Матричные РНК вторичная структура

ЭТОМ образуются специфич. пары комплементарных оснований, имеющие почти одинаковые размеры. Поэтому двойная спираль имеет очень однородную регулярную структуру, мало зависящую от конкретной последовательности оснований-св-во очень важное для обеспечения универсальности механизмов репликации (самовоспроизведение ДНК или РНК), транскрипции (синтез РНК на ДНК-матрице) и трансляции (синтез белков на РНК-матрице). В каждом из этих т. н. матричных процессов К. играет определяющую роль. Напр., при трансляции важное значение имеет К. между тройкой оснований матричной РНК (т. и. кодоном, см. Генетический код] и тройкой оснований транспортной РНК (поставляют во время трансляции аминокислоты). К. определяет также вторичную структуру нуклеиновых к-т. Одноцепочечные РНК благодаря К. оснований, навиваясь Сами на себя, образуют относительно короткие двухспиральные области ( шпильки и петли ), соединенные одноцепочечными участками, К. в отдельных парах оснований ДНК может нарушаться из-за появления отклонений в их строении, к-рые могут возникать спонтанно или в результате действия разл. факторов (химических и физических). Следствием этих изменений м. б. мутации. [c.443]

Если вязкость матричной фазы не очень велика, то даже при резком изменении состава системы, приводящем к застудневанию ее, вторичная структура двухфазных студней будет содержать большое количество глобу-лизованных под влиянием межфазного натяжения элементов структуры, хотя непрерывность сетки может еще [c.108]

К достоинствам метода можно отнести дешевизну и высокую удельную активность исходного препарата ( НгО), а также легкость его последующего удаления гель-фильтрацией и упариванием. Кроме того, в реакцию гораздо охотнее вступают остатки цитозина, не участвующие в образовании водородных связей, следовательно, уровень включения для однонитевых ДНК на порядок выше, чем для двунитевых. Это открывает возможности исследования вторичной структуры нуклеиновых кислот. Недостаток метода — изменение химического состава нуклеиновой кислоты в результате замены некоторых остатков цитозина на урацил. Уровень такой замены и вытекающие из него последствия (например, для матричной функции ДНК) должны учитываться. [c.251]

Мне хотелось бы остановиться на вопросе, входящем в число проблем, охватываемых данным, симпозиумом, но не получившем на нем должного отражения. Это вопрос о роли радиа-ционно-химического синтеза. Заслушанные нами доклады, посвященные действию ионизирующих излучений на первичную, вторичную и надмолекулярную структуры ДНК и ДНП, лишь указали на возможность изменения матричной способности ДНК после облучения. [c.186]

Важная особенность репликационной системы фага Qp заключается в том, что вновь синтезируемая нить не формирует протяженного дуплекса с матричной нитью другими словами, на однони-тевой матрице образуется однонитевой продукт. Предполагают, что возникновению межцепочечного дуплекса препятствует весьма выраженная внутрицепочечная вторичная структура матричной и вновь синтезируемой цепей. [c.320]

Комплекс нативной 40S субчастицы с инициаторной метионил-тРНК (включающий некоторые факторы инициации и ГТФ) вступает в ассоциацию с мРНК. На этом этапе абсолютно необходимым оказывается eIF-3. Механизм его действия не ясен. Предполагается, что он, будучи связанным с нативной 40S субчастицей, участвует в формировании центра, узнающего мРНК. Ему приписывают также функции белка, способствующего расплетанию вторичной структуры матричного полинуклеотида в [c.250]

Построение молекулярной биологии ознаменовалось крупнейшими открытиями, сделанными за сравнительно короткое время. В 1953 г. Уотсон, Крик и Уилкинз установили методом рентгенографии вторичную структуру ДНК (см. стр. 489). История этого открытия ярко описана Уотсоном [19]. Структура ДНК — двойная спираль — непосредственно объясняет способность ДНК к конвариантной редупликации. Общее понимание биосинтетической функции ДНК позволило сформулировать физическую проблему генетического кода (Гамов, 1954, см. гл. 9). В дальнейшем были выяснены детали процесса биосинтеза и характер участия в нем других нуклеиновых кислот — матричной и транспортной РНК—и нуклеопротеидов — рибосом. Эти успехи моле- [c.485]

Скорость установления равновесия фаз по составу и сам равновесный состав матричной фазы при студнеобразовании, естественно, различны для разных полимерных систем. Для некоторых систем, например для студнеобразной пленки нитрата целлюлозы, полученной растеканием ацетонового раствора этого полимера на поверхности воды (рис. П1.П), вязкость матричной фазы в процессе студнеобразования несколько ниже, чем в ранее рассмотренном случае ацетата целлюлозы. Поэтому наряду с вытянутыми элементами вторичной структуры наблюдается и частичная глобулизация отдельных участков матричной фазы. Однако общая морфология студня сохраняется и отчетливо отражает образование вторичной структуры студня в результате частичного разрушения исходной (первичной) структуры. [c.108]

Рибонуклеиновые кислоты характеризуются одноцепочной молекулярной структурой. Полинуклеотидная цепь этих кислот нередко рассматривается как их первичная структура. Молекулы РНК имеют вид гибких, беспорядочно свернутых одинарных цепей. В зависимости от рн, ионного состава среды РНК в растворе содержат в молекуле участки в виде двойной спирали, возникающей при сворачивании цепочки на себя. В этих участках появляются водородные связи между азотистыми основаниями, находящимися в разных местах одной и той же нуклеотидной цепи. Такую структуру молекулы РНК )ассматривают как вторичную. Она установлена для НК в растворе. Но вторичная структура РНК в растиоре может соответствовать и не соответствовать конформации функциональных молекул РНК в клетках. Во всяком случае, если рибосомная и растворимая РНК и могут иметь вторичную структуру молекулы, то для матричной эта возможность ставится под сомнение. [c.141]

ДНК-полимераза гена 43 обладает обычной 5 —З -синтетической активностью, связанной с 3 —З -экзонуклеазной корректирующей активностью (гл. 32.) Оставшиеся три белка отнесены к полимеразным вспомогательным белкам . Продукт гена 45 является димером. Продукты генов 44 и 62 образуют прочный комплекс, который характеризуется АТРазной активностью и тем, что он увеличивает скорость движения ДНК-полимеразы в 3 раза, от 250 до примерно 800 нуклеотидов/с последнее значение близко к скорости движения ДНК-полимеразы in vivo ( 1000 нуклеотидов/с). Увеличение в скорости не зависит от того, используется одно- или двухцепочечная матрица. В тех случаях, когда ДНК-полимераза фага Т4 работает на одноцепочечной матрице ДНК, скорость ее движения непостоянна. Фермент быстро передвигается в пределах одноцепочечных областей, однако при прохождении через области, имеющие вторичную структуру, образуемую спарившимися внутри цепи основаниями, движение его замедляется. Прохождению ДНК-полимеразы через такие участки способствуют вспомогательные белки. Их роль заключается в увеличении скорости репликации в трудных областях и, следовательно, в поддержании равномерности движения ДНК-полимеразы. Присутствие белков увеличивает сродство ДНК-полимеразы с ДНК, а также ее способность удерживаться на матричной молекуле без диссоциации. Возможно, что белки действуют как зажим , удерживая ДНК-полимеразную субъединицу на матрице более прочно. Для такого эффекта необходимо совместное действие всех трех белков. Подобный тип взаимоотношений оставляет открытым вопрос о том, что является компонентом ДНК-полимеразы, а что-вспомогательным фактором. [c.428]

Наконец, в последнее время разработан вариант ПЦР с горячим стартом, в котором из реакции при низкой температуре выводятся праймеры, образующие характерную вторичную структуру, разрушающуюся при нагревании [278]. Для реализации этого подхода к 5-концам праймеров присоединяют одинаковые последовательности, которые отсутствуют в матричной ДНК. ПЦР проводят в присутствии трех праймеров двух, специфичных в отношении амплифицируемого участка ДНК, и одного, комплемен- [c.210]

Вообще говоря, частоты колебаний v( = 0) зависят от того, в какой фазе и в каком растворителе находится вещество, и убывают в ио-следовательности паровая фаза > в гексане > в ССЦ ( Sa) > в H I3 (например, для СНзСОСбНз эти частоты соответственно равны 1709, 1697, 1692, 1683 см- ) частоты колебаний в H I3 могут оказаться примерно иа 10—20 см- ниже, чем в ССЦ. Частоты колебаний веществ в КВг и других матричных фазах зависят от структуры кристалла (это в особенности относится к амидам), а также от наличия водородной связи (у кислот, первичных и вторичных амидов, имидов, мочевины и се производных и т. д.). В этих случаях полосы поглощения часто смещаются к более низким v на величину 30—40 см- или более по сравнению с соответствующими значениями для разбавленных растворов в H I3- Для более концентрированных растворов частоты принимают промежуточные значения в пределах этого сдвига. В результате сопряжения частоты колебаний v( = 0) понижаются примерно на 30 см при сопряжении с одной связью С = С (или арильным циклом) и еще на 15 см" при сопряжении с двумя двойными связями дальнейшее сопряжение почти не приводит к сдвигам частот. В этих случаях интенсивность полосы колебания v( = ) повышается и эта полоса расширяется ио сравнению с соединениями, в которых отсутствует сопряжение. Водородная связь также понижает частоту v( = 0), как, например, в оксикетонах, р-дикето- (енольных) структурах, о-амино- илп [c.213]

Специфич. наборы водородных связей между пиримидиновыми и пуриновыми основаниями в комплементарных участках цепей (см. Комплементарность), а также меж-плоскостные взаимод. между соседними основаниями в цепи определяют формирование и стабилизацию вторичной и третичной структуры нуклеиновых к-т. Последовательность пуриновых и пиримидиновых оснований в полинуклеотидной цепи определяет генетич информацию ДНК и матричных РНК. Модификация Пов полинуклеотидах под воздействием мутагенов может приводить к изменению информац. смысла (точковой мутации). [c.530]

Рибосома имеет собственное сродство к матричным полинуклеотидшу / Уже давно известно, что среди синтетических полирибонуклеотидов вакантная рибосома лучше всего связьшает полиуридиловую кислоту, на чем и было основано широкое применение поли(и) в качестве матрицы в бесклеточных системах трансляции. Возможно, что отсутствие стабильной вторичной и третичной структуры в поли(и) является существенным фактором ее хорошего связьшания с рибосомой. В случае природных мРНК имеются совершенно определенные предпочтительные места на полинуклеотиде, с которыми могут связьшаться вакантные рибосомы (см. гл. В.VI). В любом случае прочная сплошная двойная спираль вряд ли может служить местом присоединение вакантных рибосом. [c.136]

Выделяя названную группу студней в самостоятельную не только из-за специфики их образования, но и вследствие принципиального различия механизмов, обусловливающих высокую обратимую деформацию студней первого и второго типов, мы определяем ее как группу двухфазных студней в отличие от первой группы, которая отнесена к однофазным системам. Правда, к группе однофазных студней были отнесены и студни с локальной кристаллизацией, несмотря на их гетерофазность. Но малые размеры узлов и тот факт, что структурная сетка таких студней имеет молекулярный, а не фазовый характер, оправдывает это отнесение. Однако следует учесть, что распад на аморфные фазы и образование студней, рассматриваемых в настоящей главе, может сопровождаться дальнейшими процессами, в том числе частичной кристаллизацией полимера в остовообразующей (матричной) фазе, но такой вторичный процесс кристаллизации не приводит к уравниванию структуры и многих свойств студней, образованных по механизму распада раствора на аморфные фазы, со структурой и свойствами студней, возникших в результате локальной кристаллизации молекул полимера в растворе. [c.82]

Суммируя все сказанное относительно морфологии двухфазных студней, следует сделать вывод, что размеры структурных элементов этих студней, гетерогенных в принципе, могут существенно изменяться в результате того, что первичная структура, содержащая очень малые по размеру фазовые образования и при некоторых условиях рассмотрения принимаемая за гомогенную, может переходить во вторичную, отчетливо гетерогенную структуру вследствие частичного разрушения элементов матричной (полимерной) фазы и микросинерезиса (слияния отдельных участков низкоконцентрированной фазы). [c.109]

Согласно представлениям о tpyкiype э№х студней, концентрация полимера в сосуществующих фазах постоянна, а с изменением общей концентрации студня изменяется лишь соотношение объемов этих фаз. Отсюда, казалось бы, следует, что упругость должна возрастать пропорционально концентрации полимера. Однако деформационные свойства зависят не только от суммарного объема матричной фазы, но и от ее пространственной структуры. Но пространственная структура студня зависит от скорости возникновения и роста зародышей новой фазы и от тех вторичных превращений в формирующемся студне, которые связаны с возникновением и релаксацией внутренних напряжений в матричной фазе и проявляются в ее частичном разрушении и си-неретическом отделении жидкой фазы, особенно при низких общих концентрациях полимера в студне. [c.130]

Именно пространственный код, т. е. общее структурное соответствие, определяет и организацию обратных связей во всех описанных случаях. Матрица — оперон — производит вторичные матрицы (РНК), на которых синтезируются белки — ферменты они катализируют какие-то реакции. Если продукт этих реакций не используется с должной скоростью, то он может реагировать с белком, производимым геном-регулятором, и, соединяясь затем с геном-оператором, затормозить синтез целой группы биокатализаторов. Эта иллюстрация важности матричного принципа данная молекула реагирует с такой, конфигурация которой соответствует ее собственной геометрии, а движения отдельных частей молекулы могут лишь способствовать лучшему и более энергически выгодному контакту. Вполне естественно, что в конечном счете обратные связи этого типа поддерживают и сохраняют именно геометрический план динамической структуры. [c.191]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология