Фенилаланин в грамицидине

Четыре оставшихся аминокислоты включаются сходным путем тяжелым ферментом в виде сложных эфиров тиоловых киолот. Синтез начинается только в присутствии фенилаланина, связанного с легким ферментом, после чего остаток D-фенилаланина переносится от легкого к тяжелому ферменту с попутным образованием пептидной связи между фенилаланином и пролином. Дальнейший рост связанной с ферментом пептидной цепи происходит вплоть до пентапептида путем последовательного присоединения соответствующих аминокислот, как показано на схеме (3). После того как присоединяется конечная аминокислота — лейцин, грамицидин высвобождается из комплекса с ферментом. Точный механизм циклизации по типу голова к хвосту двух пентапептидов еще не ясен. [c.296]

Как видно, в структуре грамицидина 8 имеются 2 остатка орнитина (Орн), производные аминокислоты аргинина и 2 остатка неприродных В-изомеров фенилаланина. Стрелки указывают направление синтеза от КН,-групп к СООН-группам каждого остатка, и вследствие цикличности грамицидин 8 не имеет конца. [c.77]

Грамицидин С представляет собой трудно гидролизуемый полипептид, в состав которого входят эквимолекулярные количества пяти аминокислот /-валина, /-орнитина, /-лейцина, /-про-лина и /-фенилаланина. [c.480]

Изображая строение грамицидина С, мы воспользовались принятыми в химии белков сокращенными обозначениями аминокислот (лей — лейцин фал — фенилаланин про — пролин вал — валин орн — орнитин). При такой записи условно считают, что начало сокращенного обозначения соответствует аминному концу молекулы аминокислоты, конец—ее кислотному концу, т. е. обозначение — вал представляет собой группировку [c.440]

X = Val Y = Phe (фенилаланин) Валин-грамицидин В [c.219]

Порядок чередования аминокислот в небольших полипептидных цепях, содержащих 5—10 аминокислотных остатков, может быть установлен прн помощи весьма трудоемких и сложных аналитических методов. Таким путем была установлена, например, структура циклопептида — грамицидина С (см. гл. XV). Структура различных пептидов, получаемых при частичном гидролизе инсулина и гемоглобина, была установлена главным образом путем метки концевых групп динитрофторбензолом [17,89]. Результаты этих анализов показали, что как инсулин, так и гемоглобин построены из гетерогенных фрагментов. Так, например, пептид А, полученный из инсулина, содержал глицин, изолейцин, валин и тирозин. Определение аргинина, гистидина, лизина, фенилаланина и треонина в этом пептиде дало отрицательные результаты. Пептид В, выделенный из того же препарата инсулина, содержал фенилаланин, валин, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту, лизин, треонин и аланин [89] (см. гл. 111 и ХП1). Полученные данные указывают на то, что в пептидах, выделенных из инсулина, нет того периодического чередования аминокислот, о котором говорит Бергман [90]. [c.135]

Другие исследователи [41 дополнили указанные данные подтвердили аминокислотный состав, показали, что фенилаланин входит в правовращающей форме, уточнили последовательность сочетания аминокислот друг с другом, выделили продукты неполного расщепления, осуществили ряд синтетических моделей и пришли к выводу, что грамицидин представляет собой циклический пентапептид. [c.365]

На основании изложенных данных Г. Ф. Гаузе [5] в 1946 г. сделал предположение, что грамицидин-С является циклопептидом, у которого ароматический цикл фенилаланина расположен внутри цикла. [c.365]

В некоторых микроорганизмах синтез пептидной связи происходит по более простому, примитивному, механизму. В этом случае пептидный синтез идет очень эффективно, хотя и в отсутствие высокоупорядоченного синтезирующего аппарата, обеспечиваемого структурами рибосомы и тРНК. Поэтому таким путем синтезируются лишь короткие белки (полипептиды), например грамицидин S [5]. Грамицидин S считается интересным антибиотиком по нескольким причинам. Во-первых, он содержит фенилаланин в D-конфигурации. d-Аминокислоты встречаются в природе очень редко, а в белках присутствуют только ь-аминокислоты. Во-вторых, грамицидин S содержит аминокислоту орнитин, которая обычно не входит в состав белков. [c.61]

В синтезе грамицидина 8 участвуют два фермента легкий (М = 100 000) и тяжелый (Л4 = 280 ООО), Синтез начинается иа легком ферменте, который действует также как рацемаза , превращая ь-фенилаланин в о-энантиомер. Нуклеофильная тиольная [руппа легкого фермента атакует активированный фенилаланин (АТР и аминокислота реагируют с образованием ангидрида), образуя (катализ основанием) высокоэнергетическин тиоэфир, ДСп1др —38 кДж/моль (—8 ккал/моль). Различие свойств тио-эфиров и ацильных эфиров связано с гораздо большей степенью делокализации неспаренных электронов кислородом карбонильной группы, чем атомом серы. Такая делокализация понижает электрофильность карбонильной группы. Кроме того, тиольная группа — более хорошая уходящая группа, чем соответствующая гидроксильная. Напомним, что для меркаптана рКа Ю, тогда как для спирта рКа 15 (табл. 2.1). [c.62]

Весьма важным и широко применяемым для лечения ряда болезней является антибиотик, выделяемый одним почвенным микробом. Молекула этого антибиотика, открытого в 1942 г. Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой и названного грамицидином С (советский), представляет собой сложный циклический декапептид, в состав которого входит по два остатка следующих пяти аминокислот пролин, валин, орнитин, лейцин, фенилаланин. Четыре первые аминокислоты имеют .-конфигурацию, а фенилаланин принадлежит к О-ряду. Полный синтез этого антибиотика был осуществлен в 1956 р. в Швейцарии (Р. Швицер и П Зибер), [c.602]

Как показали А. Н. Белозерский и Т. С. Пасхина, при длительном гидролизе грамицидина кипящей 20%-ной соляной кислотой происходит расщепление молекулы с выделением пяти аминокислот . /-пролина (1), /-валика (П),. /-орнитина (П1),. /-лейцина (IV) и -фенилаланина (V) [c.739]

Для оптимального разделения некоторых аминокислот, плохо отделяющихся друг от друга в перечисленных системах, используют п другие растворители, которые приведены в соответствующих руководствах (см., например Хроматография на бумаге//Под ред. И. Хайса и К. Мацека. М., 1962). Так, для отделения валина от фенилаланина (проблема, возникающая при анализе антибиотика грамицидина С. состоящего всего из пяти разных аминокислот) можно рекомендовать последовательное пропускание двух растворителей систему 2-бута-нол — 3%-ный аммиак (3 1), а затем систему н-бутанол — уксусная кислота — вода (8 3 1). [c.129]

Грамицидин 8 действует только на грамположительные и не влияет на грамотрицательные возбудители. Изучение взаимосвязи структуры и активности показало, что без потери активности можно заменить пролин на глицин или сарказин н орнитин на лизин. Заменяя о-фенилаланин на о-аланин или глицин, получают аналоги со слабым биологическим действи- [c.306]

Основные достижения этой важной работы [44, 45] следуют из представленных на схеме (3) данных для циклического декапептида грамицидина С (19). Фракционированием освобожденного от клеток экстракта Ba illus brevis выделена синтетаза грамицидина С, состоящая из легкой и тяжелой фракций ферментной системы. Легкий фермент специфически активирует L-фенилаланин, получается соответствующий аденилат с переносом аминокислоты на тиольную группировку молекулы фермента, хиральный а-центр которой имеет D-конфигурацию. Хотя этот механизм не выяснен до конца, известна его независимость от коферментов и он, возможно, катализируется основаниями. [c.296]

Пептидные антибиотики. Они синтезируются микроорганизмами, часто не по матричному механизму. В их состав могут входить непротеиногенные аминокислоты, а также о-изомеры. В качестве примера может служить грамицидин 8, в молекуле которого присутствует аминокислота — орнитин и О-изо-меры фенилаланина [c.25]

Остатки О-аминокислот входят в состав многих природных пепти дов, прежде всего антибиотиков В частности, в грамицидин входит О-фенилаланин, в грамицидин А — О-валин, О-лейцин, О трипто фан, в актиномнцнн О О изолейцни, в полимнксин О-серин О Пролин встречается в эргоалкалоидах. [c.84]

Пространственное строение грамицидина S аь яснеио с помошью метода рентгеноструктурного анализа (Д. Ходжкнн, 1957) и подтверждено позднее при исследовании конформации антибиотика в растворе (Р, Швицер, Ю. А. Овчинников). Молекула грамицидина S имеет форму fi-складчатого листа с четырьмя внутримолекулярными водородными связями, что обеспечивает относительную жесткость циклопептидного скелета и специфическую ориентацию боковых цепей остатков орнитина. Для реализации предпочтительной конформации антибиотика важное значение, несомненно, имеет наличие в нем остатков D-фенилаланина (рис. 169). [c.285]

По-видимому, встречающиеся в природе пептиды (но не из микроорганизмов) содержат аминокислотные остатки, принадлежащие к Ь-конфигу-рационному ряду. Так, окситоцин, который является гормоном задней Д0Ш1 гипофиза (стимулирует сокращение матки), состоит только из Ь-амино-кислотных остатков. Некоторые из аминокислотных групп, найденных в антибиотиках, имеют В-конфигурацию. Например, остаток В-фенилаланина обнаружен в грамицидине 3 (рис. 24.2). Пенициллин — второй пример пептидообразного вещества, состоящего из аминокислотных групп, среди которых имеются группы с В-конфигурацией. Это вещество можно рассматривать как производное аминокислоты, пеницилламина, который похож по структуре и на аланин, и на цистеин, но имеет В-конфигурацию. Пенициллин был первым открытым природным антибиотиком и до сих пор остается важнейшим. Это вещество в очень малых дозах тормозит рост разнообразных болезне- [c.539]

Грамицидин С выделен Т. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой в 1942 г. из штамма споровой палочки Ba illus brevis, найденного в огородных почвах Подмосковья. Изучение химической природы грамицидина показало, что грамицидин построен из пяти различных аминокислот 1-пролина, 1-валина, 1-орнитина, 1-лейцина и d-фенилаланина, соединенных между собой по типу циклопептида. Свободная б-амипогруппа орнитина, обусловливающая основные свойства грамицидина С, способна вступать в реакцию с пикриновой кислотой с образованием пикрата и реагировать с азотной кислотой по типу первичных аминов. Блокирование этой аминогруппы вызывает инактивацию грамицидина С. В структуре грамицидина установлено следующее чередование аминокислот [c.310]

Этим методом Томида и сотр. [24[ подтвердили D-конфигура-пию фенилаланина в грамицидине J , идентифицировав N-ТФА-метиловые эфиры l-Рго-L-Val, L-Val-l-Огп, l-Огп-L-Leu, L-Leu-D-Phe и D-Phe-L-Рго. Ta же последовательность была доказана и для грамицидина S при идентификации хроматограммы частичного гидролизата. [c.172]

А, Н. Белозерским и Т. С. Пасхиной и продолженное затем зарубежными исследователями, показало, что он представляет собой полипептид, дающий при гидролизе эквимолекулярную смесь пяти аминокислот L-лейцина, D-фенилаланина, L-пролина, L-валина и L-орни-тина. Этот пентапептид повторяется в молекуле грамицидина дважды, причем концы цепи из десяти остатков аминокислот замыкаются в одно гигантское кольцо. Таким образом, грамицидин С представляет собой циклический декапептид [c.389]

Грамицидин С (грамицидин советский) был выделен в 1942 г. Г. Ф. Гаузе н М. Г. Бражниковой из одного вида Ba ilus brevis (из садовой земли). Изучение его химического строения, начатое А. Н. Белозерским и Т. С. Пасхиной и продолженное затем зарубежными исследователями, показало, что он представляет собой полипептид, дающий прн гидролизе эквимолекулярную смесь пяти аминокислот L-валина, L-орнитина, L-лейцина, D-фенилаланина и L-пролина. [c.380]

Грамицидин С образуется бактерией Ba illus brevis var. G.—В ввиду токсичности при подкожном и внутривенном введении, он применяется только для местного лечения ран, ожогов, ангин. Грамицидин С (бесцветные пластинки, темп, плавл. 256—258° дихлоргидрат плавится при 268—270°) представляет собой циклический декапептид, в состав которого входят по два остатка /-прелина, /-валина, /-орнитина, /-лейцина и d-фенилаланина. Его строение может быть выражено структурной формулой [c.698]

Было установлено, что грамицидин С представляет собой полипептид, который гидролизуется с большим трудом. При нагревании с 22° о,-ной соляной кислотой он переходит в раствор только через 18 — 20 час., тогда как полный его гидрализ происходит лишь через 35—36 час. В гидролизатах было обнаружено пять аминокислот пролин (270), валин (271), орнитин (272) лейцин (273) и фенилаланин (274), из которых четыре первые относятся к /-ряду, т. е. к так называемым природным аминокислотам, тогда как фенилаланин оказался обладающим -конфигурацией. Позднее было установлено что этот антибиотик состоит из эквимолекулярных количеств пяти указанных аминокислот. [c.182]

Более детально следует остановиться на двух работах посвященных синтезу полипептидов, сходных в отношении своего строения с грамицидином С. В первой из них описано получение всех пяти дипептидов, которые могут образовываться при гидролизе этого антибиотика, а именно а-(/-валил)-/-орнитина (276), /-орнитил-/-лейцина (277), /-лейцил- -фенилаланина (278), -фенилаланил-/-пролина (279) и /-пролил-/-валина (484) [c.359]

Почти одновременно с изложенным выше синтезом дипептидов было описано получение и двух пентапептидов а-(/-валил)- ,/-орнитил-/-лейцил- -фенилаланил-/-пролина и а-(/-валил)-й,/-орни-тил-/-лейцил-/-фенилаланил-/-пролина. Оба эти пентапептида очень близки в отношении своего строения к тому пентапептиду, который может образовываться в результате гидролиза грамицидина С. Для того чтобы иметь возможность осуществить их синтез, вначале были получены два трипептида, состоящих из /-лейцина, й- и соответственно /-фенилаланина и /-пролина, а затем эти трипептиды были сконденсированы с дипептидом, содержащим остатки /-валина и й, /-орнитина. Синтез проводился, как и в цитированной выше работе через соответствующие карбобензоксипроизводные, но конденсация осуществлялась не через хлорангидриды, а через азиды. [c.360]

В настоящее время в результате применения новых методов исследования установлено, что в состав белковых молекул входят следующие аминокислоты глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, серин, треонин, цистин, цистеин, метионин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, аргинин, лизин, оксилизин, фенилаланин, тирозин, пролин, оксипролин, гистидин и триптофан. Ввиду того что количество азота этих аминокислот составляет в некоторых исследованных белках более 99 % общего содержания азота, нет оснований предполагать наличие в этих белках заметных количеств каких-нибудь других еще не известных соединений. Эти данные, однако, нельзя обобщать и переносить на другие белки. Об этом свидетельствует хотя бы нахождение таких соединений, как аминоэтанол — в гидролизате грамицидина (см. гл. XV) — и диодтирозин и дибромтирозин — в гидролизате кораллов [59] и спонгина [60]. [c.30]

В состав грамицидина входит D-антицод фенилаланина, т.е. аминокислота необычной конфигурации. Это наблюдается и у других антибиотиков. Возможно, что именно это и придает антибиотикам своеобразные свойства антагонистов микроорганизмов. [c.402]

Если необходимо дезаминировать пептид, то каплю исследуемого гидролизата, содержащую 6 н. соляную кислоту, обрабатывают парами азотистой кислоты на политеновой пластинке. С помощью этого метода было показано, например, что грамицидин представляет собой эквимолекулярную смесь пяти различных аминокислот валина, орнитина, лейцина, фенилаланина и про-лина. Было также установлено, что грамицидин 5 является циклопептидом, содержащим только одну свободную аминогруппу и ни одной свободной карбоксильной. Обнаруженная свободная аминогруппа грамицидина 5 находится в боковой цепи орнитина. В продуктах неполного гидролиза грамицидина 5 соляной кислотой были идентифицированы следующие дипептиды а-/-валил-/-орнитин, /-орнитил-/-лейцин, /-лейцил-б/-фенилаланин, -фенил-аланил-/-пролин и два тринептида а-валил-орнитил-лейцин и фенилаланил-пролил-валин. [c.159]

А. Н. Белозерский и Т. С. Пасхина [3]провели обширное исследование состава и строения грамицидина-С. Из кислотного гидролизата грамици-дина-С они выделили и идентифицировали 5 аминокислот валин, лейцин, пролин, фенилаланин и орнитин. На основании полученных данных авторы пришли к выводу, что указанные аминокислоты входят в состав молекулы грамицидина и что грамицидин является пентапептидом. В нем были обнаружены свободные аминные группы (реакцией с азотистой кислотой) и свободная карбоксильная группа (титрованием спиртовой щелочью). [c.365]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология