Контактные расстояния

Эмпирические нижние границы невалентных контактных расстояний [29] [c.30]

Конформационное пространство, интервал углов ф и ), допустимых для остатка без боковой цепи (Gly), показаны на рис. 2.3, а. Эта 0ф-карта построена для жесткой пептидной связи с параметрами, приведенными на рис. 2.1, а, и с учетом обеих, нижней нормальной и нижней предельной, границ контактных расстояний (табл.2.1). Разметка карты выполнена по старой номенклатуре [27]. При нанесении новых значений ф, 4 [21] начало сдвигается в центр карты. Остаток Gly имеет большую и непрерывную разрешенную область, занимающую около 50% пространства. Явно запрещенные контакты возникают между атомами H +i и 0/ i в центре, а также между атомами 0/-i и О,. Менее заметные затруднения обнаружены между атомами Н, и Нг+ц 0 j и С , а также 0 i и N,+i. Наименее значимо стерическое взаимодействие между атомами N,- и H i- [c.30]

Энергетические параметры могут быть определены из данных по кристаллическим структурам. Абсолютную величину параметров потенциала 6—12 Леннард-Джонса можно определить по контактным расстояниям и контактным энергиям в кристаллах малых мо- кул, которые следуют из данных рентгеноструктурного анализа и, например, теплот сублимации. Эти же данные можно получить Из экспериментов по рассеянию атомных и молекулярных пучков. [c.39]

Наблюдаемые вандерваальсовы контактные расстояния для пар [c.44]

Контактные расстояния между атомами в полипептидах [c.184]

Можно рассмотреть предельный случай, когда значения констант Гамакера для частиц и среды тождественно равны. В этом случае лондоновское притяжение равно нулю. Несмотря на то, что при этом эффекты, обусловленные постоянными диполями, могут приводить к возникновению конечного значения силы притяжения на контактных расстояниях между частицами (т. е. на расстояниях порядка в несколько десятых нанометра), барьер соответствующей толщины, состоящий из подходящего растворимого компонента, может оказаться достаточным для противодействия остаточным силам притяжения и обеспечить устойчивость дисперсии. [c.23]

Таким образом, если химическая природа частиц и дисперсионной среды подобны, то и близкодействующие, обусловленные постоянными диполями, взаимодействия на контактных расстояниях существенно уменьшаются (до значений, малых по сравнению с кТ). Это позволяет получать устойчивые дисперсии без использования специального стабилизатора. Строго говоря, такие системы практически не существуют. К ним, однако, близки дисперсии частиц полимера, содержащего поперечные связи, которые препятствуют полному растворению, но допускают некоторое набухание частиц (см. раздел V. ). [c.23]

Уравнение (25) позволяет определить минимальное значение константы ассоциации при данном контактном расстоянии между ионами. Электролиты, менее ассоциированные, чем предсказано электростатической теорией, - это обычно электролиты со значительной сольватацией ионов, такие, как, например, хлористый литий в этиловом спирте. В этих случаях включение одной или нескольких молекул растворителя между ионами, связанными в пару, увеличивает рас- [c.35]

Если начать со связей О — Н. .. О, то мы видим, что их длина может быть меньше ван-дер-ваальсового контактного расстояния между двумя кислородными атомами на величину до 0,25 А. Разность между Ку и Нср близка к нулю для самых длинных Н-связей, встречающихся в кристаллах гидроокисей. Однако даже и в этом случае нельзя констатировать отсутствия влияния Н-связи, поскольку мы не учитывали вклада в величину Ку радиуса водорода, помещенного между двумя кислородными атомами. В самом [c.245]

Если, однако, отношение радиусов меньше значения, приведенного на рис. 18.1, то анионы соприкасаются между собой, расстояние между катионом и анионом становится больше контактного расстояния ионов, [c.540]

На <р, -диаграмме (рис. 3-12) транс-петидиых конформаций Рамачандрана разрешенные комбинации углов иф лежат в заштрихованной области (расчет произведен с нормальными радиусами атомов табл. 3-7). Используя минимальные контактные расстояния, разрешенную зону расширяют (ограничена штриховой линией), и в окрестностях точки р = ф = 240 появляется новая разрешенная облает . [c.376]

Эти Карты часто называют картами Рамачандрана . а — карта глицина, не имеющего боковой цепи, с использованием модели жестких сфер с нормальными и с нижними граничными (---) контактными расстояниями, приведеинымн в табл. 2.1. В некоторых областях указаны запрещенные контакты. Обозначения атомов даны на рис. 2.2. б — карта аминокислот, содержащих -атомы, построенная с использованием той же модели жестких сфер. Указаны конформации правой а-спиралн, Р-складчатого листа н коллагена. Отмечены стерические затруднения, вызванные -атомом, которые сводят большую область глнцина к указанной иа рисунке меньшей области. Три разрешенные области иногда обозначают как — правая а-спираль, область вокруг значка а, aL — Левая а-спираль, область (0, 1))) (-l-60 -1-60 ), е — вытянутая цепь, область вокруг значка р. В предположении модели жестких сфер (- - - нормальные радиусы ---радиусы, отвечающие нижним границам) указаны области, разрешенные для поли-Ь-чис-алаиина. Конформация, приведенная на рис. 2.6, обозначена х, а конформация, отвечающая поли-Ь-пролииу I (полностью цис), обозначена как х, обведенный кружком. [c.31]

Вандерваальсовы радиусы приблизительно соответствуют контактным расстояниям. Вандерваальсовы потенциалы позволяют определить расстояния, отвечающие вандерваальсовым контактам между данными атомами. Ннжние границы этих расстояний, полученные из кристаллических структур, определили Рамачандран и Сасисекхаран [29]. Они составляют около 75% равновесных расстояний в табл. 3.2 и отвечают энергии отталкивания, равной приблизительно 1 ккал/моль. Эти контактные расстояния были использованы в модели жестких сфер для оценки стерических затруднений при Са-атоме полипептидной цепи [28] (рис. 2.3), [c.44]

Таблица 4.2. Контактные расстояния между агомами в нолинентидах

Цинковые краски требуют отверждения для большинства предложенных рецептов. Это может быть термонагрев (3 ч при 230 °С) или внесение в атмосферу СОг, или обработка раствором кислоты после сушки. Были предложены самоотверждающиеся водостойкие цинковые краски на основе полисиликата лития с модулями 4,8 и 8,0. Как и на алюминии, на цинке при обработке силикатом натрия образуется тонкая нерастворимая пленка. Чтобы краска стала водостойкой, вероятно, необходимо, чтобы контактное расстояние между частицами цинка в краске было соизмеримо с толщиной этой пленки. Поэтому дисперсность порошков для цинковых красок очень высока и строго регламентирована в дозировке каждой градации. [c.125]

При оценке величин сжатия приняты следующие предельные ван-дер-ваальсовы контактные расстояния 0,32 нм для О—Н...О, 0,33 нм для О—Н...Н, 0,34 нм для К—Н...О, 0,35 нм для Н—Н...Ы. [c.725]

Представляет интерес полученная путем моделирования радиальная функция распределения пар g(r). На рис. 2.6 приведена функция распределения пар кислород-—кислород молекул воды goo(r), рассчитанная с учетом всех пар молекул растворителя. Результаты в пределах статистической точности расчета согласуются с полученными при моделировании объемной воды [3]. Из рисунка видно, что функция goo(r) характеризуется острыми пиками и впадинами — результат проявления структуры с водородными связями. Первый пик, наблюдаемый при 2,85 А, соответствует минимуму энергии О—Н... О водородной связи. Среднее распределение атомов кислорода воды вокруг углеродных атомов метильной группы представлено на рис. 2.7 приведены средние результаты для трех метильных групп растворенного вёщества. В противоположность картине, приведенной на рис. 2.6, первый пик широкий. Центр пика соответствует 3,7 А, что сравнимо со средним контактным расстоянием между молекулой воды и метильной группой, равным примерно сумме их вандерваальсовых радиусов (3,8 А). Поскольку молекулы воды могут контактировать с метильными группами только внутри ограниченного угла вокруг атома углерода (из-за наличия остатка растворенного вещества, соединенного с метильной группой), высота первого пика в go (r) меньше величины, которая достигалась бы, если метильная группа была целиком доступна растворителю (как, например, в растворе метана). Ширина и радиальное расположение сравнимы с найденными при исследованиях аргоноподобных систем [5], т. е. первый пик соответствует примерно контактному расстоянию и относительно более широк, чем в goo(r) для воды, особенно со стороны больших значений г. Вид функции go (r) в аргоне указывает на то, что структура определяется не сильным притяжением водородных связей, как в чистой воде, а отталкиванием сфер Леннарда-Джонса. [c.42]

Пратт и Чандлер [71] показали, например, что потенциал средней силы (ПСС) двух неполярных частиц на контактном расстоянии в водном растворе не обнаруживает существенных отличий от такового в растворителе, состоящем из твердых сфер (РТС). Таким образом, необычные свойства воды связаны с поведением ПСС на расстояниях, далее 1-го минимума. Это, в частности, прекрасно видно по результатам расчета вторых вн-риальных осмотических коэффициентов (табл. V. 4), [c.160]

Если два каких-либо атома находятся на расстоянии 3-4 Л друг от друга, то между ними возникает неспецифическое притяжение. Такое притяжение, называемое вандер-ваальсовым взаимодействием, менее специфично и значительно слабее, чем электростатические взаимодействия или водородные связи, однако оно имеет не менее важное значение в биологических системах. В основе возникновения вандерваальсовых взаимодействий лежит тот факт, что распределение электронного заряда вокруг атома меняется во времени. В любой взятый момент времени распределение заряда не является полностью симметричным. Эта преходящая асимметрия электронного заряда одного атома вызывает изменение распределения электронов вокруг соседних атомов. По мере сближения двух атомов до так называемого расстояния вандерваальсова контакта сила притяжения между ними возрастает (рис, 6.27). На расстоянии, более коротком, чем контактное, начинают преобладать очень большие силы отталкивания, поскольку происходит перекрывание двух внешних электронных облаков. Контактное расстояние между атомами кислорода и углерода, например, составляет 3,4 А, т. е, сумму контактных радиусов атома О (1,4 А) и С (2,0 Л), [c.124]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология