Дезоксинуклеозид фосфаты

При прямом фосфорилировании тимидина (или дезоксицитидина) избытком дибензилхлорфосфата с последующим гидрогенолизом с целью удаления бензильных групп образуется дезоксинуклеозид-3, 5 -дифосфат [22] наряду с небольшим количеством 5 -фосфата З -фосфата при этом не образуется, что указывает на некоторую избирательность фосфорилирования гидроксильной группы в положении 5 [145]. Пиримидиновое основание может оказывать значительное влияние на относительную реакционную способность гидроксильных групп сахара использование той же методики для [c.152]

ДЕЗОКСИНУКЛЕОЗИД-3 - И ДЕЗОКСИНУКЛЕОЗИД-5 -ФОСФАТЫ [c.156]

ДНК, НО очень быстро гидролизует ДНК, денатурированную нагреванием, или ДНК из бактериофага Х-174 до дезоксинуклеозид-5 -фосфатов [298]. [c.601]

Дезоксирибонуклеазы (К-Ф.3.1.4.5) — собирательное название многих с различной степенью специфичности гидролизующих ДНК ферментов. Их можно разделить на две группы эндонуклеазы и экзонуклеазы. Эндонуклеазы весьма условно также делятся на две группы — ДНК-аза I и ДНК-аза П. Действие ферментов первой группы приводит к образованию из ДНК дезоксинуклеозид-5 -фосфатов. Действие второй группы заканчивается образованием дезоксинуклеозид-З -фосфатов. Со временем все очевиднее становится условность такого разделения, поскольку между этими двумя крайними случаями обнаруживается большая часть других ферментов этого класса. В настоящее время описано много ДНК-специфических эндонуклеаз различного биологического происхождения. Большой теоретический и практический интерес среди них представляют так называемые рестриктазы — эндонуклеазы, которые весьма специфически, в зависимости от нуклеотидной последовательности расщепляют ДНК- Такими являются, например, бактериальные эндонуклеазы, способные расщеплять вирусную ДНК, отличающуюся от ДНК хозяина характером структурной модификации. [c.48]

Это было достигнуто изучением гидролиза ДНК в различных условиях. Ферментативный гидролиз ДНК в присутствии фосфодиэстеразы змеиного яда дает 5 -фосфаты дезоксинуклеозидов (I). Напротив, при кислотном гидролизе ДНК удалось выделить 3, 5 -дифосфаты пирими-динзедоксинуклеозидов (П). [c.247]

Присутствие фосфодиэфирной связи в нуклеиновых кислотах как основного типа межмономерной связи было установлено на основании результатов потенциометрического титрования Структура V (Й = Н) для ДНК—единственный возможный тип структуры, согласующийся с выделением дезоксинуклеозид-5 -фосфатов УП при ферментативном гидролизе ДНК (под действием фосфоди-эстеразы кишечника ) и 3, 5 -дифосфатов пиримидиновых [c.41]

ЧТО указывает на существование основного катализа. В реакцию вступают главным образом ненротонированные формы оснований в составе нуклеозидов и нуклеотидов. В случае цитидина и дезоксицитидина показана, однако, возможность участия в реакции и протонированных форм нуклеозидов причем константы равновесия для протонированных форм приблизительно в 10 раз меньше, чем для нейтральных форм. При изменении температуры скорость реакции различных нуклеотидов с формальдегидом изменяется примерно одинаково. Для дезоксинуклеозид-5 -фосфатов значение энергии активации найдено равным приблизительно 16,8 ккал/моль Изменение ионной силы среды мало влияет на скорость реакции. [c.411]

Рис. 6.4. Зависимость скорости реакции дезоксинуклеозид-5 -фосфатов с диазотированной 2-аминобенэол-1,4-дисульфокислотой от pH

Под действием производных карбодиимида или уксусного ангидрида в диметилсульфоксиде происходит отщепление оснований от дезоксинуклеозид-5 -фосфатов или олигодезоксинуклеотидов с нефосфорилированной концевой ОН-группой при С-З. В этих условиях ОН-группа при С-З остатка дезоксирибозы окисляется до карбонильной и гетероциклические основания отщепляются по механизму р-элиминации . [c.507]

Обработка дезоксинуклеозидов хромовым ангидридом в пиридине также приводит к производным уроновых кислот Окисление, по-видимому, частично проходит и по вторичной гидроксильной группе при С-З, но соответствующие кетоны нестабильны и крайне легко разлагаются с выделением гетероциклического основания. Присутствие оснований в реакционной смеси было обнаружено как при реакции с нуклеозидами, так и при окислении дезок-сицитидин-У-фосфата и тимидин-5 -фосфата. [c.530]

Для отщепления З -концевых нуклеотидных звеньев от олигодез-оксинуклеотидов была использована реакция окисления первичных и вторичных спиртов диметилсульфоксидом в уксусном ангидриде. Так, дезоксинуклеозид-5 -фосфаты при нагревании в растворах уксусного ангидрида и пиридина в диметилсульфоксиде [c.591]

Устойчивость гликозидной связи в кислой среде широко варьирует в зависимости от природы как основания (и его заместителей), так и сахара (и его заместителей). Так, напрпмер, дезоксинуклеозиды менее устойчивы, чем рибонуклеозиды, тогда как в пределах каждого класса устойчивость изменяется в следующем порядке урацил-(или тимин-) > цитозин- > аденин- > гуаниннуклеозид. На скорость кислотного расщепления гликозидной связи может оказывать значительное влияние наличие ацильного остатка в гетероцикле 100, 101], хотя имеется и другая точка зрения [102]. Этерификация гидроксильных групп сахара также влияет на устойчивость гликозидной связи, как, например, в случае 0-ацетил-2 -дезоксигуанозина [79], фосфатов тимидина [103] и 2 -0-/1-толуолсульфониладенозина [78] ]4а это указывает также удивительная устойчивость 2, 3, 5 -трн- [c.37]

Первый нуклеотид, инозиновая кислота (по-гречески — мышечная ткань), был выделен Либихом [2] в 1847 г. из мясного экстракта отчасти как результат полелп1ки, поднятой Берцелиусом по поводу наличия креатина в сыром и вареном мясе). С тех пор было выделено большое число мононуклеотидов, как правило, 5 -фосфаты, хотя в яде тигровых змей и родственных видов был найден также аденозин-З -фосфат 13]. Эти соединения выделяют прямой экстракцией тканей или организмов 14—9], в которых они обычно присутствуют в небольших количествах в качестве промежуточных соеди-нени1 обмена. Однако основным источником мононуклеотидов являются их полимерные производные, нуклеиновые кислоты. При щелочном гидролизе в мягких условиях [10, 11] рибонуклеиновой кислоты образуется смесь 2 - и З -фосфатов нуклеозидов, которую можно легко разделить с помощью ионообменной хроматографии 112], Для выделения аналогичных 5 -эфиров требуется применение ферментативного гидролиза, как правило, с использованием фосфо-диэстеразы змеиного яда 113, 14]. Подобная ферментативная обработка дезоксирибонуклеиновой кислоты после предварительной обработки дезоксирибонуклеазой приводит к дезоксинуклеозид-5 -фосфатаы [15—17]. Очищенная диэстераза змеиного яда значи- [c.123]

Строение дезоксинуклеозид-З -фосфатов, выделенных из ферментативных гидролизатов дезоксирибонуклеиновой кислоты, было легко установлено благодаря устойчивости, проявленной этими нуклеотидалш к 5 -нуклеотидазе, а также непосредственным сравнением их с синтетическими соединениями [67]. [c.131]

Вышеописанные методы можно использовать также и для получения эфиров дезоксинуклеозид-З -фосфатов, а реакция с диазометаном применима к рибопуклеозид-2 - и рпбонуклеозид-З -фосфатам [158, 160]. Этерификация нуклеозид-2, 3 -циклофосфатов первичными спиртами, катализируемая как основаниями [138, 161], так и кислотами (последняя предпочтительней) [162, 163], приводит к смеси нуклеозид-2 - и пуклеозид-З -алкилфосфатов. Такой этери-фикации подвергается и нуклеотидмочевина, получающаяся при действии на мононуклеотид дициклогексилкарбодиимида во влаж- [c.162]

Как и в случае адениновых нуклеотидов, широкое распространение имеют 5 -фосфаты, 5 -пирофосфаты и 5 -трифосфаты цитидина, гуанозина и уридина [13—16]. Они являются промежуточными соединениями при биосинтезе рибонуклеиновых кислот. Трифос-фаты участвуют также в биосинтезе ряда диэтерифицированных пирофосфатных производных кроме того, они заменяют АТФ в качестве фосфорилирующего агента или кофермента в некоторых ферментативных реакциях [17—21]. Полифосфаты дезоксинуклеозидов также выделены [22—25], и снова, помимо функции непосредственных предшественников дезоксинуклеиновой кислоты, второй нх главной функцией является, вероятно, участие в биосинтезе промежуточных соединений, таких, как тимидин-5 -пирофосфат-глюкоза и дезоксицитидин-5 -пирофосфатхолин. Строение всех этих нуклеозидполифосфатов установлено методами, аналогичными примененным для определения строения АТФ, и подтверждено синтезом. [c.189]

Смешанные ангидриды алшнокислот и аденозин-5 -фосфата (и, по-видимому, других нуклеозид- и дезоксинуклеозид-5 -фос фатов) дюжно получить пои обработке смеси нуклеотидов и свобод ных аминокислот дициклогексилкарбодиимидом в водном пири дине [399]. Значительно более высокие выходы получаются npj использовании N-карбобензоксиаминокислот с последующим уда лением защитных групп из продукта гидрированием [400, 401] В другом методе с использованием бензилмеркаптоформильных производных аминокислот свободный ациладенилат получается окислением защищенного промежуточного продукта надбензойно кислотой [402]. [c.252]

Репликация последовательности при ферментативных (Е. соН) синтезах ДНК была изучена с использованием меченных Р субстратов и ДНК затравки, изолированной из вирусных, бактериальных и животных источников. Гидролиз полученных полидезоксинуклеотидов диэстеразой до дезоксинуклеозид-З -фосфатов с последующим определением распределения радиоактивности показал, что в каждом случае присутствуют все 16 возможных динуклеотидных (ближайший сосед) последовательностей, что это распределение является уникальным, не случайным, репродуцируемым и не предопределяется нуклеотидным составом затравочной ДНК и что эта ферментативная репликация включает образование пар аденин — тимин и гуанин — цитозин в двух цепях с противоположной последовательностью оснований (т. е. с противоположной полярностью ), как в модели Уотсона и Крика. [c.322]

Окончательное установление первичной структуры дезоксинуклеиновых кислот связано с рядом проблем, еще труднее разрешимых, чем в случае рибонуклеиновых кислот, и достижений в этой области пока еще мало. Тем не менее достигнут некоторый успех в определении последовательности оснований в одиночной цепи олигодезоксинуклеотидов. Такие продукты распада легко получаются в результате обработки дезоксирибонуклеиновых кислот дезоксирибонуклеазами. Панкреатическая дезоксирибонуклеаза [350] (дезоксирибонуклеаза I) активна в нейтральном растворе, требует присутствия магния или некоторых других двухвалентных катионов и имеет минимальный молекулярный вес 61566 [351]. Этот фермент катализирует гидролиз ДНК до сложной смеси, из которой с помощью хроматографии на бумаге, электрофореза [352] и ионообменных методов [353] были выделены дезоксинуклеозид-5 -фосфаты ( 1 %), ряд динуклеотидов (- 16%), тринуклеотиды и более высокомолекулярные олигодезоксинуклеотиды с 5 -фосфатной группой на конце. Хотя специфичность действия дезоксирибонуклеазы I не установлена полностью, ясно, что расщепление происходит по связи —3 - О — Р. Изучение динуклеотидов, содержащих как пуриновые, так и пиримидиновые основания, указало на то, что такие соединения являются почти исключительно 5 ф—Пир—З ф—5 Пур, изомерная же последовательность 5 ф—Пур—З ф—5 Пир фактически отсутствует. Предположение, что ферментом атакуются преиму- [c.421]

Другой механизм гидролиза, рассматривающий образование 3,4-или 4,5-циклофосфатов при участии Q-гидроксильной группы ациклической формы апуриновых звеньев дезоксирибозы, является, по-видимому, менее вероятным, поскольку промежуточные продукты такого рода могли бы дать пиримидиновые дезоксинуклеозиды или пиримидиновые полидезоксинуклеотиды, которые лишены концевой моноэтерифиццрованной фосфатной группы. Небольшие количества дезоксинуклеозид-3 - и дезоксинуклеозид-5 -фосфатов возможно образуются в результате такого механизма гидролиза или в результате вторичного гидролиза образовавшихся ранее дезоксинуклеотидов или олигодезоксинуклеотидов, имеющих две концевые фосфатные группы. [c.431]

Дальнейшее изучение кислотных гидролизатов дезоксинуклеиновых кислот показало, что, кроме простых дезоксинуклеозид-3, 5 -дифосфатов, в гидролизатах действительно присутствуют пиримидиновые олигодезоксинуклеотиды ряда (пиримидиндезоксинуклео-зид) (фосфат) +1 и что они образуют в соответствии с описанным механизмом элиминирования основную массу пиримидиннуклео-тидных продуктов деградации [410, 411]. С помощью ионообменной [c.432]

Дезоксинуклеиновые кислоты из Т-четных бактериофагов полностью гидролизуются до дезоксинуклеозид-5 -фосфатов фосфодиэстеразой из Es heri hia oli. Хроматографический анализ продуктов показал, что в случае бактериофага Т2 25% общего содержания [c.444]

Важное значение имел открытый Очоа и Гринберг-Манаго ферментативный метод синтеза полирибонуклеотидов из нуклеотида и аналогичный синтез полидезоксирибонуклеотидов из дезоксинуклеозид-5 -три-фосфатов, осуществленный Корнбергом. [c.681]

Смотреть страницы где упоминается термин Дезоксинуклеозид фосфаты: [c.167] [c.14] [c.100] [c.101] [c.131] [c.261] [c.87] [c.93] [c.125] [c.126] [c.143] [c.158] [c.322] [c.323] [c.419] [c.424] [c.424] [c.429] [c.432] [c.433] [c.434] [c.435] [c.437] [c.438] [c.442] [c.443] [c.444]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология