Валин грамицидине

Весьма важным и широко применяемым для лечения ряда болезней является антибиотик, выделяемый одним почвенным микробом. Молекула этого антибиотика, открытого в 1942 г. Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой и названного грамицидином С (советский), представляет собой сложный циклический декапептид, в состав которого входит по два остатка следующих пяти аминокислот пролин, валин, орнитин, лейцин, фенилаланин. Четыре первые аминокислоты имеют .-конфигурацию, а фенилаланин принадлежит к О-ряду. Полный синтез этого антибиотика был осуществлен в 1956 р. в Швейцарии (Р. Швицер и П Зибер), [c.602]

X = Val Y = Trp (триптофан) Валин-грамицидин А [c.219]

X = Val Y = Phe (фенилаланин) Валин-грамицидин В [c.219]

X = Val Y = Tyr (тирозин) Валин-грамицидин С [c.219]

Грамицидин С представляет собой трудно гидролизуемый полипептид, в состав которого входят эквимолекулярные количества пяти аминокислот /-валина, /-орнитина, /-лейцина, /-про-лина и /-фенилаланина. [c.480]

Из приведенного выше обсуждения очевидно, что аминокислотная последовательность пептида может быть определена по его масс-спектру, если можно идентифицировать пики, обусловленные расщеплением пептидной связи. Идентификация пиков аминокислотного типа фрагментации может быть облегчена подходящим выбором защитных групп. Ацилирование М-концевой аминогруппы пептида эквимолекулярной смесью уксусной и три-дейтероуксусной кислот (или смесью СОз-и СНз-декановых кислот) [25] приводит к появлению пар пиков равной интенсивности, отличающихся на 3 м. ед., которые соответствуют ионам аминокислотного типа фрагментации. Можно использовать другие смешанные реагенты, содержащие ацильные группы, например такие, как эквимолекулярная смесь гепта- и октадекано-вых кислот [18], которые для всех ацилсодержащих ионов дают пары пиков, отличающихся на 14 м. ед,, тем самым облегчая интерпретацию масс-спектров. В некоторых природных олигопептидах дублеты с разницей в 14 м. ед, могут быть вызваны присутствием различных аминокислотных гомологов, например валин или изолейцин в грамицидинах А, В и С [32]. Однако лучше использовать смешанные, содержащие СНз- и СОз-ациль-ные цепи. [c.198]

Изображая строение грамицидина С, мы воспользовались принятыми в химии белков сокращенными обозначениями аминокислот (лей — лейцин фал — фенилаланин про — пролин вал — валин орн — орнитин). При такой записи условно считают, что начало сокращенного обозначения соответствует аминному концу молекулы аминокислоты, конец—ее кислотному концу, т. е. обозначение — вал представляет собой группировку [c.440]

Перейдем к изложению пути синтеза пентапептидов Для их получения были использованы этиловый эфир трипептида (498) и метиловый эфир трипептида (505). С другой стороны, возникла необходимость предварительно осуществить синтез дипептида, содержащего остатки /-валина и /-орнитина. Однако вместо последнего был взят более доступный /,/-орнитин. Поэтому полученные в конечном итоге пентапептиды оказались несколько отличающимися от того пентапептида, который может образовываться при расщеплении грамицидина С. [c.362]

При перекристаллизации из ацетона грамицидин В образует палочки с т. пл. 258—259°, тогда как грамицидин А кристаллизуется в виде тонких листочков с т. пл. 227—228°. Грамицидин В менее растворим в органических растворителях, чем грамицидин А. По своему составу эти два антибиотика очень сходны между собой. Гидролиз с последующей распределительной хроматографией на бумаге показал, что в их состав входят все те аминокислоты, которые были раньше обнаружены в нефракционированном грамицидине, а именно валин, лейцин, триптофан, аланин и глицин. Однако эти два антибиотика отличаются друг от друга соотношением перечисленных аминокислот. Так, если содержание триптофана в грамицидине А принять за 100 ,с, то его содержание в грамицидине В составит только 85 /q. [c.367]

Порядок чередования аминокислот в небольших полипептидных цепях, содержащих 5—10 аминокислотных остатков, может быть установлен прн помощи весьма трудоемких и сложных аналитических методов. Таким путем была установлена, например, структура циклопептида — грамицидина С (см. гл. XV). Структура различных пептидов, получаемых при частичном гидролизе инсулина и гемоглобина, была установлена главным образом путем метки концевых групп динитрофторбензолом [17,89]. Результаты этих анализов показали, что как инсулин, так и гемоглобин построены из гетерогенных фрагментов. Так, например, пептид А, полученный из инсулина, содержал глицин, изолейцин, валин и тирозин. Определение аргинина, гистидина, лизина, фенилаланина и треонина в этом пептиде дало отрицательные результаты. Пептид В, выделенный из того же препарата инсулина, содержал фенилаланин, валин, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту, лизин, треонин и аланин [89] (см. гл. 111 и ХП1). Полученные данные указывают на то, что в пептидах, выделенных из инсулина, нет того периодического чередования аминокислот, о котором говорит Бергман [90]. [c.135]

Для оптимального разделения некоторых аминокислот, плохо отделяющихся друг от друга в перечисленных системах, используют п другие растворители, которые приведены в соответствующих руководствах (см., например Хроматография на бумаге//Под ред. И. Хайса и К. Мацека. М., 1962). Так, для отделения валина от фенилаланина (проблема, возникающая при анализе антибиотика грамицидина С. состоящего всего из пяти разных аминокислот) можно рекомендовать последовательное пропускание двух растворителей систему 2-бута-нол — 3%-ный аммиак (3 1), а затем систему н-бутанол — уксусная кислота — вода (8 3 1). [c.129]

Хотя из всего набора спектроскопических методов — инфракрасной и рамановской спектроскопии, ДОВ, КД, ЯМР, флуоресцентной и ЭПР-спектроскопии, часто лишь одна (лучше остальных) подходит для определенного конформационного исследования, все же полученная с ее помощью информация почти неизменно успешно дополняется данными, полученными с использованием другого метода. В предыдущих разделах неоднократно указывалось на множество примеров применения более чем одного спектроскопического метода примерами этого из области олигопептидов могут служить исследования защищенных олигомеров -аланина (ИК и КД) [15, 70], аналогов -валина и -норвалина [70] и грамицидина А [56] (ЯМР и КД). Хороший растворитель для олигопептидов, полипептидов и белков, гексафторизопропанол, используется для сравнительных исследований с применением ИК, ДОВ и КД [c.443]

Остатки О-аминокислот входят в состав многих природных пепти дов, прежде всего антибиотиков В частности, в грамицидин входит О-фенилаланин, в грамицидин А — О-валин, О-лейцин, О трипто фан, в актиномнцнн О О изолейцни, в полимнксин О-серин О Пролин встречается в эргоалкалоидах. [c.84]

Грамицидин С выделен Т. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой в 1942 г. из штамма споровой палочки Ba illus brevis, найденного в огородных почвах Подмосковья. Изучение химической природы грамицидина показало, что грамицидин построен из пяти различных аминокислот 1-пролина, 1-валина, 1-орнитина, 1-лейцина и d-фенилаланина, соединенных между собой по типу циклопептида. Свободная б-амипогруппа орнитина, обусловливающая основные свойства грамицидина С, способна вступать в реакцию с пикриновой кислотой с образованием пикрата и реагировать с азотной кислотой по типу первичных аминов. Блокирование этой аминогруппы вызывает инактивацию грамицидина С. В структуре грамицидина установлено следующее чередование аминокислот [c.310]

А, Н. Белозерским и Т. С. Пасхиной и продолженное затем зарубежными исследователями, показало, что он представляет собой полипептид, дающий при гидролизе эквимолекулярную смесь пяти аминокислот L-лейцина, D-фенилаланина, L-пролина, L-валина и L-орни-тина. Этот пентапептид повторяется в молекуле грамицидина дважды, причем концы цепи из десяти остатков аминокислот замыкаются в одно гигантское кольцо. Таким образом, грамицидин С представляет собой циклический декапептид [c.389]

Грамицидин С (грамицидин советский) был выделен в 1942 г. Г. Ф. Гаузе н М. Г. Бражниковой из одного вида Ba ilus brevis (из садовой земли). Изучение его химического строения, начатое А. Н. Белозерским и Т. С. Пасхиной и продолженное затем зарубежными исследователями, показало, что он представляет собой полипептид, дающий прн гидролизе эквимолекулярную смесь пяти аминокислот L-валина, L-орнитина, L-лейцина, D-фенилаланина и L-пролина. [c.380]

Грамицидин С образуется бактерией Ba illus brevis var. G.—В ввиду токсичности при подкожном и внутривенном введении, он применяется только для местного лечения ран, ожогов, ангин. Грамицидин С (бесцветные пластинки, темп, плавл. 256—258° дихлоргидрат плавится при 268—270°) представляет собой циклический декапептид, в состав которого входят по два остатка /-прелина, /-валина, /-орнитина, /-лейцина и d-фенилаланина. Его строение может быть выражено структурной формулой [c.698]

Было установлено, что грамицидин С представляет собой полипептид, который гидролизуется с большим трудом. При нагревании с 22° о,-ной соляной кислотой он переходит в раствор только через 18 — 20 час., тогда как полный его гидрализ происходит лишь через 35—36 час. В гидролизатах было обнаружено пять аминокислот пролин (270), валин (271), орнитин (272) лейцин (273) и фенилаланин (274), из которых четыре первые относятся к /-ряду, т. е. к так называемым природным аминокислотам, тогда как фенилаланин оказался обладающим -конфигурацией. Позднее было установлено что этот антибиотик состоит из эквимолекулярных количеств пяти указанных аминокислот. [c.182]

О порядке сцепления остатков в молекуле грамицидина пока известно очень мало. При его неполном гидролизе до сих пор удалось выделить только два дипептида валнл-валин (292) /-валил-глицин (293) [c.191]

Есть основания считать, что выделенный валил-валин является смесью d — )-валил-й (—)-валина и /(-j-)-валил-/()-валина Однако остается открытым вопрос о том, входят ли эти две пространственно изомерные формы взлил-валина в состав молекулы грамицидина или они возникли в результате рацемизации, которая могла произойти во время гидролиза и выделения этих дипептидов [c.191]

Более детально следует остановиться на двух работах посвященных синтезу полипептидов, сходных в отношении своего строения с грамицидином С. В первой из них описано получение всех пяти дипептидов, которые могут образовываться при гидролизе этого антибиотика, а именно а-(/-валил)-/-орнитина (276), /-орнитил-/-лейцина (277), /-лейцил- -фенилаланина (278), -фенилаланил-/-пролина (279) и /-пролил-/-валина (484) [c.359]

Почти одновременно с изложенным выше синтезом дипептидов было описано получение и двух пентапептидов а-(/-валил)- ,/-орнитил-/-лейцил- -фенилаланил-/-пролина и а-(/-валил)-й,/-орни-тил-/-лейцил-/-фенилаланил-/-пролина. Оба эти пентапептида очень близки в отношении своего строения к тому пентапептиду, который может образовываться в результате гидролиза грамицидина С. Для того чтобы иметь возможность осуществить их синтез, вначале были получены два трипептида, состоящих из /-лейцина, й- и соответственно /-фенилаланина и /-пролина, а затем эти трипептиды были сконденсированы с дипептидом, содержащим остатки /-валина и й, /-орнитина. Синтез проводился, как и в цитированной выше работе через соответствующие карбобензоксипроизводные, но конденсация осуществлялась не через хлорангидриды, а через азиды. [c.360]

С высоким сродством к электронам устраняет необходимость калибровки при детектировании и сводит к минимуму очистку образцов перед их хроматографическим определением, что особенно важно при анализе природных продуктов. ]У1етиловые эфиры ДНФ-производных были использованы для идентификации аминокислот, образующихся при гидролизе полипептида грамицидина А [58] (рис. 10). Аланин, валин, глицин, лейций и изолейцин определялись количественно с точностью до 2 % при хроматографическом разделении на двухметровой колонке с силиконовой жидкой фазой ЗЕ-ЗО. Наиболее полное разделение некоторых нейтральных алифатических и дикарбоновых аминокислот в виде фенилтиоги-дантоинов и метиловых эфиров ДНФ-производных получено при анализе на колонке с фторированным силиконовым полимером РР-1 и низким содержанием стационарной жидкой фазы [59]. [c.268]

В настоящее время в результате применения новых методов исследования установлено, что в состав белковых молекул входят следующие аминокислоты глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, серин, треонин, цистин, цистеин, метионин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, аргинин, лизин, оксилизин, фенилаланин, тирозин, пролин, оксипролин, гистидин и триптофан. Ввиду того что количество азота этих аминокислот составляет в некоторых исследованных белках более 99 % общего содержания азота, нет оснований предполагать наличие в этих белках заметных количеств каких-нибудь других еще не известных соединений. Эти данные, однако, нельзя обобщать и переносить на другие белки. Об этом свидетельствует хотя бы нахождение таких соединений, как аминоэтанол — в гидролизате грамицидина (см. гл. XV) — и диодтирозин и дибромтирозин — в гидролизате кораллов [59] и спонгина [60]. [c.30]

Рентгеноструктурное исследование этой молекулы [1031 показало наличие оси симметрии второго порядка. Хотя полностью расшифровать структуру не удалось, авторы этого исследования предложили пространственную модель грамицидина С. Десятилетием позже Ликвори [104] и Шерага [13, 14] нашли пространственные модели, удовлетворяющие критерию допустимых контактов, причем Шерага делал выбор из 282 различных конформаций, минимизируя потенцнальн то функцию. Однако все три предложенные структуры не удовлетворяли некоторым косвенным экспериментальным данным [105]. В связи с этим было рассмотрено еще несколько моделей пространственной структуры грамицидина С [106, 107]. И все же до настоящего времени конформацию этой молекулы пока еще нельзя считать окончательно выясненной, хотя наиболее вероятной представляется структура, стабилизируемая двумя водородными связями между группами С=0 и N—Н остатков валина и лейцина [108]. [c.386]

Если необходимо дезаминировать пептид, то каплю исследуемого гидролизата, содержащую 6 н. соляную кислоту, обрабатывают парами азотистой кислоты на политеновой пластинке. С помощью этого метода было показано, например, что грамицидин представляет собой эквимолекулярную смесь пяти различных аминокислот валина, орнитина, лейцина, фенилаланина и про-лина. Было также установлено, что грамицидин 5 является циклопептидом, содержащим только одну свободную аминогруппу и ни одной свободной карбоксильной. Обнаруженная свободная аминогруппа грамицидина 5 находится в боковой цепи орнитина. В продуктах неполного гидролиза грамицидина 5 соляной кислотой были идентифицированы следующие дипептиды а-/-валил-/-орнитин, /-орнитил-/-лейцин, /-лейцил-б/-фенилаланин, -фенил-аланил-/-пролин и два тринептида а-валил-орнитил-лейцин и фенилаланил-пролил-валин. [c.159]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология