Урацил спектр поглощения

Из экспериментов со смешанными спиралями сополимера АУ и полимеров поли-У и поли-А получены новые данные, касающиеся спаривания оснований. Одноцепочечный сополимер АУ представляет собой цепочку, составленную из аденина и урацила, соединенных в случайной последовательности. Были получены образцы сополимера АУ с различными отношениями А У. Во всех случаях при образовании смешанной спирали с поли-А или поли-У минимум поглощения в ультрафиолетовой области спектра наблюдался при одинаковом числе комплементарных оснований в сополимере и гомополимере, но не при равном количестве молекул того и другого компонентов. Таким образом, имеет место соотношение 1 1 между комплементарными основаниями двух полимеров, а не между их молярными содержаниями. Аналогичные результаты были получены для трехцепочечной спирали (АУ-ЬУ-ЬУ). В этом случае число остатков урацила в гомополимере в 2 раза больше числа остатков аденина в сополимере. Очевидно, остающиеся без пары основания (например, урацил в сополимере АУ в последнем примере) должны образовывать петли, выходящие из структуры двух- или трехцепочечной опирали. Анализ модели показывает, что выходящая из спирали петля может быть образована даже всего лишь одним основанием. Считают, что такие петли играют важную роль в структуре РНК. Благодаря им может также сохраняться двойная спиральная структура ДНК при выпадении или включении оснований в одной из цепей. [c.348]

Рис. 12.8. Спектры поглощения фотодимера урацила при pH 7 (кривая 1) и при pH 13 (кривая 2), а также продукта, полученного облучением фотодимера (2537А), при pH 13 (кривая 3)

Некоторые константы скоростей реакций пиримидинов, их нуклеозидов и нуклеотидов с гидратированным электроном приведены в табл. 5.4. Из таблицы видно, что присутствие отрицательно заряженной фосфатной группы в нуклеотиде уменьшает константу скорости реакции с е . Электронные аддукты пиримидина наблюдались при импульсном радиолизе в деаэрированных водных растворах с добавлением трет-бутанола для удаления Н - и ОН -радикалов [7731. Спектр поглощения электронного аддукта урацила имеет [c.228]

В качестве сенсибилизаторов наиболее часто применяют кетоны — бензофенон, ацетофенон, пропиофенон, ацетон. Все эти вещества обладают заметным поглощением выше 310 ммк в отличие от пиримидинов, спектр поглощения которых расположен в более коротковолновой области. Под действием облучения в области 310— 340 ммк урацил 2 2 °, тимин оротовая кис- [c.677]

ИК Спектр урацила. В отличие от УФ-спектра этот спектр состоит из ряда полос. Основные полосы поглощения расположены около 1600—1700, 1400 и 1200 см [c.154]

Для идентификации У. к. наряду с химич. реакциями (см. Урацил, Рибоза) можно воспользоваться изменением абсорбционного спектра поглощения [c.182]

Основными хромофорами нуклеиновых кислот являются пуриновые (аденин и гуанин) и пиримидиновые цитозин и тимин у ДНК, цитозин и урацил у РНК) азотистые основания нуклеотидов. Все эти соединения, как и соответствующие нуклеозиды и нуклеотиды, обнаруживают длинноволновую границу поглощения при А=300 нм. За поглощение света ответственна в основном я-электронная система колец (я —я -переходы). Полосы поглощения оснований (максимум около 260 нм), сформированные п — я -переходами, характеризуются высокой молярной экстинкцией. Некоторый вклад в общее поглощение, особенно в длинноволновой части спектра, вносят п — я -переходы с участием не-поделенной пары электронов гетероатомов азота и кислорода. Участие п — я -переходов наиболее существенно в малополярных растворителях и проявляется в спектрах поглощения в виде плеч в области 280 — 320 нм. Выраженное влияние на положение максимума спектра поглощения оснований и прежде всего на относительную энергию я — я - и п — я -переходов оказывают заместители в пуриновом и пиримидиновом кольцах. Наибольший эффект при этом вызывают заместители при углеродном атоме во втором и четвертом положении у пиримидинов и втором и шестом положении у пуринов. [c.222]

Еще в начале нашего века, когда из клеточных ядер выделили нуклеиновую кислоту (ее и назвали от слова нуклеус — ядро), обратили внимание на то, что она поглощает ультрафиолетовые лучи, не очень далекие от видимых. Впоследствии выяснилось, что за это поглощение ответственны азотистые основания — те самые ура-цил, цитозин, аденин, которые уже упоминались. А теперь допустим, что наш химик синтезирует как раз производные урацила. Берет он для начала сам урацил, растворяет точно отвешенные 1—2 миллиграмма в измеренном количестве воды и записывает УФ-спектр. Оказывается, что урацилу присуща сильная полоса поглощения, причем сильнее всего поглощается свет с длиной волны 256 нм (эта величина называется максимум поглощения). [c.151]

Строгий ревнитель квантовой теории с появлением первого же рисунка этой главы, изображающего УФ-спектр, мог бы отметить, что получается, будто эта теория соблюдается не очень-то строго. Ведь если молекуле свойственно поглощать свет определенной длины волны, то полоса поглощения обязана быть узкой, как лезвие. Так, как это бывает в спектрах атомов. Однако в ультрафиолетовых и видимых спектрах молекул полоса обычно довольно широка, расплывчата, а иногда еще явно распадается на ряд горбов поуже. Так, урацил поглощает свет не только при положенных ему 256 нм, а в интервале от 230 до 280 нм, что соответствует энергиям возбуждения от примерно 418 до 502 кДж/моль. Куда [c.167]

Данные по периодатному окислению псевдоуридин-З -фосфата и уридин-2 (3 )-фосфата приведены в табл. 11.1. При pH 7,5 урацил-5-карбоновая кислота является единственным продуктом окисления псевдоуридин-З -фосфата, поглощающим в ультрафиолетовой области одновременно становится заметным и другой процесс — разрушение соединения с потерей характерного поглощения в УФ-области спектра. Образующиеся при этом продукты не идентифицированы, и механизм реакции остается неясным (см. также ). [c.611]

После введения в пиридиновое кольцо карбонильных групп полученные соединения, например, урацил и тимин, могут подвергаться енолизации, что приводит к значительному увеличению количества резонансных форм этих соединений. Спектры этих соединений характерны для сопряженной системы, интенсивность максимума поглощения резко увеличена (lg е = 3,95 -н 3,98). Следует отметить, что производные пиримидина, имеющие одну или две двойные связи, поглощают гораздо сильнее, чем сам пиримидин, у которого имеется [c.38]

Возможности применения метода ультрафиолетовой спектроскопии для идентификации неизвестных соединений особенно хорошо выявляются при изучении нуклеотидной последовательности в молекулах тРНК [38]. В процессе исследования получали индивидуальные рибонуклеотиды и определяли, какие именно — пуриновые или пиримидиновые основания содержатся в данном продукте аденин, гуанин, цитозин, урацил или их производные (так называемые минорные основания) [39]. Ультрафиолетовые спектры поглощения З -рибонуклеотидов этих четырех оснований приведены на рис. 9.15. Наличие системы сопряженных двойных связей в этих молекулах приводит к появлению полос поглощения между 190 и 280 нм. Их спектры поглощения [c.521]

Так, например, максимум длинноволновой полосы поглощения в спектре нейтрального водного раствора ГМФ находится при 255 нм, ЦМФ — при 271 нм, УМФ — при 262 нм, а АМФ — при 259 нм [40]. Простое определение положения первого максимума поглощения дает возможность более или менее определенно идентифицировать ГМФ и ЦМФ, тогда как сделать выбор между АМФ и УМФ таким путем довольно трудно. Однако с помощью спектров поглощения этих нуклеотидов при экстремальных значениях pH можно решить и эту задачу. При высоких значениях pH атомы водорода, связанные с атомами азота кольца, в случае урацила и гуанина диссоциируют, и это приводит к изменению я-электронной системы этих оснований. Поэтому спектры поглощения УМФ и ГМФ (но не ЦМФ и АМФ) при pH 7 и 12 сильно различаются (рис. 9.15). Таким образом, измерение спектров поглощения при pH 7 и 12 дает возможность сделать однозначный выбор между АМФ, ЦМФ, ГМФ и УМФ Для идентификации содержащихся в тРНК производных аде пина, цитозина, гуанина и урацила (т. е. минорных оснований) аналитическая процедура включает изучение спектров погло щения при низких значениях pH [41] с последующим сопостав лением результатов с данными, полученными другими методами и в частности методом бумажной хроматографии [42]. [c.522]

Согласно данным Рутмана [5], урацил-2- можно получить конденсацией мочевины-С с малоновым эфиром. Об отсутствии примесей свидетельствуют хроматографирование на бумаге (н-бутиловый спирт — вода), измерение спектра поглощения в ультрафиолетовой области, а также отсутствие выделения двуокиси углерода-С " под действием уреазы. [c.113]

На рис. 5.12 б приведен спектр поглощения аддукта урацила с И--радикалом (длина волны, соответствующая максимуму спектра поглощения, равна 420 нм). Этот спектр был также получен методом импульсного радиолиза кислых растворов урацила с избытком формальдегида для удаления ОН -радикалов 13681. Этот ад, 1укт можно также получить окислением дигидроурацила в насыщенных МеО нейтральных растворах [c.228]

На примере систем 3,4—бензпирен — урацил, 3,4 —бензпирен— ДНК, на основании наблюдаемого изменения соотношения интенсивностей полос поглощения, соответствующих неплоским деформационным колебаниям ароматических С-Н-связей канцерогена, и появления новой полосы при 860см , сделан вывод о химическом взаимодействии в системах канцероген — нуклеиновая кислота. В ИК-спектрах препаратов нуклеиновых кислот (и-РНК, р-РНК, т-РНК), выделенных из нормальных и раковых клеток, обнаружены отличия, однако специфичность их пока не подтверждена, а воспроизводимость не достигнута. Главная причина невоспроизводимости спектроскопических данных состоит в биохимической части — невоспроизводимости препаратов ДНК и РНК для спектрального исследования. [c.95]

В — 5-хлорурацилом Г — 5-бромурацнлом. Несмотря на небольшие различия в положении максимумов поглощения, эти спектры не позволяют надежно отличить друг от друга производные урацила. Следовательно,спектроскопия поглощения не даст возможность установить полную структурную формулу соединения, но позволяет судить о строении ненасыщенной основы молекулы. [c.152]

Спектры неустойчивых продуктов, образующихся при облучении водных растворов пиримидиновых оснований в присутствии закиси азота, довольно сложны [304]. Тем не менее методом импульсного радиолиза удалось определить константу скорости реакции (130) как методом конкурирующих реакций с использованием тиоцианата, так и непосредственно по скорости уменьшения поглощения, обусловленного двойной связью в положении 5,6 [299]. Результаты этих измерений согласуются с данными других методов конкурирующих реакций [299—304]. Для урацила при pH 7 130= (5 0,6) 10 л МОЛЬ" С [304]. Это высокое значение константы скорости реакции (130) согласуется с предположением об атаке гидроксильным радикалом по двойной 5,6-связи. Анализ спектров ЭПР радикала, образующегося при взаимодействии тимина с гидроксильным радикалом, генерируемым в растворе Ti + и Н2О2, показывает, что атакуется атом С-5 [305, 306]. С ростом pH 130 для урацила монотонно растет без резких изменений вблизи pi . Это означает, ч.то эффективная реакционная способность кетонной и енольной форм пиримидинового основания приблизительно одинакова [299]. Выше pH 13 130 несколько уменьшается, что объясняется, вероятно, образованием 0" по реакции гидроксильного радикала с ионом гидроксила [307] [уравнение (21)]. [c.189]

Спектры четырех нуклеозидов в воде при pH 7 выглядят обманчиво просто (рис. 7.12). Однако электронная структура пуринов и пиримидинов гораздо сложнее, чем белковых хромофорных групп. Основания имеют очень низкую симметрию и много несвязывающих электронов. Сопоставление со спектрами ряда более простых молекул показывает, что у всех оснований в области от 200 до 300 нм должно проявляться несколько разных п — 7г -и тг — 7г -переходов. Кажущиеся простыми полосы поглощения аденина и ураци-ла с = 260 нм, имеющие вид гауссовых кривых, в действительности порождаются более чем одним переходом. G и С, имеющие на первый взгляд лишь по две полосы, на самом деле, вероятно, обладают большим числом невыявленных полос. [c.38]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология