Ферменты расщепление амидных связей

Оценить относительную специфичность различных ферментов можно, сравнивая вероятности расщепления амидных связей в белках и пептидах [19563, т.е. отношение числа расщепляемых связей к общему числу связей в изученных последовательностях. Среди исследованных таким образом ферментов химотрипсин и пепсин относятся к наиболее специфичным [c.194]

В качестве примера такого ферментативного разделения рассмотрим расщепление ( )-лейцина при помощи фермента ацилазы, выделенного из почек свиньи. Этот фермент катализирует гидролиз амидных связей ъ-аминокислот, но не в-аминокислот. Сначала рацемическую аминокислоту ацетилируют уксусным ангидридом [c.392]

Автолитическое расщепление ферментов - свойство, присущее только протеазам. Оно заключается в катализе протеазой гидролиза амидных связей в молекулах того же фермента, подвергшегося частичной или полной денатурации. В простейшем случае кинетика инактивации фермента за счет автолиза описывается схемой [c.267]

Многие ферменты обладают групповой специфичностью. Они катализируют расщепление связей, образованных определенными -функциональными группами (например, эфирную связь). Такая групповая специфичность может быть абсолютной или относительной. Ферменты с абсолютной групповой специфичностью действуют только на один род функциональных групп. Ферменты с относительной групповой специфичностью действуют преимущественно на один тип связи, например амидную, но при этом могут действовать и на другой тип связи (например, эфирную). Примером последнего типа может служить фермент пищеварительного тракта — трипсин. [c.346]

Обнаружено, что существенная для связывания карбоксильная группа субстрата образует солевой мостик с гуанидиновой группой аргинина-145, тем самым, а также предпочтительными положениями связывания боковых радикалов, приводя подлежащую расщеплению амидную связь в контакт с атомом 2п. Теперь единственными другими функциональными группами, близкими к этой амидной связи, являются карбоксильная группа глутаминовой кислоты-270, которая (как и аргинин) сдвигается на 0,2 нм по сравнению со свободным ферментом, и фенольный гидроксил тирозина-248. Последняя группа не является одной из пяти групп, которые, как полагают, обычно участвуют в ферментативном катализе. Имеются также химические доказательства важности тирозина в карбоксипептидазе. Примечательно наблюдение, что эта группа не содержится вблизи цинка активного центра нативного фермента. Связывание глицил-тирозина, однако, вызывает весьма существенный конформационный сдвиг, в процессе которого фенольная группа тирозина-248 сдвигается не менее, чем на 1,2 нм с поверхности белка к новому положению вблизи пептидной связи субстрата. В результате этого движения происходит закрывание углубления, в котором находится активный центр, так что последний, по-видимому, не находится более в равновесии с растворителем. [c.502]

Для дальнейшего снижения потерь оснований необходима разработка количественного, возможно ферментативного, метода расщепления амидной связи. Однако ферменты нужного типа пока еще недостаточно доступны. [c.327]

Др. способ расщепления Р.-биохимический-основан на том, что микроорганиз.мы при своем развитии используют только один из двух оптич. изомеров, присутствующих в р. Остающийся энантиомер м. б. выделен. Этот путь позволяет получать только один из энантиомеров, второй необратимо теряется. Избирательность действия микроорганизмов по отношению к энантио.мера.м связана с высокой энантиоселективиостью содержащихся в микроорганизмах ферментов. Поэтому для разделения энантиомеров нет необходимости применять самн микроорганизмы, достаточно использовать в этих целях выделенные из биол. объектов фер.ментные препараты. Наиб, широко для расщепления Р. применяют гидролазы - ферменты, катализирующие гидролиз сложноэфирных или амидных связей. При этом гидролизу подвергается только один из двух энантиомеров субстрата, а разделение конечной смеси, напр., своб. к-ты и ее сложного эфира м.б. легко осуществлено обычными методами. Так, при действии фермента ацилазы на рацемич. К-ациламинокислоту гидролизу (а следовательно, и отделению) подвергается лишь Ь-форма. [c.200]

Гидролазы. В класс гидролаз входит большая группа ферментов, катализирующих расщепление внутримолекулярных связей органических веществ при участии молекулы воды. Наименование их составляют по форме субстрат-гидролаза . К ним относятся зстеразы —ферменты, катализирующие реакции гидролиза и синтеза сложных эфиров гликозидазы, ускоряющие разрыв гликозидных связей фосфатазы и пептидгидролазы, катализирующие гидролиз фосфоангидридных и пептидных связей ами-дазы, ускоряющие разрыв амидных связей, отличных от пептидных, и др. [c.161]

Гидролитическая деструкция белков и синтетических полиамидов протекает по амидной (пептидной) связи и катализируется щелочами и кислотами. Для деструкции белков можно пользоваться некоторыми ферментами. Конечными продуктами реакции являются аминокислоты или дикарбоновые кислоты и диамины, которые при надобности могут быть опять применены для синтеза полимеров. У полиэфиров основания являются более активными катализаторами, чем кислоты в результате расщепления сложноэфирной связи образуются новые концевые группы ОН и СООН. Полиэфиры, полученные из гликолей и алифатических кислот, более устойчивы к гидролизу, чем полимеры, синтезированные из тех же двухатомных спиртов и ароматических кислот. [c.624]

Одну из наиболее многочисленных групп ферментов о-ставляют так называемые гидролазы, т. е. ферменты, ускоряющие реакцию гидролиза — расщепления сложных орга нических соединений с участием воды. В частаости, к этой группе относятся уже упомянутые ранее протеолитические ферменты — протеиназы и пептидазы, вызывающие расщепление белков (протеинов) и полипептидов по амидным связям с нрисоединением молекулы воды. [c.35]

При другом общем подходе полусинтеза белков используют протеолитические ферменты для лигирования пептидов. В этом случае для обращения протеолитической реакции условия реакции изменяют таким образом, что аминолиз промежуточного пептидил-ферментного комплекса становится предпочтительнее его гидролитического расщепления. Необходимые условия создаются путем включения в реакционную смесь органических растворителей, таких как глицерин, диметилформамид или ацетонитрил. При наличии в реакционной смеси второго пептида в процессе аминолиза происходит его объединение с пептидом из комплекса посредством амидной связи [52,53]. Обратный протеолиз был успешно использован для лигирования пептидов с папа-ином, трипсином и субтилизином. С использованием такого рода [c.307]

Установлено [27], что частично очищенный папаин способен атаковать синтетические субстраты амидного и пептидного типа. Аналогичными свойствами обладает и кристаллический фермент [178], который вызывает расщепление, хотя и с весьма различными скоростями, всех синтетических субстратов для трипсина, пепсина, химотрипсина, карбоксипепти-дазы и пептидаз. Из известных в настоящее время субстратов папаина наиболее чувствительным оказался бензоил-/-арги-ниламид. Атака фермента иа фракцию А окисленного инсулина свидетельствует о широком спектре гидролитического действия, напоминающем действие пепсина, хотя степень разрыва различных связей этими ферментами весьма различна. [c.210]

Аргументы, выдвигаемые в защиту этой, гипотезы, общеизвестны. Тот факт, что лротеолитические ферменты способны к медленному расщеплению некоторых простых пептидов, хотя и часто выдвигается в качестве довода, не является достаточно убедительным. Отсутствие строгой специфичности в случае химо-трипсина (который гидролизует эфирные связи гораздо быстрее, чем амидные [408]), а также возражения, сформулированные Лин-дерштрём-Лавгом [409], очевидно, не позволяют прийти к какому-либо определенному заключению. Два следующих аргумента, не будучи решающими, являются более существенными. Во-первых, при гидролизе появляется почти одинаковое количество групп СООН и МН2. Во-вторых, в химических и ферментативных [c.165]

Были обнаружены ферменты, специфически расщепляющие 0-гликозид-ные связи, соединяющие N-ацетилгексозамин с серином и треонином, и N-гликозидную связь между N-ацетилглюкозамином и амидной группой аспарагина (том 1, гл. 10). Для изучения строения и конфигурации углевод-пептидной связи было бы удобно использовать гликозидазы, действующие только на определенный тип связи. Если бы были найдены гликозидазы, действующие на нативный гликопротеин, можно было бы получить нерас-щепленный апопротеин. Пока еще такой возможности нет. Даже при очень мягкой щелочной обработке, при которой происходит расщепление 0-глико-зидных связей, соединяющих углеводный и сериновые или треониновые остатки, происходит расщепление некоторых пептидных связей. Ферментативное отщепление гетеросахаридов может помочь оценить роль углеводного участка молекулы в биологической активности определенных гликопротеинов. Данные, полученные при обработке нейраминидазой клеточных рецепторов вируса гриппа и некоторых гормонов, убедительно показали важную роль нейраминовой кислоты в биологической активности этих белков. [c.295]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология