Физические карты

За четыре года, прошедших со времени выхода в свет первого издания книги Молекулярная биотехнология принципы и применение , в области биотехнологии было сделано огромное количество открытий. На рынке появилось множество новых генноинженерных продуктов (например, вакцин и лекарственных препаратов). Рутинной практикой клинических лабораторий стало использование иммунологических методов диагностики и методов, основанных на применении полимеразной цепной реакции. Открыты и охарактеризованы многие гены, ассоциированные с различными заболеваниями человека, неизмеримо возрос объем клинических испытаний в области генной терапии. Построены подробные генетические и физические карты хромосом человека впервые из дифференцированной соматической клетки клонировано жизнеспособное млекопитающее. Производство одного из трансгенных растений, сои, поставлено на коммерческую основу. [c.7]

Опубликованы подробные генетические и физические карты хромосом человека [c.18]

Чтобы регулировать работу над различными аспектами всей программы, HGP распределяет финансы между разными исследовательскими группами. В большинстве случаев ответственность за создание генетических и физических карт конкретной хромосомы делят между собой крупные центры и небольшие лаборатории, которые сотрудничают друг с другом. Некоторые из наиболее крупных исследовательских институтов занимаются укомплектованием данных о генетических и физических картах генома. В результате молекулярно-генетических исследований генома человека появляется огромное количество новых данных о полиморфных зондах, STS-клонах, содержании генетических, физиче- [c.478]

Международная программа, целью которой является построение генетической и физической карт генома человека и определение полной нуклеотидной последовательности ДНК. [c.557]

Участки ДНК, по которым происходит расщепление той или иной рестрикта-зой, называют сайтами рестрикции. Поскольку эндонуклеазы рестрикции используются не только для подготовки ДНК к секвенированию, но и для других целей, в частности для генной инженерии (см. 7.11), распределение сайтов рестрикции вдоль молекулы ДНК является важной характеристикой ДНК. Установление взаимного расположения этих сайтов называют физическим картированием ДНК, а саму схему такого распределения — физической картой ДНК. [c.276]

Число известных и охарактеризованных рестриктаз непрерывно растет, так как эти ферменты играют важную роль и в фундаментальных, и в прикладных исследованиях в области молекулярной генетики. Например, полученные с их помощью фрагменты ДНК (рестрикционные фрагменты) можно расположить в такой последовательности, что это даст возможность построить физическую карту генетического материала. [c.469]

Размер площадей частей света был принят по данным М. И. Львовича [63] и БСЭ. Подсчет площадей отдельных областей и зон в пределах каждого материка выполнен с помощью карт растительности, почв и геологических, причем за основу была взята физическая карта полушарий Большого Атласа Мира [149] равновеликой азимутальной проекции. [c.79]

Условные обозначения на физической карте даются в цветной шкале. Все участки выше 200 м над уровнем моря изображаются коричневатым цветом различной интенсивности, а все равнинные и низменные территории (ниже 200 м над уровнем моря) — зеленым цветом различной интенсивности. Гидрографическая сеть дается синим цветом, причем пересыхающие реки изображаются синей пунктирной линией, а соленые озера синей штриховкой или фиолетовой окраской. Болота показаны синей штриховкой. [c.282]

На гипсометрических картах рельеф показан штриховкой или горизонталями — линиями, соединяющими все точки поверхности, лежащие на одной и той же высоте над уровнем моря. Обзорные гипсометрические карты обычно раскрашиваются по типу физических карт. [c.282]

После построения физической карты можно перейти к определению последовательности ДНК между близко расположенными точками (обычно около 300 п. п.). Выбирая подходящие точки, отдельные расшифрованные последовательности можно соединить в последовательность целого гена. Затем установленную последовательность ДНК сравнивают с последовательностью соответствующего белка. Это позволяет выявить участки ДНК, отвечающие за структуру белка. Продолжив определение последовательности в одном из направлений, определяют расстояние до следующего гена. [c.43]

Сравнивая между собой последовательность ДНК дикого типа и его мутантного аллеля, можно точно локализовать мутационный сайт и установить природу мутации. Таким методом определяется соответствие между генетической картой (целиком основанной на мутационных сайтах) и физической картой (составленной на основе нуклеотидной последовательности ДНК). В конечном итоге карту какого-либо участка генома можно выразить в нуклеотидах ДНК, а не в относительных единицах карты, принятых в формальной генетике. Действительно, теперь можно идентифицировать гены по их белковому продукту и даже иногда только по нуклеотидной последовательности. Таким образом, при построении карты генома мы [c.43]

Чтобы сопоставить рестрикционную и генетическую карты, нужно сравнить рестрикционные карты ДНК дикого типа и соответствующих мутантов. Связь между генетической и физической картами можно установить на основе одного рестрикционного картирования, если имеются мутанты, сильно изменяющие генетическую карту. Например, маленькая делеция или вставка, нарушающая генетическую карту, вызовет соответственно уменьшение или увеличение размера того рестрикционного фрагмента, в котором она находится. Более протяженная делеция (или вставка) может удалять (или вводить) серии рестрикционных сайтов. Такой пример разобран на рис. 3.4. [c.46]

В основе этих методов лежит способность ферментов рестрикции (рестриктаз) расщеплять ДНК на отдельные, довольно короткие нуклеотидные последовательности. В гл. 3 мы уже обсуждали использование рестриктаз для составления физической карты ДНК и получения фрагментов ДНК, нуклеотидная последовательность которых может быть определена непосредственно. Таким образом, если исследователь располагает участком ДНК, соответствующим, например, определенному гену, то определение его нуклеотидной последовательности сейчас уже представляется вполне рутинной, чтобы не сказать рядовой, процедурой. Используя эти данные, с помощью некоторых химических и биохимических методов можно разрывать молекулу ДНК и снова восстанавливать ее целостность практически в любом месте. [c.236]

Сопоставление генетической и физической карт фага Л [c.211]

ДНК с известными генетически картированными делециями и добавками (рис. 7.11). Такой гетеродуплексный анализ позволяет построить физическую карту параллельно с генетической картой на рис. 7.7. Поскольку известна общая длина молекулы ДНК X (она составляет около 49 ООО н. п.), можно определить примерную величину каждого гена. [c.213]

Из одного F штамма может возникнуть множество различных штаммов Hfr, для каждого из которых характерна собственная локализация и ориентация F-фактора в хромосоме бактерии (рис. 8.8). Это проявляется в описанных выше опытах с прерванной конъюгацией в каждом Hfr-штамме передача бактериальной хромосомы начинается с собственной, иной чем у других штаммов точки различна также и ориентация хромосомы при этом. Для каждого штамма можно установить характер сцепления между генами, расположенными неподалеку от точки, с которой начинается передача бактериальной хромосомы. Совокупность таких данных по множеству различных штаммов Hfr позволяет установить характер сцепления маркеров в хромосоме в целом и построить физическую карту хромосомы Е. соИ. Как показано на рис. 8.9, эта карта имеет форму кольца, что полностью соответствует кольцевой форме бактериальной ДНК. [c.238]

Сопоставление физической карты, полученной методом прерванной конъюгации, и генетической карты, построенной на основании данных [c.249]

V 8.1 Последовательность передачи генов -р зличных Hfr-штаммов Е. соН различна для нескольких штаммов она представлена ниже. Постройте на основе этих данных физическую карту бактериального генома. [c.256]

Кривая, характеризующая износ детали в процессе эксплуатации, представлбна на рис. 2.2. В соответствии с физической карти юй износа строится кривая интенсивности отказов детали (рис. 2.7). Участок I этой кривой характеризует изменение интенсивности отказов в период приработки, участок II — интенсивность отказов в период нормальной работы, участок III — изменение интенсивности отказов в период повышенного износа. [c.56]

Поскольку на электронных. микрофотографиях можно достаточно точно измерить расстояния, этим путем можно получать точные физические карты . Хромосомная карта, показанная на рис. 15-22, является такой физической картой , и поэтому приведенные на ней расстояния более точны, чем на генетической карте Е. oli, приведенной на рис. 15-1. Описанный метод был использован также для исследования колициногенных факторов [166]. [c.263]

Обработка образца ДНК определенной рестриктазой всегда дает один и тот же набор фрагментов - при условии, что расщепление происходит по всем сайтам узнавания. Если использовать несколько ферментов рестрикции и сначала обработать ДНК каждой из рестриктаз в отдельности, а затем их комбинациями, можно построить физическую карту данной ДНК, т. е. установить порядок следования сайтов рестрикции вдоль молекулы. Определив размер полученных фрагментов с помощью гель-электрофореза, можно найти положение рестрикционных сайтов (дополнение 4.1). На рис. 4.4,А указаны размеры фрагментов, полученных в результате расщепления ДНК разными рестриктазами и их смесью. Из этих данных следует, что данный участок ДНК имеет по два сайта для ВатШ и ЕсоШ. [c.53]

При построении физических карт тех или иных районов хромосом или целых хромосом из геномных библиотек, содержащих крупные вставки (YA -, ВАС- или РАС-библиотек), наиболее приемлем метод картирования, основанный на использовании STS. STS — это короткий одно-копийный участок ДНК (примерно 100-300 п. п.), который можно вьшвить при помощи ПЦР с использованием уникального набора праймеров. Для получения протяженного контига, охватывающего значительный участок хромосомы, требуется большое число STS, находящихся на расстоянии 50-100 т. п. н. друг от друга. Напри- [c.462]

Некоторые из намеченных на период 1990-1995 гг. задач той части HGP, которая выполняется в США, в 1993 г. были пересмотрены это связано с быстрым прогрессом в генетическом картировании благодаря внедрению мик-росателлитных полиморфных маркеров и построению практически полных физических карт. К 1996 г. удалось решить несколько вновь поставленных задач. Например, в 1994 г. была опубликована карта (генетического) сцепления человека, которая содержала 5826 локусов, охватывающих 4000 сМ. Хотя только для 908 локусов шансы сцепления составили больше 1000 1, ко- [c.477]

Физическая карта (Physi al map) Расположение генов на хромосоме, установленное с помощью различных методов (электронная микроскопия, секвенирование, рестрикционное картирование). Расстояние на такой карте измеряется в числе пар нуклеотидов. [c.563]

Теперь доказано, что кроссинговер генетического материала вирусов, лежащий в основе этих явлений, может наблюдаться и действительно наблюдается до тех пор, пока в инфицированной клетке присутствует свободная ДНК, принадлежащая потомству двух фаговых линий. Частота появления специфических рекомбинантов слуншт мерой физического расстояния между соответствующими генами в молекуле ДНК. Именно на этой особенности и основано составление генетических карт. Как можно было и предвидеть, чем дальше отстоят друг от друга генетические маркеры, тем чаще они рекомбинируют. Исключения, обнаруженные в случае Т-четных фагов, послужили первыми указаниями на кольцевой характер генетической (названной так в отличие от физической) карты этих вирусов (см. гл. VI, разд. Г) [109[. [c.212]

Существование генетической рекомбинации в митохондриях дрожжей (см. ниже) позволило создать генетическую карту генома митохондрий, которая была сопоставлена с физической картой при изучении возникающих естественным путем делеций митохондриального генома (называемых петит-мутациями). Участок, занимаемый каждым геном, определяли по положению на карте соответствующей мРНК. [c.285]

Рис. 7.7. Геном фага А,. Гены, существенные для развития фага, обозначены строчными буквами. А, Процентная шкала расстояний вдоль молекулы ДНК. Б. Генетическая карта, построенная на основании частот рекомбинации. В. Физическая карта, основанная на гетероду-плексном анализе. Г. Некоторые из перестроек, использованные при гетеродуплексном картировании gal и bio-замещения, делеции и замены, влияющие на иммунные свойства фагов лямбдоидного семейства. Д. Распределение генетических функций в геноме.

Селективный маркер Супрессорчувствительные мутации Температурочувствительные мутации Трехфакторное скрещивание Физическая карта [c.222]

Физическая карта F-фактора Е. соИ изображена на рис. 8.13, Л. Она содержит 94 500 н. п., в ее состав входят гены, обеспечивающее конъюга- [c.242]

Рис. 8.13. А. Физическая карта F-фактора Е. oli, на которой изображена локализация генов, необходимых для передачи хромосомы, и IS-эле-менты, ответственные за интеграцию F-фак-тора в бактериальную хромосому. Б. Физическая карта фактора устойчивости, на которой указаны области гомологии с F-фактором и сайты устойчивости к некоторым антибиотикам, окаймленные IS-эле-ментами и образующие транспозоны. Обратите внимание на то, что транснозон ТпЗ, несущий ген атр, представляет собой часть более крупного транспозона Тп4.

Когда фаг Р1 размножают на клетках thr leu azi , и затем полученным препаратом фага инфицируют реципиента ihr leu azi , то лишь 3% от рекомбинантов типа Thr" обладают также фенотипом Leu, и ни один из них - фенотипом Az . Однако, если отбирать рекомбинанты типа Leu, то 50% из них составляют Az . Следовательно, leu более тесно сцеплен с azi , чем с thr, и гены, по-видимому, расположены в последовательности thr leu azi . Частоты совместной трансдукции (котрансдукции) соответствующих маркеров можно использовать для определения степени их сцепления. Тот факт, что лишь 3% трансдуцирующих фагов thr содержат также ген leu, указывает на то, что эти гены столь удалены друг от друга, что редко оказываются вместе во фрагменте ДНК, попадающем в головку фага Р1. На физической карте, полученной методом прерванной конъюгации, эти маркеры расположены на расстоянии около 1/50 от общей длины хромосомы бактерии, что составляет 6,4 10 н. п. Это находится в хорошем соответствии с данными, согласно которым молекула ДНК фага Р1 содержит чуть меньше 10 н.п. [c.250]

ЛПри скрещивании F -штамма с различными Hfr-штаммами последовательность переноса генов различна. В таблице приводится порядок переноса различными Hfr-штаммами нескольких генов, расположенных неподалеку от точки начала (0). На основании этих данных постройте физическую карту бактериальной хромосомы. [c.257]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология