Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Динуклеотиды и олигонуклеотиды

    Переваривание нуклеопротеинов и всасывание продуктов их распада осуществляются в пищеварительном тракте. Под влиянием ферментов желудка, частично соляной кислоты, пуклеопротеины пищи распадаются на полипептиды и нуклеиновые кислоты первые в кишечнике подвергаются гидролитическому расщеплению до свободных аминокислот. Распад нуклеиновых кислот происходит в тонкой кишке в основном гидролитическим путем под действием ДНК- и РНКазы панкреатического сока. Продуктами реакции при действии РНКазы являются пуриновые и пиримидиновые мононуклеотиды, смесь ди- и тринуклеотидов и резистентные к действию РНКазы олигонуклеотиды. В результате действия ДНКазы образуются в основном динуклеотиды, олигонуклеотиды и небольшое количество мононуклеотидов. Полный гидролиз нуклеиновых кислот до стадии мононуклеотидов осуществляется, очевидно, другими, менее изученными ферментами (фосфодиэстеразами) слизистой оболочки кишечника. [c.469]


    Изучение олигонуклеотидов, выявившее, в частности, различия АДОВ и КД для 16 динуклеотидов [152, 153], дает основания надеяться на получение сведений о первичной структуре фрагментов нуклеиновых кислот. По-видимому, оптическую активность одноцепочечных полимеров можно представить в виде суммы вкладов димеров [154]. [c.320]

    ДНК расщепляется ДНК-азой панкреатической железы и слизистой кишечника с образованием динуклеотидов и олигонуклеотидов различной степени полимеризации, которые дальше расщепляются фосфатазой (например, слизистой кишечника) до мононуклеотидов и нуклеозидов. [c.377]

    Гидролиз РНК до олигонуклеотидов (преимущественно динуклеотидов) протекает также при нагревании со слабыми анионитами, [c.559]

    Из числа щелочных систем все еще применяются смеси С1 и Сз. Первая особенно пригодна для разделения монофосфатов нуклеозидов, а вторая позволяет разделить соединения даже с большим числом фосфатных групп (от динуклеотидов до олигонуклеотидов, высшие фосфорилированные мононуклеотиды), малоподвижные в системе Сь [c.127]

    НО также и у динуклеотидов и более длинных олигонуклеотидов (рис. 8-38 и 8 39). [c.633]

    Среди продуктов реакции открыты также моно- и динуклеотиды. Типичными представителями этих ферментов являются ДНКазы поджелудочной железы. Одна из них (ДНКаза I) была получена в чистом виде, расшифрована последовательность всех ее 257 аминокислотных остатков. Фермент наиболее активен при pH 6,8-8,0, активируется двухвалентными ионами Mg и Мп и ингибируется конечными продуктами ферментативной реакции - олигонуклеотидами. [c.499]

    Нуклеотиды могут связываться друг с другом при использованпи фосфатной связи С—О—Р. Так могут образоваться динуклеотиды, тринуклеотиды, олигонуклеотиды. Нуклеиновые кислоты являются полинуклеотидами, в которых нуклеотидные молекулы связаны между собой 3 -5 -фосфатной связью С—О—Р—О—С. В приведенной формуле тринуклеотида R, R и R —остатки урацила, тимина, цитозина, аденина или гуанина. [c.715]

    Метод синтеза, при котором на каждом последующем шаге присоединяется мономерное звено, называется ступенчатым. Обычно таким образом синтезируются не более чем 3 — 4-звенные олигонуклеотиды, что связано с трудностями отделения продукта конденсации от исходного олигонуклеотида по мере увеличения д,7ины цепи, поскольку они различаются всего на одно звено. Для синтеза более длинных олигонуклеотидов используют блочный метод. К динуклеотиду со свободной 3 -гидроксильной группой (tt) [c.359]

    Михельсон [99] изучал влияние осевого взаимодействия в олигонуклеотидах на гиперхромный эффект, наблюдая оптическое поглощение при разрушении большого числа оли-горибонуклеотидов. Оказалось, что гиперхромный эффект, достаточно большой даже для динуклеотидов, быстро достигает лредельного значения уже для цепи из 7—10 нуклеотидов [c.191]


    Более того, уже в рассмотренной нами работе [94] Кантор и Тиноко отмечают полное отсутствие кооперативности. Исходя из этого они предложили простую схему для расчетов оптических свойств полинуклеотидов из оптических данных составляющих их динуклеотидов. В основе этой схемы лежат два предположения 1) оптические свойства могут быть полностью объяснены взаимодействием ближайших соседних оснований и 2) относительная конформация любых двух оснований одинакова как в динуклеотиде, так и в длинном олигонуклеотиде, если эти два основания являются ближайшими соседями, Вычисленные согласно этой схеме кривые ДОВ прекрасно согласуются с экспериментальными данными, что подтверждает высказанные предположения. [c.192]

    Подобно экзонуклеазе I, экзонуклеаза II начинает разрушение иолидезоксирибонуклеотидной цепи с З -гидроксильного конца, освобождая последовательно дезоксирибонуклеозид-5-моно-фосфаты (фиг. 40). Однако в отличие от экзонуклеазы I этот фермент действует и на динуклеотиды. Так, экзонуклеаза II гидролизует олигонуклеотид фТфТфТфТфТ до 5фТ. Фермент этот быстрее действует на нативную (двухцепочечную) ДНК, чем на денатурированную (одноцепочечную) ДНК, и не разрушает олигонуклеотиды, содержащие З -фосфомоноэфирную группу не действует он и на РНК. [c.94]

    В ряде опытов был изучен фосфоролиз, т. е. обращение реакции полимеризации [158, 166, 168]. Для этого используемый полинуклеотид инкубировали с ферментом в присутствии избытка неорганического фосфата, что приводило к образованию нуклеозиддифосфатов в результате последовательного отщепления моно-нуклеотидных единиц. Оказалось, что легко фосфоролизируются не только полимеры, полученные путем биосинтеза, но и обладающие затравочной активностью олигонуклеотиды. Динуклеотиды же и динуклеозидмонофосфаты, как и следовало ожидать, не поддаются фосфоролизу. РНК вируса табачной мозаики и высокополимерная РНК дрожжей могут легко подвергнуться фосфоролизу, но если дрон<жевую РНК предварительно обрабатывают щелочью, то фосфоролиз протекает медленно. Медленно протекает и фосфоролиз многочисленных тяжей, образованных, например, из поли-А и поли-У. Неполностью (па 20—30%) протекает фосфоролиз транспортной РНК клеточной цитоплазмы, что можно объяснить особенностями вторичного строения s-PHK. По-видимому, фосфоролиз затрагивает преимущественно концевые группы. [c.256]

    Даже относительно бесструктурные полимеры, такие, как, например, денатурированная нагреванием ДНК или одноцепочечные гомополинуклеотиды, обнаруживают значительный остаточный гипохромизм. Это объясняется тем, что гипохромизм свойствен олигонуклеотидам и даже динуклеотидам соответствующей структуры. [c.144]

    Обычным методом кислотной деградации ДНК является нагревание ее 2%-ного раствора в 0,2 и. серной кислоте при 100° С в течение 35 мин 2 . При данном методе гидролиза эти условия являются оптимальными, так как они позволяют достичь достаточно полного расщепления фосфодиэфирных связей у дезоксирибозильных звеньев, образовавшихся в результате апуринизации ДНК (см. также стр. 500). Большая продолжительность реакции приводит к частичной апиримидипизации ДНК и расщеплению соответствующих фосфодиэфирных связей, как было показано при изучении кинетики кислотного гидролиза пиримидиновых олигонуклеотидов. При этом остаток цитозина отцепляется с большей скоростью, чем остаток тимина Так, при длительном нагревании динуклеотида р(1Тр(1С в 0,2 н. серной кислоте при 100° С протекает преимущественное отщепление цитозина и образование тимидин-3, 5 -дифосфата  [c.574]

    Если олиго- или полинуклеотид фосфорилирован по З -концу, первой стадией является ферментативное дефосфорилирование. Затем следует периодатное окисление, превращающее З -концевой нуклеозидный остаток в 2, 3 -диальдегид XVI, в котором 5 -фосфо-диэфирная связь находится в р-положении к З -альдегидной группе (подробнее о периодатном окислении см. стр. 531). Завершающей стадией является расщепление 5 -фосфоэфирной связи в диальде-гидном производном XVI под действием различных первичных аминов. В результате образуется олиго- или полинуклеотид, укороченный с З -конца на одно нуклеотидное звено. Весь цикл превращений может быть повторен. От продукта превращения бывшего З -концевого нуклеотидного звена XVII при действии кислоты (рН< 3) или щелочи (pH > 11) отщепляют основание, определяемое далее обычными аналитическими методами. Разрешающая способность метода (возможность определять достаточно длинную З -концевую последовательность олигонуклеотида или РНК) зависит от полноты прохождения каждой стадии реакции. Важнейшей из этих стадий является расщепление фосфодиэфирной связи в диальдегиде XVI под действием аминов. Первоначально для этой цели использовали глициновый буфер (pH 10—10,5 37° С, 18 ч) 175,176 Хаким методом была проведена ступенчатая деградация 3 ряда динуклеотидов [c.588]

    Фосфодиэфирная связь в фотодимерах динуклеотидов устойчива к действию фосфодиэстеразы змеиного яда При гидролизе этой фосфодиэстеразой УФ-облученной ДНК образуются олигонуклеотиды типа d (рИрТрТ) . [c.654]

    Гидролиз РНК гидроокисями различных металлов, такими, как гидроокиси свинца, кадмия, цинка или алюминия, приводит к образованию смесей нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов [195]. После расщепления дрожжевой РНК гидроокисью лантана остается устойчивая фракция [196]. Из гидролизатов рибонуклеиновой кислоты гидроокисью висмута (pH 4) выделены все шестнадцать димеров, которые возможно получить комбинированием четырех классических оснований [197] при действии слабоосновных ионообменных смол образуются преимущественно динуклеотиды [198]. В последнем случае происходит миграция непрогидролизовав-шихся фосфодиэфирных связей (изомеризация 3 —5 -связи в 2 —5 ) в противоположность тому, что имеет место при действии разбавленной щелочи на простые эфиры рибонуклеотидов. [c.401]


    Впоследствии для дезоксинуклеозидов была полностью установлена Р-0-2-дезоксирибофуранозная структура [91], и сравнением свойств синтетического тиминового динуклеотида, содержащего 3 — 5 -межнуклеотидную связь, со свойствами олигонуклеотидов, полученных в результате ферментативного гидролиза дезоксинуклеиновой кислоты [349], было дано подтверждение основной структуры ДНК. [c.421]

    ОКОЛО трех мононуклеотидов) с последующей сополимеризацией смеси олигонуклеотидов приводит к образованию полинуклеотидов с пуриновыми и пиримидиновыми участками 131]. Кроме двух первых типов сополимеров, был получен и третий тип при полимеризации динуклеотида — аденилил-3 5 -уридин-3 -фосфата (после циклизации концевого моноэтерифицированного фосфата в 2 3 -циклический фосфат под действием хлоругольного эфира). Этот тип представлял собой олигонуклеотиды с определенным расположением чередующихся адениловой и уридиловой кислот [32]. [c.497]

    Прямой предпосылкой для такой интерпретации rипepxpo шзмa олигонуклеотидов является тот факт, что низкомолекулярные полинуклеотиды обладают определенной конформацией и что даже динуклеотиды и динуклеозидфосфаты характеризуются ограниченным вращение.м вокруг межнуклеотидной связи. Это подтверждается подвижностью изомерных динуклеозидфосфатов при электрофорезе [22]. Во всех изученных случаях производные с 2 —5 -связями обладают более высокой подвижностью, чем 3 — 5 -изоме-ры (что параллельно их гиперхромизму) таким образом, соединения первого типа более компактны, чем соединения второго типа, что приводит к более сильному взаимодействию между основаниями. Это особенно примечательно, так как в других отношениях 3" — 5 -соединения ведут себя как более сильные кислоты. [c.526]

    Сумио и др. исследовали также эффекты матрицы на смолах, образованных стиролом с присоединенными олигонуклеотидами (типа 7). Кроме различных динуклеотидов изучали два типа тринуклеотидов (рёАр(1Ср(1А и рсЮрёЛрдС). [c.199]

    Эююнукдеазы II и VI — экзонуклеазы, связанные с ДНК-полимеразой I кишечной палочки. Они осуществляют экзогенное расщепление ДНК соответственно в направлениях 3 -> 5 я 5 -> 3. Расщепление в направлении 3 -> 5, по-видимому, присуще той же молекуле белка, которая обладает и ДНК-полимеразной активностью. Расщеп-левие ДНК в этом случае начинается с З -гидроксильного конца цепи с образованием 5 -монофосфатов. В отличие от экзонуклеазы I этот фермент может осуществлять гидролиз я динуклеотидов, кроме того, он может гидролизовать ДНК не только с З -конца, но и с 5 -конца, в результате чего образуются 5 -мононуклеотиды. Лучшим субстратом для j j фермента являются денатурированные ДНК, но он не действует на олигонуклеотиды с 3 -фосфатным нуклеотидом на конце и на РНК. [c.89]

    Была также изучена возможность применения метода с участием дициклогексилкарбодиимида и для синтеза некоторых высших полинуклеотидов. В первых работах были достигнуты удовлетворительные результаты при получении олигонуклеотидов, содержащих три-четыре мононуклеотидные единицы. Так, например, по реакции между тимидилил-(3 5 )-тимидином, защищенным соответствующим образом (полностью защищенный динуклеотид, каким он получается в результате первой стадии синтеза, подвергают мягкому щелочному гидролизу, причем происходит отщеиление только ацетильной, но не тритильной группы), и 3 -0-ацетилтимидин-5 -фосфатом [c.505]


Смотреть страницы где упоминается термин Динуклеотиды и олигонуклеотиды: [c.505]    [c.173]    [c.365]    [c.423]    [c.276]    [c.145]    [c.76]    [c.88]    [c.231]    [c.316]    [c.402]    [c.423]    [c.424]    [c.424]    [c.500]    [c.502]    [c.524]    [c.15]    [c.18]    [c.68]    [c.70]    [c.90]    [c.423]   
Смотреть главы в:

ЯМР высокого разрешения макромолекул -> Динуклеотиды и олигонуклеотиды




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Динуклеотиды

Олигонуклеотиды



© 2025 chem21.info Реклама на сайте