Нуклеиновые кислоты уменьшение молекулярного вес

Предложено много специальных способов для уменьшения трудоемкости таких расчетов, но в определении структур сложных кристаллов, по-видимому, почти всегда остается некоторый элемент проб и ошибок. В прошлом для определения структур сравнительно простых молекулярных кристаллов требовались месяцы вычислительной работы. Сейчас применение электронных вычислительных машин чрезвычайно ускорило этот процесс. Для относительно простых структур требуются уже не месяцы, а дни работы, и в то же время появилась возможность исследования таких сложных структур (например, протеинов и нуклеиновых кислот), изучение которых раньше казалось совершенно безнадежным. [c.315]

ВИСЯТ от протяженности областей неразрушенной молекулярной структуры. Разрушение спирали будет сопровождаться уменьшением электростатического взаимодействия, потому что, хотя общие размеры макромолекулы сокращаются, расстояние между близко расположенными зарядами в отдельных спиралеобразных участках увеличивается (так же как в случае полипептидов при переходе спираль—клубок отдельные расстояния между зарядами увеличиваются), и, следовательно, величина уменьшается. Детали процесса разворачивания пока не установлены полностью, потому что этот процесс, по-видимому, состоит из нескольких последовательных стадий, большинство из которых необратимо. Поэтому результаты экспериментов в значительной степени зависят от тоге, насколько низким или высоким было pH, при котором изучали эту реакцию, и как долго нуклеиновая кислота подвергалась воздействию среды с таким pH. [c.592]

Уменьшение молекулярного веса, происходящее во время облучения, обусловлено преимущественно тем, что радикалы воздействуют на фосфатные эфирные группы нуклеиновой кислот.ы [c.278]

При увеличении длины цепи олигонуклеотида гипохромизм быстро достигает предельного значения. Некоторый предел имеется также и для более высоких уровней спирализации структур за счет образования водородных связей, при котором значительное уменьшение молекулярного веса (на основании измерения вязкости) нативных нуклеиновых кислот при ферментативном гидролизе или разрушении ультразвуком уже может не сказываться на вели- [c.634]

Для жизненной функции клеток решающее значение имеют белки и нуклеиновые кислоты. Белки — главный органический компонент цитоплазмы. Некоторые белки относятся к структурным элементам клетки, другие — к имеющим важное значение ферментам. Радиационное повреждение белков состоит в уменьшении их молекулярной массы в результате фрагментации полипептидных цепочек, в изменении растворимости, нарушении вторичной и третичной структуры, агрегировании и т. п. Биохимическим критерием радиационного повреждения ферментов является утрата ими способности осуществлять специфические реакции. При интерпретации пострадиационных изменений ферментативной активности in vitro наряду с радиационными нарушениями самого фермента следует учитывать и другие повреждения клетки, прежде всего мембран и органелл. Чтобы вызвать явные изменения ферментативной активности в условиях in vitro, требуются значительно большие дозы, чем in vivo. [c.16]

Нуклеиновые кислоты являются очень трудным для работы материалом. Они чувствительны к расщеплению ферментами (ри-бонуклеаза, например, может быть обнаружена даже на кончиках пальцев исследователя). Они не терпят экстремальных значений pH и температуры и даже действия механических разрывающих сил. Длина молекулы ДНК, полученной из распространенной бактерии Е. oli, составляет примерно 1 мм, в то время как ее диаметр— около 2 нм. Таким образом, простое перемешивание или даже неосторожное взятие пипеткой раствора ДНК обычно приводит к существенному уменьшению ее молекулярной массы. Естественно, что наиболее ранние препараты ДНК представляли собой фрагментированный материал с низкой молекулярной массой. [c.35]

Гель-хроматография (гель-фильтрация, или ситовая хроматография) — метод разделения, очистки и анализа веществ, основанный на различии в размерах или массе молекул. В качестве стационарной фазы используют различные гели с трехмерной сетчатой структурой декстраны (полисахариды), полиакри ламиды, пористые силикагели, цеолиты и др. При разделении смеси небольшие молекулы диффундируют через поры набухшего в растворителе геля, а крупные молекулы проходят через пространство между частицами геля. При промывании геля растворителем в первую очередь перемещаются крупные молекулы, а затем уже мелкие, т. е. компоненты смеси элюируют в порядке уменьшения их молекулярной массы. Гель действует как молекулярное сито. Аппаратурная простота метода и мягкие условия разделения способствовали особенно широкому применению гель-хроматографии в биохимических исследованиях. Основное назначение гель-хроматографии — разделение высокомолекулярных веществ. С ее помощью выделены и очищены многие ферменты, пептидные гормоны, нуклеиновые кислоты. [c.498]

Как показывают эти наблюдения, само уменьшение вязкости еще не является доказательством, что разрывы цепочки полимера являются основной реакцией эту точку зрения мы настойчиво подчеркивали выше. Однако имеются и другие доказательства, подтверждающие, что действие Ионизирующего излучения на нуклеиновые кислоты вызывает их деградацию. Спарроу и Розенфельд [127] показали, что рентгеновские лучи снижают двойное лучепреломление в потоке дезоксирибонуклеогистоиа зобной железы и свободной дезоксирибонуклеиновой кислоты. Измерения констант седиментации и диффузии облученных нуклеиновых кислот [124, 129, 139] также показали, что происходит деградация, при которой образуются недиализуемые с )раг-менты [144], молекулярный вес которых колеблется в широки.х пределах. [c.257]

В этом разделе мы будем рассматривать влияние электростатических сил на поведение тех макроионов или макромолекул полиэлектролитов, которые в отсутствие таких сил имели бы одну специфическую предпочтительную конформацию. (Большинство макромолекул, отнесенных в разделе 7 к этому классу, т. е. белки, нуклеиновые кислоты и вирусы в действительности являются полиамфолитами.) Когда такие молекулы приобретают заряд, то, как и в случае гибких макроионов полиэлектролитов, развернутая конформация, в которой заряды расположены дальше друг от друга, будет отвечать меньшему значению электростатической свободной энергии, чем конформация компактно свернутой цепи, в которой заряды находятся близко друг от друга. (Такое возможное уменьшение величины можно проиллюстрировать, например, сравнивая значения приведенные в табл. 30 для компактного белкового иона, со значениями, приведенными в табл. 31 для иона того же молекулярного веса с тем же зарядом, имеющего развернутую конформацию и вдвое больший радиус.) Единственным исключением из этого общего правила являются полиамфолиты, находящиеся в изоэлектрическом состоянии или вблизи него, когда наличие равного-количества положительных и отрицательных зарядов, конечно, способствует принятию компактной конформации точно так же, как и в случае гибких макроионов полиамфолитов, которые в этих условиях стремятся сократиться, а не развернуться. [c.576]

Эффекты, вызываемые облучением нуклеиновых кислот в сухом или слегка влажном состоянии, весьма сходны с эффектами, вызываемыми облучением в водном растворе, несмотря на различный механизм. Разрываются фосфорноэфирные связи [L49], что приводит к уменьшению молекулярного веса, которое можно проследить по измерениям вязкости [К43, L49], измерению константы седиментации [К43, S62] и светорассеянию [А19]. Вследствие двойной спиральной структуры ДНК молекулярный вес может уменьшаться только тогда, когда два разрыва происходят почти один напротив другого. На разрыв водородной связи при облучении указывает тот факт, что для водного раствора облученного материала оптическая плотность вблизи 260 ммк выше, чем для необлученного [548]. При растворении облученной нуклеиновой кислоты в разбавленном соляном растворе она образует гель, а не прозрачный раствор [548] это показывает, что имевшаяся исходная структура утрачена, но существует тенденция к агрегированию путем образования новых водородных связей. В опытах с ультрацентрифугированием также отмечалась агрегация [562]. [c.280]

Азотсодержащие органические соединения представлены в бытовых сточных водах белками и продуктами их гидролиза — пептидами и аминокислотами. Белки по химическому строению являются естественными полимерами — продуктом конденсации аминокислот. Молекулярная масса белков изменяется от десятков тысяч до нескольких миллионов. Количество звеньев аминокислот колеблется от нескольких десятков до сотен тысяч. В образовании белков участвуют аминокислоты различного строения с алифатическим, ароматическим или гетероциклическим радикалами и содержащие, кроме того, другие функциональные группы. Это обусловливает разнообразие строения белковых молекул, их сложность и различную биологическую активность. Белки, содержащие только остатки аминокислот, называются протеинами. Если же в молекуле наряду с белковыми группами содержится небелковая часть, то такие соединения называются протеидами. К протеидам относятся глико- и мукопротеиды, которые представляют собой соединения белков с углеводами фосфопротеиды, содержащие фосфор липопротеиды, содержащие кроме белковой части липидные группы нуклеопро-теиды — соединения бе.лков с нуклеиновыми кислотами. В воде белки образуют коллоидные растворы, устойчивость которых зависит от pH, присутствия электролитов, температуры. Повышение температуры, действие ультрафиолетовых лучей, ионизирующего излучения, некоторых химических веществ способствует биологической инактивации белков и уменьшению их растворимости в воде. [c.164]

Метод гель-электрофореза всякий раз ставит экспериментатора перед выбором либо, используя концентрированный гель, добиться высокого разрешения нуклеиновых кислот с относительно небольшой молекулярной массой, либо в геле низкой концентрации с невысоким разрешением разделить высокомолекулярные соединения. Поэтому для каждого конкретного набора молекул приходится принимать некое компромиссное решение. Верхний предел по молекулярной массе можно увеличить путем уменьшения концентрации сшивающего агента и (или) суммарной концентрации геля. Такой подход оказался эффективным в случае выделения и анализа матричных и рибосо- [c.178]

Переход от этой в основном упорядоченной конформации к отдельным цепям беспорядочного клубка приводит к изменению молекулярных размеров, которые проявляются в изменении светорассеяния или свойств, основанных на внутреннем трении макромолекул. За изменениями кажущейся плотности и двукратным уменьшением кажущегося молекулярного веса ДНК за счет диссоциации двойной спирали можно проследить при помощи ультрацентрифугирования в градиенте плотности (гл. IV). Наиболее наглядным доказательством существования перехода спираль — клубок в ДНК является значительное изменение ультрафиолетового спектра поглощения (гл. V). Кроме этих физико-химических методов, однозначным критерием целостности нативной спиральной структуры служит биологическая активность некоторых препаратов ДНК. Авери и др. [3411 обнаружили, что контакт некоторых бактерий с растворами ДНК может привести к трансформации наследственных характеристик микроорганизмов. Эта трансформирующая активность , которая исчезает после денатурации нуклеиновой кислоты, может быть использована в качестве наиболее чувствительного средства определения доли молекул, присутствующих в нативной двойной спирали [342, 343]. [c.127]

Уменьшение каталитической активности фермента за счет стерических факторов проявляется особенно часто в случае высокомолекулярных субстратов. Поэтому при создании биокатализаторов, действующих на белки, нуклеиновые кислоты и другие природные биополимеры, предпочтительнее иммобилизовать ферменты на водорастворимых носителях с небольшой молекулярной массой. Стерические ограничения иногда удается уменьшить или даже полностью устранить путем деградации носителей под действием химических реагентов (мягкой обработкой окислителями, кислотами и т. п.) или специальными ферментами (декстраназой, цел-люлазой и др.). При этом важно, чтобы такая обработка не затронула первичную структуру и не нарушила пространственную организацию ферментов, пришитых к носителю. [c.108]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология