное позволяет сделать важный вывод введение стадии изомеризации не влияет на форму уравнения скорости, если ни один из изомеров не способен связыьать реагенты. Этот вывод означает, что, измеряя стационарные скорости, нельзя обнаружить многие типы изомеризации (для этого можно использовать предстационарпую кинетику см. гл. 9) и что константы скорости, входящие в уравнение скорости, на самом деле могут представлять собой комбинации констант для нескольких элементарных стадий механизма. Как и для правила большого пальца , полезно различать изомеризацию свободного фермента, которую в принципе все-таки можно выявить на основе исследования стационарной кинетики, и изомеризацию промежуточных комплексов, обычно в стационарной кинетике не проявляющуюся. На самом деле все эти рассуждения представляют, по-видимому, чисто академический интерес, поскольку стадию изомеризации (будь то изомеризация свободного фермента или изомеризация других форм) никогда не удается надежно идентифицировать на основании измерения стационарных скоростей реакции. Действительно, по крайней мере в одном случае было показано, что изомеризация, которую можно было зарегистрировать другими методами, в измерениях стационарной скорости не выявлялась. Этот случай будет рассмотрен далее, в разд. 5.10. [c.74]

В результате двух стадий (а и 6) реакции (7-26) происходит обратимая изомеризация глюкозо-1-фосфата в глюкозо-6-фосфат с промежуточным образованием глюкозо-1,6-дифосфата. Поскольку фосфорили-рованная форма фермента относительно нестабильна и подвергается гидролизу до свободного фермента (Е) и неорганического фосфата, существует отдельная реакция, катализируемая киназой (стадия в). Эта стадия обеспечивает генерирование глюкозо-1,б-дифосфата, который ре-фосфорилирует любой свободный фермент, образующийся при гидролизе фосфофермента. [c.132]

Следует отметить, что механизмы односубстратных реакций совсем не так просты, как может показаться на первый взгляд,, потому что из более близких к реальности моделей катализа, учитывающих изомеризацию фермента, следует, что свободный фермент высвобождается при каталитическом распаде фермент субстратного комплекса в форме, отличающейся от исходной формы, которая связывает субстрат. Поэтому более вероятным является механизм [c.102]

Скорость реакции изомеризации зависит от присутствия основной группы с р/Са =6,8 и кислой группы с р/Са =9,3 в свободном ферменте [250]. Исходя из данных по теплотам изомеризации было высказано предположение, что эти значения рКа относятся К имидазольной и аммонийной боковым цепям остатков гистидина и лизина соответственно [250]. Остаток глутаминовой кислоты модифицируется эпоксидом 1,2-ангид-ро-0-маннитол-6-фосфатом (гл. 7, разд. Ж) [251]. Все эти данные в совокупности с результатами кристаллографического анализа позволили сформулировать механизм действия фермента. Интересно, что при этом аминокислотная последовательность глюкозо-6-фосфат—изомеразы все еще не установлена, и, следовательно, боковые цепи аминокислот не могут быть четко идентифицированы. [c.409]

Теория переходного состояния и ферментативный катализ [740]. Показаны профили свободной энергии некатализнруемой реакции (пунктирная линия) и соответствующей реакции, катализируемой ферментом (сплошная линия). Учитывается только одно соединение (субстрат) рассматриваемая реакция может быть, в частности, реакцией изомеризации. Предполагается, что и катализируемая, и иекатализируемая реакции следуют одному н тому же механизму. Использованы следующие обозначения [c.277]

Поступление, распределение и выведение из организма. Т. всасывается в кровоток при поступлении в организм через дыхательные пути, неповрежденную кожу и в/ж. Через 0,5—1 ч после в/ж введения - крысам в дозе 120 мг/кг обнаруживается во всех органах и тканях. Через 4 ч в крови, печени и жировой ткани определяется эпоксид Г. Окисление Г. в эпоксид осуществляется с участием ферментов 1 юнооксигеназной системы печени. После однократного введения Г. и его эпоксид 3—6 мес. сохраняются в жировой ткани. Возможны изомеризация Г. и эпоксидирование изомеров. Один из метаболитов Г. образуется в результате гидроксилирования путем прямой реакции со свободными радикалами. Выделение Т. и его метаболитов осуществляется преимущественно через ЖКТ в первые дни после однократного введения (Гиренко и др.). Обнаружен в коровьем молоке. [c.562]

Реакция катализируется ферментом гексозофосфат-уридил-трансферазой. Ури-диновый фермент принимает участие и в реакции изомеризации галактозы в глюкозу и обратно. Этому своеобразному превращению, как оказалось, подвергается не свободный сахар и не фосфорный эфир галактозы, но уридиндифосфогалактоза (УДФГал) [c.273]

В пре-люмиродопсине иммониевая связь очень легко расщепляется (гидролизуется) и образуются опсин и все-транс-ретиналъ. Свободный все-транс-ретиналь под влиянием света снова превращается в 11-чис-изомер. В присутствии фермента протекает реакция i u -изoмepa с опсином, которая дает родопсин. Поскольку эта реакция быстрая и количественная, зрительный пурпур снова образуется, хотя фотохимическая изомеризация (12.7) не обеспечивает полного превращения гранс-изомера. [c.358]

Свободные моносахариды, глюкоза например, в случае брожения дрожжевым соком получают фосфорную кислоту от аденозинтрифосфата (АТФ). Перенос фосфатного остатка с аденозинтрифосфата совершается при участии фермента гексокипазы. Первым продуктом фосфорилирования является гек-созо-6-фосфат. В случае же мышечного сокращения первым продуктом фосфорилирования гликогена, как уже известно, будет гексозо-1-фосфат. Одновременно под влиянием изомеразы происходит изомеризация глюкозо-6-фосфата во фруктозо-6-фосфат. Этот последний получает за счет аденозинтрифосфата в результате перефосфорилирования вторую молекулу фосфорной кислоты, которая становится при первом углероде. Таким образом возникает фруктозе-1,6-дифосфат (гексозодифосфат). Все это мол ет быть формулировано в тех же выражениях, как и в случае уже рассмотренного гликолиза, только исходным веществом будет глюкоза (иногда крахмал). [c.385]

Например, возможна изомеризация галактозы в глюкозу и обратно. Этому своеобразному превращению подвергается не свободный сахар и не фосфорный эфир галактозы, как это предполагали раньще, а уридинфосфогалактоза (УДФ-галактоза) при участии соответствующего уридинового фермента [c.382]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология