Рибонуклеазы поджелудочной железы

Самосогласованность можно использовать в качестве критерия качества. Существенно иной подход к оценке качества метода предсказания состоит в применении его к нескольким гомологичным белкам. Можно полагать, что такие белки свертываются одинаковым образом и имеют одинаковую вторичную структуру. Следовательно, предсказания должны быть инвариантны по отношению к наблюдаемым заменам аминокислот чем меньше вариаций, тем лучше метод предсказания. Такая проверка качества трех методов предсказания была проведена на 24 гомологичных последовательностях рибонуклеазы поджелудочной железы [385], [c.151]

Этот автоматический синтез на твердой фазе состоял в последовательном включении всех 124 аминокислотных остатков в строгом соответствии с последовательностью аминокислот (с первичной структурой) естественного фермента—рибонуклеазы поджелудочной железы . [c.119]

Предполагают, что формирование активного центра фермента начинается уже на ранних этапах синтеза белка-фермента (см. главу 14) на рибосоме, когда линейная одномерная структура пептидной цепи превращается в трехмерное тело строго определенной конфигурации. Образовавшийся белок приобретает информацию совершенно нового типа, а именно функциональную (в частности, каталитическую). Любые воздействия, приводящие к денатурации, т.е. нарушению третичной структуры, приводят к искажению или разрушению структуры активного центра и соответственно потере ферментом каталитических свойств. Если при подходящих внешних условиях удается восстановить нативную трехмерную структуру белка-фермента (ренатурировать его), то восстанавливается и его каталитическая активность. Это было показано впервые на примере рибонуклеазы поджелудочной железы (см. рис. 1.13). [c.125]

Рибонуклеаза Поджелудочная железа Уц 15 000 [c.423]

Размеры молекул ферментов обычно составляют несколько десятков ангстрем по длине, ширине и высоте. По форме частицы представляют собой эллипсоид вращения (приближенно), характеризуемый отношением полуосей bla, где Ь — удлиненный размер, а — короткий. У ферментов отношение bla, как правило, не более 5, но чаще от 1,5 до 3,0 и даже близко к единице. Размеры молекулы рибонуклеазы поджелудочной железы — 29-29-45 А [c.71]

В данном разделе речь будет идти о таких ферментативных реакциях, в которых участвуют ферменты, не имеющие в активных центрах ионов металлов, и для которых достаточно точно установлен механизм нуклеофильного замещения у тетраэдрического атома фосфора в молекуле субстрата. В подобных случаях электрофильная атака в пуш-пульном механизме нуклеофильного замещения у фосфора обеспечивается за счет образования водородной связи между нуклеофильным центром реагирующей части молекулы фосфорсодержащего соединения и кислотной группой активного центра фермента. В качестве примера рассмотрим недавно опубликованные работы, посвященные механизму действия рибонуклеазы поджелудочной железы быка ниже будут обсуждены некоторые вопросы, связанные с фосфорилированием и дефосфорилированием активных центров эстераз. [c.577]

Гидролиз Т-РНК аланина рибонуклеазой поджелудочной железы [c.680]

Рибонуклеаза поджелудочной железы . Наиболее важным достижением последних лет является определение полной аминокислотной последовательности рибонуклеазы, выполненное Хирсом, Муром и Штейном Панкреатическая рибонуклеаза — фермент, выделяемый из поджелудочной железы животных организмов. Она расщепляет фосфо-диэфирные связи рибонуклеиновых кислот [c.179]

Рибонуклеаза широко распространена в природе и обнаружена во многих органах и тканях животного организма, а также в ряде растений. Однако не все рибонуклеазы получены в очищенном виде. Наиболее изучена рибонуклеаза поджелудочной железы, выделенная в кристаллическом виде. Она катализирует расщепление фосфодиэфирных связей нуклео- [c.296]

Рибонуклеаза (поджелудочная железа быка 90 [c.36]

Рибонуклеаза Поджелудочная железа быка 13 700 I Lys 0 4 I [c.171]

Повторное свертывание модифицированных белков дает информацию о процессе свертывания. Исследования повторного свертывания нативных белков были дополнены опытами по повторному свертыванию модифицированных белков. В ранних исследованиях [445] было показано, что рибонуклеаза поджелудочной железы, иодинированная по расположенному на поверхности нативной структуры Туг-115, после денатурации теряет способность к повторному свертыванию. Эго показывает, что состояние остатка Туг-115 имеет важное значение для процесса свертывания. Для того чтобы установить, можно ли модифицировать белок (путем расщепления цепи и делеций в последовательности или путем присоединения объемных трупп к боковым цепям) без потери им способности к свертыванию, был проведен ряд систематических исследований нуклеазы стафилококка и панкреатической рибонуклеазы. [c.183]

Углевэдиая часть может составлять от не менее одного до более восьмидесяти процентов общего веса гликопротеида. Поскольку углеводные фрагменты, присоединенные к определенному месту белка, могут варьировать, гликопротеид редко относится к гомогенному типу молекул. Пзрвыл пример из табл. 10.3 показывает, что вязкость и гидрофильные свойства углеводных фрагментов важны для функции многих гликопротеидов. В других случаях (типичными примерами являются рибонуклеазы поджелудочной железы различных млекопитающих [145]) наличие углеводного фрагмента не означает каких-либо преимуществ или недостатков, а связано лишь с тем фактом, что неспецифический присоединяющий сахар фермент распознает [c.268]

Ковальски [4, 5] и Мендел [7, 8] сообщили о заметных изменениях в спектрах рибонуклеазы, снятых при 60 и 100 МГц. Изменения, главным образом, проявляются в сужении пиков при расщеплении дисульфидных мостиков или при нагревании водного раствора белка выше температуры 65 °С, при которой обычно происходит денатурация. Мак-Дональд и Филлипс [9—11, 24] показали, что если раствор денатурированного белка с неповрежденными ди-сульфидными мостиками охладить ниже температуры ренатура-ции, то при повторном свертывании цепей в спектре на частоте 220 МГц появляется много новых резонансных сигналов и изменяется распределение интенсивностей пиков по всему спектру. Это видно из рис. 14.8. Здесь (а) —спектр рибонуклеазы поджелудочной железы быка, построенный по спектрам составляющих его аминокислот, подобно тому, как это показано для лизоцима на рис. 14.4, а. Спектр (б) относится к термически денатурированному [c.363]

Стехелин и сотр. [162] частично деполимеризовали рибонуклеиновую кислоту из дрожжей при помощи рибонуклеазы поджелудочной железы. Затем пропускали образец через колонку длиной 30СМС диэтиламинозтилцеллюлозой и вымывали раствором бикарбоната аммония, постепенно повышая концентрацию аммиака. На элюентной кривой получается двадцать один пик не полностью разделенных компонентов. Первые тринадцать из них идентифицировали как нуклеотиды состава Ц, У, АЦ,, АУ, ГЦ, ГУ 4 ААЦ, ААУ, ГАЦ, АГЦ, ГАУ, АГУ, ГГЦ и ГГУ, где использованы следующие обозначения А — аденин, Г — гуанидин, У — уридин и Ц — цитидин. Последние восемь пиков на хроматограмме принадлежали, по-видимому, неидентифициро-ванным тетрануклеотидам. [c.335]

За последние годы достигнуты определенные успехи в изучении молекулярного механизма действия ферментов, участвующих в переносе фосфорильной группы. Так, в результате исследования строения активного центра рибонуклеазы поджелудочной железы быка было показано, что в состав активного центра этого фермента входят две имидазольные группы, одна из к-рых находится в виде основания, а другая — протонирована. Предполагается, что первое имидазольное кольцо участвует в образованш водородной связи с молекулой воды или оксигруииой спирта, в то время как вторая имидазольная группа, находящаяся в протонированном состоянии, образует водородную связь с эфирным кислородом. [c.254]

Гидролиз простых эфиров (метилового, этилового, бензилового) пиримидиннуклеозид-3 -фосфатов рибонуклеазой поджелудочной железы состоит в однонаправленном расщеплении промежуточного 2, 3 -циклофосфата лишь до З -фосфата [158]. На пуриновые соединения этот фермент не действует, однако при помощи других специфических диэстераз они превращаются в свободные нуклеотиды [232]. Уже выделены родственные ферменты, которые не действуют на эфиры нуклеотидов, но расщепляют 2, З -циклофосфаты с образованием исключительно 2 -фосфата [233]. Первая стадия гидролиза с помощью панкреатической рибонуклеазы обратима, и ферментативная реакция переэтерификации пиримидиннуклео-зид-2, 3 -циклофосфатов, осуществляемая в присутствии первич- [c.177]

Изотермы адсорбции неионных полимеров и противоположно заряженных полиэлектролитов часто описываются так называемыми изотермами высокого сродства , характеризующимися полным извлечением полимера из раствора при низких концентрациях (начальная часть изотерм совпадает с осью ординат) и быстрым выходом Г на насыщение при высоких. Рис. 3.1 иллюстрирует такие изотермы на примере адсорбции рибонуклеазы поджелудочной железы крупного рогатого скота частицами полистирольного латекса (по данным Норде и Ликлема, 1977). [c.41]

Рис. 3.1. Изотермы адсорбции рибонуклеазы поджелудочной железы крупного рогатого скота частицами латекса полистирола при pH 4,0 ( ), 7,0 (о), 9,3(х) и 11,0 (V), Изозлектрическая точка полиэлектролита около 94 (Норде и Ликлема)

В последнее время проблема установления первичной структуры ферментов и других белков развивается весьма успешно. Доступность данных о первичной структуре белков послужила стимулом для попыток синтеза фрагментов некоторых ферментов. В частности, особое внимание исследователей было обращено в связи с этим на рибонуклеазу поджелудочной железы быка (рис. 73а). Так, Ричардс и Витаятиль [1811] установили, что при действии на рибонуклеазу бактериальной протеазы суб-тилизина происходит разрыв пептидной связи лишь между остатками Ala и Ser при этом отщепившийся N-концевой эйкозапептид (S-пептид) остается связанным с основной частью фермента (S-белком) при помощи нековалентных связей. После разделения S-пептида и S-белка каждый из них оказался биологически неактивным однако при смешивании S-пептида и S-белка в молярном соотношении 1 1 ферментативная активность полностью восстанавливается (рибонуклеаза S ). [c.353]

Последовательность нуклеотидов в транспортной РНК аланина, выделенной из дрожжей и очищенной, устанавливалась путем ее гидролиза двумя разными ферментами — рибонуклеазой поджелудочной железы и рибонуклеазой Т1 такадиастазы. Гидролиз обоими ферментами проводился до предела. Сумма полученных в каждом случае коротких полинуклеотидов и мононуклеотидов разделялась хроматографически эти полинуклеотиды (по большей части ди- и три-, но не более окта-) пдентифици- [c.718]

Рибонуклеаза (КФ 2.7.7.16) переносит З -фосфат-пиримидин-нук-леотидный остаток из положения 5 соседнего нуклеотида в положение 2 самого пиримидинового нуклеотида с образованием циклического 2, 3 -нуклеотида. В этом случае она выполняет трансферазные функции. Рибонуклеаза поджелудочной железы способна также осуществлять перенос фосфорильной группы положения 2 циклического нуклеотида на воду. В последнем случае суммарная реакция выражается в деполимеризации RNA, и рибонуклеаза действует как эстераза, расщепляющая фосфоуглеродные связи и освобождающая мононуклеотид [18]. В активном центре фермента каталитически активными группами являются два остатка гистидина 12 и 119 [19, 20, 21], расстояние между которыми составляет примерно 10 A [21]. Входящий в состав активного центра остаток лизина участвует в связывании фосфатной группы субстрата. Модели активного центра рибонуклеазы приведены в гл. И1 на рис. 33 и 34. [c.174]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология