Рибонуклеотиды, гидролиз

Таблица 10.3. Гидролиз рибонуклеотидов в 0,1 и. НС при

В результате щелочного или нейтрального [225] гидролиза рибонуклеотидов (катализируемого ионами металла) образуются соответствующие нуклеозиды и фосфорная кислота. Освобождению фосфорной кислоты при кислотном гидролизе (pH —1), вероятно, предшествует разрыв гликозидной связи, после чего образуется неустойчивый фосфат сахара , расщепляющийся затем дальше [226]. Так как пиримидиновые гликозиды значительно более устойчивы, чем соответствующие пуриновые соединения, фосфорная кислота при кислотном гидролизе освобождается значительно медленнее в случае цитидиловой и уридиловой кислот, чем адениловой и гуаниловой (а также 4,5-дигидропиримидиннуклеотидов). Однако при pH 4 механизм гидролиза иной и включает прямой разрыв связи Р — О при отсутствии расщепления гликозидной связи и без заметной миграции фосфорного остатка [148]. Для определения расположения фосфатных групп в аденозин-2, 5 -дифосфате и аденозин-3, 5 -дифосфате оказался полезным гидролиз в аммонийно-формиатном буфере при гидролизе 2, 5 -изомера образуется аденозин, аденозин-2 -фосфат, аденозин-5 -фосфат и лишь в очень незначительном количестве аденозин-З -фосфат. Структура этих синтетических дифосфатов была подтверждена при помощи моноэстеразы, специфически расщепляющей З -фосфоэфирную связь в аденозин-3, 5 -дифосфате. [c.175]

Задача 0-78. При обработке продуктов гидролиза 3,63 г рибонуклеотида, содержащего 19,28% азота по массе, избытком известковой воды выпало 1,55 г осадка. Установите структурную формулу рибонуклеотида и назовите его. [c.140]

Четыре простых пиримидиновых рибонуклеотида, полученных щелочным гидролизом рибонуклеиновых [458] (уридиловой и цитидиловой) кислот, являются 2 - и З -фосфатами нуклеозидов уридина и цитидина [459а]. 5 -Фос-фаты уридина и цитидина найдены в энзиматических гидролизатах рибонуклеиновых кислот [460]. Монофосфаты этих соединений синтезированыфосфорили-рованием соответствующих нуклеозидных производных [461]. 2, 5 - и 3, 5 -Дифосфаты уридина и цитидина найдены в продуктах гидролиза рибонуклеиновых кислот змеиным ядом [462а] . Были синтезированы циклические 2, З -фос-фаты уридина и цитидина, встречающиеся в гидролизатах рибонуклеиновых кислот под действием рибонуклеазы [463]. [c.257]

Задача 0-78. При гидролизе любого рибонуклеотида образуется азотистое основание (цитозин, урацил, аденин или гуанин), Р-рибоза и фосфорная кислота [c.307]

РНКаза поджелудочной железы гидролизует фосфодиэфирные связи внутри молекулы одноцепочечной высокополимерной РНК. В результате образуется смесь олиго-, ди- и мононуклеотидов, которые могут быть отделены от фермента и субстрата — высокополимерной РНК — гель-хроматографией на колонке. Разделение рибонуклеотидов, различающихся по числу нуклеотидных звеньев, может быть проведено методом ионообменной хроматографии. [c.176]

Поскольку При гидролизе мононуклеотидов кислотами можно выделить гетероциклическое основание и фосфат моносахарида, ясно, что в нуклеотиде остаток фосфорной кислоты связан с углеводной частью молекулы. Таким образом, для природных рибонуклеотидов возможно существование трех изомеров 2 -фосфата (I), З -фосфата (П) и 5 -фосфата (HI). [c.215]

Нуклеотидный состав РНК обычно определяют после щелочного гидролиза препарата, дающего смесь свободных рибонуклеотидов. О нуклеотидном составе ДНК судят по соотношению азотистых оснований, образующихся при глубоком кислотном гидролизе препарата. [c.94]

Основными продуктами щелочного гидролиза РНК являются 2 - и 3 -рибонуклеотиды. — Прим. перев. [c.163]

Наличие 2 -0Н-группы у рибонуклеотидов значительно усиливает чувствительность 5 -эфирной связи к щелочам, так как способствует образованию циклического 2 -,3 -фосфата, сопряженному с разрывом 5 -связи. Нуклеиновые кислоты часто символически изображают в таком виде, как это представлено на фиг. 19, где показано действие щелочи и фосфодиэстеразы змеиного яда на поли-рибонуклеотид. Щелочной гидролиз РНК заканчивается образованием смеси 2 - и З -нуклеотидов. Под действием [c.93]

Фосфорклкрование рибофуранозилнуклеозидов ill. Японские химики обнаружили, что Ф. х. является прекрасным катализатором для превращения рибонуклеозидов в 2, 3 -0-изопропилиденовые производные, которые при добавлении пиридина этерифицируются в первичное 5 -положение. Последующий водный гидролиз приводит к нуклеотидам. Этот метод можно применять для одностадийного превращения рибонуклеозидов в рибонуклеотиды при этом используют Р0С1з, ацетон и пиридин без выделения изопропилиденового производного. [c.315]

Идентификация углеводных компонентов также проводится после кислотного гидролиза нуклеиновых кислот. При этом из пуриновых или предварительно гидрированных по 5, 6-двойной связи пиримидиновых рибонуклеотидов образуется О-рибоза. Основания дезоксирибонуклеотидов отщепляются в значительно более мягких условиях, чем рибонуклеотиды, но вследствие нестабильности образующаяся дезоксирибоза превращается в левулиновую кислоту. При чрезвычайно мягкой обработке кислотой пуриновых или восстановленных пиримидиновых дезоксирибонуклеотидов удается выделить дезоксирнбозу или ее легко идентифицируемые производные [c.306]

Нуклеотидами "называются фосфорные эфиры нуклеозидов, в которых, сахар связан с фосфатной группой через атом кислорода. Их можно получить при химическом или ферментативном гидролизе нуклеиновых кислот, если проводить гидролиз в мягких условиях. В случае рибонуклеотидоВ гидролизат может содержать смесь 2 -, 3 - и 5 -мононуклеотидов (т. е. рибо-яуклеозид-2 -, рибонуклеозид-3 - или рибонуклеозид-5 -фосфатов цифра со-штрихом указывает положение, в котором произошла этерификация сахара) в случае дезоксирибонуклеотидов в гидро лизате могут присутствовать только [c.126]

И 5 -изомеры. Эти соединения встречаются в природе не только в качестве продуктов или субстратов обмена нуклеиновых кислот по крайней мере некоторые из них входят также в состав нуклеотидных коферментов (см. гл. У1И). Среди продуктов гидролиза нуклеиновых кислот обнаруживаются циклические 2, З -дифосфаты всех рибонуклеотидов (см. стр. 128) циклический 3, 5 -фосфат аденозина выполняет функцию активатора фосфорилазы и других ферментов (см. стр. 285), а адснозин-2, 5 -дифосфат и аденозин-3, 5 -дифосфат входят в состав двух коферментов — соответ ственно НАДФ и кофермента А (см. стр. 228). Нуклеотиды можно рассматривать также как моноэтерифицированные производные фосфорной. [c.127]

Гидролиз фосфомоноэфирных связей в рибонуклеотидах [c.542]

Ступенчатой деградации по такому пути был подвергнут ряд ди- и тририбопуклеотидов, структура которых таким образом была твердо установлена в принципе метод можно применить и к олиго-рибонуклеотидам большего размера [188]. Так, обработка АЗ ф5 ГЗ ф5 ЦЗ ф фосфомоноэстеразой дает соответствующий три-мер со свободной цис-гликольной группой. В результате периодатного окисления последнего получается диальдегид, который при pH 10,5 быстро распадается на динуклеотид АЗ ф5 ГЗ ф и производное цитозина (превращающееся при кислотном гидролизе в цитозин). Повторение всего процесса с динуклеотидом дает гуанин и аденозин-З -фосфат. Кроме определения нуклеотидной последовательности, этот метод позволяет также отличать 3 —5 -межну-клеотидную связь в динуклеотидах от 2 —5 -связи, так как при его применении миграции фосфата не происходит. [c.397]

Гидролиз РНК гидроокисями различных металлов, такими, как гидроокиси свинца, кадмия, цинка или алюминия, приводит к образованию смесей нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов [195]. После расщепления дрожжевой РНК гидроокисью лантана остается устойчивая фракция [196]. Из гидролизатов рибонуклеиновой кислоты гидроокисью висмута (pH 4) выделены все шестнадцать димеров, которые возможно получить комбинированием четырех классических оснований [197] при действии слабоосновных ионообменных смол образуются преимущественно динуклеотиды [198]. В последнем случае происходит миграция непрогидролизовав-шихся фосфодиэфирных связей (изомеризация 3 —5 -связи в 2 —5 ) в противоположность тому, что имеет место при действии разбавленной щелочи на простые эфиры рибонуклеотидов. [c.401]

Расщепление фосфоэфирных связей и некоторые другие реакции фосфатных групп нуклеиновых кислот и их компонентов реакции с разрывом связей Р—О (гидролиз фосфомоноэфирных связей в рибонуклеотидах и расщепление РНК до нуклеозидов, гидролиз фосфодиэфирных связей в полинуклеотидах реакции с разрывом связей С—О (расщепление фосфоэфирных связей после удаления гетероциклических оснований у концевых звеньев полинуклеотидов и некоторые другие реакции) некоторые реакции с образованием фосфоэфирных связей (алкилирование по кислороду фосфатной группы, реакции концевых фосфатных групп в полинуклеотидах) " . [c.567]

Хотя образование комплекса с ионом металла обычно не ускоряет значительно гидролиз простых производных фосфата, с поли-рибонуклеотидами дело обстоит иначе. В этих полимерах фосфодиэфирные связи быстро гидролизуются в присутствии некоторых металлов, особенно Zn +, с образованием монорибонуклеотидов, которые пе распадаются дальше до фосфата [106]. Атом фосфора фосфодиэфирной группы уже поляризован под действием двух эфирных связей, и это может служить объяснением того, что дополнительная поляризация при связывании иона металла не может быть компенсирована оттягиванием электронов от кислородных атомов (гл. 34). [c.649]

Если в растворе присутствует в-глюкоза или в-фруктоза, которые дают коричневое или красновато-коричневое окрашивание с орсином, их влияние мо кно исключить, проводя дихроматические измерения при 670 ммк и несколько ниже 600 Л1М,к. При длине волны 600 ммк соответствующие гексозы имеют те же коэффициенты экстинкции, что и при 670 ммк. Четыре альдопептозы в этой цветной реакции имеют почти одинаковые коэффициенты экстинкции, а коэффициенты экстинкции пуриновых рибонуклеотидов и свободной пентозы идентичны. Однако скорость появления окраски для в-рибозо-5-фосфата много выше, чем для свободной в-рибозы или в-рибозо-З-фосфата, что можно использовать для дифференциации и количественного определения двух типов в-рибо-зофосфатов [5]. Пиримидиновые рибонуклеотиды не вступают в эту реакцию, за исключением тех случаев, когда ниримидины до введения в реакцию подвергаются бромировапию и продолжительному кислотному гидролизу при 105° [61. Кетопентозы дают зеленую окраску с максимумом поглощения при 670 ммк. [c.28]

Состав продуктов гидролиза нуклеиновых кислот зависит от условий проведения реакции. Нагревание РНК или ДНК при 100X в 70%-ной хлорной кислоте приводит к образованию азотистых оснований [7], тогда как при действии на РНК соляной кислоты образуются пуриновые основания и пиримидиновые нуклеотиды [8], а щелочной гидролиз РНК дает смесь 3 - и 5 -рибонуклеотидов. В случае ферментативного расщепления нуклеиновых кислот состав продуктов определяется типом использованной нуклеазы. Например, РНКаза Тг расщепляет молекулу РНК до З -рибонуклеотидов [10], а при последующем действии фосфодиэстеразы из змеиного яда образуются нуклеозиды [11]. Аналогичным образом последовательная обработка ДНК панкреатической ДНКазой I и фосфодиэстеразой из змеиного яда приводит к образованию 5 -дезоксирибонуклеотидов [c.163]

Как и в случае ДНКаз, существует большая группа (более десяти) экзорибо-нуклеаз, ускоряющих реакции отщепления рибонуклеотидов по концевым оста кам РНК, и олигорибонуклеотидов, возникающих при селективном гидролизе РНК под действием эндорибонуклеаз. Таким образом, в результате деятельности разнообразных нуклеаз нуклеиновые кислоты при распаде дают сложную смесь индивидуальных рибо- и дезоксирибонуклеозид-3 и 5 -фосфатов. [c.230]

Дезоксирибонуклеотиды в организме используются для образования ДНК. Функции рибонуклеотидов более разнообразны. Основная их масса расходуется на образование РНК. Кроме того, рибонуклеотиды выполняют роль коферментов в некоторых трансферазных реакциях (в частности, при синтезе полисахаридов). Адениловые рибонуклеотиды входят в состав коферментов НАД, НАДФ, ФАД, КоА. Уникальную роль в превращениях энергии в организме выполняет АТФ (гл. 8). Все нуклеозидтрифосфаты, подобно АТФ, содержат две высокоэнергетические связи, т. е. связи, при гидролизе которых освобождается значительное количество энергии (около 50 кДж/моль) это связи между фосфатными остатками. [c.104]

Полинуклеотид-фосфорилаза и РНК-поли-мераза катализируют совершенно различные реакции. В приведенной реакции активированными предшественниками служат рибонуклеозидди фосфаты, а не три-фосфаты. Продукт реакции - ортофосфат, а не пирофосфат. Следовательно, равновесие в реакции не может быть сдвинуто вправо в результате гидролиза пирофосфата. В самом деле, in vivo равновесие сдвинуто в сторону распада РНК, а не ее синтеза. Принципиальное отличие состоит в том, что полинуклеотид-фосфорилаза не использует матрицы. Состав РНК, синтезированной этим ферментом, определяется соотношением рибонуклеотидов в инкубационной смеси, а последовательность близка к случайной. Благодаря этому полинуклеотид-фосфори л аза оказалась ценнейшим инструментом в экспериментах по расшифровке генетического кода. Например, poly(U) синтезировали, инкубируя в присутствии фермента раствор высокой [c.70]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология