Динуклеотиды, образование

Рис. 4.16. Строение одной из простетических групп — флавинадениндинуклеотида (ФАД). ФАД представляет собой динуклеотид, образованный в результате соединения двух нуклеотидов. Нуклеотид состоит из сахара, основания и фосфата. В данном случае нуклеотиды представлены флавинмононуклеотидом (ФМН) и аденозинмо-нофосфатом (АМФ). Обратите внимание, что в состав одного из нуклеотидов (ФМН) входит рибофлавин (витамин В2). Этот витамин, следовательно, лжен содержаться в рационе.

Инициация синтеза цепи РНК начинается реакцией АТР или GTP со второй молекулой рибонуклеозидтрифосфата [уравнение (15-5)], приводящей к образованию динуклеотида, с 5 -концом которого все еще связан трифосфат. [c.207]

Динуклеотиды. Простые нуклеиновые кислоты, вроде адениловой, называются мононуклеотидами. Нуклеиновая кислота, образованная из двух [c.332]

Некоторые подробности реакции ДЦГК с органическими кислотами, приводящей к образованию их ангидридов, уже обсуждались. По очень похожему механизму происходит и образование фосфодиэфирной связи. Зто показано на примере синтеза динуклеотида тимидил- (3 - 5 ) -тимидина [c.174]

Здесь энергия света превращается в энергию макроэргической фосфатной связи АТФ. При нециклическом фотофосфорилировании часть световой энергии затрачивается на образование АТФ, а другая часть — на восстановление никотинамид-аденин-динуклеотид-фосфата [c.135]

Наряду с этим известно, что разрушение РНК щелочью приводит, как это описано ниже, к образованию смеси нуклеозид-2 -и нуклеозид-З -фосфатов. Весьма вероятно, таким образом, что основные межнуклеотидные связи представлены фосфоэфирными группами, соединяющими С-5 одного нуклеотида с С-2 или С-3 следующего нуклеотида. На фиг. 10 изображен динуклеотид, содержащий связь (С-3 ) — О — Р — О — (С-5 ). [c.46]

Фермент, катализирующий эту реакцию, был назван дегидрогеназой этилового спирта потому, что он же катализирует и обратный процесс — дегидрирование этилового спирта в присутствии окисленной формы никотинамид-аденин-динуклеотида с образованием уксусного альдегида. [c.271]

ДНК расщепляется ДНК-азой панкреатической железы и слизистой кишечника с образованием динуклеотидов и олигонуклеотидов различной степени полимеризации, которые дальше расщепляются фосфатазой (например, слизистой кишечника) до мононуклеотидов и нуклеозидов. [c.377]

Образование динуклеотидов и полинуклеотидов [c.141]

Эта изменчивость в центрах связывания субстрата дает возможность полагать, что семейство сериновых протеиназ возникло в процессе эволюции от общего предка и относительно недавно. Структурную близость, обнаруженную в ряде ферментов, использующих кофермент никотинамидадениндинуклеотид NAD [107] (см. гл. 24.3), объясняют гораздо более далекими и древними эволюционными взаимоотношениями. В некоторых случаях такие ферменты, включая лактат-, малат- и глицеральдегид-З-фосфат-дегидрогеназы, имеют очень близкие трехмерные структуры в участках связывания кофермента, в то время как другие участки структуры совершенно различны. Этот участок связывания динуклеотида присутствует в широко варьируемых участках первичной структуры этих ферментов и состоит из двух очень близких звеньев связывания мононуклеотида, одно из которых специфично к адениновой половине кофермента. Гораздо большее число ферментов катализирует реакции адениновых нуклеотидов, АМР, ADP и АТР (см. гл. 24.3), и можно полагать, что в процессе эволюции более вероятно образование связывающего звена для АМР, а не обычного участка связывания динуклеотида . Действительно, имеются данные о существовании такого звена в киназах, и что это звено родственно мононуклеотнд-связывающему звену дегидрогеназ. Отсюда вытекает интригующее предположение о том, что участок связывания нуклеотида во всем множестве существующих ферментов происходит от общего изначального нуклеотид-связывающего белка [107]. [c.515]

Моноэфиры амида ортофосфорной кислоты могут реагировать с фосфатными анионами с образованием пирофосфатной связи при этом не происходит фосфорилирования спиртовых гидроксильных групп, фосфоамиды могут быть использованы для синтеза несимметричных динуклеотидов. [c.82]

Для аэробных организмов основной путь накопления АТФ состоит в окислительном расщеплении углеводов, приводящем в конце концов к образованию двуокиси углерода и воды. При этих процессах в биологических системах в качестве окислителей выступают никотинамидаденин-динуклеотид (НАД) или его фосфат (НАДФ), переходящие в соответствующие восстановленные нуклеотиды (НАД-На, НАДФ-На) [c.364]

Витамин РР в растениях находится главным образом в виде кислоты, которая, превращаясь в амид, используется для синтеза важнейших окислительно-восстановительных ферментов, содержащих в активной группе никотинамид-аденин-динукле-отид или никотинамид-аденин-динуклеотид-фосфат (стр. 54). При недостатке никотиновой кислоты задерживается образование большой группы ферментов, катализирующих окислительновосстановительные реакции в организмах. [c.94]

На следующем этапе происходит окисление З-фосфоглицеринового альдегида. Окисление катализируется ферментом, который называется триозофосфатдегидрогеназа. Активной группой этого фермента является Н5-группа трипеп-тида глутатиона, поэтому сокращенно этот фермент обозначается как Н5-фермент. В состав Н8-фермента входит также нико-тинамид-аденин-динуклеотид (НАД). Вначале происходит образование комплексного соединения между 3-фосфоглицериновым альдегидом и Н8-ферментом [c.157]

При изучении дыхательных ферментов отмечалось, что обычно окисление органических веществ происходит отщеплением от них водорода и что перенос водорода на кислород воздуха идет не сразу, а ступенчато, через промежуточные переносчики водорода никотинамид-аденин-динуклеотиды, флавиновые ферменты и цитохромную систему. Белицер предположил, что окислительное фосфорилирование происходит не в самом цикле ди- и трикарбоновых кислот, а при переносе электронов от окисляющегося вещества на кислород через промежуточные переносчики электронов, входящих в дыхательную цепь. Белицер показал, что изменение свободной энергии для переноса пары электронов от восстановленного никотинамида на кислород составляет приблизительно 55 ккал АР = —55 ккал). В связи с тем, что для образования 1 моля АТФ из АДФ требуется затрата 12 ккал, то, очевидно, при наличии соответствующего ферментативного механизма перенос каждой пары электронов от НАД или НАДФ на кислород теоретически может сопровождаться образованием около четырех молей АТФ (12X4 = 48 ккал). [c.172]

Дезоксирибонуклеаза стрептококка (стрептодорпаза) относится к числу дезоксирибонуклеаз эндонуклеазного типа. Она вызывает разрыв З -фосфатных связей, что приводит к образованию фрагментов различной длины с концевыми 5 -фосфорильными группами. Среди продуктов распада ДНК обнаружены лишь следы мононуклеотидов и небольшое количество динуклеотидов большинство образующихся фрагментов крупнее, чем динуклеотиды. Действие [c.90]

Фермент гидролизует денатурированную нагреванием одно-ценочечную ДНК и почти не действует на нативную двухцепочечную ДНК. Эта экзонуклеаза гидролизует цепь ДНК последовательно, начиная с З -гидроксильного конца, приводя к образованию дезоксирибонуклеозид-5 -монофосфатов это происходит до тех пор, пока не останется лишь один динуклеотид. [c.93]

В ряде опытов был изучен фосфоролиз, т. е. обращение реакции полимеризации [158, 166, 168]. Для этого используемый полинуклеотид инкубировали с ферментом в присутствии избытка неорганического фосфата, что приводило к образованию нуклеозиддифосфатов в результате последовательного отщепления моно-нуклеотидных единиц. Оказалось, что легко фосфоролизируются не только полимеры, полученные путем биосинтеза, но и обладающие затравочной активностью олигонуклеотиды. Динуклеотиды же и динуклеозидмонофосфаты, как и следовало ожидать, не поддаются фосфоролизу. РНК вируса табачной мозаики и высокополимерная РНК дрожжей могут легко подвергнуться фосфоролизу, но если дрон<жевую РНК предварительно обрабатывают щелочью, то фосфоролиз протекает медленно. Медленно протекает и фосфоролиз многочисленных тяжей, образованных, например, из поли-А и поли-У. Неполностью (па 20—30%) протекает фосфоролиз транспортной РНК клеточной цитоплазмы, что можно объяснить особенностями вторичного строения s-PHK. По-видимому, фосфоролиз затрагивает преимущественно концевые группы. [c.256]

Обычным методом кислотной деградации ДНК является нагревание ее 2%-ного раствора в 0,2 и. серной кислоте при 100° С в течение 35 мин 2 . При данном методе гидролиза эти условия являются оптимальными, так как они позволяют достичь достаточно полного расщепления фосфодиэфирных связей у дезоксирибозильных звеньев, образовавшихся в результате апуринизации ДНК (см. также стр. 500). Большая продолжительность реакции приводит к частичной апиримидипизации ДНК и расщеплению соответствующих фосфодиэфирных связей, как было показано при изучении кинетики кислотного гидролиза пиримидиновых олигонуклеотидов. При этом остаток цитозина отцепляется с большей скоростью, чем остаток тимина Так, при длительном нагревании динуклеотида р(1Тр(1С в 0,2 н. серной кислоте при 100° С протекает преимущественное отщепление цитозина и образование тимидин-3, 5 -дифосфата [c.574]

Гидролиз РНК гидроокисями различных металлов, такими, как гидроокиси свинца, кадмия, цинка или алюминия, приводит к образованию смесей нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов [195]. После расщепления дрожжевой РНК гидроокисью лантана остается устойчивая фракция [196]. Из гидролизатов рибонуклеиновой кислоты гидроокисью висмута (pH 4) выделены все шестнадцать димеров, которые возможно получить комбинированием четырех классических оснований [197] при действии слабоосновных ионообменных смол образуются преимущественно динуклеотиды [198]. В последнем случае происходит миграция непрогидролизовав-шихся фосфодиэфирных связей (изомеризация 3 —5 -связи в 2 —5 ) в противоположность тому, что имеет место при действии разбавленной щелочи на простые эфиры рибонуклеотидов. [c.401]

ОКОЛО трех мононуклеотидов) с последующей сополимеризацией смеси олигонуклеотидов приводит к образованию полинуклеотидов с пуриновыми и пиримидиновыми участками 131]. Кроме двух первых типов сополимеров, был получен и третий тип при полимеризации динуклеотида — аденилил-3 5 -уридин-3 -фосфата (после циклизации концевого моноэтерифицированного фосфата в 2 3 -циклический фосфат под действием хлоругольного эфира). Этот тип представлял собой олигонуклеотиды с определенным расположением чередующихся адениловой и уридиловой кислот [32]. [c.497]

Дальнейшая обработка этих динуклеотидов (выделенных в твердом состоянии в виде свободных кислот) дибензилхлорфосфатом приводит к образованию промежуточных Р -дибензил-Р -динуклео-тид-5 -пирофосфатов, гидрогенолизом которых получают динуклео-тидные производные с концевой 5 -пирофосфатной группой.Эти соединения, вероятно, интересны с точки зрения действия на них полинуклеотидфосфорилазы. Другой метод синтеза аналогичных соединений состоит в обработке дибензилпроизводного (или Р -дифе-нил Р -динуклеотид-5 -пирофосфата, получающегося при действии дифенилхлорфосфата) фосфорной кислотой, замещающей в результате нуклеофильной атаки дибензил(или дифенил)фосфорную группу. Следует отметить, что при данных условиях хлорфосфаты реагируют только со вторичной гидроксильной группой фосфатного остатка (иначе наблюдался бы разрыв межнуклеотидной связи ) и что при анионном обмене снова более устойчивый анион вытесняется менее устойчивым. Превращение динуклеотида в незащищенный пирофосфат включает таким образом два нуклеофильных замещения с освобождением в каждом случае более устойчивого аниона (сначала С1 , а затем дифенилфосфат-иона [37]). Факт, что предпочтительной реакцией является взаимодействие вторичной гидроксильной группы , уже обсуждался при описании действия на аналогичные соединения этилового эфира хлоругольной кислоты эта специфичность обусловливается значительным различием в стабильности первичных и вторичных фосфорильных анионов. [c.504]

Сумио и др. исследовали также эффекты матрицы на смолах, образованных стиролом с присоединенными олигонуклеотидами (типа 7). Кроме различных динуклеотидов изучали два типа тринуклеотидов (рёАр(1Ср(1А и рсЮрёЛрдС). [c.199]

Эююнукдеазы II и VI — экзонуклеазы, связанные с ДНК-полимеразой I кишечной палочки. Они осуществляют экзогенное расщепление ДНК соответственно в направлениях 3 -> 5 я 5 -> 3. Расщепление в направлении 3 -> 5, по-видимому, присуще той же молекуле белка, которая обладает и ДНК-полимеразной активностью. Расщеп-левие ДНК в этом случае начинается с З -гидроксильного конца цепи с образованием 5 -монофосфатов. В отличие от экзонуклеазы I этот фермент может осуществлять гидролиз я динуклеотидов, кроме того, он может гидролизовать ДНК не только с З -конца, но и с 5 -конца, в результате чего образуются 5 -мононуклеотиды. Лучшим субстратом для j j фермента являются денатурированные ДНК, но он не действует на олигонуклеотиды с 3 -фосфатным нуклеотидом на конце и на РНК. [c.89]

Механизм действия этого витамина сводится к участию его в образовании ферментов биологического окисления. В виде фосфорного эфира — мононуклеотида (флавинмононуклеотид ФМН) или динуклеотида (флавинадениндинуклеотид ФАД) он является коферментом ряда Савиновых ферментов (желтого дыхательного фермента, диафоразы, цитохромредуктазы, оксидазы аминокислот, ксантиноксидазы), обеспечивающих нормальное протекание в организме окислительно-восстановительных процессов, суть действия которых заключается в переносе атомов водорода. [c.162]

Смотреть страницы где упоминается термин Динуклеотиды, образование: [c.175] [c.175] [c.175] [c.175] [c.365] [c.477] [c.135] [c.137] [c.313] [c.242] [c.298] [c.643] [c.417] [c.227] [c.316] [c.402] [c.477] [c.478] [c.502] [c.503] [c.524] [c.532] [c.134] [c.34]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология