Модель различимых структур

Ж. МОДЕЛЬ РАЗЛИЧИМЫХ СТРУКТУР [c.18]

Рис. 9. Модель различимых структур.

Модель различимых структур [41] позволяет рассчитать ДУпл, если коэффициенты пропорциональности между числом дырок и энергией взаимодействия и между числом дырок и изменением объема при плавлении определены из опыта. Соот- [c.34]

Эти представления сходны с моделью, полученной в работе [17], и г моделью теории различимых структур (см. гл. ).- Прим. ред. [c.314]

Электронно-микроскопическая картина хромосом [490, 517]. Чтобы выявить тонкую структуру хромосом человека, были использованы многочисленные методы электронной микроскопии. Современные модели организации генетического материала эукариот будут обсуждаться в разд. 2.3, здесь же достаточно сказать, что данные электронной микроскопии не противоречат модели, предполагающей, что хроматин состоит из сверхспирализованных нитей, причем имеется несколько порядков спирализации (рис. 2.17). Обнаружено три типа хроматиновых фибрилл фибриллы первого типа имеют диаметр 250 A, фибриллы второго типа-100 A и третьего-только 30-50 A. Имеются довольно убедительные доказательства того, что фибриллы этого последнего типа представляют собой генетически активный хроматин. Двойная спираль чистой ДНК имеет диаметр 20 A, следовательно, фибриллы 30-50 A соответствуют диаметру нити ДНК вместе с белками (гистонами и негистонами). Фибриллы диаметром 100 A отражают, по-видимому, вторичную спирализа-цию фибрилл 30-50 A, а нити 250 A могут отражать третичный уровень спирализации. В метафазной хромосоме эти третичные спирали могут иметь примерно такую укладку, как указано на рис. 2.17. Примерно девять фибрилл 250 A, вероятно, каким-то образом связаны вместе, и два таких пучка образуют различимую [c.53]

С помощью квантовомеханических расчетов в принципе можно определить наиболее предпочтительную конформацию молекулы и разность энергий между этой структурой и другими конформациями. Однако, в действительности, из-за сложности расчетов это пока осуществить не удается. Тем не менее были развиты классические модели, которые свели эту проблему к оценке отчетливо различимых энергетических вкладов последние можно рассчитать с помощью относительно простых выражений. Это позволило делать надежные качественные предсказания о предпочтительности конформаций, а в некоторых случаях и о предпочтительной хиральности расположения хелатных колец. В данной главе довольно подробно обсуждается каждый энергетический член такая форма конформационного анализа применяется для ряда комплексных соединений металлов с тем, чтобы определить, какая из конформаций стабильна, т. е. соответствует минимуму энергии, какая из конформаций наиболее предпочтительна и чему равна разность энергий между различными стабильными конформациями. [c.51]

Если принять модель регулярного соленоида, это даст степень снижения линейных размеров хромосомной фибриллы в 6 раз по сравнению со 100 А-нуклеосомной фибриллой, а по сравнению со свободной ДНК — примерно в 40 раз. Хотя детали строения соленоида не установлены, ясно, с какими белками связано его образование. 300 А-фибрилла распадается, коль скоро из хроматина удаляется тем или иным способом гистон Н1, и ее нельзя восстановить ни при каких концентрациях солей в растворе. Как отмечалось выше, Ю. В. Ильин в нашей лаборатории в свое время показал решающую роль гистона Н1 в конденсации хроматина. Очевидно, что эта конденсация зависит от перехода 100 А-фибриллы в 300 А, причем последняя уже, как, правило, нерастворима в водных растворах, давая преципитат. В более поздних работах нашей лаборатории зависимость конденсации хроматина от присутствия гистона Н1 была продемонстрирована на примере минихромосомы SV40. В присутствии Н1 они выглядели при электронной микроскопии как компактные частицы 300 А в диаметре. Удаление гистона Н1 вело к разворачиванию структуры и появлению четко различимых нуклеосом, связанных линкерной ДНК. Их число равно 22—24 на минихромосому (см. рис. 16). [c.101]

Эта модель была разработана Эйрингом, Ри и Хираи [40] на основе квазирешеточных представлений, но содержит элементы кристаллитной модели и модели сжатого газа. Плавление в модели различимых структур представляется как результат образования двух типов дефектов — дырок и дислокаций. При этом дырки возникают также двух типов — Шоттки и Френ,-келя. Две различимые структуры — это, по существу, те же частицы, что и в эйнштейновском кристалле, но с несколько измененными свойствами из-за наличия сил натяжения на границах с дефектами, и газоподобные частицы, присутствующие в полостях, связанных с дислокациями (рис. 9). [c.18]

Все а-, р- и 7-глиадины состоят из единственной полипептидной цепи [64—69, 72, 73, 156]. Цистеины в молекулах а-, Р- и 7-глиадинов связаны внутримолекулярными дисульфидными мостиками. Эти дисульфидные мостики расположены так в полипептидной цепи, что их разрыв приводит к значительной фрагментации цепи [79]. В твердом состоянии после экстракции и лиофилизации глиадины имеют компактную структуру, в образовании которой, вероятно, участвуют гидрофобные остатки [163]. При высокой концентрации в растворе они стремятся к агрегированию, видимо, вследствие образования водородных связей между молекулами [8]. В денатурируюш,ей среде (8М мочевина и 0,1М муравьиная кислота) глиадины имеют рыхлую и асимметричную структуру, на что указывают коэффициенты трения. Восстановление дисульфидных мостиков еш,е сильнее увеличивает асимметрию и степень рыхлости, т. е. пространственного расширения молекулы [140]. Присущая ш-глиадинам вязкость в среде 6М гуанидинхлорида указывает на то, что в этих условиях они находятся в виде статистического клубка из-за отсутствия дисульфидных мостиков. Они обладают такой конформацией в присутствии 2М гуанидинхлорида — концентрации, которая не вызывает денатурации, следовательно, в нативном состоянии в растворе конформация ш-глиадинов — это статистический клубок. Аналогичное исследование а-, р- и 7-глиадинов показывает, что они не имеют жесткой глобулярной конформации, но, наоборот, представляют собой молекулы полужесткой структуры с низкой степенью организации [153]. Основываясь на известных N-концевых последовательностях, Перноле и Мосс [154] предложили модели вторичной структуры. Они представили а-, Р- и 7-глиадины в основном как р-структуру, прерываемую р-из-гибами и непериодическими структурами. Практически отсутствует а-спираль ш-глиадины четко различимы, поскольку наиболее выраженная их структура — это р-изгиб, прерываемый [c.196]

В качестве последнего примера приближенных теорий расплавленных солей рассмотрим решеточную теорию жидкости для конкретных расплавов. В отличие от теории различимых структур и дырочной теории здесь за основу берется точное выражение для канонической функции состояния, из которого выводится решеточная теория простых расплавленных электролитов, причем на каждой стадии ясно, какие именно приближения необходимы. Как будет показано ниже, решеточная теория расплавленных электролитов позволяет вычислять не только конфигурационный вклад в термодинамические величины исходя из основных определений, но и характерные особенности распределения ионов в расплавах. В принципе эта теория вообще не содержит произвольных параметров и поэтому она должна до пускать прямое вычисление всех величин в рамках определенной модели расплавленных солей. Тем самым это приближение гарантировано от кажущегося и часто вводящего в заблуждение совпадения с экспериментальными данными, которое может способствовать признанию некорректно построенных полуэмпи-рических теорий. [c.128]

Эйринг и др. [18] предложили новую теорию жидкого состояния— так называемую теорию различимых структур, не связанную с моделью ячеек. Теория предполагает, что частицы имеют разные степени свободы. Одни колеблются около равновесных положений подобно частицам в твердом кристалле, другие движутся поступательно подобно частицам газа. Функция состояния системы является произведением двух членов, один из которых относится к кристаллической структуре, а другой — к газоподобной. Бломгрен [19] применил эту теорию к расплавленным солям и рассчитал с ее помощью термическое расширение расплавленного K I. [c.192]

Ввиду ограниченной применимости более строгих теорий, Эй-ринг с сотрудниками предложили модель расплавленной соли, позволяющую вычислять функцию состояния. Эта модель получила название теории различимых структур [12—18]. Согласно этой модели, в жидкости сосуществуют в динамическом равновесии области со структурой кристаллической решетки и газоподобные молекулы в пустотах. Поэтому функция состояния жидкости определяется как произведение функций состояния газовых молекул и кристаллов. [c.34]

Уолл и Хорниг [473] исследовали спектр HDO в Н2О и D2O, в котором 80% интенсивности полос обусловлено невзаимодействующими молекулами HDO. Полосы валентных колебаний более узкие, чем в спектрах чистой Н2О или D2O, однако наблюдаемые полосы оставались широкими, и четко различимые типы структуры воды установить не удавалось. Значительная полуширина полос [278 см- для v(0 — Н) и 160 см для v(0 — D)] была приписана различиям в частотах осцилляторов, возникающим из-за различных типов водородных связей. Сопоставление значений v(0 — Н) с расстояниями О... О позволило вычислить функции распределения этих расстояний. Уолрэфен [468] придерживается другой точки зрения и обсуждал спектр жидкой воды на основе двух структур или подобной льду модели. Позднее этот автор исследовал контур полосы валентного колебания О—D в интервале 2500 —2600 см при температурах от 16 до 97 °С [469]. При помощи ЭВМ эта полоса была разложена на две гауссовы компоненты при 2510—2540 п 2630—2660 см . Темпе- [c.90]

Поскольку на практике точность измерений неизбежно ограничена случайными погрешностями, вокруг любой точки исследуемого объекта всегда существует окрестность таких размеров, что перемещения дипольного генератора в пределах этой окрестности не могут быть ста- тистически точно идентифицированы по измерениям внешнего поля. Иными словами, генераторы любой структуры как дискретной, так и непрерывно распределенной, находящиеся в пределах этой малой области и имеющие один и тот же суммарный дипольный момент, нельзя различить по измерениям внешнего поля. Как показывают расчеты на математических моделях, при исследовании биоэлектрических генераторов мозга размеры этой минимальной зоны различимости диполя для реальных условий эксперимента составляют 1—2 см [73, с. 266]. Соответственно можно предполагать, что два одновременно присутствующих дипольных гейератора будут идентифицироваться как отдельные диполи лишь тогда, когда расстояние между ними не меньше размеров указанной области. Таким образом, точечный диполь, определяемый по внешнему полю и приписываемый некоторой точке изучаемого объекта, можно трактовать как обобщенную характеристику электрической активности данного малого участка ткани, не вникая в микроскопическую структуру электрического процесса, действительно происходящего на данном участке [96]. Если биоэлектрический генератор может занимать пространство, превышающее зону различимости диполя , и возникает необходимость его идентификации, то нужно сформулировать эквивалентный генератор более сложной структуры, чем один токовый диполь, и решить соответствующую обратную электродинамическую задачу. [c.263]

Традиционная с гратегия корреляционного анализа электронно-микроскопических изображений основана на выборе из экспериментального набора профильтрованных изображений одного в качестве модельной проекции. По этой модели проводится ориентация остальных изображений и усреднение тех из них, максимальные коэффициенты корреляции которых с моделью достаточно высоки. Усредненную проекцию можно принять за новую модель и весь цикл анализа повторить заново. Описанная стратегия анализа эффективна в тех случаях, когда в силу особенностей структуры объекта количество возможных его ориентаций на пленке-подложке мало и соответствующие им изображения хорошо различимы визуально на микрофотографиях. Далее, используя ограниченное число визуально выбранных моделей, легко классифицируют все изображения и получают проекционную структуру объекта, усреднив изображения внутри классов. [c.205]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология