Метод Кори

Рис. 2.7. Схема синтеза по методу Кори [12]. Хиральный центр показан звездочкой.

Оптические выходы аминокислот, полученных по методу Кори и сотр. [158, 159] (реакция (5. 76)] [c.158]

Однако это ограничение не является единственным. Выход целевой двухцепочечной структуры является произведением выходов промежуточных дуплексов. Если выход дуплексов-интермедиатов низкий, при конструировании протяженной ДНК не получается достаточно материала для клонирования. Поэтому конденсация олигонуклеотидов является ключевой стадией синтеза ДНК по методу Кораны. Проведение ее часто затрудняется из-за образова- [c.60]

Несмотря на то, что метод Кораны в принципе прост, на практике возникает ряд осложнений, приводящих к ошибкам при синтезе целевого гена. Например, для того чтобы снизить ошибки при синтезе олигонуклеотидов, последние должны быть достаточно коротки, в то же время ДНК-дуплексы в местах перекрывания олигонуклеотидов должны быть прочны, чтобы обеспечить правильную сборку цепи. Необходимо избегать образования любых неправильных [c.69]

Синтез искусственных фрагментов ДНК методом Кораны в настоящее время является широко используемым инструментом молекулярной биологии. [c.72]

Рассматриваемый метод требует меньшего числа полинуклеотидов, чем метод Кораны, вследствие чего на 30-40 % снижаются затраты на химический синтез и анализ олигомеров. В этом методе значительно меньше стадий, поэтому он не столь трудоемок и, по-видимом>, более надежен по сравнению с методом Кораны. Кроме того, при использовании полинуклеотидов длиной до 40 нуклеотидных звеньев нет необходимости в компьютерном анализе. Вероятно, это связано с достаточной стабильностью образующихся комплексов из-за большей длины области комплементарного взаимодействия полимеров и способности ДНК-полимеразы проходить низкоэнергетические шпильки. [c.72]

Окисление а,(З-ненасыщениых альдегидов (V, 267—268). Ву и Зондхеймер [5 получили метил-[181-аннуленкарбоксилат (2) по методу Кори и сотрудников (V, 267, [42]) обработкой [18]-аннулеЫ альдегида (1) в ТГФ и метаноле цианистым водородом и МпОз (выход 44%). В этом случае классический метод окисления реагентом Джонса непригоден, так как он полностью разрушает структуру аннулена [c.158]

Сиитез олефинов по Кори — Уинтеру. Синтез олефинов по методу Кори —Уинтера (III, 389) осуществляют взаимодействием тиоикарбонатов с триметилфосфитом [c.227]

Среди стереоселективных методов дегидроксилирования наиболее известным является метод Кори — Винтера, основанный на си -элиминировании из циклических производных. Первоначаль-ная методика Кори —Винтера [495], включающая десульфуриза-цию тионкарбоната при действии триалкилфосфита [схема (368)], нашла применение в ряде важных синтезов. Реакцию рассматривали как протекающую через циклофрагментацию карбена (201), однако это утверждение оспаривается [496]. Среди других реагентов, вызывающих десульфуризацию, следует отметить (202), актив- [c.155]

Более общим является метод Иствуда [501], заключающийся в катализируемом кислотой термическом элиминировании из циклических ортоэфиров. В большинстве случаев достигаются высокие выходы продуктов [схема (371)] и, как при использовании методов Кори —Винтера и Уитэма [500], смн-элиминирование протекает даже в случае производных дитретичных диолов. Ортоэфиры можно рассматривать также как промежуточные соединения при получении алкенов путем восстановительного элиминирования моноэфиров диолов при действии цинка и уксусной кислоты [502]. Сходные элиминирования могут вызываться при нагревании циклических ацеталей ДМФ (203) с АсгО [503] и при восстановлении циклических фоефорамидных эфиров дитретичных диолов (204) действием Li/NHa схема (372) [504]. Другим типом производных, способных подвергаться термическому цикло-элиминированию, служит соль (205) тозилгидразона карбоната, [c.156]

На реакции 1,2-диолов с Ы,Ы -тиокарбонилдиимидазолом [345] основан наиболее часто, по-видимому, используемый метод получения 1,3-диоксолантионов-2 (376) (уравнение 163) [346]. Они являются важными исходными веществами для синтеза алкенов по методу Кори — Винтера (см. разд. 11.22.7.3). [c.641]

Синтез алкенов по методу Кори — Винтера [346, 355, 356] основан на реакции 1,3-диоксолантионов-2 (376) с триалкилфос-фитом, которая происходит путем отщепления серы с образованием карбеноидного интермедиата (391), из которого в результате мгновенного стереоспецифичного йс-элиминирования получаются алкены и диоксид углерода (уравнение 173). Эта реакция [c.644]

Метод Кори и Бейлара заключается в рассмотрении членов торсионной энергии и энергии деформации угла для определения возможных конформаций кольца с последующим основанным на этих конформациях обычным расчетом вандерваальсовского члена. Такой подход уместен только в случае, когда энергия вандерваальсовского взаимодействия заместителей в хелатном кольце и других атомов в молекуле комплекса сравнительно незначительна, поскольку при этом подходе не учитывается влияние вандерваальсовских взаимодействий на данные конформации кольца. Голлогли и Хокинс [50] варьировали геометрию молекулы таким образом, чтобы минимизовать сумму различных членов, определяющих энергию конформации. В настоящей работе для ряда октаэдрических и плоских квадратных комплексов, содержащих пятичленные хелатные кольца с диаминами, следуют этому методу. Когда для расчетов необходимы данные для определенного металла, будут рассматриваться комплексные соединения Со(1П). [c.94]

Важный вопрос, которьш необходимо было решить с помощью модельных полимеров, это определение структурной возможности образования двойных спиралей Крика—Уотсона из одной нити полирибонуклеотида и второй нити полидезоксирибонуклеотида. Ответ отнюдь не очевиден, так как атом кислорода в рибозе требует около 3 А лишнего места и трудно понять, возможна ли комбинированная спираль по чисто стерическим сообра/кениям. С другой стороны, если РНК в клетке реплицируется с ДНК ядра, то образование двойных спиралей Крика—Уотсона должно происходить. Рич исследовал комплексообразованне длинных нитей нолирибоадениловой кислоты (со степенью полимеризации порядка 2000) п коротких цепочек полидезоксирибо-тимидиловой кислоты (со степенью полимеризации 11—13), полученных химическим сочетанием мономеров по методу Кораны. [c.234]

В работах, выполненных НИИАТом ранее [1, 2, 3], были сделаны оервые попытки приложения методов кор- реляционного анализа для исследования связи между моторными и физико-химическими свойствами масел. Для этой цели было предложено нормир01вать применяемые оценочные показатели при помощи введения коэффициентов качества. [c.139]

В методе Кори определяют освобождающийся в результате реакции фосфоролиза гликогена неорганический фосфат. Метод используют как для титрования активной формы фермента (фосфорилазы а), так и для измерейия активности его неактивной формы (фосфорилазы б), которая осуществляет катализ только при добавлении в реакционную смесь аденозин-5 -фосфата, АМФ. В смесь, содержащую фермент в буферном растворе, вносят гликоген, глюкозо-1-фосфат, в случае фосфорилазы б также и АМФ. Через определенные промежутки времени отбирают пробы и методом Фиске — Суббароу определяют в нлх содержание неорганического фосфата (Умбрейт и соавт., 1951). Освободившийся неорганический фосфат в присутствии сильной кислоты образует с молибдатом аммония интенсивно желтую соль (ЫН4)зН4[Р(М02О7)б]. Фосфомолибдат аммония восстанавливается далее в присутствии эйконогена (натриевой соли 1-амино-2-нафтолсульфоновой кислоты) до ярко-синего продукта, концентрацию которого измеряют фотометрически. [c.100]

Для преодоления неправильного комплек-сообразования и избавления от необходимости очистки промежуточных субфрагментов при синтезе искусственных генов методом Кораны предложена последовательная сборка ДНК на твердой матрице (рис. 1.50). Нерастворимый носитель с присоединенным к нему стартовым олигонуклеотидом последовательно обрабатывают небольшим молярным избытком фосфо-рилированных по 5 -концу олигонуклеотидов. Перед добавлением очередного олигомера избыток предьщущего отмывается. По окончании процесса комплексообразования проводят сшивку дуплекса и отщепление его от носителя. Затем дуплекс клонируют в необходимом векторе. [c.69]

В настоящее время DNA Works, по-види-мому, является лучшей программой для планирования синтеза искусственных генов по методу Кораны. [c.72]

Альтернативный методу Кораны способ конструирования искусственных протяженных фрагментов ДНК сформулирован в работе К. Итакуры с сотрудниками. В его основе лежит способность некоторых ферментов, в частности фрагмента Кленова ДНК-полимеразы I, достраивать комплементарную цепь в присутствии праймера. Это свойство фермента эпизодически использовалось в рамках метода Кораны для удлинения олигонуклеотидов, в более поздних работах — для получения ДНК-дуплексов. [c.72]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология