Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

сериновая

    С другой стороны, эти ферменты сильно различаются по специфичности их действия. Так, сериновые протеазы а-химотрипсин и эластаза осуществляют гидролиз пептидной связи, образованной аминокислотой, содержащей в положении гидрофобную боковую группу R при этом специфичность а-химотрипсина определяется объемным гидрофобным радикалом в молекуле субстрата (типа боковой группы фенилаланина, триптофана), а для эластазы — метильной группой аланина. Механизм наблюдаемой специфичности обусловлен весьма незначительными различиями в строении активных центров этих двух ферментов. По данным рентгеноструктурного анализа, в активном центре а-химотрипсина имеется довольно вместительный гидрофобный карман , где связывается ароматическая боковая группа гидролизуемого пептида (рис. И, а ср. с рис. 9). В активном центре эластазы размеры сорбционной области, где происходит связывание метильной группы субстрата (рис. 11, б), намного меньше, чем в случае а-химотрипсина. Это вызвано тем, что вместо Gly-216 и Ser-217 см. рис. 9) в соответствующих положениях эластазной пептидной цепи расположены более объемные остатки треонина и валина [3]. [c.35]


    Итак, в активном центре сериновых протеаз функциональные участки (осуществляющие сорбцию и нуклеофильный катализ) пространственно разделены. Эту структурную особенность можно в большей [c.35]

    Комияма и Бендер [98] также изучали системы с переносом заряда в сериновых иротеазах. В качестве модельной системы они исследовали реакцию гидролиза этилхлорацетата, катализируемую 2-бензимидазолуксусной кислотой по механизму общего основного катализа. [c.229]

    В то же самое время, при образовании связи между сериновым кислородом и карбонильным углеродом, происходит ослабление связи между карбонильным углеродом и амидным азотом, и этому ослаблению способствует наличие поблизости атома водорода, ранее принадлежавшего сери-ну, а теперь связанного с азотом гистидина. Когда пептидная связь, N—С, разрывается, этот атом водорода присоединяется к азоту, завершая образование группы —НН2 на конце удаляющейся цепочки, которая на стадии 4 обозначена как продукт 1. Половина цепи субстрата теперь отщепляется, а другая половина остается присоединенной к сериновой боковой цепи фермента. Конфигурация связей вокруг карбонильного атома углерода снова становится плоской тригональной и среди них снова имеется двойная связь С=0. [c.320]

    Приложение к сериновым протеазам [c.249]

    Левая половина исходной молекулы субстрата отсоединяется, сериновая боковая цепь у фермента восстанавливается, и фермент снова готов повторить весь процесс сначала. Отметим, что уравнение ( 1-3) обратно уравнению (21-2), но теперь правая половина цепи субстрата замещена молекулой воды. [c.319]

    Полагают, что кислотная группа Азр-102 находится в глубине молекулы, и, видимо, ее уникальное положение относительно необычно поляризуемой системы имидазольного кольца Н1.я-57, который в незаряженном состоянии способен нести протон на любом из двух своих атомов азота, является ключом к пониманию активности этого фермента, а также и других сериновых протеаз [c.220]

    Много попыток было сделано по созданию модели системы с эстафетной передачей заряда , которая функционирует в активном центре а-химотрипсина (а возможно, и других сериновых протеаз)  [c.100]

    Не менее поучительно сопоставление сорбционных функций а-химотрипсина и другой сериновой протеазы — трипсина. Размеры и форма субстратсвязывающего (сорбционного) участка в активных центрах обоих ферментов примерно одинаковы [3]. Единственное различие в первичной структуре полипептидных фрагментов, образующих гидрофобный карман , состоит в том, что в а-химотрипсине остаток 189 — это серин (см. рис. 9), а в трипсине в соответствующем положении находится отрицательно заряженная аспарагиновая кислота. Это приводит к тому, что в отличие от а-химотрипсина трипсин обнаруживает специфичность к гидролизу пептидных связей, образованных положительно заряженной аминокислотой (Lys, Arg). Сорбция положительно заряженного субстрата на ферменте (вблизи каталитически активного нуклеофила активного центра) происходит в данном случае за счет электростатических взаимодействий (рис. И, б). [c.35]


    Одиако, если трансоидно-цисоидная изомеризация эфирного субстрата под действием фермента происходит до атаки сериновым остатком, образуется другой тетраэдрический интермедиат  [c.251]

    Приведем здесь некоторые примеры высокомолекулярных соединений-катализаторов, в частности содержащих имидазол, которые обладают омыляющей способностью и во многом напоминают сериновые протеазы. [c.294]

    В настоящее время трудно указать ферментативную реакцию, в механизме которой участие общеосновного или общекислотного катализа строго доказано. Нельзя считать законченными даже исследования столь хорошо изученных сериновых протеаз, в частности а-химотрип- [c.65]

    ПЛАЗМ И Н (фибринолизин), фермент класса гидролаз ЙЗ группы сериновых протеаз. Гликопротеид белковая часть молекулы состоит из двух соединенных связью S — S полипептидных цепей — тяжелой (мол. м. ок, 60 ООО) и кгкой (ок. 25 ООО), в к-рой локализован активный центр. Обра.зус тся из неактивного предшественника — плазми-вогена. Катализирует расщепление фибрина, приводящее к растворению к])0вят 1.1х сгустков. [c.445]

    Трипсин, химотрипсин и эластаза-три родственных фермента, обладающих одинаковым каталитическим механизмом, но имеющих различную избирательность к субстрату. Они воздействуют на белковую цепь субстрата, образуя ацильный промежуточный продукт между сериновым радикалом фермента и фрагментом цепи субстрата, а затем отщепляют этот фрагмент цепи с молекулой воды. Избирательность этих ферментов определяется наличием на их поверхности по соседству с активным центром кармана , в который вставляется один из радикалов субстрата, подходящий по размеру. [c.339]

    Структура поворачивающейся руки тяжелого фермента, содержащего тиольную группу рука включает Р-меркаптоэтиламин и пантотеновую кислоту (важный компонент кофермента А) последняя соединена фосфодпэфирной связью с сериновым остатком фермента. [c.63]

    Аналогично и ароматические эфиры быстро гидролизуются а-циклодекстрином. В катализе участвуют, по-видимому, вторичные гидроксильные группы, но не известно, сколько и какие именно. При перемещении ацильной группы к акцепторной молекуле циклодекстрина образуется интермедиат. Эта ситуация формально аналогична механизму действия гидролитических ферментов, таких, как сериновые протеазы, и может служить в качестве модели фермента, поскольку перед началом реакции образуется комплекс с субстратом. Такое превращение молено рассматриват  [c.303]

    Эффективность ферментативного катализа просто завораживает, особенно если удается получить кристаллографические данные о структуре и имеются достаточно полные физико-химические сведения о ферментативном механизме действия. В этом отношении наиболее изучен фермент группы сериновых протеаз— а-химотрипснн. Термин сериновая протеаза своим происхождением обязан тому, что ферменты этого класса содержат в активном центре гидроксильную группу серина, которая проявляет необычную реакционную способность к необратимому ингибитору — динзопропилфторфосфату (ДФФ). [c.219]

    Получены данные о том, что в процессе гидролиза я-анилид-ных производных пептидов, катализируемом сериновой протеа-зой из Myxoba ter 495, которую называют а-литической протеа-зой, возникает тетраэдрический интермедиат и происходит согласованный переход протона от Ser-195 к His-57 и от His-57 к Asp-102. В этом ферменте присутствует только один остаток гистидина [82, 83]. Стадией, лимитирующей скорость гидролиза, является разложение тетраэдрического интермедиата на ацилфермент и п-нитроанилин. Экспериментальные данные говорят в пользу того, что два перехода протонов осуществляются согласованно, а не последовательно. [c.221]

    Субтнлизин, сериновая протеаза бактериального происхождения, также проявляет, подобно а-химотрипсину, обращенную специфичность к D-K TI [103]. Это предполагает, что оба фермента обладают сходной специфичностью к конфигурации их субстратов. Такая общая специфичность ясно подтверждает близкую структурную аналогию первичных связывающих центров обоих ферментов, и, более того, она отражает эту аналогию. Близкая структурная аналогия объясняет, каким образом а-химотрипсин и субтилизин, имеющие абсолютно разное филогенетическое происхождение, в действительности замораживают свои субстраты в одинаковой активной конформации. [c.234]

    Как указывалось в предыдущем разделе, близкое геометрическое расположение триады А5р-Н1з-5ег в активном центре сериновых протеаз называлось системой с переносом зарядов. Эти группы находятся в гидрофобном окружении во внутренней области фермента, и атаке гидроксильной группой серииа способствует отщепление протона по механизму общеосновного катализа имидазольным кольцом остатка гистидина. Это приводит к [c.226]

    Однако присоединение остатка серина к тетраэдрическому интермедиату приведет к возникновению значительного стерического напряжения ( 33,4 кДж, или 8 ккал) из-за взаимодействия с алкоксицепью. Чтобы устранить это напряжение, в активном центре должно произойти изменение конформации путем поворота вокруг связи С—О, соединяющей тетраэдрический углерод с сериновой ОЫ-групиой, на 120°. [c.250]


    При высоких pH переход ацильной группы 0->-М к имидазо-лид-аниону происходит по нуклеофильному механизму. Последующий гидролиз ацилимидазольного промежуточного производного происходит благодаря тому, что скорость гидролиза пре-выщает скорость термодинамически невыгодного перехода N- 0. Такая модель действительно имеет определенную аналогию с действием сериновых протеаз, хотя механизмы сходны лищь при нейтральных pH. Однако введение карбоксильной группы приводит к более точной аналогии системы с переносом зарядов  [c.227]

    Конечно, действие гидроксильной группы при катализе в определенной степе1ш аналогично функции остатка серина в сериновых протеазах. Поэтому были синтезированы и исследованы модельные соединения. [c.231]

    Диизопроиилфторфосфат (ДФФ. разд. 4.4)—также необратимый ингибитор активного центра, который блокирует активный остаток серина в сериновых протеазах. Легко показать, что ингибирование необратимо, поскольку после исчерпывающего диализа фермент по-прежнему неактивен. [c.449]

    Делоншам любезно сообщил нам свои собственные взгляды на механизм, по которому ог-химотрипснн и другие сериновые протеазы могут гидролизовать вторичные амины при стереоэлектронном контроле (рис. 4.7). Петков и др. [119], изучая влияние уходяш,ей группы на реакционную способность анилидов ири гидролизе, катализируемом а-химотрипсином, пришли к подобному же заключению. Кроме того, теория стереоэлектронного контроля была пспользована в приложении к механизму действия рибо-пуклеазы А, нуклеазы стафилококков и лизоцима [120]. [c.256]

Рис. 11. Схематическое изображение взаимодействия пептидных субстратов с сериновыми про-теазами, активный центр которых состоит из пространственно разделенных сорбционного и каталитического участков а— я-тимотрипсии б — эластаза в — трипсин Рис. 11. Схематическое изображение взаимодействия пептидных субстратов с сериновыми про-теазами, <a href="/info/5969">активный центр</a> которых состоит из <a href="/info/1581807">пространственно разделенных</a> сорбционного и каталитического участков а— я-тимотрипсии б — <a href="/info/88865">эластаза</a> в — трипсин
    Остановимся более подробно на катализе сериновыми протеазами. Эти ферменты отличаются лишь некоторыми деталями построения их активных центров, в частности, механизмом сорбции боковой субстратной группы (см. рис. 11). Обш,ее же в механизме действия этих ферментов — это сорбция а-ациламидного субстратного фрагмента при образовании им водородной связи с карбонильной группой полипептидной цепи фермента 23, 25]  [c.47]

    Для более глубокого понимания механизма действия активного центра интересно Сравнить абсолютное значение стандартной свободной энергии образования ацилфермента (в отсутствие гидрофобного субстратного фparмeнta К) с аналогичной характеристикой какой-либо модельной (неферментативной) реакции. Процесс (4.31) представляет собой фактически переэтерификацию субстратной молекулы при участии серинового остатка 8ег-195. Для производного 01у (не содержащего углеводородной боковой группы Н) [c.153]

    Механизм конденсации, непосредственно приводящей к образованию метафазных хромосом, пока не выяснен. Очевидно, что существенную роль в этом процессе играет фосфорилированне гистона Н1 по сериновым и треонииовым остаткам, которое протекает на строго определенной стадии клеточного цикла и предшествует по времени образованию метафазных хромосом. [c.248]

    В качестве донора фосфата используется АТФ, акцептором служат сериновые и треониновые аминокислотные остатки белков. Регуляторная субъединица выступает в данном случае в качестве ингибитора каталитической субъединицы. К обладает способностью связывать цАМФ как в составе холофермента, так и в свободном состоянии. [c.330]

    Синтез сложных эфиров. Иногда бывает необходимо этери-фидировать аминокислоту, О синтезе 0-сериновых производных а-ациламинокислот уже упоминалось выше. [c.202]


Смотреть страницы где упоминается термин сериновая: [c.320]    [c.142]    [c.224]    [c.225]    [c.237]    [c.276]    [c.289]    [c.304]    [c.35]    [c.154]    [c.483]   
Химия протеолиза Изд.2 (1991) -- [ c.162 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Гистидин-сериновые каталитические комплексы гидролаз

Гликоген-синтаза инактивируется при фосфорилировании специфического серинового остатка

Глиоксилат как регенерирующий субстрат в сериновом пути

Ингибитор сериновой протеиназы

Кальвина сериновый

Маннан-связывающий лектин-ассоциированные сериновые

Периплазматические протеазы сериновые

Приложение к сериновым протеазам

Пример 1 сериновые протеазы

Протеаза сериновые, инактивация антитромбином

Протеиназы вирусов сериновые

Протеиназы змей сериновые

Протеиназы сериновые

РНК рибонуклеиновые кислоты сериновые

Серии в сериновых протеазах

Сериновая эндопептидаза

Сериновы эстеразы

Сериновые амидгидролазы

Сериновые амидгидролазы, активные центр

Сериновые пептидазы

Сериновые протеазы

Сериновые протеазы каталитический механизм

Сериновые протеазы микроорганизмов конвергентная эволюция

Сериновые протеазы структуры

Сериновые протеазы функциональное разнообрази

Сериновые протеазы, водородные связи

Сериновые протеиназы вирусов, сходство с цистеиновым

Сериновые протеиназы змей влияние ионов

Сериновые протеиназы змей заряда

Сериновые протеиназы змей комплексах

Сериновые протеиназы змей систе а переноса заря

Сериновые протеиназы инвентаризация протонов

Сериновые протеиназы ингибирование

Сериновые протеиназы панкреатические

Сериновые протеиназы электростатическая стабилизация

Сериновые протеиназы, ассоциированные

Сериновый путь

Сериновый цикл

Стафилококковая сериновая протеиназа

Стафилококковая сериновая протеиназа активный центр

Химотрипсин с другими сериновыми

Центры связывания субстрата сериновых протеаз

Цитоплазматические протеазы сериновые

Щелочные протеиназы микробные сериновые

Эстеразы сериновые

цепи L печени сериновый



© 2024 chem21.info Реклама на сайте