Изотерма связывания

И. Линейная молекула имеет очень большое число идентичных центров связывания лиганда X. Свободная энергия взаимодействия между лигандами, связанными с расположенными по соседству друг с другом центрами, равна е. Считается, что взаимодействие между лигандами, не являющимися ближайшими соседями, пренебрежимо мало. Если обозначить константу связывания с центром, расположенным рядом с незанятыми центрами, через Кт, то выражение для изотермы связывания будет иметь вид [c.333]

Изотерму связывания можно получить из уравнений (3.33) и (3.34). Параметры и а в уравнениях определяются соответственно из концентрации свободного олигомера и тангенса угла наклона в точке перегиба экспериментальной изотермы связывания. Смоделированная таким образом изотерма связывания (Л = 2, Х52=1,1-10 моль/л, а == 0,017) показана пунктирной линией на рис. 3.8. [c.38]

Кривые элюирования, полученные математическим моделированием на вычислительной машине с использованием уравнений (3.37а) и (З.ЗТб), хорошо согласуются с экспериментальными результатами и показаны на рис. 3.10. Изотерма связывания, использованная в этом расчете, была выведена из уравнений (3.33) и (3.34), поскольку их параметры лучше соответствуют экспериментальной кривой для равновесного диализа (рис. 3.8). [c.40]

Когда п — параметр, можно получить изотерму связывания. Если принять во внимание влияние исключающего объема, то параметр а можно принять равным 2. Он входит во множитель функции разделения, возникающий благодаря образованию петель спирали [c.56]

По этому методу при раствора хлорида натрия при 10 °С найдено Х 5 = 3,4-10 л/моль ( 50%), а при 5°С х52 = 8-10 л/моль ( 50%). К сожалению, с, от которой зависит удовлетворительное соотношение сигнал — шум для кривой элюирования, недостаточно мала, чтобы можно было ограничиться двухчленным приближением. В результате траектория пика — вогнутая и оба значения нельзя определить с достаточной точностью, однако они очень приближенно соответствуют величинам, получаемым из изотермы связывания. [c.57]

Из рассмотрения изотермы связывания меченого антигена с антителами следует, что условия В <[Ат]о/2 и Ат]о<1//С могут выполняться одновременно только при [Аг ]о< МК. Если популяция антител гетерогенна по аффинности к антигену, то концентрацию меченого антигена следует выбирать такой, чтобы условие В <[Ат]о/2 выполнялось для высокоаффинной фракции антител, определяющей чувствительность анализа. [c.230]

На рис. 23.26 изображены изотермы связывания, построенные согласно уравнениям (23.101) и (23.102) для трех разных значений . При = 1 мы получаем простой линейный график Скэтчарда. При > 1 график Скэтчарда обычно имеет максимум при некотором промежуточном значении V. Это обусловлено кооперативностью, которая приводит к большему заполнению мест связывания при промежуточных концентрациях лигандов, чем в отсутствие взаимодействия между лигандами. [c.369]

Полученные нами уравнения математически описывают процесс насыщения, который называют также изотермой связывания или изотермой Лангмюра. Как мы увидим позже, в биологическом эксперименте чаще [c.122]

Предположение об отсутствии равновесия на момент анализа проверяется постановкой дополнительных экспериментов по связыванию малых концентраций лигандов. Данное предположение подтверждается, если на момент анализа равновесие по изотерме связывания не достигнуто (рис. 3.30, кривая а) и опровергается, если равновесие достигнуто (рис. 3.30, кривая б). [c.375]

Как видно, изотерма связывания при наличии процессов диффузии напоминает случай неравновесного лиганд-рецептор-ного взаимодействия (см. рис. 3.29). [c.385]

Суммарная концентрация мест связывания равна абсциссе точки пересечения с осью X кривой насыщения, представленной в координатах Скэтчарда. Концентрация мест связывания определяется тем точнее, чем больше экспериментальных данных использовано для вычисления точки пересечения изотермы насыщения с осью абсцисс. Если имеется несколько типов связывающих мест, то их концентрация определяется по точкам пересечения с осью абсцисс асимптот, проведенных через участки изотермы связывания, полученные при малых и больших концентрациях добавленного лиганда (см рис. 3.39). [c.400]

Аналогичное уравиение может быть записано и для общего случая. Обратите внимание, что концентрация Р ие входит в уравнение (4-15), т. е. у является функцией только [X] и констант образования, соответствующих отдельным стадиям. Такие уравнения описывают изотермы связывания двух или большего числа молекул X с Р. Из экспериментально полученного графика, построенного в координатах [X] (или ]g[X]) у (или ДА) иногда удается определить константы образования для соответствующих стадий — К, К2, Кз. .. Ка- Однако реально рещить такую задачу оказывается довольно сложно. Чтобы упростить уравиение (4-15) и соответствующее уравнение для общего случая, сгруппируем константы образования и обозначим произведения констант (/Сь К1Кй, К1К2К3-. и т. д.) соответственно через г зь о1)2, о1)з и т. д. При этом наши уравнения примут следующий вид [c.253]

Связывание протона анионом тиамина — это пример кооперативного процесса, названного так потому, что присоединение первого протона облегчает присоединение второго. При связывании небольших молекул кооперативные процессы встречаются сравнительно редко, однако в биохимии они распространены ч резвычайно широко и играют большую роль. Кривую кооперативного связывания называют сигмоидной (5-образной), поскольку график зависимости у от [X] (изотерма связывания) имеет 5-образную форму. Процесс связывания называется полностью кооперативным, если возможная степень кооперативности максимальна Это значит, что п-й центр связывания с лигандом X практически не обладает сродством к X до тех пор, пока не заняты остальные (п—1) центров. Однако после того как этн центры будут заняты, сродство п-го центра к X возрастает настолько сильно, что в любой равновесной смеси присутствуют в значительных количеству только Р и РХ . [c.262]

Изотерма связывания олигоадениловой кислоты с полиуридиловой кислотой [c.36]

Изотерма связывания показывает, что связывание олигоадениловой кислоты происходит кооперативно и поэтому наблюдаемая константа диссоциации не постоянна. В соответствии с типом связывания кривые элюирования, полученные при 5 и 10°С и различных концентрациях олигоадениловой кислоты, изменяются, как показано на рис. 3.10. [c.39]

Анализ кривых элюир.ования макромолекул, специфически сорбируемых на аффинном сорбенте, является потенциальным аналитическим методом для изучения специфических взаимодействий биополимеров. Кривые элюирования очень близки к изотермам связывания элюируемого вещества с иммобилизованным аффинантом, и, следовательно, из хроматограммы можно получить термодинамические параметры молекулярных взаимодействий. Метод эквивалентен повторяющемуся диа-лизу и имеет много преимуществ по сравнению с обычным равновесным диализом. Например, он требует намного более низких концентраций и небольших количеств образца, несколько образцов разных молекул можно наносить одновременно и обнаруживать небольшие различия в связывающих способностях при хорошем разделении. [c.55]

Ряд термодинамических параметров был получен из экспериментальных изотерм связывания. Член был определен исходя из концентрации свободного олигомера в точке перегиба изотермы связывания, а член (4У2Уа)- — исходя из тангенса угла наклона изотермы связывания в этой точке. Такие приемы оправданны, если (т С 1. Для сг было найдено значение 0,017. [c.55]

Полагая известным кооперативный параметр Ь (0,1—0,001), можно смоделировать изотерму связывания и кривые элюирования при этом полученные кривые элюирования будут иметь прямоугольный вид, поскольку при некоторой концентрации олигомера изотерма связывания резко стремится к нулю, что отражает влияние энтроппи образования петли из двух цепей полимера. Однако экспериментальные кривые элюирования не являются прямоугольными (рис. 3.10) и экспериментальная изотерма связывания не стремится резко к нулю (рис. 3.8). [c.56]

Мы можем также показать, что Х-537А в растворе образует комплексы с Sr +, Са +, Mg +, а также Ва + и ионами щелочных металлов. Изотермы связывания с Ва + согласуются с таким составом комплекса (ионофор)2Ва + [71]. Х-537А действует как ионофор для двухвалентных ионов мы подтвердили его способность переносить jj 9ogj.2+ g объемную фазу, состоящую из толуола и бутанола [71]. [c.264]

Исходя из вида кривой насыщения, представленной в координатах Скэтчарда, можно предположить, что ДАДЛЭ или взаимодействует с двумя типами связывающих мест, или имеется связывание ДАДЛЭ мембранами мозга с отрицательной кооперативностью. Как было указано выше, координаты Хилла не позволяют дискриминировать эти два случая. Поэтому представим изотерму связывания в координатах Бьеррума (рис. 3.52). Исходя из вида графика в этих координатах нельзя предположить существование более чем одного типа мест связывания. По точке перегиба log (1,3 нМ) определяем константу диссоциации (20 нМ). [c.403]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология