Полиуридиловая кислота

Другой тип кооперативности в молекуле белка обнаруживается при обратимом конформационном переходе между а-спиралью и беспорядочным клубком. Если создать условия, при которых более устойчивой является спиральная конформация, то все молекулы, которые находятся в состоянии беспорядочного клубка, быстро примут форму спирали. Аналогичным образом в условиях, при которых более устойчивой конформацией является беспорядочный клубок, все спирали расплетутся и произойдет полное их превращение в клубки. Плавление ДНК (гл. 2, разд. 10), как и любого кристалла, происходит кооперативно [21]. Формирование новой полинуклеотидной цепи на комплементарной матрице, приводящее к возникновению стэкинг-взаимодействий, также может быть кооперативным процессом. Так, например, формирование цепи полиадениловой кислоты на двух цепях полиуридиловой кислоты приводит к кооперативному образованию комплекса, представляющего собой тройную спираль (гл. 2, разд. Г.6). Наличие стэкинг-взаимодействия делает рост спирали энергетически более выгодным, чем инициацию новых спиральных участков [22]. Проблеме кооперативности посвящена обширная литература, в частности работы [23—25]. [c.263]

Ясные сведения об ЭКВ дают исследования влияния конформации на скорость медленного изотопного обмена водорода в полинуклеотидах, проведенные Варшавским и сотрудниками [128]. Скорость обмена водорода на тритий у атома Се пуринового кольца в полиадениловой кислоте зависит от распределения электронной плотности в пурине. Это распределение изменяется при конформационных движениях, вызванных сдвигом pH и комплексообразованием с полиуридиловой кислотой. Скорость изотопного обмена весьма чувствительна к таким изменениям электронной плотности. [c.408]

Однако, несмотря на отмеченные здесь трудности, некоторые олигонуклеотиды и их мономеры все же были успешно разделены (см. литературу, приложение XV). Дело обстоит гораздо проще, когда речь идет о полимерах одного нуклеотида. При исследовании влияния длины цепи олигонуклеотидов на биосинтез белка потребовались олигонуклеотиды определенных размеров. Для этого синтетический полинуклеотид (применявшийся в качестве искусственной информационной РНК) частично гидролизовали ферментативным путем, а затем хроматографировали [81]. Например, из полиуридиловой кислоты на сефадексе 0-200 удалось получить фракцию со средней степенью полимеризации от 42 до 132, а на 0-75 —фракции со степенью полимеризации от 5,8 до 42. [c.223]

Содержание спиральной структуры в полиуридиловой кислоте можно выразить с помощью следующего уравнения [1] [c.36]

Найдено, что привязка полиуридиловой кислоты к агарозе происходит по 5 -концу. Согласно этому, а также принимая во внимание другие данные, по-видимому, можно предположить, что им- [c.37]

Си, Си —концентрация всех и свободных участков связывания в цепи полиуридиловой кислоты соответственно [c.57]

Рибосомы ретикулоцитов Полиуридиловая кислота Сефароза 4В 685 [c.294]

Транслирующие рибосомы Полиуридиловая кислота, окисленная КМ-целлюлоза с дигидразидом ди- 97 [c.294]

Полиуридиловая кислота Поли (U) -сефадекс 365 [c.345]

Полиадениловую кислоту содержа- Полиуридиловая кислота 1056 [c.346]

Рибосома имеет собственное сродство к матричным полинуклеотидшу / Уже давно известно, что среди синтетических полирибонуклеотидов вакантная рибосома лучше всего связьшает полиуридиловую кислоту, на чем и было основано широкое применение поли(и) в качестве матрицы в бесклеточных системах трансляции. Возможно, что отсутствие стабильной вторичной и третичной структуры в поли(и) является существенным фактором ее хорошего связьшания с рибосомой. В случае природных мРНК имеются совершенно определенные предпочтительные места на полинуклеотиде, с которыми могут связьшаться вакантные рибосомы (см. гл. В.VI). В любом случае прочная сплошная двойная спираль вряд ли может служить местом присоединение вакантных рибосом. [c.136]

В ряде лабораторий (в частности, в лаборатории С. Бреннера) были получены данные о возможности существования в клетках в соединении с рибосомами короткоживущей РНК, названной информационной (иРНК). Сейчас она обозначается как матричная РНК (мРНК), потому что ее роль заключается в переносе информации от ДНК в ядре (где она синтезируется под действием ДНК-зависимой РНК-полимеразы) до цитоплазмы, где она соединяется с рибосомами и служит матрицей, на которой осуществляется синтез белка. Эта блестящая гипотеза затем экспериментально бьша доказана в лаборатории М. Ниренберга. При изучении влияния различных фракций клеточной РНК на способность рибосом, выделенных из Е. oli, к синтезу белка было установлено, что некоторые из них стимулировали включение С-аминокислот в синтезируемый полипептид. Добавление синтетического полинуклеотида, в частности полиуридиловой кислоты (поли-У), в белоксинтезирующую систему приводило к включению в синтезирующуюся белковую молекулу единственной аминокислоты -фенилаланина. Поли-У вызывал синтез в бесклеточной системе необычного полипептида полифенилаланина. Таким образом, искусственно синтезированный полирибонуклеотид, добавленный к препаратам рибосом, включавшим известные к тому времени факторы белкового синтеза и источники энергии, вызывал синтез определенного, запрограммированного полипептида. [c.519]

Свойством полинуклеотидов, сформированных из одного типа асимметрических молекул, является способность к точному воспроизведению, основанная на принципе структурной комплемен-тарности. В модельных опытах было показано, что полинуклеотид-ная цепь может служить матрицей, связывающей свободные нуклеотиды. При смешивании АМФ с полиуридиловой кислотой [c.200]

Рис. 33. Взаимное расположение гетероциклов в которые входят две полипирими-тройном комплексе полиадениловой кислоты с диповые цепи. В плоскости, пер-двумя цепями полиуридиловой кислоты пендикулярной оси спирали, вза-

Информация о последовательности аминокислот в полипептидной цепи белка, программируемого информационной РНК, записана в молекуле этой РНК, а следовательно, и в соответствующем участке одной из цепей ДНК, в виде последовательности кодирующих эти аминокислоты тринуклеотидных фрагментов — кодонов. Необходимость как минимум трех нуклеотидов для кодирования каждой из 20 аминокислот, формирующих первичную полипептидную цепь при биосинтезе белков, вытекает из очевидных арифметических соображений ни каждый из четырех нуклеотидов по отдельности, ни 16 мыслимых динуклеотид-ных фрагментов не могут однозначно кодировать 20 аминокислот. Соответствие между 64 кодонами и 20 аминокислотами, участвующими в биосинтезе полипептидных цепей на рибосомах, получило название генетического кода. Первое доказательство самого факта существования генетического кода и первый шаг к его расшифровке были получены в эксперименте Ниренберга и Маттеи. Эти авторы показали, что на рибосомах в присутствии всех компонентов, необходимых для биосинтеза белка, и построенной полностью из фрагментов уридин-5 онофос-фата полиуридиловой кислоты в качестве информационной РНК, синтезируется полифенилаланин. Отсюда следовало, что фенилаланин кодируется несколькими, скорее всего тремя остатками уридиловой кислоты, т. е. кодоном для фенилаланина является тринуклеотид ШШ (в этом параграфе в табл. 5.2 символы межнуклеотидных фосфатов или заменяющие их черточки опущены). [c.172]

Аналогичный тип перехода также наблюдается у синтетических полинуклеотидов. Полиаделиновая и полиуридиловая кислоты, например, при смещении в разбавленном растворе образуют упорядоченную биспираль, проявляющую все свойства индивидуальной молекулы. Поэтому вполне уместно говорить [c.61]

Изотерма связывания олигоадениловой кислоты с полиуридиловой кислотой [c.36]

Рис. 3.8. Изотерма комплексообразования полиуридиловой кислоты с олигоадениловой кислотой при 5°С, pH 7,0 в 0,033 М фосфатном буфере, содержащем моль/л N801 н 1 ммоль/л

Когда концентрация свободного олигомера забуферена, содержание спиральной формы полиуридиловой кислоты выражается следующим образом [c.37]

Рис. 3.9. Температурная зависимость элюирования олигоадениловой кислоты с иммобилизованной полиуридиловой кислоты [11].

Состав элюирующего буферного раствора Чх М фосфатный буфер + 1 М КаС1 + 1 мМ М СЬ (pH 7,0) концентрация нанесенной олигоадениловой кислоты 4,9-10- моль/л объем фракций 0,1 мл концентрация полиуридиловой кислоты 0,98-10- моль/л — свободный [c.38]

Отрезок Уе(0) траектории пиков на оси Уе дает константу ас-социащ и при бесконечном разбавлении, а тангенс угла наклона касательной к кривой в точке Уе (0) дает первый нелинейный член /. Термодинамические параметры для системы олигоадепиловая кислота — полиуридиловая кислота, определяемые этим способом, таковы [c.42]

Си, Си—концентрация всех или соответственно свободных участков связывания на цепи полиуриди- ловой кислоты с, с — концентрация всей или соответственно свободной олигоадениловой кислоты = —Си)1си—содержание спиральной формы в полиуридиловой кислоте [c.42]

КООПЕРАТИВНОЕ ЭЛЮИРОВАНИЕ ОЛИГОАДЕНИЛОВОЙ КИСЛОТЫ В ХРОМАТОГРАФИИ НА ИММОБИЛИЗОВАННОЙ ПОЛИУРИДИЛОВОЙ КИСЛОТЕ [13] [c.55]

Метод анализа кривых элюирования применен в колоночной хроматографии олигоадениловой кислоты на агарозе со связанной полиуридиловой кислотой при нескольких температурах и концентрациях олигоадениловой кислоты. Теория кооперативного связывания олигонуклеотидов с полинуклеотидом была расширена таким образом, что эта хроматографическая система может быть описана теорией теоретических тарелок, как упоминалось в разд. 3.2. [c.55]

Связывание олигоадениловой кислоты с полиуридиловой кислотой носит кооперативный характер, и стабильность комплекса зависит от температуры и концентрации олигоадениловой кислоты. Следовательно, характер кривых элюирования олигоадениловой кислоты, хроматографируемой на агарозе с иммобилизованной полиуридиловой кислотой, зависит от концентрации олигоадениловой кислоты и температуры, как это следует из рис. 3.9 и 3.10. [c.55]

В данных экспериментальных условиях комплекс полиуридиловой кислоты с олигоадениловой кислотой в растворе находится в виде свитой тройной спирали. Следовательно, чтобы рассчитать [c.55]

Расхождение теоретической модели и экспериментальных данных хможно объяснить следующим образом. Поскольку отношение с /с равно 10 —10 и число лифосфатных групп в полиуридиловой кислоте составляет 10 —10 на макромолекулу, образованием петли полиуридиловой кислоты с олигоадениловой кислотой при их свивании можно пренебречь (для бесконечно длинных полимеров такое приближение неправильно). Следовательно, в двойной или тройной спиралях можно не принимать во внимание петли. В данных экспериментальных условиях полиуридиловая кислота, по крайней мере частично, образует двойную спираль. Следовательно, предложенное выше решение, подтвержденное в случае образования двойной спирали, верно также и в случае образования тройной спирали при кооперативной адсорбции на линейной цепи. [c.56]

Линдберг и Персон [33] и Ветекам и сотр. [60] использовали сефарозу с ковалентно связанной полиуридиловой кислотой для выделения РНК из полисом клеток животных. Для очистки ДНК Эдельман [15] также применил аффинный сорбент, приготовленный из сефарозы, однако аффинный не к ДНК, а модифицированный лектинами, подходящими для примесей полисахаридов, которые могут быть с большим трудом удалены из ДНК. Наиболее часто используется конканавалин А — сефароза, поскольку наиболее общими полисахаридными примесями являются фракции гликогена или крахмалоподобные вещества. Если присутствуют полисахариды, которые кроме глюкозы, фруктозы или маннозы [c.132]

Гомополимер полиадениловой кислоты Гомополимер полиуридиловой кислоты Полиуридиловая кислота—поли (А)триплекс Разрезанная однонитевая ДНК Разрезанная двунитевая ДНК 4S РНК из Е. oli [c.148]

Аффинная хроматография (1980) -- [ c.347 ]

Органическая химия нуклеиновых кислот (1970) -- [ c.101 , c.264 , c.265 , c.287 , c.288 , c.292 , c.330 ]

Начала органической химии Кн 2 Издание 2 (1974) -- [ c.681 ]

Начала органической химии Книга 2 (1970) -- [ c.754 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.487 ]

Современная генетика Т.3 (1988) -- [ c.76 ]

Основы биохимии (1999) -- [ c.221 , c.297 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология