Субстратно

Фермент- субстратный комплекс [c.444]

В заключение отметим чтобы модель фермента была действующей, она должна отвечать ряду критериев, характерных для ферментативного катализа, в том числе обладать субстратной специфичностью, т. е, селективно связывать субстрат. Каталитическая реакция, моделирующая ферментативный процесс, должна также подчиняться кинетике Михаэлиса — Ментен (явление насыщения субстратом) при этом должна увеличиваться скорость реакции и осуществляться би- и/или полифункциональный катализ [348], [c.265]

Ферментативная реакция — это, как правило, многостадийный процесс, в котором на первой стадии образуется комплекс между ферментом и субстратом (комплекс Михаэлиса), Чаще всего эта стадия представляет собой сорбцию субстрата на ферменте, обусловленную, например, их гидрофобным, полярным и (или) ионным взаимодействием (см, гл. I), На образование комплекса Михаэлиса, предшествующее химическому взаимодействию, указывают многочисленные экспериментальные данные, в том числе и кинетические (см, гл. V и VI) некоторые фермент-субстратные комплексы были выделены в чистом виде [1]. Возникает вопрос, в какой мере способствует (и способствует ли) образование фермеит-субстратного комплекса ускорению катализируемой реакции. [c.34]

Ранее полагали, что стадиен, определяющей скорость реакции электрофильного замещения, является образование а-комп-лекса, а генерация я-комплекса представляет собой быстрый равновесный процесс (рис. 3.1). Однако в последнее время высказывают предположение о важной роли интермедиатов, предшествующих образованию а-комплексов. Так, установлено, что при использовании в реакции активных электрофилов наблюдается низкая субстратная селективность при сохранении высокой позиционной селективности. В подобных случаях скорость реакции определяется образованием я-комплексов. [c.64]

С достаточно высокой степенью точности описано количественное соотношение изомеров, а также субстратная и позиционная реакционная способность ароматических соединений в ряде реакций электрофильного замещения. Полученные результаты основаны на предположении о первоначальном образовании л-комплексов, структура которых контролируется электронными факторами, и дальнейшем их превращении в а-комплексы, изомерный состав которых определяется термодинамической стабильностью. [c.86]

Ниже представлены наблюдаемые константы скорости и т (л-моль ч- ) и субстратная селективность /йт в [c.188]

В фермент-субстратном комплексе фермент взаимодействует с молекулой (молекулами) субстрата (субстратов), ослабляя ключевые связи и уменьшая энергию активации. Обсуждая работу автомобильных каталитических [c.443]

Данный простой пример приводит к интересным предположениям относительно механизмов ферментативных реакций. Происходит ли конформационное изменение субстратного тетраэдрического интермедиата пли остатка активного центра фермента Очевидно, для решения этой проблемы необходимы биоорганические модели. Такие модели, которые еще только будут созданы, дадут возможность определить механизм действия протеаз исходя из тетраэдрического интермедиата с относительно фиксированной конформацией. [c.252]

Рассмотрим триггерные свойства точечной мембранной системы, используя кинетическую модель ферментативного процесса с субстратным угнетением и обратимой реакцией притока субстрата извне [4] [c.34]

Наряду с субстратной селективностью для данных условий экспериментов была изучена также избирательность реакции относительно положений ароматического ядра в толуоле. Фактор селективности Sf, мера неспецифичности Нз и фактор стерического затруднения Е при указанных температурах представлены ниже [c.184]

Таким образом, в реакции переалкилирования наблюдается параллелизм между способностью электрофильного агента всту пать во взаимодействие с бензолом и толуолом и направлением атаки в то или иное положение толуола. Это — отличительная особенность переалкилирования по сравнению с рядом реакций ароматического замещения, характеризующихся низкой субстратной и одновременно высокой позиционной селективностью. [c.185]

Отсутствие скелетной изомеризации при межмолекулярном переносе алкильных групп может быть объяснено на основании механизма, предложенного Мак-Коли-и Лином [201]. Этот механизм соответствует наблюдаемым величинам кинетического изотопного эффекта при использовании дейтерированных в а-положение алкилбензолов и ряду других данных, но не соответствует предсказываемым этим механизмом высоким значениям позиционной и субстратной селективности [219], а также различиям скоростей межмолекулярной миграции первичных, вторичных и третичных алкильных групп. Следовательно долевая значимость и этого пути в случае его существования должна быть незначительна. [c.226]

Обратим внимание, что образование промежуточного фермент-субстратного комплекса (комплекса Михаэлиса) само по себе вовсе не оказывает влияния на ускорение ферментативной реакции (в кинетическом режиме второго порядка, т. е. при [НУ] С Кз)- Дело в том, что концентрация стабилизированного пере- [c.40]

Интенсивность флуоресценции фермент-субстратного комплекса / пропорциональна его концентрации [c.86]

Следовательно, построив зависимость aji от l/[So], можно определить константу диссоциации фермент-субстратного комплекса Ks- [c.86]

Была изучена позиционная и субстратная селективность реакции алкилирования нафталина алкилгалогенидами (метил-, этил-, изопропил- и грет-бутилбромид) при контакте с А1С1з в растворах нитрометана и сероуглерода в условиях конкурирующих реакций с бензолом и нафталином. Установлено, что в сероводороде субстратная селективность, выраженная отношением н/ б, и позиционная селективность (отношение скоростей образования а- и р-алкилнафталинов) изменялись от условий реакции. Когда в качестве растворителя использовали нитрометан, отношение йн/ б и изомеров а-/р-алкилнафталинов при 25 °С оставалось постоянным в случае метилирования и этилирования [c.154]

Когда мы проводим анализ, отталкиваясь от реальности, то имеем дело с множеством материальных (субстратных) частиц — атомов. В этом случае определенность используемых понятий достаточно высока. Понятие же химия — идеальное (не субстратное), субъективное, а значит, не строго определенное. Следовательно, и членение этого общего на части (элементы) не наделяет их признаками субстрата, делает их в такой же мере идеальными и неопределенными, как и делимое общее, [c.141]

С аналог ичных по зиций подходил и Ь. М. Кедров н своих попытках раскрыть объективное содержание понятия химический элемент [3]. Рассматривая его в разрезе элемен -атом, где элемент выступает как вид атомов, он пытался установить генетическую и субстратно-смысловую связь между этими понятиями и системно-иерархическую соподчиненность в русле концепции о дискретном строении материи. А при рассмотрении химического элемента в разрезе элемент-простое вещество, где элемент выступает как материальное содержание простого вещества, он пытается с позиций диалектической логики установить критерии сходства и различия этих понятий, причину их частого отождествления. Здесь он отмечает, что данный анализ надо проводить с позиций не только химической науки. [c.164]

Допустим, что химическое превращение фермент-субстратного комплекса ХЕ РV протекает намного быстрее десорбции субстрата с активного центра, т. е. 1,внутр -1- В данном случае значение к определится скоростью диффузии субстрата к активному центру к л к- ) и процесс (2.1) фактически лишен специфики, которую в него вносит взаимодействие Е-Р (вернее, свободная энергия этой сорбции). Поэтому больший интерес вызывает обратное соотношение кон- [c.37]

КУ] /С и, фермент насыщен субстратом и, следовательно, скорость процесса (2.1) кинетически контролируется химическим превращением фермент-субстратного комплекса [c.38]

Молекулы реаге 1Т0В (субстраты) и (1 ермснт подходят друг к другу. Молекулы субстратов присоединяются к активному центру фермента, образуя фермент-субстратный комплекс, в котором их функциональные группы удерживаются в нужном положении (рис. VII.1) [c.443]

Подробное изучение селективности (субстратной и позиционной) в зависимости от структуры реагента и температуры реакции проведено на примере переалкилирования смеси [1—6- С]-бензола и толуола моноалкилбензолами различной молекулярной массы и структуры А1к = СзН7, СгНз, изо-СзН , вгор-С4Нд, ЦИКЛО-СбНц. [c.183]

Таблица 5.9. Константы скорости ( т и л-мoль- -ч- ) и субстратная селективность Ат/Аб в реакции переалкилирования бензола и толуола алкилбензолами

Если фермент-субстратный комплекс флуоресцирует в другой спектральной области, нежели исходные компоненты, можно, измеряя флуоресценцию этого комплекса, определить ко(нстанту его диссоциации. В условиях избытка субстрата по сравпению с ферментом ([Eq] [So]) система описывается следующими уравнен ия ми [Е] [S]. rggi [E][S] ([Eq]-[ES])[S ] [c.85]

Для проведения измерения готовят раствор субстрата и фермента (в качестве субстрата используют 1-диметиламиноиафта-линсульфонил-пептид в качестве фермента — пепсин) в 0,1 М формиатном буферном растворе (pH 3,1). Концентрации субстрата (моль/л) 0,02-10-3 0,06-10- 0,Ы0- 0,15-10- 0 2-10-з. Концентрация фермента постоянна 7,14-10 моль/л. Измеряют флуоресценцию образовавшегося фермент-субстратного комплекса (А-воаб = 285 нм, >ифл = 500 нм) в каждом из растворов и строят график зависимости aji от l/[So]. По тангенсу угла наклона определяют константу диссоциации комплекса /(,. [c.86]

Помимо эффекта сближения и эффекта ориентации следует учитывать также третий фактор — стерическое сжатие. Тем не менее эти факторы не объясняют повыщення констант скорости реакций ио крайней мере еще в 10 —10 раз. Среди возможных объяснений следует упомянуть электростатическую стабилизацию переходного состояния и снятие напряжения в основном состоянии. Следует учесть и такой фактор, указанный Бендером, как замораживание субстратной специфичности . Примером этого служит ароматическая полость в, а-химотрипсине (см. ниже), создающая благоприятную стерическую ситуацию для боковой цепи аминокислоты субстрата. [c.215]

Полимер-субстратные взаимодействия были изучены методом газовой хроматографии данные использованы для определения степени рацемизации аминокислот и других природных соединений. Во всех случаях о-энантиомер рацемической смеси аминокислот элюировался из ь-аминокислотиой (полимерной) фазы раньше 1.-формы. Из рис. 5.14 следует, что преимущественно взаимодействует один энантиомер. Такой благоприятный стэкинг между акцепторной поверхностью полимера и субстратом невозможен, если субстрат имеет о-коифигурацию. Значение диметилсилоксановых [c.300]

Хотя налицо все факторы, благоприятствующие изменению структуры, система предпочитает сохранить ароматичность. Следовательно, образование NADH должно управляться конформацион-ными изменениями, которые смещают равновесие в сторону неароматической системы. Однако внутримолекулярный перенос гидрида наблюдался [276] в присутствии лактатдегидрогена.яы из сердца свиньи с использованием кофермент-субстратного ковалентного аналога, состоящего из лактата и NAD+. [c.403]

В предыдущей главе мы, по существу, уже прошли часть пути, ведя анализ с субстратных позиций, и обнаружили при членении общего (системы атомов) такую структурную часть (элемент), как изопротонный генетический ряд. Этот элемент структуры Системы атомов при рассмотрении его внешних (по отношению к ядру) свойств показал, что этой, второй, своей ипостасью, он выступает в качестве элемента системы нового, более высокого уровня организации вещества. Заработала электронная оболочка, одинаковая для всех атомов этого ряда, что тождественно смыслу, приписываемому ранее химическому элементу. Вот мы и наткнулись на него, идя снизу вверх. Самое время было бы придумывать этому понятию название, если бы наука не присвоила его авансом, назвав "химическим элементом . И потому нам остается только сделать более или менее мягкую стыковку двух уровней организации материи и сделать логически корректную и лингвистически правильную связку понятий "изопротонного генетического ряда , "вида атомов , "химического элемента . [c.141]

Система же химических элементов не представляет собой субстратно цельного объекта, химические элементы рассеяны пространственно. Модель призвана свести их воедино, наглядно гюказать те признаки моделируемого объекта, которые прямо не созерцательны и существуют только функционально, делая моделируемый объект органически целостным. Модель, построенная в пространственных координатах, делает систему химических элементов физически цельной и наглядной. [c.193]