Метилированные основания

На рис. 16-16 показано, как гипотетический фермент Е1 может модифицировать участок ДНК путем метилирования основания в одной из двух палиндромных последовательностей. Этот фермент, которому приписывается довольно необычная специфичность, должен также метилировать второй участок в комплементарной цепи, но вне палиндромной области. После репликации одна молекула ДНК остается неизмененной, тогда как вторая окажется субстратом фермента Е2. Под действием последнего произойдет метилирование второй половины палиндрома и всех ДНК-потомков. В результате совместного действия ферментов Е1 и Е2 модифицированные клетки будут все больше и больше отличаться [c.362]

Характер модификаций в М. и. варьирует очень широко, но в значит, степени преобладает N-, О- и С-метилирование оснований. [c.91]

I. В большинстве случаев иоднстый метил присоединяется к первичным, вторичным и третичным основаниям. Первичные вторичные основания образуют иодгидраты метилированных оснований, а при действии щелочи получаются свободные. метилированные амины [c.622]

Часто говорят, что сравнение силы ряда веществ в смешанных растворителях может быть произведено лишь в том случае, если эти вещества химически родственны. Это справедливо лишь до тех пор, пока не требуется результатов высокой точности. Так, из табл. 3.5 видно, что в водных растворителях с увеличением содержания спирта анилин и его М-метильные производные становятся более слабыми основаниями. Однако влияние спирта является наименьшим в случае неметилированного основания причем наблюдается такой парадоксальный случай, когда метилирование основания повышает основность с увеличением содержания спирта от О до 35%, а в более концентрированных спиртовых растворах оно уменьшает ее. [c.62]

Другим общепринятым методом разделения оснований является ионообменная хроматография. Большинство оснований содержит по крайней мере один заместитель, способный к ионизации, в результате чего молекулы приобретают положительный или отрицательный заряд (табл. 37.5). Вследствие этого возможно использование как катионитов, так и анионитов. Хорошим примером разделения оснований является хроматография на катионите дауэкс 50 (№) в 2 н. соляной кислоте [33]. При этом основания элюируются в следующем порядке урацил, цитозин, гуанин, аденин. Аналогичным образом, но при элюировании в линейном градиенте соляной кислоты (1—4 М) выделяли метилированные основания (в основном метилированные производные гуанина) из полных гидролизатов РНК хлорной кислотой [63]. Также на катионите анализировали основания, отщепленные от полирибонуклеотидов в ходе ступенчатой деградации полинуклеотидной цепи периодатным окислением [53]. [c.44]

С помощью метода гибридизации было показано также, что очень небольшая доля (примерно 0,025%) клеточной ДНК составляет участок, комплементарный по порядку оснований s-PHK [64, 66—68]. Высокое содержание метилированных оснований в s-PHK является, по-видимому, следствием метилирования уже па поли-нуклеотидном уровне [69—73]. [c.240]

От суммы метилированных оснований. [c.369]

Рис. 2. Хроматография на бумаге метилированных оснований и нуклеозидов — минорных компонентов т. РНК [5, 6, 7].

Полученный сырой продукт достаточно чист, чтобы его применить для алкилирования (метилировавия) фенолов. Если же его хотят употребить для метилирования оснований, то его промывают ледяной водой, сушат прокаленной сернонатриевой солью и еще раз перегоняют в вакууме. [c.67]

Как же тогда объяснить тотипотентность ядер дифференцированных клеток Имеются многочисленные данные о том, что в цитоплазме яйцеклетки содержатся факторы, выключающие транскрипцию специализированных генов. Создается впечатление, что какой-то механизм переводит стрелки часов развития, заставляя клетки дифференцироваться. Вполне вероятно, что до тех пор, пока не происходит заметной потери ДНК из генома, модифицированная ДНК ферментативно превращается в исходную немодифицированную форму. Если рассматривать метилированную ДНК, то весьма существенно, что в случае отсутствия в цитоплазме яйцеклетки ферментов Е1 и Е2 (рис. 16-16) дальнейшего метилирования в ходе дробления не произойдет. На стадии гаструлы, когда, видимо, Начинают включаться часы развития, в ДНК большинства клеток метилированные оснований далжвы-Лтсутстврвать. [c.362]

Алкилирование вторичных азетидинов изучено недостаточно в этой области необходимы дальнейшие исследования. Янбиков [25] сообщил, что соединение, анализ которого хорошо подходит к иодистоводородному Ы-метил-азетидину, образуется при взаимодействии азетидина с иодистым метилом в эфире. Позднее Гибсон и др. [27], не знавшие о работе Янбикова, сообщили, что им не удалось получить Ы-метильное соединение из азетидина и иодистого метила. При смешении реагентов в холодном эфире получался иодистоводородный азетидин, в то время как реакция в спиртовом растворе приводила к полному метилированию основания до четвертичного иодида. Известны и другие примеры полного метилирования (см. стр. 75). [c.71]

В производстве акрифлавина из профлавина аминогруппу Защищают ацетилированием [86, 179, однако не всегда [141]. При анализе акрифлавина на. .содержание в нем метилированного и неметилированного основания обычно исходят из того, что метилированные основания проявляют более сильные основные свойства, а неметилированные менее растворимы [180]. Потенцио-.метрйческое титрование чистого хлористого 2,8-диамино-Ы-метилакридиния дает кривую, которая при pH 3 не отличается от кривой титрования эквивалентного количества соляной кислоты едким кали при 20°. Нельзя утверждать на основании одних только данных анализа на С, Н, N и С1, что любой образец четвертичного соединения не содержит примесь профлавина, так как имеется много других фактов, свидетельствующих против такого вывода. [c.404]

Остальная работа та же, что и при лабораторном опыте. Прежде чем перейти к описанию производства синтетического кодеина, познакомимся с получением триметилфениламмони й-х л о р и д а, применяемого для метилирования основания морфия. [c.387]

Редкими компонентами ДНК являются метилированные основания 5-метилцитозин, 6-N-мeтилaдeнин и некоторые другие.В ДНК [c.302]

Ряд нуклеотидов в обеих тРНК содержат минорные основания дигидроурацил вместо урацила, который отмечен буквой К, метилированные основания, отмеченные буквой т, цифра перед которой указывает положение метильной группы (если цифра отсутствует, то метил находится в положении 1). [c.429]

Уже давно было известно, что в бактериальной ДНК среди миллионов обычных оснований (А, Т, G и С) встречаются основания, несущие дополнительные метильные группы. Биологическое значение этих метилированных оснований стало понятным в результате ряда важных открытий, которые оказали большое влияние на развитие генетики и, в частности, биохимической генетики. Для каждого вида бактерий характерна своя особая картина распределения метилированных оснований по ДНК, отличающая ее от ДНК других видов. Если ДНК какого-либо другого вида каким-то образом проникнет в живую бактериальную клетку, то она будет признана там чужеродной именно по отсутствию в ней специфической для данного вида картины распределения метилированных оснований, присущей ДНК клеток этого вида. В такой ситуации чужеродная ДНК будет разрушена специфической нуклеазой, которая расщепляет обе цепи ДНК непосредственно в том месте, где отсутствуют характерные для ДНК клетки-хозяина метилированные основания, или вблизи этого места. Таким образом чужеродные ДНК подвергаются рестрикции они разрушаются с помощью специфических ну-клеаз, вырабатываемых каждым видом бактерий. [c.880]

Получение и формула. Метилирование основания акридинового желтого (основного, желтого К) метиловым эфиром 4-т олуолсульфокнслоты в ацетонр вом растворе с последующей очисткой полученного красителя. . [c.47]

В некоторых нуклеиновых кислотах в небольших количествах присутствуют так называемые минорные основания [45, 46, 49, 54]. Например, растворимая РНК, или РНК-переносчик (х-РНК), мо/кет содержать такие метилированные основания, как 2-метил-аденин, 6-метиламинопурин, 6-диметиламинопурин, 1-метилгуанин, 6-окси-2-метиламинопурин, 5-метилцитозин и даже тимин [49]. (Более подробно -РНК рассматривается на стр. 52 и 267.) Эти необычные для нуклеиновых кислот основания составляют 5% общего содержания оснований 5-РНК, причем их относительное количество у разных видов различно. [c.18]

Содержание псевдоуридина (г()У) и метилированных оснований, так называемых минорных оснований РНК, особенно высоко во фракции S-PHK (табл. 2 и 3). Различия в относительном содержании оснований разных фракций РНК из клеток одного типа показаны также в табл. 3 на примере s-PHK, г-РНК и т-РНК Е. oli. Б некоторых РНК, например в РНК реовируса и вируса раневой опухоли (а также в s-PHK), обнаружена строгая эквн-молярпость между содержанием аденина и урацила, а также между содерн<анием цитидина и гуанина (табл. 4). Значение этих соотношений для образования двуспиральной структуры обсуждается на стр. 56. [c.44]

Химические свойства растворимой, или транспортной, РНК были описаны раньше (стр. 58). Мы уже говорили о том, что молекула s-PHK состоит примерно из 75 нуклеотидов, причем ее конец, акцептирующий аминокислоты, имеет строение. ..фЦфЦфА. Молекула s-PHK представляет собой сложенную вдвое цепочку, закрученную в виде двойной спирали. Эта концепция о строении s-PHK основывается на эквивалентности оснований А и У, Ц и Г, на сильном гиперхромическом эффекте при нагревании и на данных рентгеноструктурного анализа. В центре цепи находится иетля или изгиб этот участок цени богат метилированными основаниями и псевдоуридином он содер- [c.267]

Помимо необычных и метилированных оснований некоторые виды РНК,, особенно транспортная РНК, содержат в довольно значительных количествах также еще один нуклеозид урацила, так называемый псевдоуридии ( 1з-уридин, ф-У или я])), имеющий С-гликозидную связь [c.126]

Содержание 11>У в тех случаях, когда оно не указано, включено в содержание У. Растворимая РНК, помимо 11)У, содержит еще и ряд метилированных оснований в значительно более высоких концентрациях, чем любой другой тип РНК. В растворимой РНК из печени крыс 25% У замещены на 1 )У кроме этого в ней содержится 10% 5-метилцитозина,., 8,1% 6-метиламинопурина и приблизительно по 3% 1-метилгуанина, 2-метил-6-оксипурина и 2,2-диметил-6-оксипурина. [c.155]

Транспортные РНК. Большое внимание, которое привлекают к себе в последние годы транспортные РНК, обусловлено тем, что они представляют собой, по существу, отдельные элементы, составляющие генетический словарь. Интерес к ним особенно усилился после выдающейся работы Холли, которому в 1965 г. удалось полностью расшифровать первичную структуру (т. е. нуклеотидную последовательность) одной из аланиновых s-PHK дрожжей Суммируя вкратце некоторые наиболее важные структурные характеристики молекул s-PHK (см. гл. V), можно сказать, что эти сравнительно небольшие и поэтому легко растворимые в воде полирибонуклеотиды весьма однородны по своим размерам (приблизительно 70—80 нуклеотидных остатков). Помимо четырех обычных оснований они содержат такн е в относительно большом количестве редкие, или минорные, основания, в частности различные метилированные основания и псевдоуридии. Модификация обычных оснований происходит, по-видимому, уже после их включения в полимерную структуру. Несмотря на присутствие редких оснований, для молекул S-PHK характерны высокая степень комплементарности и выраженная вторичная структура, особенно в присутствии ионов Mg +. Возможно, что число различных видов s-PHK совпадает с числом смысловых кодонов. В некоторых случаях (нанример, в случае лейцина) оказалось возможным приписать те или иные фракции s-PHK к отдельным кодонам выяснилось, что данная фракция s-PHK поставляет активированную аминокислоту только в ответ на совершенно определенный кодон и ни на какой другой. [c.522]

В настоящее время известно несколько реакций, позволяющих ввести заместители в 3 - и 5 -концевые фосфатные группировки ДНК и в 5 -концевые фосфатные группировки РНК. Первой из них явилось метилирование концевых фосфатов Метод метилирования основан на том, что триалкиламмониевые соли фосфомоноэфиров под действием дициклогексилкарбодиимида реагируют с метанолом, давая соответствующие диэфиры XXI триалкиламмониевые соли фосфодиэфиров не вступают в эту реакцию 6,217 О О [c.597]

Все исследованные рибонуклеиновые кислоты из бактериальных, растительных и животных тканей содержат несколько минорных оснований. Однако количественное распределение их в рибонуклеиновых кислотах из различных источников неодинаково, и во фракциях нуклеиновых кислот из данного типа клеток (табл. 6-3) действительно имеются значительные вариации. Так, например, дрожжевые рибонуклеиновые кислоты, растворимые в молярном растворе хлористого натрия, содержат значительно больше псевдоуридина, чем те рибонуклеиновые кислоты, которые нерастворимы в таком растворе [261]. Точнее, этот компонент концентрируется в так называемой растворимой , или транспортной , рибонуклеиновой кислоте клетки (хотя он в значительных количествах присутствует, вероятно, и в высокомолекулярной рибосомальной РНК), и его содержание, по-видимому, прямо пропорционально способности рибонуклеиновой кислоты акцептировать аминокислоты наиболее активная (по включению лейцина) из выделенных до сих пор рибонуклеиновых кислот содержит около 5,6 мол.% превдоуридина [250, 264—267]. По сравнению с высокомолекулярной рибосомальной РНК растворимые цитоплазматические фракции клеточной рибонуклеиновой кислоты содержат метилированные основания также в значительно больших количествах [251, 268, 269]. В растворимых рибонуклеиновых кислотах из опухолевой ткани по сравнению с таковыми из клеток печени тоже было обнаружено заметное увеличение содержания метилированных пуринов (особенно 2-метил-амино-6-оксипурина) [269]. [c.411]

В литературе описаны небольшие расхождения между результатами, нолученными для ряда ДНК по Гпл и по плавучей плотности [22, 25] эти расхождения, по-видимому, обусловлены отклонениями от линейной зависимости вследствие слишком высокого или слишком низкого содержания ГЦ-нар. Правда, пока еще не проводилось достаточно глубокого изучения влияния метилированных оснований (метилцитозина и метиладе-нина) на характер тепловой денатурации ДНК. [c.190]

В отличие от мнения О. Фишера, Перкин й Робинсон [4] указывают, что вещества, получаемые действием СНзЛ на гармин и гармалин, не ведут себя как простые иодистоводородные соли, так как они не разлагаются ни аммиаком, ни даже разбавленными едкими щелочами на холоду, а что для получения метилированных оснований необходимо нагревать эти соли со щелочью. Поэтому их следует рассматривать как четвертичные иодметилаты. Образование же алкилированных оснований Перкин и Робинсон объясняют, допуская, что при образовании этих веществ происходит перегруппировка. [c.362]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология