Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Центры связывания

    На рис. 5.1 приведены некоторые доступные синтетические акцепторные соединения. Можно ли использовать такие органические краун-эфиры в качестве аналогов ферментов для разделения энантиомеров (или рацемических смесей) Крам и др. сообщили, что хиральные комплексы краун-эфиров действительно обладают этим удивительным свойством селективно связывать один из антиподов аминокислотных производных [134—136]. При создании акцепторных молекул неоценимую помощь оказывают молекулярные модели Кори — Полинга — Колтуна [137, 138]. Пространственные модели дают возможность находить акцепторные структуры, способные связывать в качестве доноров определенные аминокислоты. Например, главное при создании акцептора — это вопрос влияния взаимного расположения центров связывания на их связывающую снособность. Другая проблема заключается во введении заместителей в такие положения, которые направлены к функциональным или связывающим центрам до-норных соединений [137]. [c.267]


    Это можно объяснить тем, что полифункциональная молекула является как бы жесткой матрицей , которая благодаря наличию многих центров связывания стабилизирует структуру окружающей воды в некой заданной конфигурации. В результате уменьшается релаксационная составляющая сжимаемости и теплоемкости. Температурная зависимость сжимаемости воды приближается к линейной, что свойственно нормальной жидкости. Заметим, что определению стабилизация структуры воды разные авторы придают различный смысл. Здесь под ним понимается сохранение геометрии водородных связей и уменьшение разнообразия возможных конфигураций. [c.55]

    Эти объемные группы разной формы очень важны для гидрофобной стабилизации белка и для формирования центров связывания в ферментах [c.81]

    Для двух центров связывания (п = 2) [c.253]

    Микроскопическая константа относится к определенному центру связывания. Рассмотрим, например, связывание протона с карбоксилат-ионом  [c.254]

    Наконец, наиболее дискуссионный вопрос что является центром связывания С-концевой карбоксильной группы субстрата Агд-145 или 2п(П) Механизм Бреслоу допускает, что верно и то, и другое [222]. Действительно, ион 2п(П) связывает карбоксильную группу гидролизованного продукта, которая становится субстратом в обратной или в последующей реакции. Таким образом, мои но ожидать, что экзопептидазы имеют два различных центра связывания, находящиеся на расстоянии, соответствующем одному аминокислотному остатку в субстрате, [c.348]

    Другими ионами кальций в этой системе заменить нельзя. Ионы ртути, цинка, кадмия связываются в областях фиксации кальция и вызывают ингибирование ферментной активности этот эффект исчезает при добавлении в смесь ионов кальция. При замещении иона кальция на ион стронция сохраняется активность по отношению к гидролизу ДНК, но замещение ионом бария ведет к полной инактивации, как считают, вследствие геометрических искажений центра связывания кальция, которые передаются и на область связывания нуклеотида. Стерическое соответствие фермент — субстрат при этом утрачивается и активность резко падает. Эти примеры говорят о большом значении геометрической структуры, создаваемой и поддерживаемой ионом в системе фермент—ион—субстрат для правильного протекания ферментативной реакции. [c.364]

    Интересно, что при выводе уравнения Ленгмюра не использовано предположение о том, что адсорбция протекает на геометрически единой поверхности. Адсорбент рассматривается только как совокупность одинаковых центров связывания. Поэтому все сказанное в равной мере относится и к связыванию молекул субстрата на глобулах фермента или к любому другому бимолекулярному взаимодействию в гомогенных системах, при котором на опыте можно определить свободную концентрацию г-го компонента при равновесии. [c.165]


    Участки связывания характеризуются одинаковыми величинами микроскопической константы ассоциации комплекса белок — лиганд. Таким образом, для первой молекулы лиганда существует равная вероятность взаимодействия с любым из центров связывания (на рис. 45 макромолекула схематически изображена в виде квадрата с четырьмя [c.345]

    Рассмотрим присоединение молекулы X к другой молекуле Р, которая может представлять собой молекулу белка, нуклеиновой кислоты, ион металла или любую другую частицу. Если на поверхности Р имеется лишь один центр связывания для X, то взаимодействие может быть описано уравнением (4-1), а константа равновесия /Сг определяется уравнением (4-2)  [c.243]

    Несколько центров связывания в одной молекуле [c.252]

    С первого взгляда может показаться, что уравнение (4-17) (уравнение Эдера) полностью описывает процесс связывания, однако, как правило, это не так. Зачастую в макромолекуле имеются центры связывания более чем одного типа, а уравнение (4-17) ничего не говорит нам о характере распределения лиганда X между различными центрами в комплексе РХ. Более того, если п велико, то невозможно экспериментально определить все п констант. Чтобы проанализировать оба вопроса, рассмотрим микроскопические константы связывания. [c.254]

    Далее, ион титана обладает именно такой электронной структурой, которая позволяет ему образовать прочную ковалентную связь с алкильной цепью, причем эта последняя становится лабильной только а присутствии олефина, образующего я-связь, что и приводит к облегченной миграции лиганда. Этот переходный комплекс затем образует новую Со-связь между и олефипом дальнейший рост цепи происходит путем миграции цепи и присоединения следующего олефина к первоначальному центру связывания. [c.201]

    На практике многие хорошо известные лекарственные препараты обладают свойством ингибировать тот или иной фермент, но только некоторые из них предназначены именно для этой цели. Познание структуры и механизма действия ферментов заметно продвинулось вперед за последние два десятилетия. В связи с этим поиск специфических ингибиторов ферментов с целью их использования в фармакологии стал еще более заманчивым. Чтобы такие поиски увенчались успехом, необходимо получить по возможности больше сведений о специфичности фермента, а также о второстепенных центрах связывания вблизи его активного центра, если таковые существуют. Интенсивные исследования в этом направлении привели к разработке новой интересной группы необратимых ингибиторов ферментов активируемых ферментом необратимых ингибиторов, или, как их иначе называют, самоуничтожающихся инактиваторов ферментов [313, 318, 319]. Смысл выражения са-моуничтожающийся инактиватор не совсем определен, но тем не менее это выражение используется. [c.452]

    Донорно-акцепторное взаимодействие подразумевает комплементарную пространственную упорядоченность центров связывания в доноре и акцепторе. Поэтому в любом синтетическом до-норно-акцепторпом комплексе центры связывания (полярные и дипольные) и стерические барьеры должны быть локализованы определенным образом, чтобы структуры обоих компоиентов соответствовали друг другу. Свойства существующих в природе акцепторов, мицелл и циклодекстринов рассмотрены в следующих разделах данной главы. Простетические группы гемоглобина, хлорофилла или витамина В12 также принадлежат к этой категории, поскольку селективно связывают ионы железа, магния и кобальта. [c.267]

    Наблюдения показали, что эфиры L-аминокислот реагируют с циклическим полиэфиром в 10 —10 раз быстрее, чем с его разомкнутым аналогом. Очевидно, вынужденное сближение центров связывания в значительной степени способствует комплексообразованию. В то же время пролиновые эфиры реагируют с обоими акцепторами с одинаковой скоростью. Следовательно, как было показано ранее, для эффективного комплексообразования [c.276]

    Длинные алкильные цепи с каталитической группой иа одном конце могут обеспечить достаточное количество гидрофобных центров связывания с такими субстратами, как эфиры жирных кислот, чтобы увеличивать скорость их реакций (наблюдалось 10-крагпое увеличение скорости ири pH 8 в трис-буфере и 25°С). [c.312]

    Связывание металла, если оно происходит, может обеспечивать различные пути протекания реакций. Интересный пример такого влияния наблюдается для ь-серилгидроксиметилтрансферазы, которая может также катализировать переаминирование о-серина. Центр связывания тот же. но продукты образуются другие  [c.440]

    Теперь, объективно рассмотрев все три механизма, которые согласуются с экспериментальными данными, коснемся наиболее важной проблемы функционирования биотина. В последние годы возникли противоречия относительно локализации в нем центра связывания карбоксильной группы. При выделении и идентификации сравнительно неустойчивого, особенно при кислых значениях pH, свободного карбоксибиотина установлено, что при обработке диазометаном он превращается в более устойчивый диметиловый эфир [343, 344]. Это производное впоследствии было идентифицировано как Г-Ы-метоксикарбонил-(-)-)-биотинметило-вый эфир. Тот же самый продукт был также получен в результате протеолитического расщепления связанного с биотином фермента. На рис. 7.16 показаны некоторые из подобных превращений. [c.475]

    Достаточно эффективными оказались рентгеноструктурные и ЯМР-исследования комплексов кристаллического лизоцима в тетрагональной и триклинпой формах, а также лизоцима в растворе с катионами лантанпдов, в частности с трехвалентными лантаном, лютецием и гадолинием [32, 46, 46а]. Выбор этих металлов был основан на их способности приводить к пертурбации спектров ЯМР лиганда (в данном случае — функциональных групп активного центра лизоцима), с которым связываются катионы. Анализ соответствующих смещений резонансных частот (химических сдвигов), при которых происходит поглощение энергии, и (или) анализ уширения резонансных линий (времени релаксации) приводит к выявлению геометрических отнош.ений между центром связывания иона металла и соответствующими функциональными группами лиганда. [c.157]


    По1енциоме1рическим и вискозиметрическим методами изучено влияние ионной силы раствора на комнлексообразующие свойства катионных полиэлектролитов (КПЭ). Рассчитаны константы диссоциации (Кд) комплексов К1ТЭ -ПАВ. Установлено, что в водно-солевых растворах для полисолей с Р>50%, где вклад электростатических контактов ионов ПВП и ДСН высок, Кд комплексов ПВП-ДСН увеличивается в 4-5 раз с ростом ионной силы в результате экранирования центров связывания, в то время как для ассоциатов с р 9-25% зависимость Кд от ионной силы выражена слабо. [c.84]

    Субъединица формирует центр связывания антибиотиков ри-фампицина и стрептолидигина, являющихся специфически.ми ингибиторами бактериальных РНК-полимераз. Функция а-субъеди-ницы не известна. [c.135]

    Помимо общей регуляции с помощью БАК-сАМР существует индивидуальная регуляция катаболитных оперонов. Классическим примером является негативная регуляция лактозного оперона. В отличие от ранее рассмотренных ди.мерных белков-регуляторов репрессор лактозного оперона представляет собой тетрамер и содержит два идентичных центра связывания ДНК- Пространственная структура этих центров формируется -концевыми участками папи-пептидных цепей, которые, судя по их аминокислотной последовательности, способны образовывать биспиральные элементы, аналогичные биспиральным ДНК> знающим элементам репрессора фага /. и БАК. С-концевые домены субъединиц лактозного репрессора 4юрмирует два центра связывания индуктора лактозного оперона. [c.150]

    Принципы действия энхансеров, способных оказывать свое влияние на значительном расстоянии (более чем тысячи нуклеотидных пар) и вне зависимости от ориентации по отношению к старту транскрипции, не выяснены. Короткие нуклеотидные блоки могут служить центрами связывания специфических ядерных белков, выступающих как транс-действующие факторы. Сила энхансера, вероятно, может зависеть от числа таких блоков (модулей). Обсуждаются следующие два основных механизма действия энхансеров. Считается, что функциональные участки генома, содержащие один или несколько генов, образуют длинные петли, включающие десятки тысяч нуклеотидных пар ДНК. Высказано представление, что петли закреплены в матриксе клеточного ядра и могут быть сверхспира-лизованы. В состав матрикса входит топоизомераза И, по-видимому, определяюш,ая топологию петли ДНК (см. гл. ХП), В таком случае взаимодействие энхансера с бе.1ками может менять конформацию всей петли, включая и удаленный от энхансера участок ДНК, в результате чего в составе петли изменяется локальная структура хроматина и облегчается транскрипция гена (рис. 112,6). Более вероятно, что влияние энхансера, связанного с белком, определяется его непосредственным взаи.чодействием с РНК-полимеразой и другими факторами транскрипции в процессе инициации- Такое взаимодействие может осуществляться благодаря сгибанию молекулы ДНК, что создает возможность непосредственного контакта районов промотора и удаленного от него энхансера, связанных со специфическими белками (рис. И2, в). [c.204]

    Эти соображения в определенно степен сохраняют свою силу и при использовании низкомолекулярных лигандов, если в ходе аффинной хроматографии на них будут сорбироваться белки. Разумеется, ситуация здесь лучше, так как на поверхности белка может быть лишь небольшое число аффинных центров связывания, а действующие здесь силы уступают ковалентным связям, поэтому денатурации белка при посадке на аффинный сорбент опасаться не приходится (мы сейчас оставляем в стороне возможность связыва- [c.386]

    При введении тербия(П1) в каль-цийсвязывающий центр термолизина (гл. 7, разд. Г, 4) наблюдалась флуоресценция, обусловленная переносом энергии от иона кобальта(II), находящегося в центре связывания цинка. С помощью уравнения Фёрстера было получено расстояние между Са + и 2п2+, равное 1,37 нм, что согласуется с результатами рентгеноструктурного исследования этого фермента [66] [c.32]

    ДНК-полимераза имеет один центр связывания нуклеозидтрифосфата, общий для всех четырех нуклеотидов. Выбор Р13 среды нуклеотида, основание к-рого комплементарно очередному основанию матрицы, протекает без ошибок, блаюдаря определяющему влиянию ДНК-матрицы (исходно] цепи ДНК). При нек-рых мутационных повреждениях структуры ДНК-полимеразы в ряде случаев происходит включение некомплементарных нуклеотидов. [c.252]

    Комплексообразование может также включать ионы, а не белки или липиды, но в этом случае отсутствие комплекса может быть источником проблем, поскольку многие белковые определяемые вещества содержат центры связывания двухвалентных катионов, и антитела, вьфащенные иа эти белки in vivo, могут распознавать конфигурацию, удерживаемую катионным комплексом (главным образом, Са + или Mg +) таким образом, в отсутствие этих катионов конформация может измениться, так что распознавание с антителом становится неэффективным и анализ терпит неудачу. [c.602]

    Гуанидиниевая группа имеет рК выше 12 и в большинстве случаев остается протонирован-ной. Стабилизируется резонансом (как показано кривыми стрелками). Гуанидиниевые группы приобретают иногда важное значение как центры связывания фосфатных групп [c.83]

    Свойство или изменение свойства, которое количественно харакгери-зуют (АЛ), при насыщении (т. е. когда все вещество Р переходит в РХ) достигает максимального значения — ААтах. Отношение [РХ] к суммарной концентрации всех форм Р, присутствующих в растворе [Р]по.тл, называется степенью насыщения и обозначается через у. Если молекула Р имеет более одного центра связывания для X, то величина у характе-.ризует долю занятых центров от общего числа центров связывания. Если обозначить через п число центров связывания в расчете на одну молекулу, то общее число центров связывания будет равно п-[Р]. Величину у часто принимают равной ДЛ/АЛтах. Для макромолекул с несколькими центрами связывания это равенство соблюдается только при условии, что добавление каждой новой молекулы X приводит к оди- наковому изменению А. Это условие выполняется не всегда, однако если оно выполняется, то должно выполняться и следующее соотно- Шение  [c.250]


Смотреть страницы где упоминается термин Центры связывания: [c.131]    [c.281]    [c.471]    [c.300]    [c.152]    [c.341]    [c.151]    [c.386]    [c.345]    [c.345]    [c.56]    [c.127]    [c.128]    [c.254]    [c.264]    [c.266]   
Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.252 ]

Кинетические методы в биохимическихисследованиях (1982) -- [ c.180 ]

Биоэнергетика и линейная термодинамика необратимых процессов (1986) -- [ c.69 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Связывание



© 2024 chem21.info Реклама на сайте