Пространство последовательностей

Во-вторых, белковая цепь может по-разному располагаться в пространстве. Последовательность аминокислот в белке задает его форму, а форма определяет функции белка. Расположение аминокислот в пространстве, способ скручивания цепи — называется вторичной структурой белка. [c.452]

Технологическая схема реакторного и печного отделений установки показана на рис. 1. Исходное сырье центробежным насосом подается через фильтры в тройник смешения с циркуляционным газом, откуда поступает в межтрубное пространство последовательно установленных теплообменников Т-1, Т-2, Т-3 и Т-4, в которых оно нагревается за счет тепла потока продуктов реакций. Из теплообменников смесь сырья и циркуляционного газа поступает в конвекционную камеру печи и из нее в первую радиантную камеру, а затем в реактор Р-1, где в паровой фазе контактирует с катализатором и подвергается ароматизации. Процесс каталитического риформинга в реакторах протекает с поглощением тепла, вследствие чего температуру в зонах реакции приходится восстанавливать путем межступенчатого подогрева в печи. [c.124]

Каждая точка на плоскости отражает индивидуальную последовательность полипептидной цепи заданной длины, а все вместе - всевозможные последовательности, собранные из данного количества аминокислотных остатков, которые составляют полное пространство последовательностей для полипептида определенного размера функциональность - количественно выраженная (в произвольных единицах) способность конкретного белка из данного пространства последовательностей выполнять конкретную функцию, например, с некоторым сродством связывать лиганд [c.285]

Схема холодильной машины показана на рис. 1Х-7. При движении поршня А вправо нагревающийся от сжатия Ь Нз поступает в змеевик Б, охлаждаемый снаружи водой (или воздухом). Охлажденный аммиак уже при имеющемся в системе давлении (7—8 ат) сжижается и стекает в приемник В. Затем жидкий аммиак поступает в змеевик Г, где испаряется вследствие разрежения, вызываемого движением поршня А. Необходимое для испарения тепло поглощается из окружающего змеевик Г пространства. Последовательное повторение всего цикла процессов создает непрерывное охлаждение этого пространства. [c.390]

Новейшие типы прямоточных аппаратов представляют собой три или несколько двухходовых паровых теплообменников, соединенных по трубному пространству последовательно, а по межтрубному паровому — параллельно. Паро-жидкостная смесь разделяется в отдельном выносном сепараторе, состоящем из горизонтально расположенного циклона, снабженного в конце дополнительным сепаратором инерционного типа. Пройдя через аппарат, раствор вторично в него не возвращается, поэтому никакой циркуляции в таких аппаратах нет. [c.454]

Многостадийный гетерогенный процесс ионного обмена включает ряд разделенных во времени и пространстве последовательных стадий, а именно [c.53]

Среди направленных методов поиска оптимальной области наиболее старым является метод Гаусса — Зейделя, при котором все факторы, кроме одного, поочередно фиксируются. Двигаясь параллельно одной из осей факторного пространства, технолог находит наилучшее для рассматриваемого разреза поверхности отклика значение параметра оптимизации, затем в этой наилучшей точке он поворачивается и двигается параллельно следующей оси факторного пространства. Последовательное прохождение всех осей факторного пространства составляет первый цикл исследования. Процедуру повторяют до получения оптимума. Распространенным недостатком проведения эксперимента по этому методу является прекращение работы после выполнения первого цикла. [c.110]

Основное количество газообразного азота из нижней колонны поступает в межтрубное пространство последовательно включенных основных конденсаторов 13 и 14 и азотную колонну 18. Жидкий азот из конденсаторов 13 и 14 используется для орошения нижней колонны. В азотную колонну, предназначенную для получения чистой азотной флегмы, подается газообразный азот, несконденсировавшийся в основных конденсаторах. Чистая азотная флегма образуется в трубном пространстве конденсатора азотной колонны за счет тепла испарения жидкого кислорода в межтрубном пространстве и отбирается из карманов конденсатора для орошения колонны чистого азота, встроенной в верхнюю часть верхней колонны. [c.45]

Практически дело сводится к передвижению многоугольника, изображающего атомный мотив. С началом координат векторного пространства последовательно совмещаются первая, вторая, третья и т. д. вершины фигуры и одновременно атомные номера всех атомов умножаются на одно и то же число сначала на 2,, затем на Z и т. д. [c.482]

Рассмотрим гауссовское распределение на пространстве последовательностей т = т(8), 5 2 с гамильтонианом Я1(т) (см. гл. 1, 4, п. 3). Такое распределение вероятностей может оказаться обобщенным, т. е. среднее значение (т(х), т(5)), вычисленное по этому распределению, будет бесконечным. Это означает, что конечными будут средние типа (т(5]) — т(52), т(51) —т(52)) или средние, включающие разности более высокого порядка, т. е. т порождает процесс со стационарными приращениями конечного порядка. Мы будем говорить, что в этом случае основное состояние 11)- не- [c.110]

В этой главе важную роль играют три объекта пространство Фока, изоморфизм Сигала и разложение Винера — Ито. Они связаны с пространством функций на сопряженном к ядерному пространстве, суммируемых с квадратом относительно гауссовой меры у. Полезно пояснить, что если от такого изощренного пространства 2 перейти к пространству (1Я , /7 (дг)) функций на оси 1К , то эти объекты приобретают весьма простой характер роль пространства Фока играет обычное пространство последовательностей вида (/ )п=о. изоморфизм Сигала — восстановление функции / Е г (1Н , йу (х)) по последовательности (/ ) =о ее коэффициентов Фурье при разложении 2 (1К . ( )) по полиномам Эрмита, а разложение Винера — Ито — само это разложение. [c.70]

Задание коэффициентов (3.12) дифференциального выражения А сейчас эквивалентно заданию отображений 1 (Й ) в пространство последовательностей [c.136]

Положим F == (IR , q х) dx), где q (IR ) — некоторый положительный вес. В качестве Gq примем пространство последовательностей / = ifn е /= ") со скалярным произведением (/, g)a, = [c.505]

Положительно определенные функции на некоторых пространствах последовательностей // Укр. мат. журн.— 1976.— 28, № 1.— С. 27—35. [c.665]

По оси Z на рисунке отражен уровень функциональности конкретных молекул пространства последовательностей, выраженный в произвольных единицах, который в случае ферментов количественно характеризует их способность осуществлять химическую реакцию (например, число оборотов или коэффициент специфичности данного фермента). Введение третьего из- [c.284]

Рис. 31. Ландшафт функциональности среди пространства последовательностей белковых молекул [13

Рис. 59. Перемещение по пространству последовательностей белковых молекул с помощью разных методов, используемых в современной белковой инженерии

Этот раствор заливают в зарубашечное пространство цилиндра на одни сутки (конденсатор охлаждения при этом должен быть снят), затем его сливают, а зарубашечное пространство последовательно промывают водой, 1%-пым раствором соды (КааСОз) и 0,2%-ным раствором бихромата калия (К2СГ2О7). [c.147]

После разборки двигателя промывают зарубашечное простран- тво цилиндра от накипи раствором следующего состава 90% юды+4% соляной кислоты (плотность 1,19 г/см )+6% техничес-юго альбумина (10%-ный раствор) или кровяной сыворотки. Этот )аствор заливают в зарубашечное пространство цилиндра на одни утки (конденсатор охлаждения при этом должен быть снят), за- ем его сливают, а зарубашечное пространство последовательно фомывают водой, 1%-ным раствором соды и 0,2%-ным раствором эихромата калия. [c.123]

Один поток подают в последний кристаллизатор, откуда он проходит по затрубному пространству последовательно противотоком к сырью все пять кристаллизаторов. Часть второго потока смешивают с теплым (4—5°) растворителем, который поступает на барабан вакуум-фильтра для холодной промывки лепешки парафина. Другую его часть отдельными порциями нодают в кристаллизаторы. [c.119]

В процессе ионного обмена можно выделить несколько раздв ленных во времени и пространстве последовательных стадий, ос- новными из которых являются следующие. [c.197]

Нагреваемый газ течет по трубам. Греющий газ (дымовые газы), образующийся от сжигания В опке газообразного или жидкого топлива, за счет естественной тяги (самотяги) проходит по меж-трубному пространству последовательно через радиационную и конвективную зоны подогревателя и, отдав тепло нагреваемому газу, выбрасывается через дымовую трубу в атмосферу с температурой около 300—350° С. [c.109]

Исследователи, работающие в области направленной эволюции, изначально используют клонотеки последовательностей, которые, несмотря на случайный характер их создания, охватывают лишь небольшую часть теоретически возможного пространства последовательностей, представляющего набор молекул с аминокислотными остатками (или нуклеотидами) во всевозможных сочетаниях. Поскольку такие клонотеки получают руками экспериментатора, то с их помощью можно конструировать макромолекулы, не встречающиеся в природных условиях. Однако размер полного пространства последовательностей слишком велик, чтобы с ним можно было работать экспериментально. Поэтому в белковой инженерии на практике часто реализуют компромиссный вариант подхода, в котором в качестве исходной последовательности при конструировании нового фермента используют известную последовательность с исследованной пространственной структурой, функциональность которой уже была апробирована в природе. В этом случае на основе имеющихся знаний о структуре и механизмах функционирования активного центра исходного фермента с помощью направленного мутагенеза заменяют конкретные аминокислотные остатки в надежде получить фермент с требуемыми свойствами. Такой подход получил название рационального редизайна. Одним из плодотворных подходов в этом направлении исследований является инженерия белковых поверхностей (pat h engineering), при котором с помощью мутаций изменяют участки полипептидной цепи в окрестностях аминокислотных остатков, сближенных на поверхно- [c.275]

Переходя к обсуждению результатов по созданию белков и ферментов с новыми функциями, которые удается получать методами рационального дизайна в белковой инженерии, необходимо сформулировать два важных понятия, которые часто используются в молекулярной генетике. Совокупность всех возможных последовательностей аминокислотных остатков полипептидной цепи (или полинуклеотида) определенной длины составляет ее полное пространство последовательностей (sequen e spa e). Например, полное пространство последовательностей 100-звенной полипептидной цепи, построенной из 20 природных аминокислотных остатков, будет представлено 20 о (-lO o) последовательностями. Хотя полное пространство последовательностей является п-мерным и его невозможно изобразить графически, для удобства обсуждения его часто изображают в виде двумерной плоскости, где каждая точка плоскости соответствует индивидуальной последовательности этого пространства (рис. 31). [c.284]

Создание методами рационального редизайна искусственных белков, обладающих совершенно новыми функциями, на основе полипептидного скелета биологически инертных макромолекул, как правило, требует введения нескольких мутантных аминокислотных остатков в разные участки их полипептидных цепей, так как одиночные мутации не приводят к желаемому результату. Говоря о возможностях метода в терминах ландшафтов функциональности, можно предположить, что введение множественных мутаций позволяет пересекать биологически инертные пространства последовательностей и попадать в зоны новых холмов, на их склоны. Это открывает путь для дальнейшего совершенствования функциональности нового белка, полученного методами белковой инженерии, и может приводить к изменению вида самого ландшафта. [c.286]

Идеи С. Спигельмана оказались исключительно продуктивными для последующего развития молекулярной биологии и легли в основу одного из ключевых подходов к получению новых белков и ферментов с использованием методов направленной эволюции макромолекул. Однако, в отличие от обсуждавшихся выше классических опытов, разнообразие последовательностей нуклеиновых кислот, которые кодируют белки, эволюционирующие in vitro в такой системе, возникает не спонтанно, а создается исследователем с помощью случайного мутагенеза перед каждым новым раундом отбора белков с требуемыми свойствами. Поэтому эксперименты по направленной эволюции белков начинаются с формирования комбинаторных клонотек случайных последовательностей, которые охватывают определенную часть исследуемого пространства последовательностей. [c.321]

Само по себе создание представительных клонотек и тестирование свойств даже небольших белков со всеми возможными комбинациями аминокислотных остатков является в настоящее время неразрешимой задачей. Исчерпывающая клонотека должна включать полное пространство последовательностей. Как уже упоминалось выше, пространство последовательностей полипептидной цепи определенной длины представляет собой сеть всех теоретически возможных взаимосвязанных аминокислотных последовательностей, в которой каждый узел представляет собой уникальную последовательность аминокислот. Пространство последовательностей для белка в п аминокислотных остатков (а.о.) будет содержать 20" членов, т.е. в пространстве последовательностей даже небольшого белка длиной в 200 а.о. будет заключено 202оо разных макромолекул, а это значение превышает число атомов в видимой части вселенной, которое оценивается 10 9. [c.322]

Конструирование ферментов методами белковой инженерии сопровождается постепенным освоением новых областей исследуемого пространства последовательностей и на зтом пути продвижения в неведомое наблюдается значительный прогресс (рис. 59). Методы классического скрининга белков с новыми свойствами, основанные на последовательном переборе отдельных различающихся последовательностей, дают возможность исследовать лишь очень ограниченное количество не связанных друг с другом представителей из теоретически доступного пространства последовательностей в разных его областях. Картина изменяется лишь незначительно при анализе большого количества геномов разных видов в процессе метагеномного скрининга. Методы направленного и случайного мутагенеза позволяют незначительно отклониться от исходной последовательнбсти и исследовать пространство последовательностей в ее окрестностях. Случайное объединение доменов разных белков и, особенно, комбинаторная перетасовка нуклеотидных последовательностей разных геномов дают возможность обследовать брлее удаленные друг от друга области пространства последовательностей. Тем не менее, наши современные возможности пока не позволяют подойти к решению этой проблемы более широко, и в исследуемом [c.460]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология